Doublet Group distance statistics: 48729

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, -0.002, 0.011, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.001, 0.017, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, -0.001, 0.017, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.002, 0.018, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.021
O2	A	0, -0.008, 0.039, 0.085, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.039 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.019, 0.066, 0.113, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.066 std_dev=0.047
O4	A	0, 0.025, 0.086, 0.146, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.086 std_dev=0.061
C2'	A	0, 0.029, 0.098, 0.167, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.098 std_dev=0.069
C4'	A	0, 0.027, 0.103, 0.179, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.103 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.007, 0.112, 0.218, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.112 std_dev=0.105
C5'	A	0, 0.052, 0.180, 0.309, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.180 std_dev=0.128
OP2	A	0, 0.057, 0.199, 0.342, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.199 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.047, 0.198, 0.348, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.198 std_dev=0.150
O3'	A	0, 0.038, 0.202, 0.367, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.202 std_dev=0.165
C2'	B	0, 0.063, 0.244, 0.426, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.244 std_dev=0.181
O2'	B	0, 0.061, 0.248, 0.434, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.248 std_dev=0.187
O5'	A	0, 0.039, 0.236, 0.433, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.236 std_dev=0.197
P	A	0, 0.051, 0.271, 0.492, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.271 std_dev=0.220
OP1	B	0, 0.090, 0.323, 0.556, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.323 std_dev=0.233
C3'	B	0, 0.065, 0.303, 0.542, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.303 std_dev=0.239
O3'	B	0, 0.064, 0.345, 0.626, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.345 std_dev=0.281
P	B	0, 0.096, 0.386, 0.677, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.386 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.012, 0.309, 0.605, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.309 std_dev=0.297
N1	B	0, 0.000, 0.299, 0.597, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.299 std_dev=0.298
C1'	B	0, 0.036, 0.336, 0.637, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.336 std_dev=0.300
C2	B	0, -0.024, 0.285, 0.593, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.285 std_dev=0.309
O2	B	0, 0.005, 0.316, 0.628, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.316 std_dev=0.311
C4'	B	0, 0.070, 0.399, 0.728, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.399 std_dev=0.329
C5	B	0, -0.027, 0.307, 0.641, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.307 std_dev=0.334
N3	B	0, -0.051, 0.290, 0.631, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.290 std_dev=0.341
C4	B	0, -0.089, 0.294, 0.677, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.294 std_dev=0.383
OP2	B	0, 0.145, 0.529, 0.912, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.529 std_dev=0.384
O4'	B	0, 0.032, 0.423, 0.813, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.423 std_dev=0.391
OP1	A	0, 0.016, 0.412, 0.807, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.412 std_dev=0.396
O5'	B	0, 0.051, 0.487, 0.923, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.487 std_dev=0.436
O4	B	0, -0.095, 0.367, 0.829, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.367 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.012, 0.686, 1.359, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.686 std_dev=0.674

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.12	0.03
C4	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.03	0.02	0.06	0.02
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01
C5	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.03	0.02	0.05	0.02
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00
C6	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01
O2	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.00	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02
O3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.06	0.02	0.01	0.02	0.19	0.05
O4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.08	0.03
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.08	0.04	0.04
O5'	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.03	0.09	0.12	0.06	0.06	0.05	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.09	0.19	0.08	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.11	0.07	0.05	0.31	0.06	0.28	0.21	0.20	0.11	0.23	0.04	0.22	0.02	0.38	0.02	0.04	0.07	0.06	0.02
C2	0.04	0.03	0.11	0.06	0.27	0.09	0.24	0.30	0.13	0.04	0.14	0.11	0.22	0.06	0.40	0.03	0.08	0.06	0.07	0.05
C2'	0.04	0.13	0.04	0.05	0.31	0.06	0.29	0.17	0.21	0.13	0.23	0.03	0.19	0.02	0.39	0.03	0.04	0.07	0.04	0.02
C3'	0.07	0.15	0.01	0.05	0.32	0.05	0.30	0.11	0.23	0.16	0.24	0.05	0.14	0.03	0.38	0.04	0.02	0.09	0.04	0.03
C4	0.20	0.18	0.21	0.04	0.06	0.06	0.07	0.27	0.07	0.16	0.08	0.25	0.24	0.09	0.20	0.19	0.08	0.08	0.11	0.08
C4'	0.08	0.16	0.02	0.02	0.29	0.02	0.27	0.08	0.22	0.16	0.24	0.06	0.18	0.08	0.33	0.05	0.04	0.14	0.11	0.07
C5	0.22	0.18	0.23	0.05	0.08	0.04	0.09	0.21	0.04	0.16	0.07	0.26	0.25	0.08	0.20	0.21	0.04	0.08	0.09	0.05
C5'	0.10	0.17	0.05	0.01	0.27	0.01	0.27	0.01	0.23	0.18	0.23	0.08	0.09	0.12	0.31	0.06	0.08	0.17	0.13	0.10
C6	0.14	0.09	0.18	0.02	0.19	0.02	0.18	0.19	0.07	0.05	0.05	0.20	0.24	0.05	0.28	0.13	0.03	0.08	0.07	0.03
N1	0.05	0.03	0.12	0.05	0.27	0.07	0.25	0.24	0.15	0.04	0.15	0.12	0.23	0.04	0.37	0.04	0.06	0.06	0.06	0.03
N3	0.12	0.09	0.16	0.05	0.16	0.08	0.16	0.30	0.05	0.06	0.03	0.17	0.23	0.08	0.31	0.10	0.09	0.07	0.10	0.07
O2	0.04	0.10	0.07	0.09	0.33	0.12	0.28	0.32	0.19	0.11	0.22	0.07	0.19	0.06	0.45	0.04	0.10	0.06	0.07	0.06
O2'	0.07	0.14	0.04	0.05	0.30	0.05	0.27	0.17	0.20	0.14	0.24	0.05	0.21	0.04	0.37	0.05	0.03	0.07	0.05	0.02
O3'	0.07	0.14	0.02	0.03	0.28	0.02	0.28	0.06	0.21	0.15	0.22	0.04	0.14	0.05	0.35	0.04	0.03	0.09	0.04	0.03
O4	0.23	0.20	0.22	0.06	0.03	0.08	0.06	0.30	0.12	0.19	0.13	0.25	0.23	0.12	0.12	0.22	0.11	0.11	0.15	0.10
O4'	0.05	0.14	0.05	0.05	0.29	0.05	0.28	0.17	0.22	0.15	0.24	0.02	0.22	0.04	0.33	0.04	0.03	0.10	0.09	0.04
O5'	0.12	0.18	0.09	0.06	0.32	0.06	0.32	0.05	0.28	0.21	0.25	0.08	0.02	0.00	0.36	0.08	0.04	0.13	0.07	0.06
OP1	0.23	0.25	0.25	0.08	0.33	0.07	0.34	0.09	0.31	0.27	0.29	0.18	0.33	0.01	0.36	0.17	0.10	0.14	0.08	0.08
OP2	0.10	0.04	0.05	0.13	0.13	0.15	0.12	0.28	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.01	0.20	0.17	0.30	0.29	0.24	0.24
P	0.07	0.12	0.09	0.00	0.25	0.01	0.26	0.10	0.21	0.14	0.19	0.04	0.12	0.00	0.29	0.02	0.12	0.16	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.30	0.34	0.25
C2	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.05	0.00	0.01	0.04	0.20	0.25	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.06	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.02	0.07	0.29	0.25	0.19
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.23	0.00	0.26	0.01	0.22	0.13	0.16	0.02	0.01	0.00	0.25	0.01	0.05	0.15	0.15	0.10
C4	0.00	0.00	0.03	0.23	0.00	0.20	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.23	0.00	0.02	0.23	0.07	0.08	0.06
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.20	0.00	0.24	0.01	0.21	0.11	0.13	0.02	0.04	0.01	0.22	0.00	0.01	0.10	0.15	0.08
C5	0.00	0.00	0.06	0.26	0.00	0.24	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.00	0.03	0.27	0.10	0.08	0.08
C5'	0.07	0.23	0.03	0.01	0.44	0.01	0.49	0.00	0.42	0.25	0.33	0.12	0.04	0.02	0.48	0.03	0.00	0.13	0.04	0.02
C6	0.00	0.00	0.06	0.22	0.00	0.21	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.23	0.00	0.02	0.19	0.06	0.18	0.03
N1	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.01	0.05	0.20	0.27	0.15
N3	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.13	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.00	0.01	0.12	0.07	0.16	0.04
O2	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.23	0.08	0.01	0.00	0.08	0.27	0.29	0.21
O2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.13	0.23	0.00	0.03	0.08	0.09	0.02	0.23	0.16	0.11
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.23	0.01	0.27	0.02	0.23	0.10	0.13	0.08	0.03	0.00	0.27	0.01	0.06	0.06	0.04	0.08
O4	0.00	0.00	0.04	0.25	0.00	0.22	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.27	0.00	0.02	0.28	0.17	0.03	0.14
O4'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.02	0.00	0.11	0.32	0.39	0.29
O5'	0.08	0.04	0.07	0.05	0.23	0.01	0.27	0.00	0.19	0.05	0.12	0.08	0.02	0.06	0.28	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.30	0.20	0.29	0.15	0.07	0.10	0.10	0.13	0.06	0.20	0.07	0.27	0.23	0.06	0.17	0.32	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.25	0.25	0.15	0.08	0.15	0.08	0.04	0.18	0.27	0.16	0.29	0.16	0.04	0.03	0.39	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.14	0.19	0.10	0.06	0.08	0.08	0.02	0.03	0.15	0.04	0.21	0.11	0.08	0.14	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00