Doublet Group distance statistics: 48678

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.044 std_dev=0.031
O4	A	0, 0.008, 0.062, 0.117, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.062 std_dev=0.055
O4'	A	0, 0.040, 0.145, 0.250, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.145 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.029, 0.139, 0.248, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.139 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.066, 0.228, 0.391, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.228 std_dev=0.163
P	B	0, 0.095, 0.275, 0.455, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.275 std_dev=0.180
C3'	A	0, 0.058, 0.245, 0.431, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.245 std_dev=0.187
O2'	A	0, 0.092, 0.283, 0.475, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.283 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.031, 0.226, 0.421, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.226 std_dev=0.195
OP2	B	0, 0.144, 0.340, 0.537, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.340 std_dev=0.196
C6	B	0, 0.103, 0.304, 0.506, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.304 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.075, 0.284, 0.493, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.284 std_dev=0.209
C2'	B	0, 0.053, 0.262, 0.472, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.262 std_dev=0.210
N3	B	0, 0.058, 0.278, 0.499, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.278 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.105, 0.329, 0.553, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.329 std_dev=0.224
C2	B	0, 0.031, 0.256, 0.481, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.256 std_dev=0.225
C1'	B	0, -0.030, 0.223, 0.476, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.223 std_dev=0.253
N4	B	0, 0.086, 0.346, 0.607, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.346 std_dev=0.261
C3'	B	0, 0.065, 0.328, 0.591, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.328 std_dev=0.263
O2'	B	0, 0.016, 0.289, 0.562, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.289 std_dev=0.273
P	A	0, 0.058, 0.332, 0.606, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.332 std_dev=0.274
C5'	A	0, 0.072, 0.346, 0.620, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.346 std_dev=0.274
O2	B	0, 0.063, 0.344, 0.624, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.344 std_dev=0.281
OP1	B	0, 0.104, 0.385, 0.667, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.385 std_dev=0.282
O3'	A	0, 0.072, 0.386, 0.701, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.386 std_dev=0.315
O4'	B	0, -0.094, 0.238, 0.570, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.238 std_dev=0.332
C4'	B	0, 0.011, 0.346, 0.682, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.346 std_dev=0.335
O3'	B	0, 0.112, 0.482, 0.852, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.482 std_dev=0.370
C5'	B	0, 0.084, 0.489, 0.893, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.489 std_dev=0.404
O5'	B	0, 0.139, 0.618, 1.098, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.618 std_dev=0.480
O5'	A	0, -0.088, 0.474, 1.036, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.474 std_dev=0.562
OP1	A	0, -0.082, 0.559, 1.201, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.559 std_dev=0.641
OP2	A	0, -0.180, 0.594, 1.368, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.594 std_dev=0.774

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.17	0.14	0.90	0.32
C2	0.02	0.00	0.08	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.01	0.02	0.27	0.35	0.81	0.33
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.02	0.06	0.14	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.16	0.74	0.27
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.15	0.02	0.16	0.06	0.03	0.10	0.01	0.01	0.08	0.02	0.04	0.23	0.57	0.20
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.10	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.05	0.47	0.48	0.58	0.25
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.15	0.05	0.04	0.07	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.25	0.64	0.17
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.15	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.01	0.07	0.55	0.41	0.58	0.22
C5'	0.04	0.08	0.03	0.02	0.22	0.01	0.27	0.00	0.25	0.12	0.14	0.02	0.04	0.04	0.23	0.02	0.01	0.38	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.15	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.01	0.07	0.50	0.30	0.76	0.25
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.32	0.28	0.86	0.31
N3	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.05	0.01	0.04	0.36	0.44	0.70	0.30
O2	0.04	0.01	0.14	0.10	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.21	0.17	0.02	0.02	0.16	0.33	0.84	0.36
O2'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.08	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.13	0.21	0.00	0.05	0.09	0.06	0.04	0.23	0.71	0.23
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.08	0.01	0.16	0.04	0.16	0.05	0.05	0.17	0.05	0.00	0.07	0.01	0.15	0.49	0.41	0.20
O4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.00	0.06	0.48	0.54	0.47	0.23
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.13	0.05	0.91	0.33
O5'	0.17	0.27	0.06	0.04	0.47	0.02	0.55	0.01	0.50	0.32	0.36	0.16	0.04	0.15	0.48	0.13	0.00	0.04	0.05	0.01
OP1	0.14	0.35	0.16	0.23	0.48	0.25	0.41	0.38	0.30	0.28	0.44	0.33	0.23	0.49	0.54	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.90	0.81	0.74	0.57	0.58	0.64	0.58	0.34	0.76	0.86	0.70	0.84	0.71	0.41	0.47	0.91	0.05	0.02	0.00	0.01
P	0.32	0.33	0.27	0.20	0.25	0.17	0.22	0.02	0.25	0.31	0.30	0.36	0.23	0.20	0.23	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.14	0.22	0.27	0.14	0.35	0.10	0.36	0.10	0.09	0.18	0.18	0.18	0.27	0.34	0.28	0.48	0.21	0.20	0.15
C2	0.07	0.20	0.15	0.25	0.17	0.34	0.09	0.36	0.05	0.09	0.23	0.20	0.25	0.23	0.37	0.20	0.40	0.24	0.19	0.14
C2'	0.21	0.17	0.25	0.28	0.15	0.34	0.11	0.35	0.12	0.13	0.19	0.20	0.24	0.31	0.35	0.27	0.46	0.17	0.24	0.12
C3'	0.12	0.15	0.16	0.20	0.13	0.29	0.10	0.34	0.10	0.06	0.18	0.18	0.22	0.22	0.28	0.20	0.37	0.14	0.34	0.08
C4	0.13	0.23	0.03	0.19	0.18	0.26	0.13	0.36	0.11	0.16	0.23	0.18	0.28	0.05	0.33	0.08	0.37	0.19	0.20	0.13
C4'	0.12	0.10	0.15	0.20	0.11	0.29	0.11	0.35	0.11	0.03	0.14	0.15	0.17	0.20	0.27	0.23	0.38	0.13	0.35	0.08
C5	0.09	0.20	0.04	0.21	0.15	0.29	0.11	0.40	0.09	0.13	0.20	0.15	0.24	0.08	0.32	0.07	0.41	0.17	0.17	0.14
C5'	0.11	0.10	0.13	0.23	0.13	0.33	0.18	0.43	0.18	0.09	0.14	0.14	0.14	0.16	0.29	0.25	0.23	0.31	0.47	0.22
C6	0.07	0.16	0.13	0.24	0.13	0.34	0.09	0.41	0.08	0.08	0.17	0.14	0.20	0.16	0.33	0.18	0.48	0.20	0.15	0.17
N1	0.11	0.17	0.17	0.26	0.15	0.35	0.09	0.38	0.07	0.08	0.20	0.18	0.21	0.23	0.35	0.23	0.46	0.22	0.18	0.15
N3	0.06	0.23	0.05	0.21	0.18	0.30	0.11	0.35	0.08	0.13	0.24	0.20	0.28	0.10	0.35	0.11	0.37	0.22	0.20	0.12
O2	0.13	0.20	0.21	0.27	0.19	0.35	0.10	0.35	0.07	0.09	0.23	0.23	0.25	0.30	0.39	0.23	0.41	0.26	0.19	0.14
O2'	0.28	0.24	0.34	0.33	0.18	0.36	0.14	0.34	0.15	0.20	0.23	0.23	0.33	0.40	0.40	0.31	0.48	0.22	0.24	0.15
O3'	0.16	0.19	0.21	0.22	0.14	0.28	0.10	0.33	0.11	0.11	0.20	0.18	0.28	0.26	0.28	0.21	0.36	0.19	0.38	0.12
O4	0.21	0.26	0.12	0.18	0.21	0.21	0.17	0.32	0.17	0.21	0.25	0.20	0.30	0.13	0.31	0.14	0.39	0.18	0.22	0.16
O4'	0.12	0.12	0.15	0.22	0.15	0.31	0.13	0.35	0.11	0.04	0.18	0.18	0.16	0.21	0.28	0.25	0.45	0.13	0.25	0.10
O5'	0.36	0.28	0.38	0.52	0.29	0.61	0.36	0.72	0.39	0.34	0.28	0.25	0.27	0.37	0.58	0.51	0.16	0.61	0.70	0.51
OP1	0.18	0.14	0.23	0.20	0.17	0.21	0.18	0.25	0.13	0.09	0.16	0.21	0.23	0.33	0.25	0.14	0.65	0.37	0.27	0.39
OP2	0.86	0.94	0.80	0.65	0.83	0.58	0.74	0.48	0.75	0.86	0.91	0.82	1.00	0.80	0.57	0.70	0.82	0.27	0.20	0.36
P	0.27	0.31	0.25	0.18	0.20	0.18	0.16	0.27	0.18	0.24	0.28	0.20	0.39	0.28	0.19	0.17	0.50	0.22	0.15	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.19	0.31	0.38	0.24
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.12	0.04	0.22	0.28	0.39	0.21
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.12	0.00	0.04	0.01	0.06	0.28	0.32	0.14
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.01	0.08	0.05	0.11	0.10	0.11	0.02	0.01	0.02	0.19	0.27	0.31	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.02	0.25	0.22	0.41	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.30	0.30	0.15
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.10	0.02	0.26	0.20	0.41	0.17
C5'	0.03	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.12	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.27	0.32	0.01
C6	0.00	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.08	0.02	0.26	0.23	0.41	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.23	0.27	0.40	0.21
N3	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.14	0.04	0.24	0.26	0.40	0.20
N4	0.03	0.03	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.05	0.14	0.03	0.26	0.20	0.40	0.17
O2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.15	0.05	0.19	0.30	0.38	0.21
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.05	0.09	0.00	0.07	0.03	0.07	0.33	0.27	0.16
O3'	0.03	0.12	0.04	0.01	0.12	0.02	0.10	0.04	0.08	0.06	0.14	0.14	0.15	0.07	0.00	0.02	0.37	0.30	0.29	0.15
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.29	0.34	0.39	0.28
O5'	0.19	0.22	0.06	0.19	0.25	0.02	0.26	0.00	0.26	0.23	0.24	0.26	0.19	0.07	0.37	0.29	0.00	0.05	0.05	0.01
OP1	0.31	0.28	0.28	0.27	0.22	0.30	0.20	0.27	0.23	0.27	0.26	0.20	0.30	0.33	0.30	0.34	0.05	0.00	0.01	0.02
OP2	0.38	0.39	0.32	0.31	0.41	0.30	0.41	0.32	0.41	0.40	0.40	0.40	0.38	0.27	0.29	0.39	0.05	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.21	0.14	0.09	0.18	0.15	0.17	0.01	0.18	0.21	0.20	0.17	0.21	0.16	0.15	0.28	0.01	0.02	0.01	0.00