Doublet Group distance statistics: 48631

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.015, 0.043, 0.070, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.043 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.043, 0.112, 0.181, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.112 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.026, 0.108, 0.191, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.108 std_dev=0.083
O4	A	0, -0.031, 0.061, 0.152, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.061 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.107, 0.217, 0.326, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.217 std_dev=0.110
C3'	A	0, 0.060, 0.172, 0.285, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.172 std_dev=0.112
O2'	A	0, 0.087, 0.201, 0.316, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.201 std_dev=0.114
O3'	A	0, 0.104, 0.260, 0.416, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.260 std_dev=0.156
OP1	B	0, 0.235, 0.458, 0.680, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.458 std_dev=0.223
P	B	0, 0.271, 0.496, 0.721, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.496 std_dev=0.225
C5'	A	0, 0.107, 0.353, 0.599, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.353 std_dev=0.246
OP2	B	0, 0.291, 0.547, 0.804, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.547 std_dev=0.256
O5'	B	0, 0.280, 0.551, 0.822, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.551 std_dev=0.271
N3	B	0, 0.245, 0.565, 0.885, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.565 std_dev=0.320
C4'	B	0, 0.245, 0.585, 0.926, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.585 std_dev=0.341
O4'	B	0, 0.225, 0.570, 0.915, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.570 std_dev=0.345
C2	B	0, 0.295, 0.647, 0.999, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.647 std_dev=0.352
C4	B	0, 0.264, 0.627, 0.990, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.627 std_dev=0.363
C1'	B	0, 0.189, 0.553, 0.917, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.553 std_dev=0.364
C3'	B	0, 0.223, 0.591, 0.958, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.591 std_dev=0.367
N9	B	0, 0.269, 0.644, 1.018, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.644 std_dev=0.375
N1	B	0, 0.328, 0.751, 1.174, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.751 std_dev=0.423
O5'	A	0, 0.107, 0.553, 0.998, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.553 std_dev=0.446
C5	B	0, 0.332, 0.779, 1.227, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.779 std_dev=0.447
P	A	0, 0.141, 0.592, 1.043, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.592 std_dev=0.451
C6	B	0, 0.347, 0.820, 1.294, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.820 std_dev=0.474
C8	B	0, 0.341, 0.823, 1.305, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.823 std_dev=0.482
C5'	B	0, 0.261, 0.756, 1.251, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.756 std_dev=0.495
C2'	B	0, 0.159, 0.685, 1.212, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.685 std_dev=0.526
N7	B	0, 0.364, 0.905, 1.446, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.905 std_dev=0.541
O3'	B	0, 0.130, 0.690, 1.250, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.690 std_dev=0.560
N6	B	0, 0.391, 0.971, 1.551, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.971 std_dev=0.580
OP1	A	0, 0.231, 1.017, 1.802, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.017 std_dev=0.786
O2'	B	0, 0.094, 0.892, 1.691, 2.785 max_d=2.785 avg_d=0.892 std_dev=0.799
OP2	A	0, 0.095, 0.933, 1.771, 2.825 max_d=2.825 avg_d=0.933 std_dev=0.838

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.28	0.34	0.57	0.24
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.02	0.02	0.39	0.47	0.52	0.29
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.14	0.03	0.02	0.06	0.08	0.00	0.03	0.06	0.01	0.30	0.33	0.65	0.33
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.18	0.26	0.69	0.28
C4	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.04	0.01	0.02	0.38	0.59	0.31	0.22
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.16	0.49	0.13
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.11	0.00	0.30	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.05	0.01	0.03	0.34	0.61	0.23	0.19
C5'	0.10	0.19	0.14	0.03	0.28	0.01	0.30	0.00	0.28	0.20	0.24	0.14	0.12	0.02	0.29	0.02	0.00	0.21	0.26	0.01
C6	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.11	0.00	0.28	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01	0.03	0.32	0.53	0.29	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.35	0.44	0.46	0.23
N3	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.24	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.07	0.02	0.01	0.41	0.53	0.44	0.27
O2	0.04	0.01	0.08	0.08	0.02	0.04	0.02	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.14	0.02	0.04	0.39	0.44	0.63	0.35
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.09	0.02	0.06	0.12	0.04	0.05	0.11	0.13	0.00	0.07	0.11	0.01	0.31	0.36	0.72	0.39
O3'	0.05	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.14	0.07	0.00	0.05	0.10	0.14	0.23	0.72	0.26
O4	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.01	0.29	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.05	0.00	0.01	0.39	0.61	0.29	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.21	0.33	0.48	0.17
O5'	0.28	0.39	0.30	0.18	0.38	0.02	0.34	0.00	0.32	0.35	0.41	0.39	0.31	0.14	0.39	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.34	0.47	0.33	0.26	0.59	0.16	0.61	0.21	0.53	0.44	0.53	0.44	0.36	0.23	0.61	0.33	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.57	0.52	0.65	0.69	0.31	0.49	0.23	0.26	0.29	0.46	0.44	0.63	0.72	0.72	0.29	0.48	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.24	0.29	0.33	0.28	0.22	0.13	0.19	0.01	0.17	0.23	0.27	0.35	0.39	0.26	0.21	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.20	0.38	0.12	0.13	0.13	0.13	0.18	0.12	0.19	0.16	0.20	0.13	0.18	0.15	0.83	0.33	0.14	0.11	0.09	0.08	0.08
C2	0.10	0.16	0.20	0.07	0.09	0.06	0.17	0.08	0.14	0.27	0.11	0.15	0.19	0.29	0.14	0.58	0.36	0.11	0.08	0.07	0.07	0.07
C2'	0.20	0.20	0.41	0.12	0.14	0.14	0.12	0.16	0.11	0.17	0.15	0.19	0.10	0.15	0.16	0.84	0.44	0.17	0.13	0.13	0.11	0.12
C3'	0.22	0.18	0.48	0.13	0.16	0.15	0.14	0.19	0.12	0.19	0.15	0.19	0.11	0.16	0.19	0.94	0.39	0.16	0.12	0.12	0.09	0.10
C4	0.08	0.16	0.09	0.13	0.08	0.13	0.17	0.15	0.12	0.31	0.10	0.14	0.18	0.32	0.14	0.41	0.26	0.04	0.14	0.09	0.12	0.12
C4'	0.26	0.23	0.48	0.24	0.21	0.24	0.19	0.31	0.18	0.23	0.20	0.23	0.18	0.21	0.23	0.95	0.36	0.14	0.19	0.14	0.11	0.14
C5	0.15	0.19	0.15	0.17	0.14	0.17	0.17	0.21	0.14	0.27	0.14	0.18	0.17	0.27	0.16	0.49	0.25	0.07	0.16	0.07	0.11	0.11
C5'	0.35	0.36	0.47	0.38	0.35	0.39	0.34	0.46	0.35	0.34	0.35	0.36	0.35	0.34	0.35	0.84	0.44	0.28	0.33	0.30	0.23	0.28
C6	0.17	0.21	0.23	0.17	0.15	0.16	0.17	0.22	0.15	0.24	0.17	0.20	0.17	0.24	0.17	0.62	0.28	0.08	0.14	0.08	0.09	0.08
N1	0.15	0.20	0.26	0.10	0.12	0.10	0.15	0.15	0.14	0.23	0.15	0.19	0.16	0.23	0.14	0.68	0.32	0.09	0.10	0.08	0.08	0.08
N3	0.08	0.15	0.12	0.09	0.08	0.09	0.19	0.09	0.14	0.32	0.08	0.13	0.21	0.34	0.15	0.46	0.32	0.10	0.09	0.08	0.08	0.09
O2	0.11	0.16	0.22	0.08	0.10	0.06	0.19	0.06	0.17	0.28	0.13	0.14	0.23	0.30	0.14	0.58	0.43	0.16	0.06	0.07	0.06	0.06
O2'	0.17	0.16	0.34	0.14	0.08	0.15	0.09	0.15	0.08	0.18	0.11	0.14	0.10	0.16	0.13	0.69	0.54	0.21	0.14	0.16	0.13	0.14
O3'	0.22	0.15	0.48	0.13	0.14	0.16	0.12	0.21	0.08	0.19	0.10	0.16	0.07	0.16	0.18	0.92	0.39	0.18	0.14	0.12	0.09	0.11
O4	0.08	0.19	0.08	0.14	0.05	0.15	0.14	0.17	0.09	0.29	0.11	0.16	0.16	0.30	0.10	0.36	0.21	0.07	0.17	0.16	0.17	0.16
O4'	0.24	0.20	0.44	0.16	0.15	0.17	0.13	0.23	0.12	0.20	0.16	0.20	0.12	0.18	0.18	0.92	0.22	0.17	0.13	0.09	0.09	0.08
O5'	0.42	0.23	0.53	0.27	0.34	0.48	0.38	0.48	0.33	0.49	0.26	0.25	0.35	0.46	0.42	0.83	0.04	0.52	0.49	0.47	0.40	0.46
OP1	0.27	0.33	0.09	0.31	0.26	0.40	0.22	0.44	0.25	0.20	0.29	0.32	0.22	0.19	0.23	0.21	0.02	0.37	0.53	0.66	0.58	0.59
OP2	0.28	0.35	0.46	0.19	0.31	0.19	0.33	0.15	0.33	0.38	0.34	0.33	0.34	0.37	0.32	0.61	0.03	0.28	0.22	0.29	0.36	0.28
P	0.14	0.22	0.23	0.03	0.15	0.14	0.15	0.06	0.15	0.19	0.19	0.21	0.15	0.18	0.15	0.44	0.01	0.21	0.15	0.23	0.19	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.26	0.00	0.11	0.13	0.14	0.13
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.30	0.49	0.07	0.09	0.18	0.12	0.14
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.14	0.08	0.08	0.10	0.11	0.08	0.07	0.04	0.00	0.06	0.03	0.11	0.09	0.18	0.14
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.03	0.07	0.19	0.07	0.11	0.09	0.17	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.24	0.30	0.04	0.10	0.17	0.14	0.15
C4'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.02	0.04	0.04	0.07	0.03	0.17	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.28	0.20	0.02	0.12	0.21	0.16	0.18
C5'	0.04	0.06	0.14	0.03	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.15	0.08	0.05	0.13	0.16	0.10	0.09	0.17	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.32	0.27	0.03	0.11	0.21	0.16	0.18
C8	0.02	0.02	0.08	0.19	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.22	0.09	0.06	0.17	0.26	0.18	0.21
N1	0.02	0.01	0.10	0.07	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.32	0.40	0.05	0.10	0.21	0.15	0.17
N3	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.26	0.48	0.07	0.08	0.15	0.12	0.12
N6	0.02	0.02	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.34	0.21	0.03	0.11	0.23	0.19	0.19
N7	0.02	0.02	0.07	0.17	0.02	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.27	0.08	0.04	0.16	0.26	0.19	0.21
N9	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.17	0.01	0.13	0.18	0.15	0.16
O2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.24	0.17	0.28	0.09	0.32	0.22	0.32	0.26	0.34	0.27	0.17	0.00	0.09	0.11	0.14	0.19	0.02	0.09
O3'	0.26	0.49	0.06	0.01	0.30	0.03	0.20	0.17	0.27	0.09	0.40	0.48	0.21	0.08	0.17	0.09	0.00	0.18	0.13	0.14	0.28	0.19
O4'	0.00	0.07	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.07	0.03	0.04	0.01	0.11	0.18	0.00	0.12	0.13	0.18	0.15
O5'	0.11	0.09	0.11	0.02	0.10	0.01	0.12	0.01	0.11	0.17	0.10	0.08	0.11	0.16	0.13	0.14	0.13	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.13	0.18	0.09	0.03	0.17	0.02	0.21	0.02	0.21	0.26	0.21	0.15	0.23	0.26	0.18	0.19	0.14	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.12	0.18	0.06	0.14	0.03	0.16	0.06	0.16	0.18	0.15	0.12	0.19	0.19	0.15	0.02	0.28	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.14	0.14	0.03	0.15	0.02	0.18	0.02	0.18	0.21	0.17	0.12	0.19	0.21	0.16	0.09	0.19	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00