Doublet Group distance statistics: 48682

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.001, 0.028, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.001, 0.029, 0.057, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.029 std_dev=0.028
C6	A	0, 0.001, 0.029, 0.058, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.029 std_dev=0.028
N1	A	0, -0.002, 0.030, 0.061, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.014, 0.048, 0.083, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.048 std_dev=0.034
O2	A	0, 0.000, 0.059, 0.117, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.059 std_dev=0.058
C3'	A	0, 0.036, 0.132, 0.227, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.132 std_dev=0.096
C4'	A	0, 0.027, 0.137, 0.248, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.137 std_dev=0.110
O4	A	0, 0.012, 0.130, 0.249, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.130 std_dev=0.119
P	A	0, 0.043, 0.175, 0.308, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.175 std_dev=0.133
OP2	A	0, 0.047, 0.186, 0.326, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.186 std_dev=0.139
C5'	A	0, 0.020, 0.171, 0.323, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.171 std_dev=0.151
O5'	A	0, 0.023, 0.176, 0.328, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.176 std_dev=0.153
O3'	A	0, 0.062, 0.217, 0.371, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.217 std_dev=0.154
C2'	A	0, -0.011, 0.183, 0.378, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.183 std_dev=0.194
P	B	0, 0.040, 0.300, 0.560, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.300 std_dev=0.260
C5'	B	0, 0.111, 0.405, 0.699, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.405 std_dev=0.294
OP1	A	0, 0.041, 0.341, 0.642, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.341 std_dev=0.301
OP2	B	0, 0.054, 0.365, 0.677, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.365 std_dev=0.311
C4'	B	0, 0.138, 0.533, 0.927, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.533 std_dev=0.394
O2'	A	0, -0.058, 0.345, 0.748, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.345 std_dev=0.403
O3'	B	0, 0.149, 0.579, 1.009, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.579 std_dev=0.430
C6	B	0, 0.120, 0.588, 1.055, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.588 std_dev=0.468
C3'	B	0, 0.141, 0.613, 1.085, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.613 std_dev=0.472
C5	B	0, 0.113, 0.610, 1.106, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.610 std_dev=0.496
O2'	B	0, 0.165, 0.695, 1.225, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.695 std_dev=0.530
O4'	B	0, 0.124, 0.660, 1.195, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.660 std_dev=0.536
C2'	B	0, 0.147, 0.711, 1.275, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.711 std_dev=0.564
C1'	B	0, 0.133, 0.720, 1.307, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.720 std_dev=0.587
OP1	B	0, -0.064, 0.542, 1.149, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.542 std_dev=0.606
N1	B	0, 0.116, 0.751, 1.386, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.751 std_dev=0.635
O5'	B	0, 0.021, 0.660, 1.299, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.660 std_dev=0.639
C4	B	0, 0.093, 0.825, 1.558, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.825 std_dev=0.733
N4	B	0, 0.086, 0.871, 1.656, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.871 std_dev=0.785
C2	B	0, 0.084, 0.970, 1.855, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.970 std_dev=0.886
N3	B	0, 0.070, 1.004, 1.938, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.004 std_dev=0.934
O2	B	0, 0.065, 1.139, 2.212, 2.578 max_d=2.578 avg_d=1.139 std_dev=1.074

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.18	0.05	0.07
C2	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.00	0.01	0.03	0.20	0.05	0.07
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.11	0.05	0.10	0.03	0.04	0.07	0.01	0.03	0.10	0.01	0.11	0.08	0.14	0.08
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.16	0.09	0.04
C4	0.00	0.00	0.09	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.06	0.00	0.01	0.06	0.13	0.06	0.05
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02
C5	0.00	0.00	0.11	0.01	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.03	0.00	0.01	0.07	0.12	0.06	0.05
C5'	0.02	0.05	0.05	0.02	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.07	0.02	0.04	0.14	0.10	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02
C6	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.03	0.00	0.00	0.05	0.16	0.06	0.06
N1	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.00	0.03	0.20	0.05	0.07
N3	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.00	0.01	0.05	0.17	0.06	0.06
O2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.01	0.03	0.22	0.05	0.08
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.15	0.10	0.15	0.04	0.12	0.07	0.11	0.02	0.00	0.07	0.17	0.05	0.08	0.06	0.13	0.08
O3'	0.09	0.08	0.03	0.00	0.06	0.02	0.03	0.14	0.03	0.05	0.07	0.09	0.07	0.00	0.06	0.05	0.11	0.29	0.05	0.18
O4	0.01	0.00	0.10	0.02	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.06	0.00	0.03	0.07	0.09	0.06	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.00	0.08	0.17	0.03	0.08
O5'	0.03	0.03	0.11	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.08	0.11	0.07	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.18	0.20	0.08	0.16	0.13	0.08	0.12	0.02	0.16	0.20	0.17	0.22	0.06	0.29	0.09	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.05	0.14	0.09	0.06	0.11	0.06	0.09	0.06	0.05	0.06	0.05	0.13	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.07	0.06	0.08	0.08	0.18	0.05	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.32	0.32	0.29	0.22	0.25	0.20	0.19	0.26	0.31	0.27	0.18	0.36	0.31	0.23	0.36	0.27	0.55	0.37	0.10
C2	0.26	0.18	0.24	0.21	0.10	0.19	0.13	0.14	0.19	0.21	0.12	0.05	0.20	0.24	0.17	0.28	0.18	0.43	0.40	0.03
C2'	0.50	0.47	0.49	0.47	0.34	0.42	0.31	0.36	0.38	0.45	0.41	0.29	0.52	0.48	0.43	0.50	0.50	0.64	0.25	0.25
C3'	0.44	0.46	0.43	0.39	0.34	0.33	0.28	0.26	0.33	0.42	0.42	0.30	0.52	0.40	0.34	0.43	0.43	0.54	0.30	0.18
C4	0.21	0.11	0.19	0.17	0.03	0.16	0.06	0.12	0.13	0.15	0.05	0.04	0.13	0.20	0.13	0.24	0.13	0.30	0.40	0.04
C4'	0.49	0.51	0.47	0.41	0.40	0.37	0.34	0.28	0.38	0.47	0.48	0.36	0.57	0.44	0.35	0.49	0.41	0.65	0.24	0.23
C5	0.30	0.23	0.26	0.23	0.13	0.22	0.14	0.17	0.21	0.25	0.17	0.09	0.26	0.26	0.17	0.32	0.23	0.43	0.38	0.05
C5'	0.61	0.66	0.58	0.52	0.53	0.47	0.45	0.38	0.49	0.60	0.62	0.49	0.73	0.54	0.44	0.60	0.53	0.73	0.10	0.35
C6	0.34	0.30	0.31	0.27	0.21	0.25	0.20	0.19	0.25	0.31	0.25	0.16	0.34	0.29	0.21	0.36	0.28	0.52	0.36	0.10
N1	0.32	0.27	0.29	0.26	0.18	0.23	0.18	0.17	0.24	0.28	0.22	0.14	0.30	0.28	0.20	0.34	0.24	0.50	0.38	0.08
N3	0.21	0.10	0.19	0.17	0.02	0.16	0.07	0.12	0.14	0.15	0.04	0.03	0.12	0.20	0.13	0.23	0.12	0.34	0.41	0.04
O2	0.26	0.17	0.24	0.21	0.10	0.19	0.14	0.14	0.20	0.21	0.12	0.06	0.19	0.23	0.17	0.28	0.17	0.43	0.40	0.03
O2'	0.48	0.41	0.49	0.48	0.26	0.44	0.25	0.40	0.34	0.41	0.33	0.19	0.46	0.49	0.46	0.50	0.50	0.66	0.27	0.24
O3'	0.41	0.45	0.39	0.34	0.34	0.29	0.28	0.23	0.31	0.40	0.42	0.32	0.51	0.35	0.28	0.41	0.40	0.51	0.30	0.16
O4	0.14	0.04	0.12	0.11	0.11	0.11	0.06	0.08	0.06	0.06	0.09	0.16	0.04	0.15	0.09	0.17	0.04	0.15	0.41	0.12
O4'	0.37	0.37	0.33	0.28	0.28	0.25	0.24	0.17	0.29	0.35	0.34	0.25	0.42	0.31	0.21	0.38	0.26	0.58	0.34	0.13
O5'	0.53	0.57	0.51	0.47	0.41	0.41	0.33	0.34	0.38	0.50	0.52	0.37	0.64	0.48	0.40	0.53	0.53	0.61	0.18	0.28
OP1	0.63	0.71	0.66	0.62	0.53	0.50	0.40	0.41	0.45	0.61	0.67	0.49	0.82	0.62	0.58	0.59	0.71	0.37	0.08	0.29
OP2	0.45	0.59	0.44	0.37	0.44	0.30	0.30	0.21	0.32	0.46	0.57	0.43	0.69	0.39	0.29	0.42	0.45	0.38	0.17	0.19
P	0.56	0.65	0.56	0.52	0.48	0.44	0.36	0.36	0.41	0.55	0.61	0.44	0.74	0.52	0.46	0.54	0.60	0.48	0.12	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.00	0.69	0.25
C2	0.00	0.00	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.04	0.27	0.12	0.66	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.05	0.03	0.17	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.59	0.22
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.18	0.06	0.02	0.11	0.12	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.45	0.18
C4	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.45	0.16	0.48	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.12	0.05	0.05	0.10	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.22	0.44	0.14
C5	0.00	0.01	0.08	0.18	0.01	0.13	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.20	0.01	0.51	0.13	0.47	0.07
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.20	0.00	0.23	0.00	0.20	0.11	0.14	0.22	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.32	0.19	0.01
C6	0.00	0.01	0.10	0.18	0.01	0.12	0.00	0.20	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.20	0.03	0.45	0.08	0.60	0.13
N1	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.29	0.07	0.68	0.20
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.36	0.15	0.58	0.14
N4	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.47	0.20	0.38	0.06
O2	0.00	0.00	0.17	0.12	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.17	0.05	0.18	0.11	0.70	0.23
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.05	0.14	0.57	0.21
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.20	0.05	0.01	0.12	0.17	0.01	0.00	0.01	0.17	0.24	0.29	0.11
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.10	0.03	0.67	0.26
O5'	0.13	0.27	0.03	0.06	0.45	0.01	0.51	0.01	0.45	0.29	0.36	0.47	0.18	0.05	0.17	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.00	0.12	0.06	0.12	0.16	0.22	0.13	0.32	0.08	0.07	0.15	0.20	0.11	0.14	0.24	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.69	0.66	0.59	0.45	0.48	0.44	0.47	0.19	0.60	0.68	0.58	0.38	0.70	0.57	0.29	0.67	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.20	0.22	0.18	0.09	0.14	0.07	0.01	0.13	0.20	0.14	0.06	0.23	0.21	0.11	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00