Doublet Group distance statistics: 48680

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.016, 0.033, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.013, 0.029, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.009, 0.027, 0.046, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.019, 0.040, 0.062, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.040 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.021, 0.045, 0.070, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.045 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.042, 0.087, 0.131, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.087 std_dev=0.045
O4	A	0, 0.038, 0.082, 0.127, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.082 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.035, 0.107, 0.179, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.107 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.089, 0.184, 0.279, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.184 std_dev=0.095
C4'	A	0, 0.083, 0.198, 0.314, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.198 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.110, 0.226, 0.342, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.226 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.088, 0.217, 0.346, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.217 std_dev=0.129
O5'	A	0, 0.110, 0.272, 0.434, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.272 std_dev=0.162
O3'	A	0, 0.115, 0.294, 0.474, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.294 std_dev=0.179
C5'	A	0, 0.071, 0.252, 0.433, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.252 std_dev=0.181
P	B	0, 0.183, 0.404, 0.625, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.404 std_dev=0.221
OP2	B	0, 0.225, 0.498, 0.771, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.498 std_dev=0.273
C4	B	0, 0.261, 0.610, 0.960, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.610 std_dev=0.349
P	A	0, -0.035, 0.322, 0.678, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.322 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.269, 0.627, 0.985, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.627 std_dev=0.358
N1	B	0, 0.181, 0.545, 0.908, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.545 std_dev=0.363
N4	B	0, 0.296, 0.670, 1.043, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.670 std_dev=0.373
O5'	B	0, 0.167, 0.546, 0.925, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.546 std_dev=0.379
C6	B	0, 0.220, 0.606, 0.991, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.606 std_dev=0.386
C3'	B	0, 0.016, 0.402, 0.789, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.402 std_dev=0.386
OP1	A	0, -0.057, 0.336, 0.729, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.336 std_dev=0.393
C2	B	0, 0.188, 0.589, 0.991, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.589 std_dev=0.402
N3	B	0, 0.212, 0.622, 1.032, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.622 std_dev=0.410
C5'	B	0, 0.107, 0.523, 0.939, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.523 std_dev=0.416
O3'	B	0, -0.047, 0.374, 0.796, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.374 std_dev=0.422
C2'	B	0, 0.044, 0.467, 0.891, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.467 std_dev=0.423
C1'	B	0, 0.122, 0.547, 0.972, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.547 std_dev=0.425
C4'	B	0, 0.068, 0.493, 0.919, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.493 std_dev=0.426
O4'	B	0, 0.134, 0.560, 0.986, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.560 std_dev=0.426
OP2	A	0, -0.104, 0.359, 0.823, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.359 std_dev=0.464
OP1	B	0, 0.178, 0.691, 1.205, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.691 std_dev=0.513
O2	B	0, 0.205, 0.728, 1.251, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.728 std_dev=0.523
O2'	B	0, 0.100, 0.637, 1.173, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.637 std_dev=0.537

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.05	0.06	0.07
C2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.06	0.10	0.11	0.14	0.12
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.07	0.02	0.04	0.10	0.06	0.03
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.05	0.04	0.02	0.00	0.11	0.01	0.04	0.13	0.09	0.07
C4	0.05	0.03	0.06	0.09	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.10	0.02	0.06	0.14	0.18	0.20	0.17
C4'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.07	0.04	0.06	0.05	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02
C5	0.03	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.09	0.02	0.04	0.13	0.17	0.19	0.16
C5'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.11	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.10	0.08	0.05	0.02	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.08	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.04	0.04	0.11	0.13	0.13	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02	0.08	0.10	0.11	0.10
N3	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.06	0.05	0.06	0.11	0.14	0.17	0.15
O2	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.04	0.07	0.08	0.09	0.10	0.12	0.11
O2'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.03	0.06	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.10	0.05	0.04
O3'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.06	0.04	0.02	0.00	0.12	0.01	0.05	0.20	0.15	0.12
O4	0.07	0.06	0.07	0.11	0.02	0.10	0.02	0.12	0.04	0.06	0.05	0.07	0.06	0.12	0.00	0.08	0.14	0.20	0.22	0.18
O4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.08	0.05	0.01	0.08	0.00	0.05	0.07	0.10	0.11
O5'	0.04	0.10	0.04	0.04	0.14	0.01	0.13	0.00	0.11	0.08	0.11	0.09	0.04	0.05	0.14	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.11	0.10	0.13	0.18	0.03	0.17	0.02	0.13	0.10	0.14	0.10	0.10	0.20	0.20	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.14	0.06	0.09	0.20	0.01	0.19	0.02	0.13	0.11	0.17	0.12	0.05	0.15	0.22	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.03	0.07	0.17	0.02	0.16	0.01	0.12	0.10	0.15	0.11	0.04	0.12	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.12	0.18	0.14	0.20	0.10	0.34	0.07	0.27	0.08	0.05	0.24	0.31	0.25	0.19	0.08	0.08	0.38	0.18	0.07
C2	0.17	0.32	0.24	0.17	0.08	0.10	0.17	0.05	0.11	0.14	0.32	0.06	0.45	0.28	0.19	0.08	0.06	0.23	0.21	0.09
C2'	0.06	0.11	0.11	0.07	0.16	0.05	0.32	0.06	0.27	0.08	0.06	0.19	0.30	0.18	0.11	0.06	0.11	0.42	0.12	0.06
C3'	0.08	0.07	0.03	0.03	0.18	0.05	0.31	0.06	0.29	0.14	0.07	0.19	0.21	0.07	0.04	0.09	0.13	0.53	0.05	0.13
C4	0.15	0.32	0.21	0.15	0.24	0.07	0.08	0.04	0.06	0.17	0.35	0.24	0.38	0.21	0.16	0.05	0.06	0.13	0.18	0.09
C4'	0.11	0.14	0.05	0.03	0.28	0.03	0.36	0.03	0.33	0.20	0.17	0.29	0.17	0.08	0.11	0.09	0.11	0.53	0.07	0.11
C5	0.06	0.19	0.13	0.10	0.09	0.05	0.17	0.07	0.18	0.06	0.20	0.10	0.26	0.14	0.12	0.07	0.12	0.26	0.14	0.07
C5'	0.23	0.23	0.20	0.11	0.30	0.09	0.36	0.06	0.35	0.28	0.24	0.30	0.21	0.13	0.05	0.17	0.15	0.60	0.03	0.17
C6	0.07	0.12	0.13	0.10	0.10	0.08	0.29	0.09	0.28	0.07	0.11	0.11	0.24	0.16	0.14	0.10	0.13	0.34	0.16	0.07
N1	0.11	0.19	0.19	0.14	0.09	0.09	0.30	0.07	0.24	0.06	0.15	0.13	0.34	0.23	0.17	0.08	0.09	0.31	0.19	0.08
N3	0.19	0.37	0.24	0.17	0.25	0.10	0.05	0.05	0.04	0.20	0.41	0.23	0.45	0.26	0.18	0.09	0.06	0.14	0.20	0.09
O2	0.20	0.36	0.27	0.18	0.08	0.13	0.15	0.07	0.08	0.16	0.35	0.05	0.50	0.32	0.20	0.11	0.05	0.22	0.22	0.09
O2'	0.07	0.11	0.14	0.09	0.21	0.06	0.34	0.03	0.26	0.08	0.06	0.27	0.32	0.24	0.15	0.05	0.09	0.42	0.15	0.06
O3'	0.11	0.08	0.07	0.06	0.19	0.07	0.31	0.07	0.29	0.16	0.08	0.19	0.19	0.06	0.02	0.11	0.15	0.58	0.05	0.16
O4	0.17	0.35	0.21	0.15	0.35	0.07	0.19	0.04	0.13	0.23	0.41	0.37	0.38	0.20	0.15	0.07	0.05	0.11	0.14	0.10
O4'	0.06	0.09	0.12	0.13	0.29	0.10	0.38	0.08	0.32	0.16	0.15	0.32	0.21	0.21	0.22	0.08	0.07	0.44	0.16	0.08
O5'	0.15	0.15	0.13	0.09	0.19	0.06	0.25	0.03	0.26	0.19	0.16	0.19	0.18	0.08	0.02	0.12	0.14	0.64	0.10	0.23
OP1	0.05	0.06	0.09	0.01	0.09	0.08	0.11	0.15	0.10	0.07	0.08	0.10	0.09	0.09	0.01	0.04	0.12	0.82	0.29	0.43
OP2	0.10	0.20	0.06	0.08	0.17	0.13	0.11	0.18	0.08	0.13	0.22	0.18	0.23	0.04	0.02	0.13	0.18	0.85	0.40	0.52
P	0.02	0.09	0.04	0.01	0.07	0.05	0.09	0.09	0.09	0.05	0.10	0.08	0.14	0.03	0.01	0.02	0.11	0.73	0.23	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.12	0.18	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.10	0.19	0.15	0.05
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.29	0.08	0.03
C3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.12	0.02	0.00	0.01	0.05	0.35	0.03	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.09	0.10	0.16	0.06
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.14	0.08	0.03
C5	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.20	0.10
C5'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.05	0.04	0.08	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02
C6	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.05	0.03	0.22	0.13
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.12	0.18	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.08	0.02	0.11	0.18	0.14	0.05
N4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03	0.09	0.09	0.15	0.06
O2	0.03	0.01	0.12	0.12	0.02	0.05	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.11	0.15	0.03	0.11	0.24	0.14	0.04
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.04	0.11	0.00	0.02	0.02	0.03	0.27	0.08	0.01
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.08	0.03	0.15	0.02	0.00	0.01	0.08	0.46	0.07	0.17
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.21	0.16
O5'	0.04	0.10	0.03	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.05	0.07	0.11	0.09	0.11	0.03	0.08	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.19	0.29	0.35	0.10	0.14	0.02	0.06	0.03	0.12	0.18	0.09	0.24	0.27	0.46	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.15	0.08	0.03	0.16	0.08	0.20	0.05	0.22	0.18	0.14	0.15	0.14	0.08	0.07	0.21	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.05	0.03	0.09	0.06	0.03	0.10	0.02	0.13	0.09	0.05	0.06	0.04	0.01	0.17	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00