Doublet Group distance statistics: 48674

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.012, 0.034, 0.056, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.016, 0.047, 0.077, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.047 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.035, 0.069, 0.102, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.069 std_dev=0.034
C4	B	0, 0.152, 0.355, 0.559, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.355 std_dev=0.203
N3	B	0, 0.117, 0.339, 0.561, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.339 std_dev=0.222
N4	B	0, 0.146, 0.387, 0.627, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.387 std_dev=0.241
C5	B	0, 0.212, 0.481, 0.751, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.481 std_dev=0.270
C5'	B	0, 0.246, 0.535, 0.824, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.535 std_dev=0.289
P	B	0, 0.229, 0.525, 0.821, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.525 std_dev=0.296
OP1	B	0, 0.161, 0.457, 0.754, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.457 std_dev=0.297
O4'	A	0, -0.034, 0.280, 0.593, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.280 std_dev=0.314
C2	B	0, 0.113, 0.432, 0.750, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.432 std_dev=0.318
C6	B	0, 0.235, 0.570, 0.906, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.570 std_dev=0.336
C2'	A	0, -0.093, 0.244, 0.581, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.244 std_dev=0.337
N1	B	0, 0.198, 0.543, 0.889, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.543 std_dev=0.345
OP2	B	0, 0.389, 0.736, 1.083, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.736 std_dev=0.347
O5'	B	0, 0.261, 0.623, 0.985, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.623 std_dev=0.362
C4'	B	0, 0.235, 0.605, 0.974, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.605 std_dev=0.369
O4'	B	0, 0.299, 0.677, 1.054, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.677 std_dev=0.377
O2	B	0, 0.068, 0.493, 0.919, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.493 std_dev=0.426
C1'	B	0, 0.220, 0.668, 1.117, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.668 std_dev=0.448
C3'	B	0, 0.083, 0.580, 1.077, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.580 std_dev=0.497
C3'	A	0, -0.110, 0.401, 0.911, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.401 std_dev=0.510
C4'	A	0, -0.101, 0.426, 0.952, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.426 std_dev=0.526
C2'	B	0, 0.110, 0.681, 1.252, 2.123 max_d=2.123 avg_d=0.681 std_dev=0.571
O2'	A	0, -0.145, 0.430, 1.004, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.430 std_dev=0.575
O5'	A	0, -0.070, 0.579, 1.229, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.579 std_dev=0.649
O3'	B	0, -0.005, 0.688, 1.381, 2.560 max_d=2.560 avg_d=0.688 std_dev=0.693
O3'	A	0, -0.141, 0.577, 1.296, 2.470 max_d=2.470 avg_d=0.577 std_dev=0.719
O2'	B	0, 0.107, 0.850, 1.592, 2.814 max_d=2.814 avg_d=0.850 std_dev=0.743
C5'	A	0, -0.111, 0.638, 1.386, 2.579 max_d=2.579 avg_d=0.638 std_dev=0.748
OP2	A	0, -0.096, 0.720, 1.536, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.720 std_dev=0.816
P	A	0, -0.156, 0.663, 1.482, 2.949 max_d=2.949 avg_d=0.663 std_dev=0.819
OP1	A	0, -0.232, 0.866, 1.964, 3.914 max_d=3.914 avg_d=0.866 std_dev=1.098

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.22	0.02	0.01	0.10	0.13	0.14	0.07
C2	0.03	0.00	0.13	0.13	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.03	0.09	0.14	0.11	0.26	0.13
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.10	0.10	0.02	0.10	0.22	0.01	0.02	0.04	0.02	0.26	0.27	0.36	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.23	0.01	0.25	0.01	0.22	0.13	0.18	0.13	0.02	0.00	0.25	0.01	0.17	0.10	0.18	0.14
C4	0.02	0.02	0.03	0.23	0.00	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.25	0.06	0.01	0.04	0.29	0.32	0.48	0.33
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.19	0.06	0.04	0.12	0.18	0.02	0.13	0.00	0.01	0.14	0.09	0.03
C5	0.02	0.02	0.07	0.25	0.01	0.19	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.03	0.29	0.12	0.01	0.11	0.33	0.36	0.47	0.36
C5'	0.03	0.03	0.10	0.01	0.18	0.01	0.25	0.00	0.21	0.06	0.08	0.10	0.07	0.13	0.21	0.01	0.01	0.19	0.06	0.01
C6	0.03	0.02	0.10	0.22	0.01	0.19	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.03	0.26	0.10	0.02	0.13	0.25	0.23	0.31	0.25
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.09	0.02	0.02	0.13	0.11	0.21	0.12
N3	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.13	0.02	0.06	0.21	0.20	0.37	0.22
O2	0.06	0.01	0.22	0.13	0.02	0.12	0.03	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.14	0.34	0.03	0.17	0.12	0.10	0.21	0.08
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.25	0.18	0.29	0.07	0.26	0.14	0.18	0.14	0.00	0.03	0.27	0.12	0.18	0.21	0.39	0.22
O3'	0.22	0.20	0.02	0.00	0.06	0.02	0.12	0.13	0.10	0.09	0.13	0.34	0.03	0.00	0.08	0.13	0.28	0.20	0.23	0.24
O4	0.02	0.03	0.04	0.25	0.01	0.13	0.01	0.21	0.02	0.02	0.02	0.03	0.27	0.08	0.00	0.05	0.33	0.39	0.56	0.39
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.13	0.02	0.06	0.17	0.12	0.13	0.05	0.00	0.17	0.19	0.14	0.12
O5'	0.10	0.14	0.26	0.17	0.29	0.01	0.33	0.01	0.25	0.13	0.21	0.12	0.18	0.28	0.33	0.17	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.13	0.11	0.27	0.10	0.32	0.14	0.36	0.19	0.23	0.11	0.20	0.10	0.21	0.20	0.39	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.26	0.36	0.18	0.48	0.09	0.47	0.06	0.31	0.21	0.37	0.21	0.39	0.23	0.56	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.28	0.14	0.33	0.03	0.36	0.01	0.25	0.12	0.22	0.08	0.22	0.24	0.39	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.25	0.24	0.14	0.11	0.14	0.19	0.29	0.20	0.19	0.17	0.11	0.42	0.37	0.15	0.14	0.53	0.22	0.21	0.29
C2	0.11	0.17	0.15	0.10	0.08	0.11	0.18	0.27	0.15	0.10	0.15	0.12	0.29	0.23	0.13	0.09	0.46	0.26	0.23	0.25
C2'	0.13	0.19	0.13	0.26	0.12	0.28	0.21	0.50	0.22	0.13	0.17	0.12	0.36	0.26	0.25	0.18	0.77	0.38	0.36	0.52
C3'	0.18	0.17	0.21	0.20	0.07	0.19	0.13	0.29	0.16	0.15	0.12	0.07	0.28	0.32	0.24	0.16	0.48	0.23	0.23	0.19
C4	0.11	0.18	0.24	0.16	0.05	0.07	0.18	0.19	0.13	0.09	0.15	0.10	0.26	0.27	0.24	0.08	0.34	0.27	0.28	0.19
C4'	0.18	0.17	0.19	0.17	0.14	0.16	0.15	0.22	0.16	0.15	0.15	0.17	0.27	0.32	0.19	0.16	0.42	0.28	0.20	0.14
C5	0.19	0.25	0.33	0.22	0.12	0.09	0.23	0.21	0.21	0.18	0.19	0.11	0.33	0.36	0.29	0.10	0.42	0.26	0.21	0.24
C5'	0.25	0.26	0.26	0.25	0.19	0.25	0.17	0.27	0.19	0.23	0.24	0.19	0.33	0.32	0.24	0.25	0.40	0.42	0.21	0.15
C6	0.24	0.28	0.34	0.17	0.13	0.12	0.24	0.27	0.24	0.22	0.21	0.11	0.40	0.40	0.23	0.13	0.52	0.24	0.20	0.29
N1	0.19	0.23	0.23	0.12	0.11	0.13	0.21	0.29	0.21	0.17	0.17	0.11	0.37	0.32	0.15	0.12	0.52	0.24	0.21	0.29
N3	0.08	0.15	0.17	0.09	0.06	0.08	0.16	0.22	0.12	0.06	0.14	0.13	0.25	0.22	0.16	0.08	0.38	0.26	0.27	0.21
O2	0.10	0.14	0.11	0.13	0.11	0.14	0.17	0.29	0.15	0.09	0.14	0.16	0.26	0.18	0.14	0.11	0.47	0.26	0.24	0.25
O2'	0.23	0.31	0.25	0.18	0.15	0.19	0.26	0.47	0.22	0.19	0.24	0.18	0.55	0.48	0.18	0.12	0.80	0.58	0.47	0.66
O3'	0.18	0.17	0.21	0.23	0.25	0.22	0.24	0.28	0.19	0.15	0.22	0.32	0.23	0.35	0.31	0.18	0.47	0.26	0.24	0.20
O4	0.10	0.15	0.24	0.20	0.05	0.08	0.15	0.15	0.10	0.08	0.13	0.10	0.21	0.25	0.28	0.09	0.24	0.26	0.34	0.15
O4'	0.19	0.16	0.23	0.15	0.14	0.14	0.17	0.21	0.17	0.14	0.13	0.18	0.31	0.37	0.19	0.14	0.42	0.20	0.18	0.15
O5'	0.21	0.20	0.25	0.11	0.19	0.09	0.23	0.16	0.24	0.20	0.19	0.19	0.24	0.31	0.02	0.14	0.37	0.46	0.22	0.15
OP1	0.07	0.09	0.13	0.01	0.08	0.09	0.15	0.23	0.15	0.06	0.08	0.09	0.17	0.22	0.01	0.05	0.20	0.72	0.20	0.27
OP2	0.16	0.27	0.13	0.12	0.32	0.18	0.34	0.29	0.30	0.24	0.30	0.34	0.27	0.10	0.02	0.19	0.30	0.74	0.24	0.24
P	0.05	0.10	0.11	0.01	0.12	0.07	0.18	0.16	0.17	0.09	0.10	0.13	0.15	0.16	0.01	0.04	0.23	0.66	0.16	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.38	0.18	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.13	0.28	0.26	0.16
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.12	0.01	0.01	0.01	0.09	0.55	0.20	0.21
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.11	0.04	0.06	0.06	0.11	0.02	0.01	0.01	0.12	0.59	0.17	0.21
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.19	0.11	0.30	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.42	0.16	0.11
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.12	0.04	0.21	0.15	0.27	0.13
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.10	0.15	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.25	0.24	0.02
C6	0.02	0.02	0.06	0.11	0.02	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.12	0.04	0.19	0.17	0.21	0.14
N1	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.12	0.27	0.21	0.15
N3	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.02	0.10	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.17	0.18	0.29	0.14
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.21	0.15	0.33	0.12
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.05	0.12	0.37	0.26	0.18
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.06	0.03	0.11	0.00	0.04	0.04	0.06	0.58	0.16	0.20
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.12	0.04	0.08	0.07	0.14	0.04	0.00	0.01	0.12	0.67	0.15	0.23
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.09	0.33	0.21	0.13
O5'	0.07	0.13	0.09	0.12	0.19	0.02	0.21	0.01	0.19	0.12	0.17	0.21	0.12	0.06	0.12	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.38	0.28	0.55	0.59	0.11	0.42	0.15	0.25	0.17	0.27	0.18	0.15	0.37	0.58	0.67	0.33	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.26	0.20	0.17	0.30	0.16	0.27	0.24	0.21	0.21	0.29	0.33	0.26	0.16	0.15	0.21	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.15	0.16	0.21	0.21	0.12	0.11	0.13	0.02	0.14	0.15	0.14	0.12	0.18	0.20	0.23	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00