Doublet Group distance statistics: 48636

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.011
O4	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.019
N1	A	0, -0.002, 0.033, 0.069, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.033 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.020, 0.059, 0.097, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.059 std_dev=0.039
O4'	A	0, -0.003, 0.079, 0.162, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.079 std_dev=0.083
C3'	A	0, 0.040, 0.137, 0.235, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.137 std_dev=0.097
C4'	A	0, 0.031, 0.133, 0.235, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.133 std_dev=0.102
OP2	B	0, 0.106, 0.248, 0.390, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.248 std_dev=0.142
P	B	0, 0.091, 0.248, 0.405, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.248 std_dev=0.157
C2'	A	0, -0.047, 0.113, 0.273, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.113 std_dev=0.160
C5'	A	0, 0.052, 0.213, 0.375, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.213 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.045, 0.207, 0.369, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.207 std_dev=0.162
C6	B	0, 0.028, 0.209, 0.390, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.209 std_dev=0.181
O5'	B	0, 0.050, 0.232, 0.413, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.232 std_dev=0.182
C5'	B	0, 0.057, 0.255, 0.452, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.255 std_dev=0.197
O5'	A	0, 0.015, 0.217, 0.420, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.217 std_dev=0.202
C4	B	0, 0.055, 0.271, 0.487, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.271 std_dev=0.216
OP1	B	0, 0.091, 0.318, 0.544, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.318 std_dev=0.227
C4'	B	0, 0.062, 0.296, 0.530, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.296 std_dev=0.234
P	A	0, -0.020, 0.223, 0.465, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.223 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.044, 0.303, 0.563, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.303 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.072, 0.334, 0.596, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.334 std_dev=0.262
O3'	B	0, 0.099, 0.362, 0.625, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.362 std_dev=0.263
OP1	A	0, 0.003, 0.273, 0.544, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.273 std_dev=0.270
OP2	A	0, -0.038, 0.240, 0.517, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.240 std_dev=0.277
C1'	B	0, 0.036, 0.348, 0.661, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.348 std_dev=0.312
O2'	A	0, -0.110, 0.226, 0.561, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.226 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.047, 0.392, 0.737, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.392 std_dev=0.345
O2'	B	0, 0.019, 0.415, 0.812, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.415 std_dev=0.396
C5	B	0, -0.028, 0.390, 0.808, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.390 std_dev=0.418
N6	B	0, -0.015, 0.450, 0.914, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.450 std_dev=0.464
N9	B	0, -0.052, 0.416, 0.883, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.416 std_dev=0.468
N1	B	0, -0.289, 0.634, 1.557, 2.666 max_d=2.666 avg_d=0.634 std_dev=0.923
N3	B	0, -0.403, 0.692, 1.786, 3.114 max_d=3.114 avg_d=0.692 std_dev=1.094
C8	B	0, -0.509, 0.838, 2.186, 3.803 max_d=3.803 avg_d=0.838 std_dev=1.348
N7	B	0, -0.528, 0.845, 2.217, 3.879 max_d=3.879 avg_d=0.845 std_dev=1.373
C2	B	0, -0.570, 0.844, 2.258, 3.988 max_d=3.988 avg_d=0.844 std_dev=1.414

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.18	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.03	0.04	0.16	0.13	0.09
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.05	0.09	0.01	0.03	0.12	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.11	0.06	0.04
C3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.14	0.06	0.05
C4	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.04	0.01	0.03	0.06	0.11	0.10	0.05
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.13	0.07	0.06
C5	0.01	0.02	0.09	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.03	0.17	0.04	0.03	0.02	0.06	0.12	0.11	0.06
C5'	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.03	0.09	0.03	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.04	0.14	0.05	0.03	0.01	0.05	0.15	0.12	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.06	0.02	0.01	0.03	0.16	0.12	0.08
N3	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.02	0.03	0.05	0.13	0.11	0.06
O2	0.05	0.01	0.12	0.08	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.11	0.03	0.05	0.07	0.18	0.16	0.12
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.15	0.10	0.17	0.05	0.14	0.07	0.12	0.08	0.00	0.02	0.15	0.06	0.11	0.17	0.21	0.13
O3'	0.11	0.09	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.05	0.06	0.07	0.11	0.02	0.00	0.03	0.06	0.07	0.16	0.08	0.08
O4	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02	0.02	0.03	0.15	0.03	0.00	0.03	0.05	0.10	0.10	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.19	0.13	0.11
O5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.11	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.18	0.16	0.11	0.14	0.11	0.13	0.12	0.07	0.15	0.16	0.13	0.18	0.17	0.16	0.10	0.19	0.03	0.00	0.03	0.03
OP2	0.14	0.13	0.06	0.06	0.10	0.07	0.11	0.02	0.12	0.12	0.11	0.16	0.21	0.08	0.10	0.13	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.10	0.09	0.04	0.05	0.05	0.06	0.06	0.02	0.07	0.08	0.06	0.12	0.13	0.08	0.05	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.96	0.24	0.19	0.06	0.14	0.34	0.10	0.04	0.91	0.70	0.66	0.32	0.98	0.36	0.17	0.18	0.15	0.09	0.16	0.04	0.07
C2	0.18	0.44	0.29	0.24	0.08	0.19	0.26	0.16	0.07	0.51	0.37	0.23	0.23	0.57	0.27	0.23	0.24	0.19	0.14	0.09	0.04	0.03
C2'	0.08	1.31	0.12	0.06	0.19	0.05	0.33	0.08	0.08	1.00	0.91	0.96	0.40	1.13	0.29	0.08	0.06	0.05	0.11	0.32	0.20	0.22
C3'	0.26	1.24	0.27	0.20	0.07	0.13	0.47	0.08	0.08	1.29	0.82	0.90	0.46	1.35	0.50	0.21	0.20	0.15	0.07	0.21	0.09	0.10
C4	0.16	0.26	0.29	0.25	0.17	0.20	0.07	0.16	0.09	0.02	0.18	0.27	0.06	0.03	0.13	0.23	0.24	0.20	0.14	0.05	0.07	0.03
C4'	0.28	1.09	0.28	0.20	0.07	0.15	0.42	0.09	0.05	1.17	0.73	0.79	0.38	1.19	0.48	0.21	0.20	0.17	0.08	0.20	0.07	0.09
C5	0.19	0.12	0.28	0.23	0.13	0.19	0.15	0.15	0.06	0.28	0.10	0.06	0.07	0.25	0.22	0.21	0.23	0.20	0.13	0.11	0.05	0.03
C5'	0.29	1.04	0.26	0.18	0.09	0.13	0.38	0.08	0.02	1.15	0.69	0.79	0.31	1.12	0.47	0.20	0.18	0.17	0.07	0.24	0.13	0.14
C6	0.22	0.52	0.27	0.22	0.08	0.18	0.26	0.14	0.05	0.63	0.36	0.33	0.16	0.63	0.32	0.20	0.21	0.19	0.12	0.15	0.04	0.05
N1	0.22	0.65	0.29	0.23	0.06	0.18	0.32	0.14	0.04	0.73	0.49	0.40	0.26	0.78	0.34	0.22	0.23	0.19	0.12	0.14	0.03	0.05
N3	0.17	0.11	0.30	0.25	0.15	0.20	0.16	0.16	0.10	0.20	0.11	0.12	0.08	0.20	0.18	0.25	0.25	0.20	0.14	0.05	0.06	0.03
O2	0.18	0.53	0.29	0.24	0.07	0.19	0.29	0.16	0.10	0.58	0.44	0.29	0.31	0.65	0.28	0.24	0.25	0.19	0.14	0.08	0.04	0.04
O2'	0.18	1.56	0.14	0.16	0.43	0.19	0.13	0.19	0.32	0.74	1.21	1.17	0.25	0.88	0.08	0.20	0.16	0.20	0.19	0.36	0.20	0.26
O3'	0.28	1.34	0.31	0.23	0.09	0.17	0.45	0.11	0.09	1.33	0.94	0.95	0.42	1.37	0.51	0.26	0.25	0.17	0.10	0.21	0.06	0.08
O4	0.14	0.69	0.29	0.26	0.24	0.21	0.09	0.18	0.12	0.33	0.48	0.59	0.20	0.42	0.05	0.26	0.26	0.21	0.15	0.04	0.09	0.06
O4'	0.29	0.90	0.30	0.24	0.06	0.20	0.38	0.15	0.04	1.01	0.62	0.61	0.31	1.02	0.45	0.23	0.24	0.22	0.13	0.15	0.02	0.05
O5'	0.27	0.93	0.23	0.15	0.06	0.12	0.33	0.05	0.03	1.03	0.63	0.69	0.27	0.99	0.42	0.17	0.15	0.15	0.06	0.22	0.10	0.12
OP1	0.30	0.50	0.26	0.19	0.12	0.17	0.35	0.11	0.15	0.82	0.30	0.35	0.29	0.78	0.41	0.16	0.18	0.22	0.12	0.14	0.12	0.11
OP2	0.30	0.61	0.26	0.20	0.08	0.18	0.36	0.14	0.12	0.90	0.37	0.42	0.32	0.87	0.43	0.15	0.18	0.22	0.14	0.08	0.09	0.07
P	0.29	0.70	0.24	0.17	0.04	0.15	0.34	0.09	0.08	0.93	0.44	0.51	0.28	0.89	0.42	0.14	0.16	0.19	0.10	0.13	0.06	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.12	0.13	0.05
C2	0.06	0.00	0.43	0.60	0.01	0.32	0.01	0.45	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.20	0.61	0.09	0.24	0.13	0.12	0.11
C2'	0.00	0.43	0.00	0.00	0.22	0.01	0.10	0.02	0.19	0.22	0.35	0.43	0.12	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.10	0.04
C3'	0.01	0.60	0.00	0.00	0.22	0.01	0.06	0.02	0.17	0.46	0.43	0.58	0.08	0.33	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03
C4	0.03	0.01	0.22	0.22	0.00	0.12	0.01	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.14	0.22	0.05	0.10	0.10	0.06	0.04
C4'	0.03	0.32	0.01	0.01	0.12	0.00	0.04	0.01	0.09	0.24	0.23	0.31	0.05	0.18	0.05	0.06	0.01	0.01	0.04	0.04	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.14	0.06	0.03	0.04	0.23	0.06	0.11
C5'	0.03	0.45	0.02	0.02	0.14	0.01	0.09	0.00	0.09	0.40	0.30	0.43	0.11	0.34	0.11	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02
C6	0.03	0.02	0.19	0.17	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.18	0.18	0.05	0.05	0.15	0.05	0.07
C8	0.04	0.03	0.22	0.46	0.02	0.24	0.03	0.40	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.40	0.05	0.16	0.39	0.18	0.21
N1	0.04	0.02	0.35	0.43	0.02	0.23	0.01	0.30	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.22	0.45	0.09	0.16	0.03	0.09	0.04
N3	0.07	0.01	0.43	0.58	0.00	0.31	0.01	0.43	0.03	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.17	0.57	0.09	0.23	0.12	0.08	0.11
N6	0.03	0.03	0.12	0.08	0.02	0.05	0.03	0.11	0.00	0.06	0.02	0.04	0.00	0.06	0.03	0.16	0.09	0.04	0.05	0.24	0.06	0.14
N7	0.04	0.02	0.11	0.33	0.01	0.18	0.01	0.34	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.10	0.30	0.03	0.14	0.39	0.14	0.21
N9	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.07	0.07	0.02	0.04	0.21	0.12	0.09
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.14	0.06	0.14	0.04	0.18	0.05	0.22	0.17	0.16	0.10	0.07	0.00	0.03	0.07	0.05	0.13	0.16	0.09
O3'	0.03	0.61	0.01	0.01	0.22	0.01	0.06	0.02	0.18	0.40	0.45	0.57	0.09	0.30	0.07	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.06	0.03
O4'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.09	0.09	0.04	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.06	0.09	0.10	0.04
O5'	0.08	0.24	0.05	0.03	0.10	0.04	0.04	0.01	0.05	0.16	0.16	0.23	0.05	0.14	0.04	0.05	0.03	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.12	0.13	0.05	0.02	0.10	0.04	0.23	0.02	0.15	0.39	0.03	0.12	0.24	0.39	0.21	0.13	0.02	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.12	0.10	0.06	0.06	0.07	0.06	0.03	0.05	0.18	0.09	0.08	0.06	0.14	0.12	0.16	0.06	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.04	0.03	0.04	0.03	0.11	0.02	0.07	0.21	0.04	0.11	0.14	0.21	0.09	0.09	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00