Doublet Group distance statistics: 48664

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 22, 14, 5, 4, 1, 3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.030 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.026, 0.093, 0.160, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.093 std_dev=0.067
C3'	B	0, 0.121, 0.236, 0.352, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.236 std_dev=0.116
C2'	B	0, 0.137, 0.259, 0.381, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.259 std_dev=0.122
O3'	B	0, 0.137, 0.273, 0.409, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.273 std_dev=0.136
C1'	B	0, 0.103, 0.251, 0.399, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.251 std_dev=0.148
O5'	B	0, 0.105, 0.259, 0.413, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.259 std_dev=0.154
N1	B	0, 0.075, 0.235, 0.396, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.235 std_dev=0.161
O2	B	0, 0.141, 0.316, 0.491, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.316 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.091, 0.268, 0.445, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.268 std_dev=0.177
P	B	0, 0.071, 0.257, 0.443, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.257 std_dev=0.186
C4'	B	0, 0.064, 0.255, 0.447, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.255 std_dev=0.192
O2'	B	0, 0.122, 0.324, 0.526, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.324 std_dev=0.202
OP2	B	0, 0.049, 0.253, 0.457, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.253 std_dev=0.204
OP1	B	0, 0.082, 0.298, 0.514, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.298 std_dev=0.216
O4'	B	0, 0.045, 0.269, 0.493, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.269 std_dev=0.224
C6	B	0, -0.002, 0.226, 0.454, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.226 std_dev=0.228
N3	B	0, 0.017, 0.271, 0.526, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.271 std_dev=0.255
C2'	A	0, -0.115, 0.156, 0.426, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.156 std_dev=0.270
C5'	B	0, -0.027, 0.255, 0.537, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.255 std_dev=0.282
C5	B	0, -0.055, 0.227, 0.510, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.227 std_dev=0.283
O4'	A	0, -0.139, 0.148, 0.436, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.148 std_dev=0.288
C4	B	0, -0.049, 0.244, 0.538, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.244 std_dev=0.294
N4	B	0, -0.106, 0.269, 0.645, 2.126 max_d=2.126 avg_d=0.269 std_dev=0.376
C3'	A	0, -0.210, 0.192, 0.594, 2.228 max_d=2.228 avg_d=0.192 std_dev=0.402
O2'	A	0, -0.178, 0.256, 0.691, 2.424 max_d=2.424 avg_d=0.256 std_dev=0.435
C4'	A	0, -0.263, 0.191, 0.646, 2.503 max_d=2.503 avg_d=0.191 std_dev=0.455
O3'	A	0, -0.236, 0.245, 0.725, 2.684 max_d=2.684 avg_d=0.245 std_dev=0.481
O5'	A	0, -0.294, 0.348, 0.990, 3.578 max_d=3.578 avg_d=0.348 std_dev=0.642
C5'	A	0, -0.344, 0.323, 0.990, 3.697 max_d=3.697 avg_d=0.323 std_dev=0.667
OP2	A	0, -0.434, 0.501, 1.435, 5.198 max_d=5.198 avg_d=0.501 std_dev=0.935
P	A	0, -0.486, 0.470, 1.427, 5.304 max_d=5.304 avg_d=0.470 std_dev=0.957
OP1	A	0, -0.674, 0.573, 1.821, 6.894 max_d=6.894 avg_d=0.573 std_dev=1.248

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.00	0.04	0.06	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.12	0.08	0.10	0.10	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.07	0.02	0.07	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.17	0.07	0.20	0.15
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.18	0.00	0.21	0.01	0.19	0.10	0.13	0.03	0.01	0.00	0.19	0.01	0.02	0.17	0.06	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.18	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.06	0.00	0.02	0.24	0.29	0.32	0.22
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.18	0.04	0.03	0.16	0.13	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.21	0.00	0.17	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.11	0.00	0.09	0.32	0.37	0.37	0.31
C5'	0.02	0.09	0.08	0.01	0.14	0.00	0.23	0.00	0.22	0.06	0.07	0.20	0.05	0.09	0.15	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.19	0.00	0.18	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.08	0.01	0.12	0.27	0.31	0.25	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.05	0.01	0.01	0.10	0.14	0.10	0.07
N3	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.08	0.14	0.17	0.19	0.10
O2	0.02	0.00	0.13	0.03	0.00	0.16	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.18	0.01	0.21	0.12	0.12	0.07	0.13
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.17	0.13	0.25	0.05	0.24	0.10	0.08	0.15	0.00	0.03	0.19	0.09	0.13	0.10	0.25	0.13
O3'	0.14	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.11	0.09	0.08	0.05	0.05	0.18	0.03	0.00	0.07	0.09	0.09	0.38	0.19	0.22
O4	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.07	0.00	0.02	0.27	0.33	0.38	0.27
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.08	0.21	0.09	0.09	0.02	0.00	0.03	0.04	0.06	0.05
O5'	0.04	0.08	0.17	0.02	0.24	0.01	0.32	0.00	0.27	0.10	0.14	0.12	0.13	0.09	0.27	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.10	0.07	0.17	0.29	0.08	0.37	0.03	0.31	0.14	0.17	0.12	0.10	0.38	0.33	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.10	0.20	0.06	0.32	0.02	0.37	0.01	0.25	0.10	0.19	0.07	0.25	0.19	0.38	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.15	0.07	0.22	0.02	0.31	0.01	0.24	0.07	0.10	0.13	0.13	0.22	0.27	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.08	0.10	0.12	0.09	0.23	0.18	0.31	0.20	0.15	0.08	0.10	0.07	0.11	0.10	0.28	0.14	0.13	0.14	0.13
C2	0.14	0.08	0.08	0.11	0.09	0.21	0.18	0.30	0.18	0.13	0.07	0.08	0.07	0.07	0.09	0.25	0.12	0.12	0.14	0.10
C2'	0.10	0.18	0.10	0.10	0.22	0.20	0.07	0.30	0.10	0.08	0.27	0.36	0.21	0.09	0.10	0.22	0.14	0.19	0.18	0.17
C3'	0.20	0.31	0.26	0.24	0.35	0.15	0.25	0.13	0.21	0.24	0.36	0.42	0.33	0.25	0.26	0.13	0.34	0.28	0.28	0.29
C4	0.12	0.08	0.06	0.10	0.08	0.21	0.06	0.31	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.06	0.08	0.24	0.11	0.11	0.14	0.09
C4'	0.11	0.16	0.15	0.14	0.19	0.09	0.16	0.11	0.13	0.13	0.19	0.24	0.16	0.15	0.17	0.09	0.31	0.28	0.28	0.28
C5	0.13	0.07	0.08	0.10	0.13	0.22	0.09	0.31	0.08	0.08	0.11	0.19	0.08	0.08	0.10	0.25	0.13	0.12	0.15	0.12
C5'	0.21	0.25	0.24	0.24	0.29	0.17	0.28	0.14	0.25	0.23	0.27	0.32	0.24	0.24	0.25	0.16	0.43	0.42	0.42	0.42
C6	0.15	0.07	0.09	0.10	0.12	0.23	0.08	0.31	0.12	0.10	0.11	0.19	0.07	0.09	0.10	0.26	0.14	0.14	0.15	0.13
N1	0.15	0.06	0.09	0.11	0.06	0.22	0.13	0.31	0.17	0.12	0.07	0.10	0.06	0.09	0.09	0.26	0.13	0.13	0.14	0.12
N3	0.13	0.09	0.06	0.11	0.09	0.21	0.13	0.30	0.15	0.12	0.09	0.09	0.09	0.06	0.08	0.23	0.11	0.12	0.13	0.09
O2	0.14	0.10	0.08	0.12	0.16	0.21	0.23	0.30	0.21	0.15	0.11	0.17	0.08	0.08	0.09	0.24	0.12	0.12	0.13	0.10
O2'	0.38	0.14	0.27	0.32	0.11	0.50	0.34	0.59	0.42	0.31	0.07	0.14	0.10	0.28	0.27	0.54	0.39	0.44	0.44	0.45
O3'	0.12	0.18	0.15	0.14	0.20	0.11	0.14	0.13	0.12	0.14	0.22	0.25	0.20	0.14	0.16	0.11	0.31	0.29	0.29	0.29
O4	0.12	0.11	0.06	0.10	0.10	0.21	0.09	0.31	0.09	0.10	0.11	0.11	0.13	0.06	0.08	0.23	0.11	0.11	0.14	0.09
O4'	0.12	0.09	0.09	0.09	0.11	0.15	0.12	0.20	0.13	0.11	0.10	0.13	0.09	0.09	0.09	0.18	0.20	0.18	0.15	0.16
O5'	0.34	0.39	0.38	0.37	0.44	0.29	0.43	0.24	0.39	0.37	0.42	0.46	0.38	0.37	0.38	0.27	0.52	0.48	0.49	0.49
OP1	0.62	0.66	0.59	0.56	0.71	0.54	0.71	0.49	0.68	0.65	0.68	0.72	0.64	0.59	0.53	0.57	0.74	0.70	0.74	0.74
OP2	0.62	0.65	0.63	0.61	0.68	0.56	0.71	0.52	0.69	0.65	0.66	0.66	0.63	0.62	0.59	0.57	0.75	0.69	0.75	0.73
P	0.48	0.51	0.48	0.46	0.56	0.42	0.58	0.38	0.55	0.51	0.53	0.57	0.49	0.47	0.45	0.44	0.65	0.62	0.65	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.09	0.11	0.10
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.19	0.17	0.17	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.08	0.10
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.02	0.10	0.02	0.04	0.05	0.12	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.06	0.11
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.29	0.29	0.29	0.31
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.02	0.32	0.32	0.30	0.33
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.05	0.06	0.07	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.28	0.26	0.22	0.27
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.18	0.15	0.19
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.24	0.23	0.23	0.26
N4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.31	0.32	0.33	0.34
O2	0.01	0.00	0.10	0.12	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.14	0.02	0.14	0.12	0.14	0.16
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.09	0.04
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.02	0.10	0.03	0.10	0.02	0.05	0.05	0.14	0.03	0.00	0.01	0.10	0.11	0.07	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.14	0.05
O5'	0.09	0.19	0.12	0.15	0.29	0.01	0.32	0.01	0.28	0.19	0.24	0.31	0.14	0.04	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.17	0.10	0.12	0.29	0.05	0.32	0.06	0.26	0.18	0.23	0.32	0.12	0.07	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.17	0.08	0.06	0.29	0.13	0.30	0.17	0.22	0.15	0.23	0.33	0.14	0.09	0.07	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.10	0.11	0.31	0.02	0.33	0.01	0.27	0.19	0.26	0.34	0.16	0.04	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00