Doublet Group distance statistics: 48675

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 1, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.001, 0.021, 0.040, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.021 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.028, 0.070, 0.112, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.070 std_dev=0.042
O2	A	0, 0.010, 0.053, 0.097, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.053 std_dev=0.044
C2'	A	0, 0.037, 0.160, 0.284, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.160 std_dev=0.123
O4'	A	0, 0.025, 0.168, 0.310, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.168 std_dev=0.143
C4'	A	0, 0.055, 0.216, 0.377, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.216 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.037, 0.212, 0.387, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.212 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.058, 0.244, 0.430, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.244 std_dev=0.186
P	B	0, 0.186, 0.373, 0.560, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.373 std_dev=0.187
C2'	B	0, 0.131, 0.371, 0.611, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.371 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.091, 0.331, 0.572, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.331 std_dev=0.241
C3'	B	0, 0.053, 0.333, 0.613, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.333 std_dev=0.280
O5'	A	0, 0.036, 0.337, 0.637, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.337 std_dev=0.301
C5'	A	0, 0.074, 0.383, 0.692, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.383 std_dev=0.309
O2'	B	0, 0.189, 0.513, 0.837, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.513 std_dev=0.324
OP2	A	0, 0.076, 0.403, 0.731, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.403 std_dev=0.327
O3'	B	0, 0.052, 0.406, 0.759, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.406 std_dev=0.354
C1'	B	0, 0.124, 0.481, 0.837, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.481 std_dev=0.357
P	A	0, 0.040, 0.399, 0.758, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.399 std_dev=0.359
OP2	B	0, 0.143, 0.521, 0.899, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.521 std_dev=0.378
N1	B	0, 0.109, 0.490, 0.871, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.490 std_dev=0.381
C2	B	0, 0.149, 0.546, 0.943, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.546 std_dev=0.397
C6	B	0, 0.115, 0.517, 0.919, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.517 std_dev=0.402
C4'	B	0, 0.077, 0.498, 0.920, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.498 std_dev=0.421
OP1	B	0, 0.262, 0.684, 1.105, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.684 std_dev=0.422
N3	B	0, 0.142, 0.565, 0.989, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.565 std_dev=0.423
O2	B	0, 0.207, 0.633, 1.059, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.633 std_dev=0.426
OP1	A	0, 0.059, 0.504, 0.948, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.504 std_dev=0.445
C5	B	0, 0.102, 0.552, 1.003, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.552 std_dev=0.450
O4'	B	0, 0.097, 0.548, 0.999, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.548 std_dev=0.451
C4	B	0, 0.087, 0.550, 1.013, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.550 std_dev=0.463
O5'	B	0, 0.070, 0.545, 1.020, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.545 std_dev=0.475
C5'	B	0, 0.082, 0.615, 1.149, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.615 std_dev=0.533
N4	B	0, 0.076, 0.616, 1.156, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.616 std_dev=0.540

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.06	0.14	0.09
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.05	0.04	0.08	0.07	0.16	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.03	0.04	0.09	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.06	0.09	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.09	0.04	0.04	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.09	0.11	0.08
C4	0.04	0.02	0.05	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.06	0.06	0.01	0.06	0.07	0.11	0.19	0.10
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.07	0.07	0.12	0.19	0.11
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.09	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.10	0.03	0.07	0.08	0.10	0.17	0.11
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.08	0.07	0.15	0.09
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.03	0.07	0.09	0.18	0.09
O2	0.07	0.00	0.09	0.07	0.03	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.10	0.08	0.06	0.09	0.08	0.07	0.15	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.03	0.06	0.10	0.00	0.05	0.08	0.05	0.06	0.08	0.08	0.04
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.10	0.03	0.10	0.05	0.05	0.08	0.05	0.00	0.07	0.01	0.12	0.15	0.17	0.13
O4	0.05	0.05	0.06	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.08	0.07	0.00	0.07	0.07	0.12	0.19	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.01	0.03	0.09	0.05	0.01	0.07	0.00	0.12	0.08	0.18	0.13
O5'	0.08	0.08	0.06	0.08	0.07	0.02	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.08	0.06	0.12	0.07	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.07	0.06	0.09	0.11	0.02	0.12	0.03	0.10	0.07	0.09	0.07	0.08	0.15	0.12	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.16	0.09	0.11	0.19	0.04	0.19	0.01	0.17	0.15	0.18	0.15	0.08	0.17	0.19	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.08	0.05	0.08	0.10	0.03	0.11	0.02	0.11	0.09	0.09	0.08	0.04	0.13	0.11	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.10	0.13	0.05	0.24	0.07	0.26	0.16	0.22	0.11	0.19	0.29	0.16	0.24	0.10	0.07	0.46	0.29	0.32	0.15
C2	0.17	0.11	0.18	0.08	0.17	0.14	0.27	0.26	0.24	0.13	0.08	0.24	0.22	0.26	0.03	0.13	0.56	0.32	0.41	0.24
C2'	0.14	0.09	0.17	0.07	0.22	0.08	0.23	0.15	0.20	0.10	0.19	0.29	0.16	0.27	0.05	0.09	0.50	0.19	0.44	0.21
C3'	0.18	0.07	0.22	0.12	0.18	0.11	0.21	0.15	0.20	0.12	0.16	0.24	0.14	0.31	0.06	0.13	0.49	0.12	0.48	0.24
C4	0.19	0.30	0.21	0.08	0.19	0.08	0.10	0.25	0.14	0.20	0.31	0.19	0.35	0.23	0.05	0.10	0.53	0.35	0.47	0.27
C4'	0.16	0.10	0.18	0.05	0.19	0.05	0.21	0.07	0.19	0.13	0.17	0.24	0.13	0.30	0.07	0.10	0.38	0.20	0.31	0.11
C5	0.19	0.29	0.22	0.09	0.18	0.06	0.04	0.21	0.09	0.19	0.29	0.18	0.35	0.22	0.08	0.09	0.52	0.34	0.42	0.23
C5'	0.21	0.08	0.24	0.10	0.14	0.09	0.17	0.05	0.19	0.14	0.13	0.18	0.10	0.36	0.04	0.14	0.34	0.17	0.28	0.11
C6	0.15	0.21	0.20	0.07	0.11	0.06	0.10	0.19	0.10	0.11	0.21	0.14	0.31	0.23	0.08	0.05	0.50	0.30	0.37	0.19
N1	0.13	0.09	0.17	0.06	0.15	0.09	0.22	0.21	0.19	0.08	0.12	0.21	0.22	0.25	0.06	0.08	0.52	0.30	0.37	0.20
N3	0.18	0.22	0.20	0.08	0.09	0.13	0.21	0.28	0.20	0.16	0.21	0.11	0.29	0.25	0.03	0.12	0.55	0.34	0.44	0.26
O2	0.19	0.12	0.18	0.11	0.27	0.17	0.33	0.28	0.28	0.19	0.13	0.34	0.17	0.27	0.05	0.18	0.56	0.32	0.40	0.23
O2'	0.14	0.17	0.13	0.07	0.28	0.08	0.27	0.14	0.23	0.15	0.26	0.34	0.19	0.24	0.06	0.11	0.47	0.20	0.40	0.18
O3'	0.18	0.09	0.21	0.13	0.19	0.12	0.21	0.15	0.20	0.12	0.17	0.26	0.14	0.32	0.08	0.13	0.48	0.14	0.51	0.27
O4	0.21	0.34	0.22	0.09	0.31	0.09	0.18	0.27	0.18	0.25	0.38	0.33	0.37	0.22	0.06	0.12	0.50	0.35	0.50	0.29
O4'	0.14	0.10	0.15	0.07	0.21	0.06	0.23	0.12	0.21	0.13	0.18	0.25	0.12	0.26	0.14	0.09	0.38	0.33	0.21	0.08
O5'	0.11	0.15	0.17	0.08	0.18	0.07	0.16	0.10	0.15	0.10	0.19	0.21	0.19	0.25	0.01	0.06	0.39	0.13	0.29	0.12
OP1	0.06	0.15	0.09	0.03	0.17	0.08	0.13	0.19	0.10	0.09	0.19	0.19	0.19	0.19	0.02	0.07	0.19	0.13	0.12	0.05
OP2	0.13	0.29	0.07	0.08	0.28	0.15	0.21	0.22	0.17	0.21	0.31	0.30	0.33	0.07	0.02	0.17	0.32	0.13	0.15	0.07
P	0.05	0.19	0.08	0.03	0.18	0.06	0.13	0.12	0.10	0.10	0.21	0.20	0.24	0.14	0.01	0.05	0.26	0.17	0.17	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.05	0.50	0.30	0.24
C2	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.16	0.02	0.15	0.60	0.28	0.24
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.03	0.08	0.05	0.19	0.00	0.04	0.02	0.12	0.45	0.21	0.17
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.09	0.06	0.13	0.10	0.20	0.02	0.01	0.02	0.16	0.39	0.16	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.23	0.58	0.26	0.23
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.05	0.07	0.10	0.06	0.04	0.01	0.02	0.30	0.14	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.02	0.23	0.52	0.27	0.21
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.17	0.08	0.11	0.16	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.15	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.02	0.17	0.52	0.30	0.22
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.56	0.30	0.24
N3	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.17	0.02	0.20	0.61	0.27	0.24
N4	0.03	0.02	0.05	0.10	0.01	0.07	0.02	0.16	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.14	0.02	0.24	0.59	0.27	0.24
O2	0.04	0.00	0.19	0.20	0.01	0.10	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.24	0.04	0.13	0.61	0.29	0.26
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.06	0.03	0.02	0.07	0.05	0.14	0.00	0.09	0.05	0.06	0.39	0.19	0.15
O3'	0.04	0.16	0.04	0.01	0.13	0.04	0.10	0.03	0.10	0.08	0.17	0.14	0.24	0.09	0.00	0.05	0.16	0.31	0.16	0.10
O4'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.05	0.00	0.14	0.45	0.36	0.28
O5'	0.05	0.15	0.12	0.16	0.23	0.02	0.23	0.01	0.17	0.11	0.20	0.24	0.13	0.06	0.16	0.14	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.50	0.60	0.45	0.39	0.58	0.30	0.52	0.15	0.52	0.56	0.61	0.59	0.61	0.39	0.31	0.45	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.28	0.21	0.16	0.26	0.14	0.27	0.03	0.30	0.30	0.27	0.27	0.29	0.19	0.16	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.24	0.17	0.13	0.23	0.11	0.21	0.02	0.22	0.24	0.24	0.24	0.26	0.15	0.10	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00