Doublet Group distance statistics: 48730

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.018, 0.063, 0.108, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.063 std_dev=0.045
P	B	0, 0.159, 0.555, 0.950, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.555 std_dev=0.396
OP2	B	0, 0.160, 0.557, 0.953, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.557 std_dev=0.397
O2'	A	0, 0.179, 0.614, 1.050, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.614 std_dev=0.436
C2'	A	0, 0.203, 0.697, 1.190, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.697 std_dev=0.493
O4'	A	0, 0.218, 0.748, 1.279, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.748 std_dev=0.530
OP1	B	0, 0.305, 1.044, 1.784, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.044 std_dev=0.740
C4'	A	0, 0.336, 1.154, 1.973, 1.803 max_d=1.803 avg_d=1.154 std_dev=0.818
C3'	A	0, 0.346, 1.188, 2.030, 1.850 max_d=1.850 avg_d=1.188 std_dev=0.842
O5'	B	0, 0.421, 1.449, 2.477, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.449 std_dev=1.028
OP2	A	0, 0.461, 1.621, 2.780, 2.646 max_d=2.646 avg_d=1.621 std_dev=1.159
O3'	A	0, 0.484, 1.658, 2.832, 2.560 max_d=2.560 avg_d=1.658 std_dev=1.174
C5'	B	0, 0.491, 1.703, 2.915, 2.721 max_d=2.721 avg_d=1.703 std_dev=1.212
C5	B	0, 0.504, 1.736, 2.967, 2.730 max_d=2.730 avg_d=1.736 std_dev=1.232
C6	B	0, 0.527, 1.822, 3.116, 2.892 max_d=2.892 avg_d=1.822 std_dev=1.295
C5'	A	0, 0.540, 1.856, 3.173, 2.911 max_d=2.911 avg_d=1.856 std_dev=1.317
C4	B	0, 0.542, 1.866, 3.190, 2.936 max_d=2.936 avg_d=1.866 std_dev=1.324
O5'	A	0, 0.553, 1.904, 3.255, 2.998 max_d=2.998 avg_d=1.904 std_dev=1.351
C3'	B	0, 0.554, 1.925, 3.296, 3.092 max_d=3.092 avg_d=1.925 std_dev=1.371
O4	B	0, 0.576, 1.976, 3.376, 3.066 max_d=3.066 avg_d=1.976 std_dev=1.400
N3	B	0, 0.571, 1.976, 3.381, 3.147 max_d=3.147 avg_d=1.976 std_dev=1.405
N1	B	0, 0.573, 2.000, 3.427, 3.231 max_d=3.231 avg_d=2.000 std_dev=1.427
C4'	B	0, 0.582, 2.033, 3.485, 3.292 max_d=3.292 avg_d=2.033 std_dev=1.451
C2	B	0, 0.586, 2.047, 3.509, 3.314 max_d=3.314 avg_d=2.047 std_dev=1.461
P	A	0, 0.593, 2.071, 3.549, 3.349 max_d=3.349 avg_d=2.071 std_dev=1.478
O4'	B	0, 0.611, 2.144, 3.677, 3.493 max_d=3.493 avg_d=2.144 std_dev=1.533
O3'	B	0, 0.629, 2.197, 3.766, 3.562 max_d=3.562 avg_d=2.197 std_dev=1.569
C2'	B	0, 0.633, 2.214, 3.795, 3.592 max_d=3.592 avg_d=2.214 std_dev=1.581
O2	B	0, 0.634, 2.226, 3.818, 3.629 max_d=3.629 avg_d=2.226 std_dev=1.592
C1'	B	0, 0.640, 2.243, 3.845, 3.644 max_d=3.644 avg_d=2.243 std_dev=1.602
OP1	A	0, 0.757, 2.660, 4.563, 4.346 max_d=4.346 avg_d=2.660 std_dev=1.903
O2'	B	0, 0.769, 2.700, 4.630, 4.401 max_d=4.401 avg_d=2.700 std_dev=1.930

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.01
C2	0.01	0.00	0.13	0.15	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.16	0.00	0.06	0.05	0.05	0.07	0.03
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.02	0.10	0.20	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.11	0.11	0.05
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.11	0.00	0.05	0.00	0.02	0.07	0.15	0.18	0.00	0.00	0.13	0.01	0.02	0.11	0.09	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.00	0.00	0.06	0.09	0.12	0.07
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.06	0.09	0.12	0.09
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02
C6	0.00	0.00	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.00	0.08	0.04	0.05	0.07	0.08
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03
N3	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.18	0.00	0.05	0.06	0.07	0.10	0.05
O2	0.02	0.00	0.20	0.18	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.20	0.00	0.10	0.06	0.05	0.06	0.03
O2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.06	0.07	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.01
O3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.14	0.00	0.07	0.03	0.03	0.07	0.18	0.20	0.03	0.00	0.17	0.01	0.07	0.09	0.07	0.01
O4	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.01	0.06	0.11	0.14	0.08
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.05	0.10	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.05	0.05
O5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.02	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.05	0.05	0.11	0.11	0.09	0.05	0.09	0.04	0.05	0.03	0.07	0.05	0.06	0.09	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.07	0.11	0.09	0.12	0.01	0.12	0.00	0.07	0.05	0.10	0.06	0.07	0.07	0.14	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.35	0.23	0.25	0.50	0.29	0.55	0.31	0.51	0.42	0.42	0.23	0.15	0.14	0.48	0.34	0.38	0.15	0.21	0.19
C2	0.09	0.10	0.11	0.08	0.16	0.13	0.31	0.20	0.25	0.09	0.06	0.23	0.16	0.04	0.19	0.13	0.26	0.18	0.23	0.19
C2'	0.30	0.36	0.21	0.20	0.49	0.23	0.51	0.23	0.46	0.38	0.43	0.29	0.14	0.10	0.50	0.28	0.30	0.23	0.12	0.11
C3'	0.25	0.29	0.18	0.17	0.42	0.19	0.45	0.20	0.41	0.32	0.35	0.23	0.09	0.08	0.43	0.23	0.29	0.23	0.12	0.10
C4	0.14	0.28	0.16	0.05	0.20	0.08	0.07	0.15	0.09	0.15	0.32	0.34	0.17	0.01	0.23	0.09	0.20	0.21	0.21	0.19
C4'	0.28	0.30	0.23	0.24	0.38	0.24	0.42	0.25	0.41	0.34	0.33	0.24	0.13	0.15	0.37	0.28	0.32	0.15	0.14	0.11
C5	0.07	0.10	0.03	0.10	0.08	0.18	0.20	0.26	0.21	0.06	0.13	0.17	0.03	0.09	0.12	0.15	0.32	0.20	0.20	0.21
C5'	0.16	0.18	0.13	0.16	0.24	0.16	0.28	0.17	0.27	0.21	0.20	0.17	0.05	0.11	0.24	0.16	0.24	0.15	0.08	0.04
C6	0.23	0.14	0.14	0.21	0.27	0.28	0.41	0.33	0.41	0.26	0.17	0.10	0.10	0.15	0.24	0.29	0.40	0.17	0.20	0.21
N1	0.19	0.13	0.11	0.17	0.34	0.23	0.45	0.28	0.40	0.25	0.19	0.07	0.07	0.10	0.33	0.24	0.35	0.16	0.22	0.20
N3	0.15	0.28	0.18	0.07	0.12	0.09	0.14	0.15	0.13	0.15	0.30	0.37	0.22	0.02	0.12	0.11	0.20	0.19	0.22	0.19
O2	0.10	0.10	0.14	0.09	0.20	0.12	0.32	0.18	0.24	0.10	0.03	0.24	0.20	0.04	0.26	0.12	0.25	0.17	0.23	0.19
O2'	0.43	0.50	0.33	0.29	0.58	0.32	0.58	0.30	0.54	0.50	0.55	0.44	0.27	0.18	0.58	0.39	0.35	0.20	0.15	0.13
O3'	0.26	0.32	0.20	0.18	0.43	0.19	0.45	0.20	0.41	0.33	0.37	0.27	0.11	0.10	0.45	0.23	0.29	0.24	0.12	0.10
O4	0.25	0.41	0.24	0.11	0.42	0.09	0.24	0.09	0.21	0.30	0.47	0.45	0.24	0.05	0.46	0.17	0.11	0.23	0.17	0.16
O4'	0.34	0.32	0.26	0.30	0.41	0.32	0.48	0.34	0.49	0.40	0.34	0.21	0.16	0.19	0.37	0.35	0.40	0.13	0.22	0.20
O5'	0.04	0.15	0.06	0.01	0.14	0.03	0.15	0.09	0.13	0.07	0.15	0.22	0.11	0.01	0.16	0.01	0.16	0.20	0.05	0.04
OP1	0.00	0.09	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.07	0.11	0.05	0.11	0.14	0.05	0.01	0.13	0.02	0.13	0.18	0.09	0.06
OP2	0.01	0.11	0.03	0.01	0.13	0.08	0.14	0.13	0.12	0.06	0.14	0.15	0.04	0.00	0.16	0.05	0.18	0.17	0.10	0.03
P	0.01	0.10	0.03	0.01	0.11	0.05	0.13	0.09	0.11	0.05	0.12	0.15	0.06	0.00	0.13	0.02	0.14	0.19	0.08	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.17	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.03	0.19	0.09	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.10	0.10
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.04	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.23	0.08	0.10
C4	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.00	0.03	0.10	0.06	0.06
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.03	0.04
C5	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04
C5'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02
N1	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.14	0.05	0.05
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.01	0.04	0.17	0.09	0.08
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.04	0.24	0.11	0.10
O2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.21	0.08	0.07
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.05	0.07	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.23	0.09	0.09
O4	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.00	0.04	0.09	0.07	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.02
O5'	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.07	0.04	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.17	0.19	0.23	0.23	0.10	0.14	0.03	0.07	0.05	0.14	0.17	0.24	0.21	0.23	0.09	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.09	0.10	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.11	0.08	0.09	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.10	0.10	0.06	0.04	0.04	0.01	0.02	0.05	0.08	0.10	0.07	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00