Doublet Group distance statistics: 48741

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
O4	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.000, 0.292, 0.583, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C2'	A	0, 0.000, 0.323, 0.646, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.323 std_dev=0.323
O2'	A	0, 0.000, 0.417, 0.834, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.417 std_dev=0.417
C4'	A	0, 0.000, 0.462, 0.925, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.462 std_dev=0.462
P	B	0, 0.000, 0.494, 0.989, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.494 std_dev=0.494
C3'	A	0, 0.000, 0.502, 1.003, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.502 std_dev=0.502
OP1	B	0, 0.000, 0.557, 1.114, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.557 std_dev=0.557
OP2	B	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
O5'	B	0, 0.000, 0.650, 1.300, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.650 std_dev=0.650
C5'	B	0, 0.000, 0.650, 1.300, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.650 std_dev=0.650
O3'	A	0, 0.000, 0.739, 1.478, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.739 std_dev=0.739
C5'	A	0, 0.000, 0.780, 1.559, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.780 std_dev=0.780
C4'	B	0, 0.000, 0.792, 1.583, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.792 std_dev=0.792
O5'	A	0, 0.000, 0.980, 1.961, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.980 std_dev=0.980
P	A	0, 0.000, 1.295, 2.591, 2.591 max_d=2.591 avg_d=1.295 std_dev=1.295
C3'	B	0, 0.000, 1.318, 2.636, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.318 std_dev=1.318
OP2	A	0, 0.000, 1.369, 2.739, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.369 std_dev=1.369
OP1	A	0, 0.000, 1.381, 2.762, 2.762 max_d=2.762 avg_d=1.381 std_dev=1.381
O4'	B	0, 0.000, 1.455, 2.911, 2.911 max_d=2.911 avg_d=1.455 std_dev=1.455
C2	B	0, 0.000, 1.528, 3.055, 3.055 max_d=3.055 avg_d=1.528 std_dev=1.528
O2	B	0, 0.000, 1.554, 3.107, 3.107 max_d=3.107 avg_d=1.554 std_dev=1.554
C2'	B	0, 0.000, 1.574, 3.148, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.574 std_dev=1.574
N3	B	0, 0.000, 1.579, 3.157, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.579 std_dev=1.579
N1	B	0, 0.000, 1.599, 3.197, 3.197 max_d=3.197 avg_d=1.599 std_dev=1.599
C1'	B	0, 0.000, 1.696, 3.393, 3.393 max_d=3.393 avg_d=1.696 std_dev=1.696
C4	B	0, 0.000, 1.703, 3.406, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.703 std_dev=1.703
C6	B	0, 0.000, 1.709, 3.417, 3.417 max_d=3.417 avg_d=1.709 std_dev=1.709
C5	B	0, 0.000, 1.769, 3.538, 3.538 max_d=3.538 avg_d=1.769 std_dev=1.769
O4	B	0, 0.000, 1.855, 3.710, 3.710 max_d=3.710 avg_d=1.855 std_dev=1.855
O3'	B	0, 0.000, 2.066, 4.131, 4.131 max_d=4.131 avg_d=2.066 std_dev=2.066
O2'	B	0, 0.000, 2.474, 4.948, 4.948 max_d=4.948 avg_d=2.474 std_dev=2.474

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.07	0.01
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.00	0.05	0.16	0.04	0.19	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.04	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.07	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.14	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.13	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.20	0.10	0.29	0.20
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.06	0.03
C5	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.00	0.00	0.17	0.11	0.28	0.19
C5'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.14	0.00	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.06	0.00	0.02	0.15	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00
C6	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.00	0.01	0.13	0.08	0.22	0.14
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.12	0.04	0.17	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.05	0.19	0.07	0.25	0.17
O2	0.02	0.00	0.13	0.10	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.13	0.00	0.08	0.15	0.02	0.17	0.10
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.05	0.14	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.03	0.08
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.14	0.02	0.15	0.03	0.03	0.13	0.03	0.00	0.05	0.01	0.03	0.20	0.06	0.09
O4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.22	0.11	0.32	0.23
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.02
O5'	0.04	0.16	0.01	0.01	0.20	0.00	0.17	0.00	0.13	0.12	0.19	0.15	0.01	0.03	0.22	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.02	0.04	0.10	0.13	0.10	0.05	0.11	0.06	0.08	0.04	0.07	0.02	0.10	0.20	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.19	0.07	0.08	0.29	0.06	0.28	0.09	0.22	0.17	0.25	0.17	0.03	0.06	0.32	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.12	0.04	0.04	0.20	0.03	0.19	0.00	0.14	0.10	0.17	0.10	0.08	0.09	0.23	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.57	0.26	0.31	0.52	0.18	0.34	0.03	0.26	0.36	0.63	0.70	0.43	0.24	0.58	0.56	0.09	0.07	0.08	0.00
C2	0.28	0.53	0.21	0.27	0.41	0.14	0.23	0.07	0.19	0.33	0.56	0.71	0.32	0.17	0.45	0.49	0.04	0.03	0.02	0.10
C2'	0.05	0.26	0.60	0.61	0.25	0.06	0.07	0.12	0.02	0.05	0.35	0.37	0.82	0.60	0.34	0.28	0.06	0.15	0.14	0.20
C3'	0.18	0.12	0.70	0.69	0.11	0.14	0.07	0.15	0.15	0.08	0.20	0.23	0.93	0.69	0.20	0.17	0.08	0.20	0.21	0.25
C4	0.26	0.48	0.15	0.20	0.28	0.11	0.10	0.16	0.10	0.27	0.45	0.68	0.20	0.07	0.29	0.42	0.15	0.10	0.12	0.18
C4'	0.11	0.39	0.42	0.42	0.37	0.09	0.20	0.01	0.12	0.20	0.47	0.51	0.61	0.38	0.44	0.43	0.10	0.05	0.05	0.03
C5	0.27	0.49	0.16	0.21	0.31	0.14	0.14	0.11	0.12	0.29	0.47	0.69	0.23	0.09	0.32	0.46	0.09	0.05	0.10	0.15
C5'	0.12	0.39	0.35	0.36	0.34	0.12	0.16	0.04	0.10	0.19	0.45	0.53	0.52	0.30	0.40	0.43	0.15	0.10	0.12	0.00
C6	0.28	0.53	0.21	0.25	0.39	0.17	0.22	0.04	0.18	0.32	0.54	0.70	0.32	0.15	0.42	0.51	0.00	0.03	0.02	0.07
N1	0.28	0.55	0.23	0.28	0.44	0.17	0.26	0.03	0.21	0.34	0.58	0.71	0.36	0.19	0.48	0.52	0.01	0.02	0.01	0.06
N3	0.27	0.51	0.17	0.23	0.34	0.12	0.16	0.13	0.13	0.30	0.50	0.70	0.25	0.12	0.36	0.44	0.11	0.08	0.08	0.15
O2	0.28	0.54	0.23	0.28	0.44	0.14	0.25	0.07	0.20	0.34	0.58	0.70	0.35	0.20	0.49	0.50	0.03	0.02	0.01	0.09
O2'	0.05	0.27	0.63	0.64	0.30	0.06	0.12	0.11	0.01	0.07	0.37	0.35	0.87	0.63	0.40	0.30	0.05	0.13	0.11	0.17
O3'	0.41	0.11	0.93	0.89	0.07	0.29	0.24	0.22	0.34	0.30	0.00	0.03	1.22	0.92	0.03	0.02	0.14	0.30	0.34	0.35
O4	0.25	0.44	0.11	0.16	0.20	0.08	0.03	0.22	0.04	0.24	0.39	0.66	0.12	0.01	0.20	0.36	0.22	0.15	0.17	0.23
O4'	0.42	0.70	0.12	0.16	0.64	0.32	0.46	0.15	0.40	0.50	0.75	0.83	0.27	0.08	0.69	0.70	0.23	0.24	0.25	0.15
O5'	0.38	0.67	0.09	0.12	0.61	0.31	0.43	0.18	0.36	0.46	0.73	0.80	0.23	0.05	0.66	0.65	0.28	0.28	0.40	0.20
OP1	0.08	0.31	0.37	0.34	0.32	0.14	0.18	0.12	0.10	0.15	0.39	0.38	0.58	0.30	0.40	0.41	0.24	0.17	0.21	0.09
OP2	0.09	0.35	0.31	0.31	0.35	0.08	0.18	0.04	0.10	0.17	0.44	0.45	0.45	0.26	0.43	0.35	0.15	0.09	0.23	0.03
P	0.21	0.47	0.24	0.25	0.45	0.18	0.29	0.10	0.21	0.28	0.55	0.57	0.39	0.18	0.53	0.48	0.22	0.19	0.30	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.22	0.01	0.24
C2	0.03	0.00	0.11	0.02	0.00	0.19	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.05	0.01	0.27	0.33	0.54	0.38	0.55
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.18	0.02	0.19	0.04	0.03	0.26	0.00	0.02	0.08	0.01	0.15	0.21	0.47	0.15
C3'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.23	0.31	0.53	0.24
C4	0.02	0.00	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.10	0.00	0.03	0.09	0.38	0.31	0.36
C4'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.00	0.16	0.00	0.19	0.01	0.12	0.42	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.13	0.05	0.15
C5	0.00	0.01	0.18	0.05	0.00	0.16	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.12	0.00	0.22	0.11	0.20	0.12	0.18
C5'	0.01	0.24	0.02	0.00	0.04	0.00	0.22	0.00	0.23	0.02	0.16	0.56	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00
C6	0.01	0.00	0.19	0.04	0.00	0.19	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.39	0.13	0.00	0.27	0.15	0.14	0.03	0.14
N1	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.01	0.05	0.29	0.12	0.30
N3	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.12	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.00	0.17	0.29	0.54	0.44	0.53
O2	0.06	0.00	0.26	0.01	0.00	0.42	0.01	0.56	0.01	0.01	0.00	0.00	0.50	0.03	0.00	0.53	0.64	0.75	0.57	0.80
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.14	0.00	0.37	0.02	0.39	0.07	0.10	0.50	0.00	0.01	0.14	0.00	0.19	0.32	0.59	0.22
O3'	0.07	0.05	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.01	0.13	0.08	0.07	0.03	0.01	0.00	0.10	0.04	0.22	0.26	0.48	0.17
O4	0.02	0.01	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.10	0.00	0.02	0.11	0.42	0.38	0.38
O4'	0.00	0.27	0.01	0.00	0.03	0.00	0.22	0.01	0.27	0.01	0.17	0.53	0.00	0.04	0.02	0.00	0.14	0.46	0.28	0.47
O5'	0.02	0.33	0.15	0.23	0.09	0.01	0.11	0.00	0.15	0.05	0.29	0.64	0.19	0.22	0.11	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.22	0.54	0.21	0.31	0.38	0.13	0.20	0.00	0.14	0.29	0.54	0.75	0.32	0.26	0.42	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.38	0.47	0.53	0.31	0.05	0.12	0.06	0.03	0.12	0.44	0.57	0.59	0.48	0.38	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.55	0.15	0.24	0.36	0.15	0.18	0.00	0.14	0.30	0.53	0.80	0.22	0.17	0.38	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00