Doublet Group distance statistics: 48720

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.018, 0.037, 0.056, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.037 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.016, 0.044, 0.072, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.044 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.092, 0.191, 0.290, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.191 std_dev=0.099
O3'	A	0, 0.105, 0.236, 0.367, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.236 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.124, 0.258, 0.391, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.258 std_dev=0.133
O4'	A	0, 0.076, 0.214, 0.351, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.214 std_dev=0.137
O2'	A	0, 0.145, 0.299, 0.452, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.299 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.113, 0.315, 0.517, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.315 std_dev=0.202
O4'	B	0, 0.257, 0.516, 0.775, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.516 std_dev=0.259
O5'	A	0, 0.283, 0.543, 0.804, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.543 std_dev=0.261
C4'	B	0, 0.265, 0.557, 0.849, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.557 std_dev=0.292
C5'	A	0, 0.219, 0.538, 0.856, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.538 std_dev=0.318
OP2	B	0, 0.155, 0.488, 0.821, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.488 std_dev=0.333
P	B	0, 0.163, 0.497, 0.832, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.497 std_dev=0.334
C1'	B	0, 0.240, 0.577, 0.915, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.577 std_dev=0.337
P	A	0, 0.287, 0.642, 0.997, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.642 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.288, 0.647, 1.007, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.647 std_dev=0.360
C6	B	0, 0.255, 0.624, 0.993, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.624 std_dev=0.369
N1	B	0, 0.215, 0.590, 0.965, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.590 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.299, 0.677, 1.055, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.677 std_dev=0.378
O3'	B	0, 0.337, 0.718, 1.098, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.718 std_dev=0.381
OP2	A	0, 0.295, 0.681, 1.067, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.681 std_dev=0.386
O5'	B	0, 0.212, 0.618, 1.024, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.618 std_dev=0.406
C2'	B	0, 0.263, 0.675, 1.088, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.675 std_dev=0.413
OP1	B	0, 0.192, 0.609, 1.025, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.609 std_dev=0.417
C5	B	0, 0.274, 0.697, 1.121, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.697 std_dev=0.424
O2'	B	0, 0.294, 0.751, 1.208, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.751 std_dev=0.457
C2	B	0, 0.224, 0.682, 1.139, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.682 std_dev=0.458
OP1	A	0, 0.310, 0.770, 1.230, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.770 std_dev=0.460
N3	B	0, 0.246, 0.741, 1.235, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.741 std_dev=0.494
C4	B	0, 0.224, 0.719, 1.214, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.719 std_dev=0.495
O2	B	0, 0.211, 0.767, 1.324, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.767 std_dev=0.556
O4	B	0, 0.261, 0.824, 1.387, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.824 std_dev=0.563

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.16	0.16	0.19	0.18
C2	0.03	0.00	0.06	0.03	0.03	0.06	0.02	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.02	0.09	0.22	0.24	0.31	0.26
C2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.11	0.04	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.03	0.01	0.21	0.26	0.23	0.24
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.04	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.13	0.06	0.08
C4	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.10	0.02	0.02	0.20	0.29	0.35	0.28
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.10	0.04	0.03	0.03	0.00	0.02	0.08	0.07	0.04
C5	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.09	0.01	0.06	0.18	0.30	0.35	0.28
C5'	0.05	0.13	0.11	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.13	0.16	0.11	0.04	0.11	0.02	0.01	0.09	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.08	0.19	0.28	0.32	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.02	0.20	0.24	0.29	0.25
N3	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.12	0.02	0.06	0.21	0.26	0.33	0.27
O2	0.05	0.01	0.09	0.06	0.02	0.10	0.02	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.15	0.03	0.14	0.23	0.23	0.29	0.25
O2'	0.01	0.12	0.00	0.04	0.06	0.04	0.08	0.11	0.08	0.03	0.11	0.19	0.00	0.05	0.07	0.01	0.23	0.31	0.29	0.28
O3'	0.11	0.13	0.03	0.01	0.10	0.03	0.09	0.04	0.08	0.10	0.12	0.15	0.05	0.00	0.10	0.10	0.04	0.13	0.06	0.05
O4	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.10	0.00	0.03	0.19	0.30	0.35	0.28
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.06	0.14	0.01	0.10	0.03	0.00	0.07	0.06	0.12	0.10
O5'	0.16	0.22	0.21	0.07	0.20	0.02	0.18	0.01	0.19	0.20	0.21	0.23	0.23	0.04	0.19	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01
OP1	0.16	0.24	0.26	0.13	0.29	0.08	0.30	0.09	0.28	0.24	0.26	0.23	0.31	0.13	0.30	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01
OP2	0.19	0.31	0.23	0.06	0.35	0.07	0.35	0.06	0.32	0.29	0.33	0.29	0.29	0.06	0.35	0.12	0.05	0.04	0.00	0.00
P	0.18	0.26	0.24	0.08	0.28	0.04	0.28	0.02	0.28	0.25	0.27	0.25	0.28	0.05	0.28	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.27	0.22	0.12	0.25	0.12	0.23	0.14	0.17	0.16	0.28	0.41	0.33	0.18	0.30	0.16	0.33	0.32	0.26	0.25
C2	0.22	0.28	0.27	0.18	0.17	0.15	0.19	0.18	0.12	0.18	0.22	0.39	0.33	0.22	0.22	0.16	0.31	0.31	0.30	0.28
C2'	0.14	0.26	0.19	0.10	0.21	0.09	0.21	0.14	0.14	0.12	0.27	0.41	0.31	0.21	0.26	0.09	0.39	0.33	0.31	0.28
C3'	0.14	0.31	0.14	0.07	0.29	0.08	0.24	0.13	0.17	0.16	0.34	0.45	0.27	0.13	0.33	0.10	0.35	0.30	0.25	0.22
C4	0.25	0.32	0.31	0.25	0.26	0.18	0.25	0.20	0.20	0.25	0.31	0.36	0.33	0.27	0.26	0.17	0.27	0.27	0.30	0.27
C4'	0.13	0.35	0.11	0.10	0.35	0.09	0.28	0.14	0.21	0.19	0.40	0.48	0.26	0.17	0.39	0.10	0.30	0.30	0.18	0.19
C5	0.25	0.27	0.32	0.25	0.23	0.15	0.31	0.15	0.27	0.24	0.24	0.31	0.34	0.27	0.22	0.18	0.28	0.30	0.30	0.27
C5'	0.17	0.37	0.15	0.09	0.33	0.06	0.26	0.13	0.22	0.23	0.38	0.50	0.23	0.13	0.35	0.10	0.33	0.28	0.18	0.19
C6	0.23	0.21	0.30	0.21	0.13	0.14	0.25	0.14	0.22	0.19	0.14	0.30	0.35	0.26	0.15	0.18	0.32	0.32	0.29	0.26
N1	0.21	0.24	0.27	0.16	0.16	0.12	0.21	0.14	0.15	0.16	0.18	0.36	0.34	0.22	0.20	0.15	0.32	0.32	0.28	0.27
N3	0.25	0.32	0.30	0.22	0.14	0.18	0.16	0.21	0.13	0.23	0.27	0.40	0.33	0.25	0.12	0.18	0.28	0.28	0.30	0.27
O2	0.22	0.30	0.25	0.17	0.30	0.16	0.26	0.19	0.17	0.20	0.30	0.43	0.32	0.21	0.38	0.18	0.31	0.31	0.29	0.28
O2'	0.16	0.28	0.20	0.11	0.21	0.08	0.21	0.14	0.15	0.14	0.28	0.43	0.31	0.21	0.25	0.09	0.39	0.35	0.35	0.31
O3'	0.11	0.26	0.12	0.08	0.26	0.08	0.22	0.13	0.14	0.10	0.30	0.41	0.27	0.14	0.32	0.08	0.31	0.30	0.23	0.21
O4	0.27	0.36	0.31	0.27	0.40	0.20	0.32	0.24	0.26	0.30	0.40	0.38	0.31	0.27	0.43	0.18	0.25	0.23	0.30	0.27
O4'	0.17	0.31	0.19	0.15	0.34	0.15	0.28	0.18	0.21	0.18	0.35	0.42	0.33	0.20	0.38	0.17	0.30	0.33	0.19	0.22
O5'	0.16	0.30	0.19	0.08	0.22	0.05	0.16	0.11	0.13	0.16	0.29	0.43	0.26	0.03	0.23	0.10	0.36	0.25	0.24	0.19
OP1	0.08	0.20	0.13	0.06	0.17	0.13	0.24	0.29	0.22	0.10	0.18	0.34	0.21	0.05	0.18	0.09	0.34	0.29	0.13	0.24
OP2	0.16	0.19	0.07	0.10	0.35	0.20	0.45	0.32	0.43	0.26	0.24	0.14	0.08	0.06	0.37	0.22	0.43	0.34	0.23	0.27
P	0.03	0.16	0.08	0.03	0.19	0.09	0.24	0.20	0.23	0.10	0.17	0.25	0.16	0.01	0.21	0.06	0.34	0.24	0.17	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.03	0.00	0.10	0.11	0.11	0.09
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.03	0.06	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.03	0.15	0.25	0.14	0.16
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.03	0.06	0.04	0.07	0.12	0.00	0.02	0.07	0.01	0.09	0.13	0.13	0.06
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.13	0.01	0.14	0.04	0.14	0.08	0.10	0.11	0.04	0.01	0.13	0.01	0.19	0.18	0.18	0.10
C4	0.04	0.03	0.08	0.13	0.00	0.10	0.01	0.19	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.05	0.24	0.40	0.26	0.28
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.10	0.06	0.06	0.07	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.18	0.09	0.01
C5	0.03	0.02	0.06	0.14	0.01	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.01	0.05	0.29	0.40	0.32	0.32
C5'	0.02	0.12	0.03	0.04	0.19	0.00	0.20	0.00	0.18	0.12	0.14	0.10	0.06	0.05	0.20	0.01	0.01	0.26	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.02	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.01	0.05	0.29	0.30	0.27	0.28
N1	0.02	0.00	0.04	0.08	0.03	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.02	0.02	0.17	0.22	0.16	0.17
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.02	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.01	0.02	0.19	0.33	0.19	0.22
O2	0.06	0.01	0.12	0.11	0.02	0.07	0.02	0.10	0.02	0.02	0.00	0.00	0.14	0.14	0.01	0.07	0.12	0.23	0.10	0.12
O2'	0.02	0.09	0.00	0.04	0.06	0.05	0.02	0.06	0.02	0.03	0.08	0.14	0.00	0.08	0.06	0.05	0.12	0.17	0.10	0.08
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.15	0.01	0.17	0.05	0.16	0.08	0.11	0.14	0.08	0.00	0.15	0.01	0.29	0.22	0.27	0.17
O4	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.04	0.25	0.45	0.30	0.31
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.07	0.05	0.01	0.04	0.00	0.20	0.11	0.17	0.14
O5'	0.10	0.15	0.09	0.19	0.24	0.02	0.29	0.01	0.29	0.17	0.19	0.12	0.12	0.29	0.25	0.20	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.25	0.13	0.18	0.40	0.18	0.40	0.26	0.30	0.22	0.33	0.23	0.17	0.22	0.45	0.11	0.02	0.00	0.04	0.01
OP2	0.11	0.14	0.13	0.18	0.26	0.09	0.32	0.10	0.27	0.16	0.19	0.10	0.10	0.27	0.30	0.17	0.02	0.04	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.06	0.10	0.28	0.01	0.32	0.01	0.28	0.17	0.22	0.12	0.08	0.17	0.31	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00