Doublet Group distance statistics: 48673

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 2, 4, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.017, 0.050, 0.082, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.050 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.036, 0.098, 0.161, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.098 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.075, 0.186, 0.297, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.186 std_dev=0.111
O5'	A	0, 0.105, 0.256, 0.406, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.256 std_dev=0.150
C4'	A	0, 0.098, 0.248, 0.399, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.248 std_dev=0.150
C3'	A	0, 0.095, 0.259, 0.424, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.259 std_dev=0.164
C5'	A	0, 0.207, 0.391, 0.575, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.391 std_dev=0.184
C2'	A	0, 0.069, 0.259, 0.448, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.259 std_dev=0.189
P	B	0, 0.250, 0.441, 0.632, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.441 std_dev=0.191
P	A	0, 0.144, 0.351, 0.557, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.351 std_dev=0.207
OP1	A	0, 0.160, 0.402, 0.644, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.402 std_dev=0.242
OP2	B	0, 0.259, 0.507, 0.754, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.507 std_dev=0.247
OP1	B	0, 0.360, 0.627, 0.894, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.627 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.278, 0.570, 0.862, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.570 std_dev=0.292
OP2	A	0, 0.098, 0.402, 0.706, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.402 std_dev=0.304
C5	B	0, 0.278, 0.587, 0.896, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.587 std_dev=0.309
C3'	B	0, 0.325, 0.647, 0.968, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.647 std_dev=0.322
N1	B	0, 0.301, 0.642, 0.983, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.642 std_dev=0.341
C2'	B	0, 0.329, 0.670, 1.011, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.670 std_dev=0.341
C4'	B	0, 0.342, 0.684, 1.025, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.684 std_dev=0.341
C4	B	0, 0.292, 0.636, 0.980, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.636 std_dev=0.344
O4'	B	0, 0.316, 0.669, 1.023, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.669 std_dev=0.354
O3'	B	0, 0.349, 0.720, 1.092, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.720 std_dev=0.371
C5'	B	0, 0.402, 0.777, 1.152, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.777 std_dev=0.375
N3	B	0, 0.357, 0.734, 1.110, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.734 std_dev=0.376
C1'	B	0, 0.294, 0.671, 1.049, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.671 std_dev=0.377
N4	B	0, 0.285, 0.671, 1.056, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.671 std_dev=0.385
C2	B	0, 0.354, 0.745, 1.136, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.745 std_dev=0.391
O5'	B	0, 0.162, 0.572, 0.982, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.572 std_dev=0.410
O2'	B	0, 0.313, 0.728, 1.143, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.728 std_dev=0.415
O2'	A	0, 0.049, 0.483, 0.917, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.483 std_dev=0.434
O3'	A	0, -0.096, 0.341, 0.778, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.341 std_dev=0.437
O2	B	0, 0.412, 0.879, 1.345, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.879 std_dev=0.467

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.23	0.04	0.00	0.09	0.19	0.08	0.12
C2	0.02	0.00	0.14	0.05	0.03	0.04	0.03	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.13	0.05	0.04	0.12	0.28	0.17	0.20
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03	0.14	0.06	0.03	0.12	0.21	0.00	0.05	0.08	0.02	0.27	0.31	0.24	0.30
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.05	0.06	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.08	0.10	0.07
C4	0.03	0.03	0.06	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.02	0.04	0.21	0.15	0.01	0.06	0.13	0.34	0.22	0.24
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.12	0.02	0.07	0.01	0.02	0.09	0.06	0.03
C5	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.02	0.02	0.03	0.15	0.19	0.02	0.06	0.12	0.31	0.18	0.20
C5'	0.05	0.10	0.14	0.01	0.11	0.01	0.09	0.00	0.06	0.06	0.11	0.11	0.04	0.13	0.14	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.21	0.02	0.04	0.10	0.26	0.12	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.18	0.03	0.01	0.10	0.24	0.12	0.15
N3	0.02	0.01	0.12	0.06	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.12	0.05	0.05	0.13	0.33	0.22	0.23
O2	0.04	0.01	0.21	0.06	0.04	0.05	0.03	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.23	0.09	0.07	0.08	0.13	0.28	0.18	0.21
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.21	0.12	0.15	0.04	0.10	0.12	0.24	0.23	0.00	0.08	0.24	0.08	0.26	0.33	0.22	0.32
O3'	0.23	0.13	0.05	0.02	0.15	0.02	0.19	0.13	0.21	0.18	0.12	0.09	0.08	0.00	0.15	0.16	0.12	0.12	0.22	0.16
O4	0.04	0.05	0.08	0.07	0.01	0.07	0.02	0.14	0.02	0.03	0.05	0.07	0.24	0.15	0.00	0.07	0.16	0.39	0.28	0.28
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.08	0.16	0.07	0.00	0.09	0.20	0.12	0.12
O5'	0.09	0.12	0.27	0.06	0.13	0.02	0.12	0.01	0.10	0.10	0.13	0.13	0.26	0.12	0.16	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.19	0.28	0.31	0.08	0.34	0.09	0.31	0.08	0.26	0.24	0.33	0.28	0.33	0.12	0.39	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.17	0.24	0.10	0.22	0.06	0.18	0.07	0.12	0.12	0.22	0.18	0.22	0.22	0.28	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.20	0.30	0.07	0.24	0.03	0.20	0.02	0.16	0.15	0.23	0.21	0.32	0.16	0.28	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.15	0.19	0.23	0.19	0.12	0.16	0.13	0.13	0.13	0.18	0.24	0.15	0.16	0.32	0.11	0.08	0.44	0.26	0.10
C2	0.17	0.20	0.22	0.22	0.24	0.15	0.22	0.17	0.20	0.20	0.22	0.27	0.20	0.20	0.29	0.16	0.17	0.46	0.25	0.17
C2'	0.10	0.15	0.19	0.22	0.19	0.10	0.17	0.10	0.14	0.13	0.17	0.23	0.14	0.16	0.32	0.09	0.09	0.39	0.29	0.09
C3'	0.11	0.17	0.19	0.23	0.21	0.11	0.18	0.12	0.14	0.14	0.20	0.26	0.17	0.16	0.32	0.11	0.07	0.41	0.26	0.09
C4	0.16	0.15	0.22	0.22	0.17	0.16	0.21	0.22	0.21	0.17	0.16	0.18	0.15	0.20	0.28	0.16	0.23	0.40	0.26	0.18
C4'	0.15	0.18	0.19	0.23	0.20	0.16	0.17	0.17	0.15	0.16	0.20	0.24	0.18	0.17	0.31	0.15	0.11	0.46	0.22	0.16
C5	0.10	0.11	0.19	0.22	0.13	0.11	0.14	0.15	0.14	0.11	0.11	0.15	0.11	0.16	0.32	0.13	0.12	0.41	0.30	0.09
C5'	0.23	0.25	0.24	0.26	0.26	0.22	0.24	0.23	0.23	0.24	0.26	0.29	0.25	0.23	0.32	0.23	0.18	0.50	0.24	0.22
C6	0.10	0.11	0.19	0.24	0.14	0.11	0.13	0.13	0.12	0.11	0.13	0.17	0.11	0.16	0.34	0.13	0.08	0.43	0.29	0.09
N1	0.11	0.14	0.19	0.23	0.18	0.12	0.16	0.13	0.14	0.14	0.17	0.22	0.14	0.17	0.31	0.12	0.10	0.45	0.26	0.12
N3	0.20	0.22	0.24	0.23	0.25	0.18	0.26	0.21	0.24	0.22	0.23	0.26	0.21	0.22	0.27	0.19	0.23	0.43	0.26	0.20
O2	0.20	0.25	0.23	0.23	0.28	0.17	0.25	0.18	0.23	0.23	0.27	0.31	0.24	0.21	0.27	0.18	0.18	0.46	0.25	0.19
O2'	0.08	0.11	0.19	0.23	0.16	0.10	0.15	0.13	0.12	0.10	0.14	0.21	0.10	0.16	0.34	0.11	0.11	0.34	0.33	0.10
O3'	0.29	0.22	0.30	0.34	0.19	0.33	0.21	0.36	0.25	0.25	0.19	0.20	0.23	0.30	0.42	0.34	0.30	0.52	0.31	0.32
O4	0.22	0.19	0.26	0.25	0.19	0.23	0.27	0.31	0.27	0.22	0.17	0.18	0.18	0.25	0.28	0.23	0.34	0.35	0.25	0.24
O4'	0.15	0.17	0.19	0.24	0.19	0.17	0.16	0.20	0.15	0.16	0.19	0.24	0.18	0.18	0.32	0.16	0.13	0.49	0.22	0.19
O5'	0.14	0.19	0.16	0.16	0.23	0.13	0.19	0.17	0.17	0.17	0.22	0.28	0.19	0.15	0.23	0.15	0.11	0.43	0.22	0.15
OP1	0.18	0.15	0.21	0.23	0.16	0.24	0.18	0.29	0.19	0.17	0.15	0.18	0.13	0.20	0.29	0.23	0.20	0.49	0.23	0.28
OP2	0.14	0.15	0.16	0.17	0.17	0.15	0.15	0.19	0.15	0.15	0.16	0.20	0.15	0.16	0.25	0.16	0.12	0.44	0.18	0.18
P	0.14	0.13	0.16	0.18	0.15	0.17	0.15	0.22	0.15	0.14	0.15	0.19	0.12	0.16	0.25	0.17	0.13	0.45	0.20	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.07	0.02	0.02	0.00	0.17	0.15	0.36	0.11
C2	0.04	0.00	0.10	0.14	0.02	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.17	0.05	0.26	0.15	0.37	0.14
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.09	0.02	0.11	0.02	0.08	0.06	0.18	0.00	0.03	0.01	0.15	0.14	0.37	0.17
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.13	0.04	0.13	0.09	0.20	0.02	0.01	0.01	0.29	0.16	0.34	0.23
C4	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.03	0.30	0.18	0.32	0.16
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.07	0.03	0.03	0.00	0.02	0.22	0.27	0.07
C5	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.13	0.05	0.29	0.21	0.34	0.17
C5'	0.04	0.12	0.02	0.02	0.14	0.01	0.13	0.00	0.12	0.10	0.14	0.15	0.11	0.03	0.04	0.02	0.01	0.29	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.15	0.05	0.28	0.18	0.39	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.25	0.15	0.38	0.14
N3	0.03	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.16	0.04	0.29	0.15	0.34	0.14
N4	0.04	0.03	0.06	0.09	0.01	0.06	0.02	0.15	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.06	0.11	0.04	0.29	0.22	0.30	0.16
O2	0.07	0.00	0.18	0.20	0.02	0.07	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.11	0.26	0.10	0.23	0.17	0.37	0.14
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.03	0.07	0.03	0.07	0.02	0.05	0.06	0.11	0.00	0.05	0.05	0.07	0.16	0.35	0.12
O3'	0.02	0.17	0.03	0.01	0.09	0.03	0.13	0.04	0.15	0.05	0.16	0.11	0.26	0.05	0.00	0.02	0.40	0.22	0.34	0.28
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.04	0.04	0.10	0.05	0.02	0.00	0.25	0.22	0.35	0.12
O5'	0.17	0.26	0.15	0.29	0.30	0.02	0.29	0.01	0.28	0.25	0.29	0.29	0.23	0.07	0.40	0.25	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.15	0.15	0.14	0.16	0.18	0.22	0.21	0.29	0.18	0.15	0.15	0.22	0.17	0.16	0.22	0.22	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.36	0.37	0.37	0.34	0.32	0.27	0.34	0.15	0.39	0.38	0.34	0.30	0.37	0.35	0.34	0.35	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.17	0.23	0.16	0.07	0.17	0.02	0.17	0.14	0.14	0.16	0.14	0.12	0.28	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00