Doublet Group distance statistics: 48692

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O4	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.000, 0.420, 0.841, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.420 std_dev=0.420
OP1	B	0, 0.000, 0.426, 0.853, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.426 std_dev=0.426
C2'	A	0, 0.000, 0.446, 0.892, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.446 std_dev=0.446
P	B	0, 0.000, 0.474, 0.947, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.474 std_dev=0.474
O5'	B	0, 0.000, 0.502, 1.003, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.502 std_dev=0.502
C5'	B	0, 0.000, 0.505, 1.010, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.505 std_dev=0.505
C4'	A	0, 0.000, 0.559, 1.118, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.559 std_dev=0.559
O2'	A	0, 0.000, 0.576, 1.152, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.576 std_dev=0.576
OP2	B	0, 0.000, 0.656, 1.312, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.656 std_dev=0.656
C3'	A	0, 0.000, 0.660, 1.319, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.660 std_dev=0.660
C6	B	0, 0.000, 0.681, 1.362, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.681 std_dev=0.681
C4'	B	0, 0.000, 0.721, 1.441, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.721 std_dev=0.721
C5	B	0, 0.000, 0.768, 1.536, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.768 std_dev=0.768
O4'	B	0, 0.000, 0.842, 1.684, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.842 std_dev=0.842
O3'	B	0, 0.000, 0.849, 1.697, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.849 std_dev=0.849
OP2	A	0, 0.000, 0.874, 1.749, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.874 std_dev=0.874
C3'	B	0, 0.000, 0.930, 1.861, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.930 std_dev=0.930
O3'	A	0, 0.000, 0.948, 1.897, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.948 std_dev=0.948
P	A	0, 0.000, 0.986, 1.972, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.986 std_dev=0.986
OP1	A	0, 0.000, 1.020, 2.040, 2.040 max_d=2.040 avg_d=1.020 std_dev=1.020
C5'	A	0, 0.000, 1.070, 2.139, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.070 std_dev=1.070
C1'	B	0, 0.000, 1.128, 2.257, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.128 std_dev=1.128
N1	B	0, 0.000, 1.150, 2.299, 2.299 max_d=2.299 avg_d=1.150 std_dev=1.150
C2'	B	0, 0.000, 1.211, 2.421, 2.421 max_d=2.421 avg_d=1.211 std_dev=1.211
O2'	B	0, 0.000, 1.321, 2.643, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.321 std_dev=1.321
C4	B	0, 0.000, 1.345, 2.690, 2.690 max_d=2.690 avg_d=1.345 std_dev=1.345
O5'	A	0, 0.000, 1.393, 2.785, 2.785 max_d=2.785 avg_d=1.393 std_dev=1.393
N4	B	0, 0.000, 1.488, 2.976, 2.976 max_d=2.976 avg_d=1.488 std_dev=1.488
C2	B	0, 0.000, 1.701, 3.402, 3.402 max_d=3.402 avg_d=1.701 std_dev=1.701
N3	B	0, 0.000, 1.789, 3.579, 3.579 max_d=3.579 avg_d=1.789 std_dev=1.789
O2	B	0, 0.000, 2.108, 4.216, 4.216 max_d=4.216 avg_d=2.108 std_dev=2.108

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.26	0.24	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.00	0.06	0.04	0.20	0.18	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.05	0.19	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.44	0.40	0.23
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.15	0.02	0.05	0.16	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.49	0.41	0.28
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.08	0.14	0.15	0.06
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.26	0.19	0.09
C5	0.00	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.17	0.00	0.04	0.12	0.17	0.22	0.10
C5'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.05	0.00
C6	0.00	0.00	0.12	0.15	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.17	0.00	0.05	0.13	0.22	0.27	0.12
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.23	0.23	0.09
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.05	0.05	0.16	0.15	0.05
O2	0.03	0.00	0.19	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.22	0.00	0.10	0.01	0.21	0.17	0.06
O2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.05	0.16	0.00	0.05	0.02	0.00	0.01	0.46	0.39	0.22
O3'	0.03	0.10	0.02	0.01	0.06	0.04	0.17	0.03	0.17	0.01	0.06	0.22	0.05	0.00	0.06	0.04	0.05	0.65	0.52	0.38
O4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.11	0.12	0.05
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.15	0.12	0.01
O5'	0.04	0.04	0.01	0.04	0.08	0.00	0.12	0.00	0.13	0.07	0.05	0.01	0.01	0.05	0.07	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.26	0.20	0.44	0.49	0.14	0.26	0.17	0.10	0.22	0.23	0.16	0.21	0.46	0.65	0.11	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.18	0.40	0.41	0.15	0.19	0.22	0.05	0.27	0.23	0.15	0.17	0.39	0.52	0.12	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.10	0.07	0.23	0.28	0.06	0.09	0.10	0.00	0.12	0.09	0.05	0.06	0.22	0.38	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.79	1.14	0.83	0.49	0.68	0.44	0.30	0.24	0.35	0.76	1.08	0.64	1.46	0.91	0.31	0.58	0.11	0.12	0.14	0.05
C2	0.76	1.19	0.75	0.44	0.87	0.41	0.42	0.23	0.42	0.80	1.24	0.87	1.41	0.78	0.26	0.55	0.14	0.14	0.12	0.04
C2'	0.59	1.00	0.63	0.30	0.64	0.22	0.23	0.01	0.21	0.60	1.01	0.66	1.31	0.69	0.13	0.37	0.08	0.31	0.23	0.21
C3'	0.35	0.67	0.40	0.16	0.35	0.07	0.01	0.08	0.01	0.33	0.66	0.38	0.95	0.45	0.02	0.18	0.16	0.26	0.23	0.22
C4	0.69	1.06	0.64	0.38	0.91	0.37	0.52	0.21	0.48	0.77	1.14	0.91	1.16	0.62	0.21	0.51	0.16	0.17	0.13	0.05
C4'	0.48	0.64	0.55	0.34	0.25	0.30	0.01	0.16	0.04	0.37	0.55	0.22	0.93	0.67	0.24	0.36	0.03	0.02	0.12	0.03
C5	0.72	1.04	0.67	0.40	0.78	0.39	0.45	0.22	0.46	0.78	1.04	0.72	1.14	0.63	0.20	0.54	0.14	0.19	0.19	0.08
C5'	0.20	0.21	0.25	0.20	0.08	0.20	0.25	0.15	0.20	0.05	0.12	0.11	0.44	0.38	0.21	0.18	0.02	0.13	0.08	0.03
C6	0.78	1.10	0.77	0.47	0.72	0.43	0.36	0.23	0.40	0.79	1.05	0.65	1.28	0.75	0.25	0.58	0.12	0.17	0.18	0.08
N1	0.79	1.17	0.80	0.47	0.77	0.43	0.37	0.23	0.39	0.80	1.15	0.73	1.42	0.82	0.28	0.57	0.12	0.14	0.15	0.06
N3	0.72	1.14	0.69	0.41	0.93	0.39	0.49	0.22	0.46	0.79	1.23	0.96	1.30	0.70	0.24	0.53	0.16	0.14	0.11	0.03
O2	0.75	1.18	0.75	0.44	0.86	0.40	0.41	0.22	0.40	0.78	1.24	0.88	1.44	0.81	0.27	0.55	0.14	0.13	0.11	0.03
O2'	0.69	1.13	0.71	0.35	0.75	0.28	0.32	0.05	0.30	0.70	1.14	0.78	1.47	0.81	0.16	0.45	0.05	0.32	0.23	0.20
O3'	0.22	0.60	0.27	0.02	0.32	0.09	0.04	0.25	0.09	0.24	0.62	0.37	0.88	0.31	0.12	0.04	0.30	0.41	0.32	0.35
O4	0.62	0.96	0.56	0.33	0.91	0.33	0.57	0.20	0.49	0.71	1.06	0.95	1.02	0.54	0.18	0.46	0.17	0.17	0.11	0.04
O4'	0.74	0.90	0.82	0.53	0.40	0.51	0.13	0.33	0.22	0.62	0.76	0.33	1.23	0.94	0.41	0.59	0.17	0.04	0.08	0.05
O5'	0.12	0.08	0.07	0.05	0.29	0.03	0.46	0.00	0.44	0.23	0.13	0.29	0.11	0.00	0.00	0.09	0.11	0.14	0.12	0.03
OP1	0.03	0.02	0.06	0.01	0.17	0.06	0.28	0.10	0.27	0.12	0.06	0.17	0.09	0.06	0.00	0.02	0.04	0.19	0.04	0.05
OP2	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.02	0.24	0.06	0.25	0.07	0.04	0.08	0.17	0.04	0.03	0.00	0.06	0.17	0.04	0.04
P	0.04	0.01	0.04	0.01	0.16	0.03	0.29	0.06	0.29	0.12	0.03	0.15	0.13	0.03	0.00	0.01	0.06	0.16	0.06	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02
C2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.03	0.03	0.13	0.17	0.11	0.11
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.10	0.02	0.04	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.19	0.06	0.02	0.06	0.12	0.03	0.00	0.02	0.02	0.10	0.03	0.01
C4	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.02	0.08	0.08	0.04	0.05
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.19	0.00	0.01	0.05	0.10	0.05
C5'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.10	0.19	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.21	0.01	0.04	0.06	0.12	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03
N3	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.14	0.17	0.12	0.11
N4	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.09	0.09	0.06	0.06
O2	0.02	0.00	0.13	0.12	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.14	0.04	0.16	0.23	0.15	0.14
O2'	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.04	0.08	0.06	0.00	0.06	0.02	0.13	0.00	0.03	0.05	0.05	0.02	0.04	0.04
O3'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.21	0.07	0.00	0.09	0.14	0.03	0.00	0.00	0.07	0.08	0.07	0.02
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.00	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02
O5'	0.05	0.13	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.14	0.09	0.16	0.05	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.07	0.17	0.10	0.10	0.08	0.05	0.05	0.04	0.06	0.07	0.17	0.09	0.23	0.02	0.08	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.00	0.11	0.01	0.03	0.04	0.03	0.10	0.02	0.12	0.01	0.12	0.06	0.15	0.04	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.11	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.11	0.06	0.14	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00