Doublet Group distance statistics: 48666

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 6, 11, 3, 7, 2, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.016 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.002, 0.031, 0.059, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.031 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.006, 0.092, 0.179, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.092 std_dev=0.086
P	B	0, 0.125, 0.317, 0.508, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.317 std_dev=0.191
O5'	B	0, 0.080, 0.299, 0.517, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.299 std_dev=0.218
C5'	B	0, 0.083, 0.321, 0.560, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.321 std_dev=0.238
OP2	B	0, 0.083, 0.325, 0.567, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.325 std_dev=0.242
OP1	B	0, 0.121, 0.367, 0.614, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.367 std_dev=0.247
O4'	A	0, -0.057, 0.247, 0.551, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.247 std_dev=0.304
C4'	B	0, 0.047, 0.359, 0.670, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.359 std_dev=0.311
C3'	B	0, 0.027, 0.345, 0.664, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.345 std_dev=0.319
C6	B	0, 0.034, 0.368, 0.701, 2.104 max_d=2.104 avg_d=0.368 std_dev=0.333
OP2	A	0, 0.080, 0.415, 0.750, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.415 std_dev=0.335
C2'	A	0, -0.059, 0.285, 0.630, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.285 std_dev=0.345
O3'	B	0, 0.028, 0.392, 0.756, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.392 std_dev=0.364
P	A	0, 0.015, 0.384, 0.753, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.384 std_dev=0.369
O4'	B	0, 0.016, 0.386, 0.756, 2.251 max_d=2.251 avg_d=0.386 std_dev=0.370
C5	B	0, 0.021, 0.392, 0.763, 2.247 max_d=2.247 avg_d=0.392 std_dev=0.371
O5'	A	0, -0.038, 0.350, 0.739, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.350 std_dev=0.388
N1	B	0, -0.017, 0.386, 0.789, 2.475 max_d=2.475 avg_d=0.386 std_dev=0.403
C2'	B	0, -0.006, 0.398, 0.802, 2.459 max_d=2.459 avg_d=0.398 std_dev=0.404
C1'	B	0, -0.012, 0.407, 0.826, 2.571 max_d=2.571 avg_d=0.407 std_dev=0.419
C4	B	0, -0.011, 0.435, 0.880, 2.656 max_d=2.656 avg_d=0.435 std_dev=0.446
OP1	A	0, 0.010, 0.457, 0.903, 2.349 max_d=2.349 avg_d=0.457 std_dev=0.446
C2	B	0, -0.014, 0.461, 0.936, 2.879 max_d=2.879 avg_d=0.461 std_dev=0.475
N3	B	0, 0.000, 0.483, 0.965, 2.906 max_d=2.906 avg_d=0.483 std_dev=0.482
C4'	A	0, -0.114, 0.377, 0.867, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.377 std_dev=0.490
N4	B	0, 0.002, 0.502, 1.003, 2.933 max_d=2.933 avg_d=0.502 std_dev=0.500
O2'	B	0, -0.004, 0.505, 1.015, 3.093 max_d=3.093 avg_d=0.505 std_dev=0.510
O2	B	0, 0.015, 0.558, 1.102, 3.288 max_d=3.288 avg_d=0.558 std_dev=0.544
C5'	A	0, -0.074, 0.478, 1.030, 2.149 max_d=2.149 avg_d=0.478 std_dev=0.552
C3'	A	0, -0.159, 0.396, 0.951, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.396 std_dev=0.555
O2'	A	0, -0.102, 0.492, 1.086, 2.150 max_d=2.150 avg_d=0.492 std_dev=0.594
O3'	A	0, -0.390, 0.553, 1.497, 3.104 max_d=3.104 avg_d=0.553 std_dev=0.944

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.27	0.02	0.00	0.15	0.15	0.22	0.16
C2	0.01	0.00	0.12	0.18	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.16	0.01	0.08	0.10	0.12	0.19	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.11	0.20	0.14	0.02	0.09	0.22	0.00	0.03	0.07	0.02	0.39	0.44	0.48	0.43
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.29	0.00	0.29	0.02	0.24	0.17	0.24	0.12	0.03	0.01	0.31	0.01	0.09	0.13	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.29	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.15	0.01	0.03	0.16	0.17	0.22	0.16
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.06	0.04	0.21	0.03	0.12	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.11	0.29	0.01	0.13	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.19	0.02	0.05	0.17	0.17	0.23	0.16
C5'	0.07	0.08	0.20	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.11	0.07	0.10	0.09	0.07	0.16	0.15	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.24	0.01	0.12	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.13	0.02	0.08	0.13	0.14	0.22	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.11	0.02	0.01	0.10	0.12	0.21	0.13
N3	0.01	0.00	0.09	0.24	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.12	0.01	0.06	0.11	0.13	0.20	0.13
O2	0.02	0.01	0.22	0.12	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.28	0.01	0.13	0.10	0.12	0.19	0.13
O2'	0.01	0.15	0.00	0.03	0.26	0.21	0.29	0.07	0.26	0.15	0.20	0.19	0.00	0.05	0.28	0.15	0.34	0.43	0.57	0.41
O3'	0.27	0.16	0.03	0.01	0.15	0.03	0.19	0.16	0.13	0.11	0.12	0.28	0.05	0.00	0.19	0.20	0.18	0.33	0.26	0.23
O4	0.02	0.01	0.07	0.31	0.01	0.12	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.01	0.28	0.19	0.00	0.04	0.18	0.20	0.25	0.18
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.06	0.13	0.15	0.20	0.04	0.00	0.07	0.09	0.09	0.08
O5'	0.15	0.10	0.39	0.09	0.16	0.01	0.17	0.01	0.13	0.10	0.11	0.10	0.34	0.18	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.12	0.44	0.13	0.17	0.07	0.17	0.09	0.14	0.12	0.13	0.12	0.43	0.33	0.20	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.19	0.48	0.11	0.22	0.03	0.23	0.01	0.22	0.21	0.20	0.19	0.57	0.26	0.25	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.12	0.43	0.09	0.16	0.02	0.16	0.01	0.14	0.13	0.13	0.13	0.41	0.23	0.18	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.21	0.13	0.10	0.23	0.12	0.27	0.14	0.26	0.21	0.21	0.22	0.24	0.15	0.11	0.15	0.16	0.18	0.17	0.16
C2	0.11	0.16	0.11	0.09	0.13	0.10	0.19	0.12	0.17	0.12	0.18	0.15	0.22	0.13	0.10	0.12	0.14	0.16	0.16	0.15
C2'	0.12	0.18	0.15	0.23	0.22	0.22	0.22	0.26	0.19	0.15	0.22	0.24	0.23	0.17	0.32	0.15	0.24	0.32	0.19	0.22
C3'	0.13	0.18	0.11	0.09	0.20	0.09	0.26	0.12	0.24	0.17	0.18	0.20	0.24	0.16	0.09	0.11	0.17	0.31	0.29	0.25
C4	0.15	0.21	0.13	0.11	0.22	0.13	0.20	0.14	0.18	0.16	0.25	0.25	0.23	0.13	0.11	0.16	0.14	0.15	0.16	0.16
C4'	0.16	0.20	0.14	0.10	0.17	0.11	0.20	0.10	0.20	0.18	0.19	0.17	0.27	0.18	0.08	0.13	0.13	0.22	0.17	0.15
C5	0.13	0.16	0.13	0.11	0.14	0.13	0.15	0.15	0.16	0.13	0.17	0.16	0.18	0.13	0.11	0.15	0.16	0.16	0.18	0.17
C5'	0.20	0.24	0.20	0.15	0.19	0.16	0.20	0.13	0.21	0.21	0.22	0.18	0.28	0.21	0.12	0.18	0.14	0.23	0.16	0.13
C6	0.14	0.15	0.13	0.10	0.13	0.13	0.19	0.15	0.21	0.15	0.15	0.12	0.19	0.14	0.09	0.15	0.17	0.18	0.18	0.17
N1	0.12	0.15	0.11	0.09	0.14	0.11	0.21	0.13	0.21	0.14	0.15	0.13	0.20	0.13	0.09	0.12	0.15	0.17	0.17	0.16
N3	0.14	0.21	0.13	0.10	0.20	0.12	0.19	0.13	0.17	0.15	0.25	0.24	0.25	0.14	0.10	0.14	0.13	0.15	0.16	0.15
O2	0.11	0.16	0.11	0.09	0.14	0.10	0.20	0.12	0.17	0.12	0.18	0.16	0.23	0.14	0.11	0.11	0.13	0.16	0.16	0.15
O2'	0.19	0.33	0.14	0.15	0.30	0.14	0.26	0.25	0.23	0.24	0.36	0.31	0.41	0.20	0.23	0.12	0.28	0.45	0.33	0.33
O3'	0.19	0.34	0.15	0.09	0.28	0.09	0.22	0.12	0.21	0.24	0.36	0.30	0.44	0.19	0.13	0.13	0.15	0.36	0.25	0.24
O4	0.20	0.27	0.16	0.13	0.32	0.16	0.29	0.15	0.25	0.23	0.31	0.36	0.27	0.16	0.13	0.21	0.16	0.15	0.17	0.15
O4'	0.16	0.17	0.15	0.14	0.18	0.15	0.22	0.17	0.23	0.18	0.17	0.17	0.21	0.16	0.13	0.16	0.19	0.21	0.18	0.18
O5'	0.12	0.15	0.12	0.07	0.14	0.06	0.17	0.05	0.18	0.14	0.15	0.13	0.19	0.13	0.02	0.09	0.09	0.25	0.18	0.16
OP1	0.06	0.09	0.08	0.02	0.10	0.06	0.11	0.11	0.10	0.07	0.10	0.11	0.13	0.13	0.02	0.03	0.10	0.26	0.17	0.15
OP2	0.08	0.16	0.05	0.06	0.20	0.09	0.20	0.13	0.17	0.13	0.20	0.23	0.17	0.05	0.02	0.10	0.13	0.25	0.20	0.17
P	0.03	0.10	0.05	0.01	0.11	0.04	0.12	0.07	0.11	0.06	0.11	0.12	0.13	0.08	0.01	0.02	0.08	0.24	0.15	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.06	0.03
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02	0.07	0.13	0.11	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.15	0.09	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.07	0.06	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.16	0.09	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.09	0.13	0.14	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.09	0.10	0.12	0.09
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.08	0.08	0.09	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.10	0.08	0.05
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.08	0.14	0.13	0.09
N4	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.03	0.10	0.14	0.15	0.11
O2	0.03	0.01	0.08	0.08	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.09	0.04	0.07	0.14	0.11	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.08	0.00	0.05	0.04	0.04	0.15	0.08	0.06
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.03	0.07	0.07	0.09	0.05	0.00	0.01	0.06	0.20	0.11	0.10
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.04	0.07	0.05	0.04
O5'	0.03	0.07	0.03	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.08	0.06	0.08	0.10	0.07	0.04	0.06	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.13	0.15	0.16	0.13	0.09	0.10	0.06	0.08	0.10	0.14	0.14	0.14	0.15	0.20	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.11	0.09	0.09	0.14	0.04	0.12	0.02	0.09	0.08	0.13	0.15	0.11	0.08	0.11	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.07	0.08	0.10	0.02	0.09	0.01	0.07	0.05	0.09	0.11	0.07	0.06	0.10	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00