Doublet Group distance statistics: 48644

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.001, 0.022, 0.046, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.024
C6	A	0, 0.005, 0.040, 0.075, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.040 std_dev=0.035
C2	A	0, 0.003, 0.039, 0.074, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.039 std_dev=0.035
N1	A	0, 0.010, 0.047, 0.084, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.047 std_dev=0.037
C4	A	0, 0.017, 0.055, 0.093, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.055 std_dev=0.038
N3	A	0, 0.022, 0.066, 0.109, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.066 std_dev=0.043
C1'	A	0, 0.016, 0.075, 0.133, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.075 std_dev=0.059
O4	A	0, 0.027, 0.086, 0.146, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.086 std_dev=0.059
O4'	A	0, 0.043, 0.112, 0.180, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.112 std_dev=0.068
O2	A	0, 0.020, 0.099, 0.177, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.099 std_dev=0.078
C4'	A	0, 0.088, 0.209, 0.330, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.209 std_dev=0.121
C2'	A	0, 0.072, 0.197, 0.323, 0.307 max_d=0.307 avg_d=0.197 std_dev=0.126
O5'	A	0, 0.104, 0.247, 0.389, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.247 std_dev=0.143
O2'	A	0, 0.070, 0.215, 0.360, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.215 std_dev=0.145
C3'	A	0, 0.101, 0.247, 0.393, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.247 std_dev=0.146
C5'	A	0, 0.106, 0.278, 0.451, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.278 std_dev=0.172
O3'	A	0, 0.143, 0.347, 0.551, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.347 std_dev=0.204
P	B	0, 0.157, 0.447, 0.737, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.447 std_dev=0.290
OP2	A	0, 0.101, 0.412, 0.722, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.412 std_dev=0.311
P	A	0, 0.135, 0.478, 0.822, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.478 std_dev=0.343
O5'	B	0, 0.064, 0.484, 0.904, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.484 std_dev=0.420
C5'	B	0, 0.026, 0.550, 1.075, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.550 std_dev=0.525
O3'	B	0, 0.133, 0.685, 1.237, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.685 std_dev=0.552
C3'	B	0, 0.093, 0.699, 1.306, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.699 std_dev=0.607
OP1	A	0, 0.199, 0.849, 1.499, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.849 std_dev=0.650
OP1	B	0, 0.074, 0.745, 1.417, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.745 std_dev=0.672
C4'	B	0, 0.111, 0.851, 1.592, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.851 std_dev=0.741
OP2	B	0, 0.454, 1.199, 1.945, 1.967 max_d=1.967 avg_d=1.199 std_dev=0.745
C2'	B	0, 0.128, 1.041, 1.954, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.041 std_dev=0.913
O4'	B	0, 0.176, 1.149, 2.122, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.149 std_dev=0.973
C8	B	0, 0.175, 1.222, 2.269, 2.381 max_d=2.381 avg_d=1.222 std_dev=1.047
O2'	B	0, 0.186, 1.311, 2.436, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.311 std_dev=1.125
C1'	B	0, 0.143, 1.301, 2.459, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.301 std_dev=1.158
N9	B	0, 0.138, 1.384, 2.629, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.384 std_dev=1.246
N7	B	0, 0.183, 1.551, 2.919, 3.053 max_d=3.053 avg_d=1.551 std_dev=1.368
C4	B	0, 0.135, 1.910, 3.686, 3.779 max_d=3.779 avg_d=1.910 std_dev=1.775
C5	B	0, 0.154, 2.027, 3.900, 4.015 max_d=4.015 avg_d=2.027 std_dev=1.873
N3	B	0, 0.128, 2.344, 4.560, 4.643 max_d=4.643 avg_d=2.344 std_dev=2.216
C6	B	0, 0.155, 2.668, 5.180, 5.312 max_d=5.312 avg_d=2.668 std_dev=2.512
N6	B	0, 0.159, 2.890, 5.621, 5.763 max_d=5.763 avg_d=2.890 std_dev=2.731
C2	B	0, 0.134, 2.914, 5.693, 5.777 max_d=5.777 avg_d=2.914 std_dev=2.779
N1	B	0, 0.154, 3.113, 6.072, 6.190 max_d=6.190 avg_d=3.113 std_dev=2.959

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.07	0.12	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.15	0.07	0.02
C2	0.07	0.00	0.14	0.15	0.01	0.09	0.03	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.01	0.04	0.20	0.19	0.04	0.05
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.11	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.14	0.22	0.01	0.01	0.13	0.01	0.04	0.24	0.03	0.04
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.13	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.15	0.21	0.02	0.01	0.15	0.01	0.02	0.27	0.04	0.07
C4	0.06	0.01	0.11	0.13	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.04	0.01	0.03	0.10	0.15	0.02	0.03	0.22	0.10	0.05	0.04
C4'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.08	0.15	0.02	0.02	0.10	0.00	0.02	0.18	0.03	0.02
C5	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.07	0.05	0.02	0.19	0.04	0.09	0.03
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.10	0.15	0.03	0.03	0.12	0.02	0.00	0.12	0.01	0.02
C6	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.18	0.08	0.09	0.03
N1	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.07	0.06	0.02	0.18	0.15	0.05	0.03
N3	0.07	0.01	0.14	0.15	0.01	0.08	0.03	0.10	0.01	0.03	0.00	0.04	0.12	0.17	0.02	0.04	0.21	0.15	0.05	0.04
O2	0.12	0.01	0.22	0.21	0.03	0.15	0.03	0.15	0.01	0.03	0.04	0.00	0.21	0.23	0.04	0.09	0.23	0.26	0.01	0.09
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.10	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.12	0.21	0.00	0.03	0.11	0.03	0.03	0.25	0.03	0.05
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.15	0.02	0.07	0.03	0.04	0.07	0.17	0.23	0.03	0.00	0.18	0.02	0.05	0.37	0.09	0.13
O4	0.08	0.01	0.13	0.15	0.02	0.10	0.05	0.12	0.06	0.06	0.02	0.04	0.11	0.18	0.00	0.05	0.25	0.11	0.03	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.09	0.03	0.02	0.05	0.00	0.09	0.09	0.09	0.05
O5'	0.10	0.20	0.04	0.02	0.22	0.02	0.19	0.00	0.18	0.18	0.21	0.23	0.03	0.05	0.25	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.15	0.19	0.24	0.27	0.10	0.18	0.04	0.12	0.08	0.15	0.15	0.26	0.25	0.37	0.11	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.09	0.01	0.09	0.05	0.05	0.01	0.03	0.09	0.03	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.02	0.05	0.04	0.07	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.09	0.05	0.13	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.59	1.95	0.52	0.33	1.18	0.32	0.98	0.16	1.34	0.18	1.82	1.67	1.10	0.34	0.65	0.51	0.24	0.46	0.11	0.30	0.25	0.07
C2	0.80	2.00	0.63	0.41	1.46	0.43	1.48	0.24	1.84	0.63	2.07	1.73	1.73	0.91	0.98	0.59	0.23	0.67	0.24	0.26	0.11	0.07
C2'	0.49	1.95	0.43	0.27	1.13	0.24	0.98	0.12	1.39	0.16	1.87	1.61	1.23	0.36	0.59	0.40	0.17	0.38	0.11	0.39	0.21	0.09
C3'	0.33	1.65	0.29	0.18	0.91	0.14	0.76	0.06	1.12	0.05	1.55	1.38	0.97	0.20	0.42	0.25	0.10	0.25	0.09	0.43	0.22	0.14
C4	0.75	1.42	0.56	0.39	1.18	0.43	1.20	0.27	1.33	0.70	1.44	1.30	1.24	0.90	0.90	0.52	0.22	0.67	0.31	0.26	0.10	0.11
C4'	0.29	1.46	0.28	0.18	0.76	0.16	0.54	0.07	0.84	0.15	1.28	1.26	0.66	0.06	0.31	0.28	0.15	0.23	0.09	0.33	0.25	0.13
C5	0.60	1.23	0.48	0.36	0.98	0.37	0.89	0.22	1.01	0.38	1.18	1.15	0.87	0.51	0.70	0.45	0.22	0.54	0.20	0.31	0.20	0.06
C5'	0.09	1.03	0.10	0.07	0.46	0.06	0.27	0.03	0.50	0.32	0.86	0.89	0.36	0.18	0.09	0.12	0.09	0.08	0.12	0.34	0.28	0.18
C6	0.56	1.43	0.48	0.34	1.04	0.32	0.88	0.17	1.08	0.21	1.34	1.31	0.89	0.37	0.65	0.44	0.22	0.47	0.12	0.32	0.24	0.08
N1	0.66	1.84	0.55	0.36	1.27	0.35	1.16	0.18	1.47	0.35	1.79	1.61	1.26	0.55	0.78	0.51	0.22	0.53	0.15	0.31	0.21	0.05
N3	0.84	1.78	0.64	0.43	1.41	0.46	1.47	0.28	1.72	0.78	1.85	1.58	1.67	1.06	1.03	0.60	0.24	0.73	0.31	0.24	0.09	0.13
O2	0.82	2.18	0.62	0.39	1.52	0.42	1.56	0.24	2.04	0.67	2.32	1.83	2.03	0.97	1.00	0.59	0.20	0.68	0.25	0.24	0.08	0.09
O2'	0.48	2.02	0.41	0.25	1.09	0.23	0.93	0.11	1.36	0.12	1.92	1.63	1.19	0.31	0.55	0.40	0.16	0.37	0.09	0.37	0.23	0.09
O3'	0.24	1.63	0.19	0.10	0.84	0.07	0.72	0.04	1.10	0.07	1.55	1.32	0.99	0.18	0.34	0.14	0.03	0.16	0.09	0.49	0.23	0.17
O4	0.71	1.24	0.51	0.34	1.06	0.40	1.10	0.26	1.21	0.75	1.27	1.14	1.17	0.92	0.85	0.48	0.17	0.65	0.33	0.25	0.13	0.16
O4'	0.47	1.62	0.47	0.31	0.94	0.29	0.66	0.14	0.93	0.08	1.39	1.46	0.68	0.10	0.47	0.48	0.26	0.38	0.09	0.25	0.26	0.08
O5'	0.06	0.84	0.05	0.07	0.33	0.09	0.18	0.11	0.41	0.41	0.72	0.70	0.30	0.26	0.05	0.03	0.01	0.08	0.19	0.48	0.37	0.30
OP1	0.01	0.65	0.03	0.01	0.29	0.07	0.19	0.13	0.35	0.23	0.57	0.54	0.28	0.12	0.04	0.07	0.01	0.05	0.14	0.17	0.16	0.04
OP2	0.11	0.74	0.08	0.07	0.44	0.04	0.37	0.06	0.53	0.07	0.70	0.64	0.47	0.11	0.18	0.02	0.01	0.09	0.16	0.33	0.17	0.09
P	0.02	0.71	0.01	0.01	0.34	0.01	0.24	0.03	0.41	0.22	0.63	0.61	0.33	0.10	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.29	0.18	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.19	0.09	0.15
C2	0.02	0.00	0.35	0.43	0.01	0.15	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.25	0.55	0.07	0.17	0.16	0.05	0.13
C2'	0.00	0.35	0.00	0.01	0.18	0.01	0.08	0.02	0.16	0.16	0.28	0.35	0.11	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.05	0.06
C3'	0.01	0.43	0.01	0.00	0.22	0.00	0.13	0.01	0.23	0.19	0.36	0.40	0.17	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.08	0.01
C4	0.02	0.01	0.18	0.22	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.11	0.26	0.04	0.13	0.16	0.05	0.12
C4'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.08	0.14	0.13	0.07	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.02	0.07
C5	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.16	0.03	0.14	0.14	0.06	0.11
C5'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.10	0.12	0.14	0.12	0.08	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01
C6	0.03	0.01	0.16	0.23	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.29	0.04	0.15	0.14	0.04	0.11
C8	0.01	0.02	0.16	0.19	0.02	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.10	0.20	0.05	0.16	0.14	0.10	0.11
N1	0.02	0.01	0.28	0.36	0.02	0.14	0.02	0.14	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.19	0.47	0.04	0.18	0.16	0.04	0.13
N3	0.02	0.01	0.35	0.40	0.00	0.13	0.01	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.23	0.49	0.08	0.15	0.17	0.05	0.13
N6	0.05	0.01	0.11	0.17	0.02	0.07	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.09	0.22	0.05	0.12	0.11	0.05	0.09
N7	0.02	0.02	0.09	0.09	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.15	0.13	0.10	0.10
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.17	0.07	0.13
O2'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.11	0.03	0.05	0.03	0.11	0.10	0.19	0.23	0.09	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.14	0.03	0.10
O3'	0.01	0.55	0.01	0.00	0.26	0.01	0.16	0.01	0.29	0.20	0.47	0.49	0.22	0.10	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.16	0.12	0.05
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.25	0.14	0.20
O5'	0.06	0.17	0.03	0.03	0.13	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.18	0.15	0.12	0.15	0.11	0.03	0.05	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.19	0.16	0.08	0.09	0.16	0.11	0.14	0.06	0.14	0.14	0.16	0.17	0.11	0.13	0.17	0.14	0.16	0.25	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.05	0.05	0.08	0.05	0.02	0.06	0.06	0.04	0.10	0.04	0.05	0.05	0.10	0.07	0.03	0.12	0.14	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.15	0.13	0.06	0.01	0.12	0.07	0.11	0.01	0.11	0.11	0.13	0.13	0.09	0.10	0.13	0.10	0.05	0.20	0.00	0.01	0.02	0.00