Doublet Group distance statistics: 48688

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O4	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
C1'	A	0, 0.000, 0.059, 0.118, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.059 std_dev=0.059
O2	A	0, 0.000, 0.078, 0.156, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.078 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.000, 0.149, 0.298, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.149 std_dev=0.149
O4'	A	0, 0.000, 0.163, 0.327, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.163 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.000, 0.174, 0.348, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.174 std_dev=0.174
OP2	A	0, 0.000, 0.258, 0.516, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.258 std_dev=0.258
C4'	A	0, 0.000, 0.280, 0.559, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.280 std_dev=0.280
P	B	0, 0.000, 0.305, 0.610, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.305 std_dev=0.305
C3'	A	0, 0.000, 0.334, 0.667, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.334 std_dev=0.334
C5'	A	0, 0.000, 0.339, 0.679, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.339 std_dev=0.339
P	A	0, 0.000, 0.402, 0.804, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.402 std_dev=0.402
O3'	A	0, 0.000, 0.415, 0.829, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.415 std_dev=0.415
O5'	B	0, 0.000, 0.489, 0.978, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.489 std_dev=0.489
O5'	A	0, 0.000, 0.496, 0.992, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.496 std_dev=0.496
OP2	B	0, 0.000, 0.564, 1.127, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.564 std_dev=0.564
OP1	B	0, 0.000, 0.595, 1.190, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.595 std_dev=0.595
OP1	A	0, 0.000, 0.763, 1.527, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.763 std_dev=0.763
O3'	B	0, 0.000, 0.944, 1.889, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.944 std_dev=0.944
C3'	B	0, 0.000, 0.962, 1.924, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.962 std_dev=0.962
O2	B	0, 0.000, 0.971, 1.942, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.971 std_dev=0.971
C2'	B	0, 0.000, 1.001, 2.002, 2.002 max_d=2.002 avg_d=1.001 std_dev=1.001
O2'	B	0, 0.000, 1.022, 2.043, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.022 std_dev=1.022
C4'	B	0, 0.000, 1.063, 2.126, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.063 std_dev=1.063
C2	B	0, 0.000, 1.069, 2.139, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.069 std_dev=1.069
N3	B	0, 0.000, 1.075, 2.151, 2.151 max_d=2.151 avg_d=1.075 std_dev=1.075
C5'	B	0, 0.000, 1.128, 2.256, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.128 std_dev=1.128
C1'	B	0, 0.000, 1.163, 2.325, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.163 std_dev=1.163
N1	B	0, 0.000, 1.178, 2.356, 2.356 max_d=2.356 avg_d=1.178 std_dev=1.178
C4	B	0, 0.000, 1.188, 2.376, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.188 std_dev=1.188
O4'	B	0, 0.000, 1.202, 2.404, 2.404 max_d=2.404 avg_d=1.202 std_dev=1.202
N4	B	0, 0.000, 1.215, 2.429, 2.429 max_d=2.429 avg_d=1.215 std_dev=1.215
C6	B	0, 0.000, 1.266, 2.532, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.266 std_dev=1.266
C5	B	0, 0.000, 1.270, 2.540, 2.540 max_d=2.540 avg_d=1.270 std_dev=1.270

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.03	0.03	0.06	0.08	0.02	0.08	0.07	0.01	0.06	0.03	0.12	0.04
C2	0.05	0.00	0.11	0.19	0.02	0.13	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.02	0.07	0.05	0.10	0.15	0.00
C2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.11	0.03	0.07	0.01	0.05	0.06	0.11	0.14	0.00	0.07	0.11	0.00	0.00	0.02	0.15	0.01
C3'	0.05	0.19	0.02	0.00	0.22	0.01	0.18	0.01	0.15	0.15	0.21	0.20	0.04	0.03	0.23	0.03	0.06	0.03	0.10	0.03
C4	0.06	0.02	0.11	0.22	0.00	0.15	0.00	0.14	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.25	0.00	0.11	0.10	0.14	0.16	0.00
C4'	0.03	0.13	0.03	0.01	0.15	0.00	0.14	0.00	0.13	0.11	0.14	0.14	0.07	0.06	0.16	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03
C5	0.05	0.01	0.07	0.18	0.00	0.14	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.11	0.08	0.10	0.16	0.02
C5'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.14	0.00	0.13	0.00	0.12	0.09	0.12	0.12	0.09	0.05	0.15	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05
C6	0.03	0.00	0.05	0.15	0.01	0.13	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.01	0.10	0.04	0.05	0.14	0.03
N1	0.03	0.01	0.06	0.15	0.03	0.11	0.02	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.17	0.04	0.07	0.02	0.05	0.14	0.02
N3	0.06	0.01	0.11	0.21	0.00	0.14	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.24	0.01	0.09	0.08	0.13	0.17	0.01
O2	0.08	0.00	0.14	0.20	0.01	0.14	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.23	0.01	0.09	0.06	0.12	0.13	0.03
O2'	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.07	0.06	0.09	0.05	0.02	0.04	0.04	0.00	0.12	0.07	0.01	0.05	0.10	0.03	0.09
O3'	0.08	0.22	0.07	0.03	0.25	0.06	0.21	0.05	0.18	0.17	0.24	0.23	0.12	0.00	0.26	0.07	0.13	0.10	0.04	0.11
O4	0.07	0.02	0.11	0.23	0.00	0.16	0.00	0.15	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.26	0.00	0.11	0.12	0.17	0.16	0.00
O4'	0.01	0.07	0.00	0.03	0.11	0.01	0.11	0.01	0.10	0.07	0.09	0.09	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.06	0.03	0.03
O5'	0.06	0.05	0.00	0.06	0.10	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.08	0.06	0.05	0.13	0.12	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01
OP1	0.03	0.10	0.02	0.03	0.14	0.04	0.10	0.07	0.05	0.05	0.13	0.12	0.10	0.10	0.17	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00
OP2	0.12	0.15	0.15	0.10	0.16	0.02	0.16	0.05	0.14	0.14	0.17	0.13	0.03	0.04	0.16	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00
P	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.09	0.11	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.13	0.04	0.01	0.42	0.16	0.41	0.17	0.24	0.09	0.27	0.56	0.02	0.23	0.02	0.14	0.15	0.40	0.21	0.11
C2	0.10	0.27	0.13	0.16	0.54	0.04	0.56	0.06	0.43	0.27	0.39	0.65	0.15	0.08	0.13	0.08	0.07	0.30	0.34	0.01
C2'	0.11	0.11	0.05	0.02	0.39	0.18	0.37	0.19	0.20	0.07	0.25	0.54	0.00	0.23	0.02	0.17	0.13	0.44	0.19	0.13
C3'	0.21	0.04	0.13	0.12	0.34	0.30	0.30	0.35	0.10	0.02	0.20	0.51	0.06	0.30	0.12	0.29	0.19	0.54	0.04	0.24
C4	0.20	0.35	0.22	0.25	0.61	0.13	0.65	0.15	0.53	0.37	0.47	0.71	0.23	0.02	0.22	0.18	0.01	0.27	0.39	0.04
C4'	0.23	0.03	0.15	0.14	0.32	0.32	0.28	0.38	0.07	0.04	0.19	0.50	0.06	0.32	0.15	0.32	0.19	0.49	0.03	0.22
C5	0.08	0.27	0.12	0.15	0.55	0.01	0.58	0.02	0.43	0.26	0.40	0.67	0.15	0.07	0.12	0.03	0.03	0.38	0.32	0.04
C5'	0.28	0.01	0.18	0.19	0.30	0.37	0.23	0.46	0.01	0.09	0.17	0.49	0.07	0.32	0.19	0.38	0.16	0.48	0.04	0.23
C6	0.01	0.20	0.04	0.07	0.49	0.09	0.50	0.12	0.34	0.18	0.34	0.62	0.09	0.15	0.05	0.07	0.08	0.39	0.26	0.08
N1	0.00	0.20	0.05	0.07	0.48	0.07	0.50	0.08	0.34	0.18	0.34	0.61	0.09	0.15	0.05	0.04	0.10	0.37	0.27	0.07
N3	0.19	0.34	0.20	0.24	0.60	0.13	0.63	0.16	0.51	0.35	0.46	0.70	0.22	0.00	0.21	0.18	0.03	0.25	0.38	0.04
O2	0.10	0.26	0.12	0.16	0.51	0.05	0.54	0.08	0.41	0.26	0.37	0.63	0.14	0.08	0.14	0.08	0.08	0.27	0.34	0.00
O2'	0.14	0.06	0.08	0.05	0.32	0.19	0.30	0.20	0.14	0.02	0.19	0.46	0.03	0.25	0.05	0.19	0.15	0.39	0.17	0.13
O3'	0.27	0.02	0.18	0.17	0.26	0.35	0.22	0.40	0.02	0.09	0.14	0.44	0.11	0.35	0.17	0.35	0.21	0.57	0.01	0.27
O4	0.30	0.42	0.30	0.34	0.66	0.24	0.70	0.28	0.60	0.44	0.52	0.74	0.29	0.11	0.30	0.29	0.07	0.17	0.41	0.10
O4'	0.18	0.06	0.12	0.11	0.36	0.28	0.34	0.31	0.15	0.01	0.22	0.53	0.04	0.30	0.12	0.26	0.20	0.45	0.09	0.18
O5'	0.13	0.16	0.05	0.08	0.47	0.26	0.41	0.38	0.18	0.07	0.34	0.65	0.08	0.19	0.10	0.25	0.05	0.40	0.02	0.16
OP1	0.15	0.17	0.05	0.10	0.46	0.29	0.35	0.44	0.12	0.04	0.36	0.67	0.11	0.16	0.10	0.29	0.02	0.39	0.12	0.16
OP2	0.35	0.12	0.22	0.21	0.12	0.39	0.06	0.48	0.13	0.21	0.02	0.28	0.17	0.31	0.17	0.45	0.03	0.28	0.03	0.12
P	0.15	0.14	0.04	0.06	0.41	0.26	0.33	0.38	0.11	0.02	0.30	0.59	0.08	0.15	0.05	0.27	0.07	0.29	0.00	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.11	0.46	0.08	0.16
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.27	0.54	0.08	0.32
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.05	0.02	0.18	0.44	0.07	0.18
C3'	0.05	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.00	0.01	0.08	0.09	0.03	0.02	0.02	0.29	0.44	0.08	0.20
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.52	0.69	0.34	0.55
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.03	0.02	0.08	0.06	0.05	0.00	0.00	0.02	0.38	0.19	0.05
C5	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.58	0.73	0.38	0.60
C5'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.01	0.08	0.06	0.05	0.01	0.02	0.00	0.39	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.09	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.05	0.50	0.69	0.26	0.51
N1	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.31	0.57	0.09	0.34
N3	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.38	0.60	0.20	0.42
N4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.58	0.73	0.42	0.62
O2	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.09	0.14	0.02	0.12	0.44	0.03	0.20
O2'	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.00	0.04	0.04	0.06	0.26	0.22	0.01
O3'	0.06	0.07	0.05	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.05	0.14	0.04	0.00	0.02	0.23	0.37	0.13	0.13
O4'	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.06	0.46	0.11	0.13
O5'	0.11	0.27	0.18	0.29	0.52	0.02	0.58	0.00	0.50	0.31	0.38	0.58	0.12	0.06	0.23	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.46	0.54	0.44	0.44	0.69	0.38	0.73	0.39	0.69	0.57	0.60	0.73	0.44	0.26	0.37	0.46	0.02	0.00	0.03	0.00
OP2	0.08	0.08	0.07	0.08	0.34	0.19	0.38	0.28	0.26	0.09	0.20	0.42	0.03	0.22	0.13	0.11	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.16	0.32	0.18	0.20	0.55	0.05	0.60	0.01	0.51	0.34	0.42	0.62	0.20	0.01	0.13	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00