Doublet Group distance statistics: 48759

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 9, 5, 7, 2, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.027 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.017, 0.049, 0.082, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.049 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.012, 0.105, 0.197, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.105 std_dev=0.092
O4'	A	0, -0.005, 0.150, 0.306, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.150 std_dev=0.155
P	B	0, 0.181, 0.370, 0.559, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.370 std_dev=0.189
C4'	A	0, -0.020, 0.181, 0.383, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.181 std_dev=0.201
OP2	B	0, 0.183, 0.393, 0.602, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.393 std_dev=0.209
OP1	B	0, 0.193, 0.414, 0.635, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.414 std_dev=0.221
O5'	A	0, 0.042, 0.277, 0.512, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.277 std_dev=0.235
C2'	A	0, -0.047, 0.191, 0.429, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.191 std_dev=0.238
O5'	B	0, 0.248, 0.493, 0.737, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.493 std_dev=0.244
C3'	A	0, -0.052, 0.199, 0.449, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.199 std_dev=0.251
P	A	0, 0.120, 0.381, 0.642, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.381 std_dev=0.261
OP2	A	0, 0.132, 0.395, 0.657, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.395 std_dev=0.262
C5'	A	0, 0.009, 0.277, 0.544, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.277 std_dev=0.268
C5'	B	0, 0.233, 0.523, 0.813, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.523 std_dev=0.290
OP1	A	0, 0.183, 0.481, 0.779, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.481 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.288, 0.618, 0.948, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.618 std_dev=0.330
C8	B	0, 0.337, 0.677, 1.017, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.677 std_dev=0.340
O4'	B	0, 0.327, 0.668, 1.009, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.668 std_dev=0.341
C3'	B	0, 0.315, 0.660, 1.005, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.660 std_dev=0.345
N7	B	0, 0.355, 0.709, 1.063, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.709 std_dev=0.354
N9	B	0, 0.378, 0.740, 1.102, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.740 std_dev=0.362
C1'	B	0, 0.372, 0.744, 1.116, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.744 std_dev=0.372
O3'	B	0, 0.309, 0.688, 1.068, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.688 std_dev=0.380
C5	B	0, 0.411, 0.796, 1.182, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.796 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.370, 0.760, 1.150, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.760 std_dev=0.390
C4	B	0, 0.423, 0.820, 1.218, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.820 std_dev=0.397
C6	B	0, 0.450, 0.874, 1.299, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.874 std_dev=0.425
O6	B	0, 0.441, 0.885, 1.330, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.885 std_dev=0.444
N3	B	0, 0.469, 0.914, 1.359, 2.028 max_d=2.028 avg_d=0.914 std_dev=0.445
O2'	B	0, 0.390, 0.838, 1.287, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.838 std_dev=0.448
N1	B	0, 0.500, 0.965, 1.431, 2.035 max_d=2.035 avg_d=0.965 std_dev=0.465
C2	B	0, 0.507, 0.983, 1.459, 2.125 max_d=2.125 avg_d=0.983 std_dev=0.476
O2'	A	0, -0.098, 0.385, 0.869, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.385 std_dev=0.484
O3'	A	0, -0.208, 0.303, 0.813, 2.304 max_d=2.304 avg_d=0.303 std_dev=0.511
N2	B	0, 0.558, 1.088, 1.619, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.088 std_dev=0.531

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.04	0.00	0.11	0.12	0.13	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.02	0.05	0.12	0.12	0.15	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.02	0.10	0.15	0.11	0.02	0.04	0.15	0.00	0.03	0.07	0.02	0.27	0.33	0.31	0.30
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.02	0.13	0.08	0.10	0.05	0.03	0.01	0.14	0.01	0.07	0.13	0.09	0.08
C4	0.03	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.02	0.19	0.11	0.01	0.03	0.16	0.17	0.20	0.16
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.04	0.11	0.04	0.07	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.11	0.01	0.04	0.17	0.17	0.19	0.17
C5'	0.05	0.08	0.15	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.10	0.07	0.07	0.10	0.14	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.13	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.11	0.02	0.05	0.15	0.15	0.16	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.01	0.12	0.12	0.14	0.11
N3	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.14	0.02	0.04	0.14	0.14	0.17	0.13
O2	0.01	0.01	0.15	0.05	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.25	0.03	0.09	0.10	0.12	0.14	0.11
O2'	0.01	0.10	0.00	0.03	0.19	0.11	0.22	0.07	0.20	0.10	0.14	0.16	0.00	0.06	0.22	0.07	0.27	0.37	0.41	0.32
O3'	0.21	0.18	0.03	0.01	0.11	0.04	0.11	0.10	0.11	0.13	0.14	0.25	0.06	0.00	0.12	0.17	0.13	0.25	0.19	0.17
O4	0.04	0.02	0.07	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.03	0.02	0.03	0.22	0.12	0.00	0.04	0.18	0.19	0.22	0.18
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.09	0.07	0.17	0.04	0.00	0.04	0.06	0.10	0.08
O5'	0.11	0.12	0.27	0.07	0.16	0.01	0.17	0.01	0.15	0.12	0.14	0.10	0.27	0.13	0.18	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.12	0.33	0.13	0.17	0.05	0.17	0.05	0.15	0.12	0.14	0.12	0.37	0.25	0.19	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.15	0.31	0.09	0.20	0.03	0.19	0.01	0.16	0.14	0.17	0.14	0.41	0.19	0.22	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.30	0.08	0.16	0.02	0.17	0.01	0.14	0.11	0.13	0.11	0.32	0.17	0.18	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.34	0.19	0.15	0.28	0.18	0.31	0.16	0.38	0.24	0.38	0.35	0.30	0.28	0.25	0.19	0.13	0.24	0.16	0.43	0.21	0.14	0.14
C2	0.22	0.30	0.17	0.13	0.26	0.17	0.29	0.17	0.35	0.23	0.34	0.31	0.27	0.28	0.23	0.17	0.10	0.23	0.17	0.41	0.22	0.14	0.15
C2'	0.36	0.49	0.32	0.27	0.43	0.29	0.45	0.25	0.51	0.38	0.52	0.50	0.44	0.42	0.38	0.32	0.22	0.35	0.25	0.57	0.25	0.24	0.21
C3'	0.30	0.40	0.24	0.19	0.34	0.24	0.36	0.22	0.42	0.31	0.43	0.41	0.35	0.34	0.31	0.24	0.15	0.31	0.22	0.48	0.26	0.22	0.22
C4	0.18	0.26	0.14	0.12	0.23	0.15	0.27	0.16	0.32	0.21	0.31	0.26	0.23	0.27	0.20	0.15	0.10	0.20	0.16	0.39	0.22	0.17	0.14
C4'	0.24	0.36	0.19	0.15	0.30	0.18	0.33	0.16	0.39	0.26	0.40	0.37	0.31	0.30	0.27	0.19	0.12	0.25	0.17	0.45	0.20	0.15	0.14
C5	0.19	0.28	0.14	0.12	0.24	0.16	0.28	0.16	0.34	0.22	0.32	0.28	0.24	0.27	0.21	0.15	0.10	0.21	0.16	0.40	0.22	0.17	0.15
C5'	0.21	0.34	0.17	0.14	0.28	0.14	0.31	0.12	0.38	0.24	0.38	0.35	0.29	0.28	0.24	0.16	0.15	0.21	0.13	0.44	0.16	0.12	0.11
C6	0.20	0.30	0.15	0.12	0.26	0.16	0.30	0.16	0.36	0.23	0.35	0.31	0.26	0.28	0.22	0.16	0.09	0.22	0.16	0.42	0.22	0.16	0.15
N1	0.21	0.32	0.17	0.13	0.27	0.16	0.30	0.16	0.36	0.23	0.36	0.32	0.28	0.28	0.23	0.17	0.10	0.23	0.16	0.42	0.21	0.15	0.14
N3	0.19	0.27	0.14	0.11	0.24	0.15	0.28	0.16	0.33	0.21	0.31	0.27	0.24	0.27	0.21	0.15	0.09	0.21	0.16	0.39	0.22	0.14	0.14
O2	0.25	0.33	0.20	0.16	0.29	0.20	0.31	0.19	0.36	0.26	0.36	0.33	0.29	0.29	0.26	0.20	0.13	0.26	0.19	0.41	0.21	0.16	0.17
O2'	0.32	0.49	0.30	0.25	0.40	0.25	0.43	0.22	0.51	0.32	0.53	0.51	0.43	0.38	0.34	0.31	0.22	0.30	0.22	0.57	0.24	0.22	0.20
O3'	0.22	0.36	0.19	0.16	0.28	0.16	0.30	0.14	0.38	0.23	0.40	0.38	0.31	0.26	0.23	0.19	0.18	0.22	0.14	0.43	0.16	0.13	0.12
O4	0.18	0.25	0.15	0.14	0.22	0.16	0.27	0.17	0.32	0.21	0.30	0.25	0.22	0.27	0.19	0.16	0.13	0.19	0.16	0.38	0.22	0.19	0.15
O4'	0.21	0.32	0.17	0.14	0.26	0.15	0.29	0.14	0.35	0.23	0.36	0.33	0.28	0.26	0.23	0.16	0.14	0.21	0.14	0.41	0.18	0.12	0.12
O5'	0.18	0.31	0.15	0.13	0.25	0.11	0.29	0.10	0.36	0.21	0.36	0.32	0.26	0.26	0.21	0.14	0.15	0.18	0.11	0.42	0.15	0.12	0.10
OP1	0.16	0.31	0.14	0.12	0.24	0.09	0.28	0.09	0.35	0.20	0.35	0.32	0.25	0.25	0.20	0.13	0.15	0.15	0.10	0.42	0.14	0.12	0.09
OP2	0.14	0.26	0.13	0.13	0.21	0.09	0.26	0.10	0.32	0.18	0.31	0.27	0.22	0.24	0.17	0.12	0.17	0.12	0.10	0.39	0.14	0.13	0.10
P	0.15	0.29	0.12	0.11	0.23	0.08	0.27	0.08	0.34	0.19	0.34	0.30	0.24	0.25	0.18	0.11	0.14	0.14	0.09	0.41	0.14	0.11	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.05
C2	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.08	0.02	0.10	0.14	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.08	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.10	0.08	0.04
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.09	0.07	0.09	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.13	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.08	0.01	0.09	0.12	0.09
C4'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.06	0.04	0.08	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.12	0.01	0.14	0.17	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.10	0.11	0.07	0.05	0.04	0.13	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.13	0.01	0.16	0.20	0.16
C8	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.11	0.03	0.12	0.12	0.11
N1	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.11	0.02	0.13	0.18	0.14
N2	0.05	0.01	0.08	0.09	0.02	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.12	0.05	0.08	0.04	0.09	0.14	0.10
N3	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.09	0.03	0.07	0.02	0.08	0.12	0.08
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.14	0.03	0.16	0.17	0.16
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.10	0.07
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.07	0.03	0.09	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.06	0.10	0.06	0.04
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.08	0.10	0.09	0.12	0.09	0.10	0.04	0.03	0.00	0.01	0.08	0.09	0.19	0.15	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.04	0.05	0.10	0.08
O5'	0.03	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.12	0.01	0.13	0.11	0.11	0.08	0.07	0.14	0.07	0.04	0.08	0.05	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.09	0.04	0.16	0.00	0.21	0.24	0.21
OP1	0.05	0.10	0.10	0.13	0.09	0.07	0.14	0.05	0.16	0.12	0.13	0.09	0.08	0.16	0.07	0.10	0.19	0.05	0.02	0.21	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.14	0.08	0.10	0.12	0.04	0.17	0.02	0.20	0.12	0.18	0.14	0.12	0.17	0.10	0.06	0.15	0.10	0.02	0.24	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.04	0.07	0.09	0.01	0.14	0.01	0.16	0.11	0.14	0.10	0.08	0.16	0.07	0.04	0.11	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00