Doublet Group distance statistics: 48672

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 6, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.016, 0.031, 0.047, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.017, 0.034, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.033 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.036, 0.070, 0.105, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.070 std_dev=0.035
O4	A	0, 0.065, 0.130, 0.195, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.130 std_dev=0.065
C4'	A	0, 0.114, 0.296, 0.478, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.296 std_dev=0.182
O4'	A	0, 0.055, 0.240, 0.426, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.240 std_dev=0.186
OP1	B	0, 0.336, 0.541, 0.745, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.541 std_dev=0.205
O5'	A	0, 0.154, 0.365, 0.576, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.365 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.146, 0.369, 0.593, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.369 std_dev=0.224
P	B	0, 0.212, 0.438, 0.663, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.438 std_dev=0.225
OP2	B	0, 0.239, 0.482, 0.725, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.482 std_dev=0.243
C5'	A	0, 0.140, 0.403, 0.665, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.403 std_dev=0.263
C2'	A	0, 0.117, 0.392, 0.667, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.392 std_dev=0.275
P	A	0, 0.236, 0.531, 0.826, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.531 std_dev=0.295
O5'	B	0, 0.168, 0.514, 0.859, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.514 std_dev=0.346
OP2	A	0, 0.280, 0.672, 1.063, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.672 std_dev=0.391
C5'	B	0, 0.154, 0.552, 0.950, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.552 std_dev=0.398
OP1	A	0, 0.332, 0.733, 1.135, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.733 std_dev=0.401
C3'	B	0, 0.167, 0.625, 1.083, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.625 std_dev=0.458
C4'	B	0, 0.164, 0.626, 1.088, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.626 std_dev=0.462
C6	B	0, 0.289, 0.780, 1.271, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.780 std_dev=0.491
O4'	B	0, 0.215, 0.710, 1.205, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.710 std_dev=0.495
O3'	A	0, 0.317, 0.816, 1.316, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.816 std_dev=0.499
O3'	B	0, 0.116, 0.617, 1.117, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.617 std_dev=0.500
C2'	B	0, 0.234, 0.735, 1.235, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.735 std_dev=0.500
C5	B	0, 0.370, 0.881, 1.393, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.881 std_dev=0.511
C1'	B	0, 0.231, 0.765, 1.300, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.765 std_dev=0.534
O2'	B	0, 0.278, 0.815, 1.352, 2.000 max_d=2.000 avg_d=0.815 std_dev=0.537
N1	B	0, 0.248, 0.802, 1.356, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.802 std_dev=0.554
C4	B	0, 0.380, 0.997, 1.615, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.997 std_dev=0.617
C2	B	0, 0.309, 0.938, 1.566, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.938 std_dev=0.628
O2'	A	0, 0.205, 0.837, 1.468, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.837 std_dev=0.631
O2	B	0, 0.356, 1.013, 1.670, 2.228 max_d=2.228 avg_d=1.013 std_dev=0.657
N3	B	0, 0.349, 1.019, 1.689, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.019 std_dev=0.670
N4	B	0, 0.442, 1.122, 1.803, 2.155 max_d=2.155 avg_d=1.122 std_dev=0.680

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.02	0.00	0.10	0.14	0.09	0.11
C2	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.25	0.01	0.05	0.11	0.21	0.11	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.11	0.18	0.13	0.02	0.07	0.21	0.00	0.05	0.06	0.03	0.33	0.36	0.30	0.33
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.02	0.12	0.09	0.13	0.09	0.02	0.01	0.14	0.01	0.06	0.24	0.09	0.16
C4	0.02	0.00	0.05	0.14	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.13	0.00	0.03	0.12	0.18	0.17	0.13
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02	0.14	0.05	0.05	0.01	0.01	0.10	0.04	0.05
C5	0.01	0.00	0.11	0.14	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.09	0.00	0.05	0.12	0.14	0.17	0.12
C5'	0.06	0.08	0.18	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.12	0.09	0.10	0.06	0.06	0.21	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.12	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.11	0.01	0.05	0.11	0.14	0.14	0.12
N1	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.20	0.01	0.01	0.11	0.17	0.11	0.12
N3	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.20	0.00	0.04	0.12	0.21	0.14	0.14
O2	0.01	0.00	0.21	0.09	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.33	0.01	0.07	0.10	0.22	0.09	0.13
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.24	0.14	0.27	0.06	0.24	0.13	0.17	0.16	0.00	0.07	0.26	0.08	0.33	0.53	0.31	0.40
O3'	0.30	0.25	0.05	0.01	0.13	0.05	0.09	0.21	0.11	0.20	0.20	0.33	0.07	0.00	0.13	0.22	0.22	0.45	0.40	0.43
O4	0.02	0.01	0.06	0.14	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.13	0.00	0.04	0.12	0.18	0.18	0.13
O4'	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.07	0.08	0.22	0.04	0.00	0.06	0.12	0.06	0.07
O5'	0.10	0.11	0.33	0.06	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.11	0.12	0.10	0.33	0.22	0.12	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.21	0.36	0.24	0.18	0.10	0.14	0.01	0.14	0.17	0.21	0.22	0.53	0.45	0.18	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.11	0.30	0.09	0.17	0.04	0.17	0.06	0.14	0.11	0.14	0.09	0.31	0.40	0.18	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.33	0.16	0.13	0.05	0.12	0.01	0.12	0.12	0.14	0.13	0.40	0.43	0.13	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.28	0.14	0.13	0.39	0.14	0.36	0.14	0.27	0.23	0.35	0.47	0.25	0.13	0.12	0.14	0.16	0.24	0.20	0.15
C2	0.17	0.27	0.13	0.13	0.37	0.14	0.34	0.15	0.26	0.23	0.33	0.43	0.24	0.15	0.15	0.15	0.14	0.18	0.15	0.14
C2'	0.27	0.31	0.24	0.25	0.40	0.30	0.38	0.31	0.31	0.29	0.36	0.46	0.28	0.28	0.26	0.28	0.29	0.40	0.21	0.25
C3'	0.13	0.25	0.13	0.12	0.39	0.10	0.36	0.09	0.26	0.21	0.34	0.48	0.22	0.11	0.14	0.10	0.13	0.18	0.21	0.13
C4	0.18	0.27	0.14	0.14	0.36	0.15	0.33	0.15	0.26	0.23	0.33	0.41	0.24	0.17	0.17	0.15	0.14	0.13	0.13	0.13
C4'	0.19	0.31	0.16	0.15	0.44	0.15	0.40	0.16	0.30	0.26	0.39	0.52	0.28	0.14	0.14	0.16	0.20	0.27	0.21	0.18
C5	0.16	0.25	0.13	0.13	0.35	0.14	0.33	0.14	0.26	0.22	0.31	0.40	0.22	0.14	0.14	0.15	0.15	0.19	0.14	0.15
C5'	0.21	0.31	0.16	0.16	0.43	0.21	0.42	0.23	0.33	0.28	0.38	0.51	0.27	0.15	0.17	0.20	0.26	0.38	0.19	0.23
C6	0.16	0.26	0.14	0.12	0.36	0.14	0.34	0.14	0.26	0.22	0.32	0.42	0.22	0.13	0.12	0.15	0.16	0.23	0.17	0.15
N1	0.16	0.26	0.13	0.12	0.37	0.14	0.34	0.14	0.26	0.22	0.33	0.43	0.23	0.13	0.13	0.14	0.15	0.22	0.17	0.15
N3	0.18	0.28	0.14	0.14	0.36	0.16	0.33	0.16	0.26	0.23	0.34	0.42	0.25	0.17	0.17	0.16	0.14	0.15	0.14	0.14
O2	0.17	0.28	0.14	0.13	0.37	0.15	0.34	0.15	0.26	0.23	0.34	0.44	0.25	0.15	0.15	0.15	0.14	0.18	0.16	0.14
O2'	0.40	0.36	0.39	0.41	0.41	0.49	0.40	0.51	0.37	0.37	0.38	0.47	0.35	0.46	0.45	0.44	0.43	0.59	0.27	0.40
O3'	0.18	0.33	0.17	0.17	0.49	0.13	0.45	0.12	0.33	0.28	0.43	0.59	0.28	0.16	0.22	0.14	0.18	0.23	0.21	0.18
O4	0.19	0.29	0.16	0.17	0.36	0.17	0.34	0.17	0.27	0.25	0.34	0.41	0.26	0.20	0.20	0.17	0.15	0.10	0.14	0.13
O4'	0.21	0.32	0.21	0.19	0.43	0.17	0.39	0.16	0.30	0.27	0.39	0.50	0.29	0.19	0.19	0.18	0.19	0.22	0.25	0.18
O5'	0.13	0.21	0.10	0.10	0.33	0.14	0.33	0.17	0.25	0.19	0.28	0.40	0.17	0.10	0.11	0.14	0.20	0.33	0.18	0.17
OP1	0.21	0.22	0.24	0.22	0.24	0.19	0.24	0.20	0.21	0.21	0.23	0.27	0.25	0.23	0.18	0.21	0.21	0.26	0.28	0.15
OP2	0.23	0.28	0.19	0.21	0.38	0.26	0.39	0.30	0.33	0.28	0.33	0.42	0.26	0.18	0.23	0.24	0.33	0.45	0.20	0.28
P	0.17	0.21	0.16	0.15	0.30	0.18	0.31	0.21	0.25	0.20	0.25	0.35	0.20	0.15	0.13	0.19	0.23	0.33	0.20	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.06	0.03
C2	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.04	0.01	0.06	0.08	0.18	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.01	0.00	0.03	0.11	0.08	0.05
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.05	0.10	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.12	0.10	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.00	0.14	0.21	0.31	0.21
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.03	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.02	0.15	0.22	0.31	0.21
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.12	0.00	0.14	0.00	0.11	0.06	0.08	0.14	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.02	0.11	0.13	0.20	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.07	0.14	0.09
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.01	0.10	0.15	0.25	0.16
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.00	0.16	0.26	0.37	0.25
O2	0.03	0.00	0.10	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.10	0.03	0.04	0.06	0.14	0.07
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.08	0.05	0.05	0.05	0.03	0.04	0.12	0.09	0.18	0.00	0.05	0.07	0.03	0.09	0.06	0.04
O3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.11	0.02	0.15	0.02	0.13	0.05	0.06	0.13	0.10	0.05	0.00	0.02	0.04	0.15	0.12	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.00	0.06	0.10	0.05	0.05
O5'	0.03	0.06	0.03	0.02	0.14	0.01	0.15	0.01	0.11	0.06	0.10	0.16	0.04	0.03	0.04	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.08	0.11	0.12	0.21	0.09	0.22	0.10	0.13	0.07	0.15	0.26	0.06	0.09	0.15	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.18	0.08	0.10	0.31	0.03	0.31	0.03	0.20	0.14	0.25	0.37	0.14	0.06	0.12	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.11	0.05	0.05	0.21	0.01	0.21	0.01	0.14	0.09	0.16	0.25	0.07	0.04	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00