Doublet Group distance statistics: 48690

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2'	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C5	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O2'	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
C3'	A	0, 0.000, 0.056, 0.111, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.056 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.000, 0.056, 0.112, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.056
C4'	A	0, 0.000, 0.063, 0.126, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.063 std_dev=0.063
O2	A	0, 0.000, 0.064, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.064 std_dev=0.064
O3'	A	0, 0.000, 0.098, 0.197, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.098 std_dev=0.098
OP1	A	0, 0.000, 0.141, 0.283, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.141 std_dev=0.141
O2'	B	0, 0.000, 0.154, 0.309, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.154 std_dev=0.154
C2'	B	0, 0.000, 0.159, 0.318, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.159 std_dev=0.159
P	A	0, 0.000, 0.163, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.163 std_dev=0.163
C3'	B	0, 0.000, 0.171, 0.342, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.171 std_dev=0.171
OP2	A	0, 0.000, 0.171, 0.343, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.171 std_dev=0.171
O5'	A	0, 0.000, 0.176, 0.352, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.176 std_dev=0.176
C5'	A	0, 0.000, 0.176, 0.352, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.176 std_dev=0.176
O3'	B	0, 0.000, 0.180, 0.360, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.180 std_dev=0.180
C4'	B	0, 0.000, 0.201, 0.401, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.201 std_dev=0.201
C5'	B	0, 0.000, 0.212, 0.424, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.212 std_dev=0.212
OP2	B	0, 0.000, 0.213, 0.425, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.213 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.000, 0.219, 0.439, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.219 std_dev=0.219
P	B	0, 0.000, 0.232, 0.464, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.232 std_dev=0.232
N1	B	0, 0.000, 0.233, 0.467, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.233 std_dev=0.233
O4'	B	0, 0.000, 0.237, 0.474, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.237 std_dev=0.237
O5'	B	0, 0.000, 0.242, 0.483, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.242 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.000, 0.244, 0.489, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.244 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.000, 0.283, 0.567, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.283 std_dev=0.283
OP1	B	0, 0.000, 0.290, 0.581, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.290 std_dev=0.290
C4	B	0, 0.000, 0.294, 0.589, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.294 std_dev=0.294
N4	B	0, 0.000, 0.317, 0.634, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.317 std_dev=0.317
C2	B	0, 0.000, 0.322, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.322 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.000, 0.345, 0.690, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.345 std_dev=0.345
O2	B	0, 0.000, 0.407, 0.813, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.407 std_dev=0.407

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01
C2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.03	0.04
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02
C4	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.06	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02
C5	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.07	0.05	0.07	0.06
C5'	0.03	0.08	0.04	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.10	0.08	0.09	0.08	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01
C6	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.05	0.05
N1	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.03	0.02	0.03
N3	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.05	0.05
O2	0.04	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.04
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01
O3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.02
O4	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.06	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04
O5'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.06	0.06	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02
OP2	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.05	0.07	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.02	0.06	0.06	0.08	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.01	0.04	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.01	0.02	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.03	0.08	0.10	0.09	0.08
C2	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.09	0.09	0.08
C3'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.03	0.02	0.02	0.07	0.10	0.09	0.08
C4	0.05	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.09	0.06	0.09	0.05	0.03	0.06	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02
C4'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.02	0.02	0.07	0.09	0.08	0.07
C5	0.05	0.03	0.04	0.05	0.06	0.06	0.09	0.06	0.09	0.06	0.04	0.06	0.00	0.03	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02
C5'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01
C6	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.07	0.03	0.07	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.04	0.02
N1	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.04
N3	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.08	0.04	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
O2	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.08	0.03	0.08	0.03	0.00	0.04	0.05	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02
O2'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.08	0.08	0.06
O3'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.02	0.07	0.10	0.09	0.08
O4	0.05	0.02	0.03	0.04	0.06	0.05	0.09	0.06	0.09	0.05	0.03	0.06	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03
O4'	0.06	0.09	0.06	0.07	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.05	0.08	0.05	0.13	0.05	0.06	0.07	0.13	0.14	0.12	0.12
O5'	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02
OP1	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.05	0.04
OP2	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
P	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.03	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.05	0.06
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05
C4	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.07	0.01	0.03
C5'	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02
C6	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.09	0.02	0.04
N1	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.03
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02
N4	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02
O2	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.02	0.08	0.00	0.03	0.01	0.08	0.09	0.06	0.07
O3'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00	0.03	0.06	0.04	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
O5'	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.04	0.03	0.04	0.04	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.04	0.09	0.07	0.05	0.06	0.07	0.06	0.09	0.06	0.04	0.04	0.04	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.03	0.06	0.05	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00