Doublet Group distance statistics: 48685

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
O4	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O5'	B	0, 0.000, 0.238, 0.476, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.238 std_dev=0.238
O3'	A	0, 0.000, 0.253, 0.506, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.253 std_dev=0.253
P	B	0, 0.000, 0.297, 0.593, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.000, 0.345, 0.691, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.345 std_dev=0.345
C2'	A	0, 0.000, 0.404, 0.808, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.404 std_dev=0.404
O4'	A	0, 0.000, 0.411, 0.822, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.411 std_dev=0.411
C3'	A	0, 0.000, 0.452, 0.904, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C5	B	0, 0.000, 0.453, 0.907, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.453 std_dev=0.453
C6	B	0, 0.000, 0.456, 0.912, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.456 std_dev=0.456
C4	B	0, 0.000, 0.504, 1.007, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.504 std_dev=0.504
OP1	B	0, 0.000, 0.542, 1.084, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.542 std_dev=0.542
C4'	A	0, 0.000, 0.550, 1.099, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.550 std_dev=0.550
OP2	B	0, 0.000, 0.552, 1.103, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.552 std_dev=0.552
N3	B	0, 0.000, 0.578, 1.156, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.578 std_dev=0.578
N4	B	0, 0.000, 0.582, 1.164, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.582 std_dev=0.582
N1	B	0, 0.000, 0.609, 1.218, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.609 std_dev=0.609
C4'	B	0, 0.000, 0.622, 1.243, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.622 std_dev=0.622
O2'	A	0, 0.000, 0.631, 1.261, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.631 std_dev=0.631
O4'	B	0, 0.000, 0.664, 1.327, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.664 std_dev=0.664
C2	B	0, 0.000, 0.669, 1.339, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.669 std_dev=0.669
C3'	B	0, 0.000, 0.686, 1.372, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.686 std_dev=0.686
C1'	B	0, 0.000, 0.775, 1.550, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.775 std_dev=0.775
C2'	B	0, 0.000, 0.837, 1.674, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.837 std_dev=0.837
O2	B	0, 0.000, 0.840, 1.680, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.840 std_dev=0.840
O5'	A	0, 0.000, 0.852, 1.705, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.852 std_dev=0.852
O3'	B	0, 0.000, 0.952, 1.904, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.952 std_dev=0.952
C5'	A	0, 0.000, 0.953, 1.905, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.953 std_dev=0.953
OP2	A	0, 0.000, 1.009, 2.018, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.009 std_dev=1.009
P	A	0, 0.000, 1.037, 2.074, 2.074 max_d=2.074 avg_d=1.037 std_dev=1.037
O2'	B	0, 0.000, 1.152, 2.305, 2.305 max_d=2.305 avg_d=1.152 std_dev=1.152
OP1	A	0, 0.000, 1.471, 2.941, 2.941 max_d=2.941 avg_d=1.471 std_dev=1.471

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.06
C2	0.00	0.00	0.11	0.03	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.03	0.06	0.27	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.09	0.15	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.08	0.02	0.05
C3'	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.13	0.06	0.07
C4	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.10	0.21	0.40	0.22
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01
C5	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.14	0.26	0.42	0.26
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01	0.09	0.13	0.20	0.33	0.22
N1	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.24	0.13
N3	0.00	0.00	0.09	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.05	0.12	0.33	0.15
O2	0.00	0.00	0.15	0.04	0.01	0.09	0.02	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.02	0.00	0.15	0.01	0.01	0.23	0.07
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.03	0.16	0.29	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.10	0.06	0.07
O3'	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.15	0.06	0.07
O4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.11	0.25	0.43	0.23
O4'	0.00	0.10	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.15	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.04	0.19	0.12
O5'	0.02	0.03	0.03	0.04	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.06	0.05	0.01	0.04	0.04	0.11	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.00	0.06	0.08	0.13	0.21	0.07	0.26	0.04	0.20	0.09	0.12	0.01	0.10	0.15	0.25	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.27	0.02	0.06	0.40	0.04	0.42	0.01	0.33	0.24	0.33	0.23	0.06	0.06	0.43	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.05	0.07	0.22	0.01	0.26	0.01	0.22	0.13	0.15	0.07	0.07	0.07	0.23	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.25	0.20	0.08	0.13	0.06	0.06	0.06	0.09	0.19	0.20	0.07	0.31	0.25	0.11	0.09	0.14	0.06	0.21	0.19
C2	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.11	0.06	0.02	0.00	0.07	0.04	0.03	0.05	0.08	0.15	0.00	0.14	0.21
C2'	0.09	0.18	0.11	0.03	0.10	0.07	0.01	0.21	0.02	0.10	0.17	0.08	0.25	0.17	0.00	0.03	0.29	0.04	0.40	0.30
C3'	0.12	0.16	0.13	0.01	0.06	0.03	0.00	0.16	0.02	0.10	0.12	0.03	0.23	0.21	0.01	0.02	0.24	0.06	0.35	0.23
C4	0.09	0.07	0.00	0.03	0.12	0.06	0.18	0.10	0.14	0.09	0.09	0.15	0.04	0.00	0.11	0.14	0.11	0.01	0.10	0.20
C4'	0.15	0.11	0.16	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.10	0.05	0.03	0.17	0.25	0.08	0.08	0.13	0.08	0.20	0.12
C5	0.03	0.05	0.12	0.12	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.09	0.12	0.19	0.04	0.10	0.09	0.15	0.19
C5'	0.01	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.09	0.10	0.07	0.05	0.09	0.12	0.04	0.09	0.02	0.04	0.17	0.08	0.22	0.10
C6	0.14	0.17	0.20	0.15	0.07	0.07	0.02	0.05	0.06	0.14	0.13	0.02	0.21	0.21	0.20	0.05	0.13	0.08	0.20	0.19
N1	0.10	0.16	0.14	0.07	0.07	0.02	0.01	0.07	0.04	0.11	0.13	0.02	0.19	0.16	0.11	0.02	0.14	0.04	0.18	0.20
N3	0.11	0.09	0.04	0.02	0.14	0.09	0.18	0.12	0.14	0.11	0.11	0.17	0.06	0.04	0.05	0.15	0.14	0.02	0.11	0.21
O2	0.04	0.01	0.01	0.03	0.05	0.07	0.09	0.12	0.07	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02	0.13	0.21
O2'	0.10	0.24	0.12	0.04	0.16	0.09	0.04	0.25	0.03	0.13	0.24	0.15	0.31	0.18	0.02	0.03	0.33	0.02	0.47	0.37
O3'	0.17	0.21	0.17	0.02	0.09	0.02	0.02	0.12	0.05	0.14	0.17	0.05	0.30	0.27	0.03	0.07	0.22	0.04	0.32	0.23
O4	0.15	0.14	0.04	0.02	0.19	0.09	0.24	0.10	0.19	0.15	0.15	0.21	0.10	0.06	0.10	0.20	0.08	0.02	0.06	0.18
O4'	0.21	0.16	0.23	0.14	0.03	0.13	0.02	0.03	0.08	0.16	0.08	0.03	0.22	0.28	0.17	0.14	0.05	0.09	0.09	0.08
O5'	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.02	0.15	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.06	0.18	0.16	0.27	0.09
OP1	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.01	0.03	0.40	0.07	0.20
OP2	0.11	0.19	0.10	0.07	0.26	0.01	0.26	0.08	0.23	0.19	0.22	0.26	0.16	0.04	0.00	0.04	0.01	0.51	0.18	0.17
P	0.04	0.05	0.04	0.02	0.09	0.01	0.10	0.06	0.09	0.07	0.06	0.08	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.33	0.15	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.01	0.08
C2	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.20	0.06	0.10
C2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.03	0.03
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02
C4	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.20	0.11	0.11
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.04	0.02
C5	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03	0.24	0.12	0.11
C5'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.05	0.00
C6	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.26	0.10	0.10
N1	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.23	0.06	0.09
N3	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.20	0.08	0.12
N4	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.20	0.11	0.13
O2	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.18	0.05	0.08
O2'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.10	0.05	0.02
O3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.11	0.07
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.01	0.10
O5'	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.24	0.20	0.07	0.04	0.20	0.13	0.24	0.10	0.26	0.23	0.20	0.20	0.18	0.10	0.15	0.31	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.01	0.06	0.03	0.06	0.11	0.04	0.12	0.05	0.10	0.06	0.08	0.11	0.05	0.05	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.03	0.02	0.11	0.02	0.11	0.00	0.10	0.09	0.12	0.13	0.08	0.02	0.07	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00