Doublet Group distance statistics: 48635

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.015, 0.039, 0.063, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.021, 0.056, 0.091, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.056 std_dev=0.035
O2'	A	0, 0.070, 0.121, 0.171, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.121 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.044, 0.118, 0.192, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.118 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.048, 0.132, 0.216, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.132 std_dev=0.084
C3'	A	0, 0.045, 0.182, 0.319, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.182 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.036, 0.179, 0.322, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.179 std_dev=0.143
O5'	B	0, 0.200, 0.392, 0.585, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.392 std_dev=0.192
C5'	A	0, 0.109, 0.313, 0.516, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.313 std_dev=0.204
O3'	A	0, 0.074, 0.287, 0.500, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.287 std_dev=0.213
P	B	0, 0.201, 0.421, 0.642, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.421 std_dev=0.221
O5'	A	0, 0.162, 0.393, 0.624, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.393 std_dev=0.231
P	A	0, 0.147, 0.413, 0.678, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.413 std_dev=0.266
OP1	B	0, 0.261, 0.572, 0.883, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.572 std_dev=0.311
OP2	B	0, 0.248, 0.563, 0.878, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.563 std_dev=0.315
OP2	A	0, 0.127, 0.449, 0.771, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.449 std_dev=0.322
OP1	A	0, 0.265, 0.590, 0.914, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.590 std_dev=0.324
C5'	B	0, 0.238, 0.567, 0.896, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.567 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.153, 0.490, 0.827, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.490 std_dev=0.337
O3'	B	0, 0.185, 0.531, 0.877, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.531 std_dev=0.346
C4'	B	0, 0.195, 0.598, 1.000, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.598 std_dev=0.403
O4'	B	0, 0.157, 0.682, 1.206, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.682 std_dev=0.525
C8	B	0, 0.173, 0.701, 1.229, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.701 std_dev=0.528
C2'	B	0, 0.086, 0.623, 1.160, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.623 std_dev=0.537
C1'	B	0, 0.074, 0.709, 1.344, 2.118 max_d=2.118 avg_d=0.709 std_dev=0.635
O2'	B	0, 0.135, 0.789, 1.444, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.789 std_dev=0.654
N9	B	0, 0.045, 0.726, 1.406, 2.273 max_d=2.273 avg_d=0.726 std_dev=0.680
N7	B	0, 0.151, 0.842, 1.533, 2.281 max_d=2.281 avg_d=0.842 std_dev=0.691
C5	B	0, 0.009, 0.989, 1.969, 3.227 max_d=3.227 avg_d=0.989 std_dev=0.980
C4	B	0, -0.035, 0.965, 1.965, 3.281 max_d=3.281 avg_d=0.965 std_dev=1.000
C6	B	0, -0.003, 1.295, 2.594, 4.276 max_d=4.276 avg_d=1.295 std_dev=1.298
N3	B	0, -0.052, 1.251, 2.553, 4.248 max_d=4.248 avg_d=1.251 std_dev=1.303
N6	B	0, 0.079, 1.417, 2.756, 4.440 max_d=4.440 avg_d=1.417 std_dev=1.338
C2	B	0, -0.070, 1.528, 3.126, 5.190 max_d=5.190 avg_d=1.528 std_dev=1.598
N1	B	0, -0.054, 1.552, 3.158, 5.252 max_d=5.252 avg_d=1.552 std_dev=1.606

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.08	0.06	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.02	0.11	0.13	0.14	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.08	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.09	0.07	0.06
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.05	0.04	0.09	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.11	0.08	0.08
C4	0.05	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.04	0.01	0.02	0.05	0.12	0.02	0.07	0.17	0.18	0.20	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.08	0.04	0.04
C5	0.04	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.10	0.02	0.07	0.16	0.16	0.15	0.15
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.06	0.04	0.07	0.05	0.06	0.02	0.11	0.01	0.01	0.08	0.03	0.02
C6	0.04	0.01	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.03	0.07	0.13	0.12	0.10	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.09	0.10	0.10	0.09
N3	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.11	0.03	0.04	0.14	0.17	0.18	0.14
O2	0.05	0.01	0.08	0.08	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.11	0.05	0.06	0.09	0.12	0.13	0.11
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.10	0.06	0.06
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.12	0.01	0.10	0.02	0.07	0.05	0.11	0.11	0.02	0.00	0.12	0.01	0.16	0.15	0.10	0.11
O4	0.06	0.03	0.06	0.09	0.02	0.08	0.02	0.11	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.12	0.00	0.08	0.18	0.21	0.23	0.19
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.04	0.06	0.03	0.01	0.08	0.00	0.11	0.10	0.07	0.08
O5'	0.05	0.11	0.06	0.12	0.17	0.02	0.16	0.01	0.13	0.09	0.14	0.09	0.05	0.16	0.18	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.08	0.13	0.09	0.11	0.18	0.08	0.16	0.08	0.12	0.10	0.17	0.12	0.10	0.15	0.21	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.14	0.07	0.08	0.20	0.04	0.15	0.03	0.10	0.10	0.18	0.13	0.06	0.10	0.23	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.06	0.08	0.16	0.04	0.15	0.02	0.11	0.09	0.14	0.11	0.06	0.11	0.19	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.55	1.42	0.51	0.30	0.94	0.30	0.82	0.21	1.05	0.36	1.34	1.24	0.90	0.43	0.60	0.57	0.22	0.43	0.22	0.21	0.25	0.22
C2	0.63	1.41	0.55	0.34	1.04	0.34	1.04	0.24	1.28	0.59	1.45	1.22	1.22	0.72	0.74	0.57	0.23	0.51	0.24	0.28	0.30	0.26
C2'	0.52	1.46	0.48	0.29	0.92	0.28	0.82	0.22	1.08	0.36	1.40	1.25	0.97	0.45	0.57	0.54	0.20	0.40	0.25	0.24	0.24	0.24
C3'	0.45	1.31	0.44	0.26	0.82	0.24	0.71	0.22	0.94	0.27	1.23	1.14	0.83	0.35	0.50	0.48	0.19	0.33	0.26	0.22	0.19	0.22
C4	0.46	0.95	0.39	0.25	0.75	0.24	0.79	0.19	0.93	0.50	0.99	0.83	0.93	0.63	0.56	0.38	0.18	0.38	0.21	0.32	0.32	0.28
C4'	0.43	1.22	0.42	0.23	0.77	0.23	0.61	0.18	0.80	0.20	1.09	1.09	0.68	0.27	0.45	0.49	0.17	0.32	0.21	0.16	0.17	0.17
C5	0.39	0.83	0.36	0.25	0.65	0.23	0.65	0.20	0.75	0.38	0.84	0.74	0.72	0.46	0.48	0.34	0.18	0.33	0.23	0.28	0.28	0.27
C5'	0.37	0.98	0.38	0.22	0.63	0.21	0.50	0.16	0.64	0.18	0.87	0.90	0.55	0.24	0.38	0.43	0.16	0.28	0.18	0.15	0.15	0.13
C6	0.47	1.00	0.44	0.29	0.76	0.27	0.71	0.22	0.83	0.37	0.97	0.90	0.74	0.43	0.54	0.43	0.20	0.38	0.24	0.24	0.24	0.24
N1	0.58	1.30	0.53	0.33	0.95	0.32	0.89	0.23	1.08	0.47	1.27	1.15	0.96	0.55	0.66	0.55	0.23	0.46	0.24	0.24	0.26	0.24
N3	0.57	1.22	0.49	0.30	0.94	0.30	0.99	0.21	1.18	0.59	1.28	1.06	1.19	0.75	0.69	0.49	0.20	0.47	0.23	0.31	0.31	0.27
O2	0.70	1.60	0.60	0.37	1.12	0.38	1.12	0.25	1.43	0.61	1.66	1.35	1.39	0.75	0.79	0.65	0.26	0.56	0.24	0.27	0.29	0.25
O2'	0.49	1.52	0.44	0.25	0.90	0.26	0.78	0.21	1.07	0.33	1.44	1.27	0.96	0.41	0.53	0.53	0.20	0.37	0.24	0.23	0.24	0.23
O3'	0.41	1.34	0.40	0.24	0.81	0.21	0.69	0.22	0.94	0.24	1.25	1.14	0.85	0.34	0.47	0.45	0.18	0.30	0.28	0.24	0.18	0.23
O4	0.40	0.82	0.33	0.23	0.65	0.21	0.72	0.18	0.84	0.47	0.88	0.71	0.89	0.60	0.50	0.32	0.18	0.34	0.19	0.37	0.33	0.29
O4'	0.50	1.26	0.48	0.26	0.84	0.26	0.66	0.18	0.83	0.23	1.12	1.16	0.68	0.29	0.51	0.55	0.21	0.37	0.20	0.16	0.22	0.19
O5'	0.17	0.74	0.16	0.06	0.46	0.06	0.40	0.14	0.52	0.23	0.68	0.65	0.47	0.26	0.26	0.16	0.03	0.09	0.18	0.10	0.13	0.09
OP1	0.06	0.52	0.09	0.02	0.29	0.07	0.26	0.15	0.36	0.15	0.48	0.45	0.35	0.17	0.13	0.11	0.01	0.04	0.19	0.24	0.15	0.13
OP2	0.06	0.45	0.06	0.07	0.27	0.17	0.27	0.27	0.36	0.12	0.44	0.38	0.37	0.18	0.13	0.07	0.02	0.13	0.27	0.20	0.17	0.14
P	0.05	0.50	0.08	0.02	0.30	0.07	0.26	0.14	0.36	0.15	0.47	0.44	0.34	0.17	0.14	0.09	0.01	0.03	0.17	0.18	0.14	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.13	0.11
C2	0.05	0.00	0.24	0.24	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.23	0.29	0.08	0.11	0.13	0.20	0.18
C2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.12	0.01	0.06	0.02	0.11	0.13	0.19	0.25	0.09	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.11	0.13	0.08
C3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.15	0.00	0.11	0.02	0.15	0.11	0.21	0.23	0.14	0.09	0.07	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.12	0.06
C4	0.03	0.01	0.12	0.15	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.04	0.10	0.11	0.16	0.15
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.06	0.07	0.08	0.04	0.06	0.01	0.00	0.03	0.10	0.06	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.15	0.15	0.18	0.17
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.07	0.05	0.12	0.14	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.04	0.01	0.11	0.15	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.03	0.16	0.18	0.21	0.20
C8	0.01	0.01	0.13	0.11	0.01	0.08	0.02	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.11	0.08	0.16	0.13	0.12	0.13
N1	0.05	0.01	0.19	0.21	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.18	0.25	0.06	0.14	0.17	0.22	0.20
N3	0.05	0.01	0.25	0.23	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.21	0.27	0.08	0.09	0.10	0.18	0.16
N6	0.04	0.03	0.09	0.14	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.13	0.16	0.03	0.19	0.21	0.23	0.22
N7	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.10	0.05	0.18	0.16	0.17	0.17
N9	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.09	0.08	0.13	0.11
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.10	0.06	0.09	0.05	0.13	0.11	0.18	0.21	0.13	0.10	0.03	0.00	0.06	0.07	0.03	0.15	0.10	0.03
O3'	0.02	0.29	0.02	0.01	0.15	0.01	0.12	0.03	0.18	0.11	0.25	0.27	0.16	0.10	0.06	0.06	0.00	0.01	0.07	0.24	0.16	0.09
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.06	0.08	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.06	0.14	0.12
O5'	0.04	0.11	0.07	0.07	0.10	0.03	0.15	0.01	0.16	0.16	0.14	0.09	0.19	0.18	0.09	0.03	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.13	0.11	0.15	0.11	0.10	0.15	0.09	0.18	0.13	0.17	0.10	0.21	0.16	0.08	0.15	0.24	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.20	0.13	0.12	0.16	0.06	0.18	0.02	0.21	0.12	0.22	0.18	0.23	0.17	0.13	0.10	0.16	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.08	0.06	0.15	0.04	0.17	0.01	0.20	0.13	0.20	0.16	0.22	0.17	0.11	0.03	0.09	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00