Doublet Group distance statistics: 48760

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 4, 6, 7, 3, 2, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.007, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O4	A	0, 0.017, 0.054, 0.092, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.054 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.031, 0.088, 0.146, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.088 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.036, 0.105, 0.173, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.105 std_dev=0.068
C4'	A	0, 0.028, 0.168, 0.308, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.168 std_dev=0.140
OP2	B	0, 0.116, 0.268, 0.419, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.268 std_dev=0.152
P	B	0, 0.099, 0.319, 0.539, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.319 std_dev=0.220
C5'	A	0, 0.043, 0.264, 0.485, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.264 std_dev=0.221
OP1	B	0, 0.176, 0.417, 0.659, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.417 std_dev=0.242
O2'	A	0, -0.097, 0.163, 0.423, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.163 std_dev=0.260
C3'	A	0, -0.071, 0.224, 0.520, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.224 std_dev=0.296
OP1	A	0, 0.070, 0.417, 0.764, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.417 std_dev=0.347
O5'	A	0, -0.043, 0.311, 0.665, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.311 std_dev=0.354
O5'	B	0, -0.137, 0.357, 0.851, 2.801 max_d=2.801 avg_d=0.357 std_dev=0.494
P	A	0, -0.135, 0.410, 0.954, 3.017 max_d=3.017 avg_d=0.410 std_dev=0.544
O3'	A	0, -0.205, 0.365, 0.935, 3.281 max_d=3.281 avg_d=0.365 std_dev=0.570
C5'	B	0, -0.278, 0.480, 1.238, 4.352 max_d=4.352 avg_d=0.480 std_dev=0.758
C8	B	0, -0.276, 0.573, 1.422, 4.952 max_d=4.952 avg_d=0.573 std_dev=0.849
OP2	A	0, -0.360, 0.505, 1.370, 4.872 max_d=4.872 avg_d=0.505 std_dev=0.865
O4'	B	0, -0.531, 0.482, 1.496, 5.788 max_d=5.788 avg_d=0.482 std_dev=1.014
N7	B	0, -0.385, 0.675, 1.734, 6.175 max_d=6.175 avg_d=0.675 std_dev=1.060
N9	B	0, -0.576, 0.600, 1.776, 6.765 max_d=6.765 avg_d=0.600 std_dev=1.176
C4'	B	0, -0.649, 0.530, 1.709, 6.706 max_d=6.706 avg_d=0.530 std_dev=1.179
C1'	B	0, -0.765, 0.571, 1.908, 7.604 max_d=7.604 avg_d=0.571 std_dev=1.337
C5	B	0, -0.652, 0.742, 2.135, 8.046 max_d=8.046 avg_d=0.742 std_dev=1.393
C4	B	0, -0.783, 0.704, 2.192, 8.525 max_d=8.525 avg_d=0.704 std_dev=1.487
C3'	B	0, -0.872, 0.664, 2.200, 8.734 max_d=8.734 avg_d=0.664 std_dev=1.536
C6	B	0, -0.869, 0.863, 2.594, 9.962 max_d=9.962 avg_d=0.863 std_dev=1.732
C2'	B	0, -1.077, 0.691, 2.459, 10.006 max_d=10.006 avg_d=0.691 std_dev=1.768
O6	B	0, -0.905, 0.944, 2.792, 10.649 max_d=10.649 avg_d=0.944 std_dev=1.848
O3'	B	0, -1.111, 0.752, 2.615, 10.544 max_d=10.544 avg_d=0.752 std_dev=1.863
N3	B	0, -1.113, 0.782, 2.678, 10.771 max_d=10.771 avg_d=0.782 std_dev=1.895
N1	B	0, -1.128, 0.913, 2.955, 11.662 max_d=11.662 avg_d=0.913 std_dev=2.041
O2'	B	0, -1.380, 0.739, 2.858, 11.917 max_d=11.917 avg_d=0.739 std_dev=2.119
C2	B	0, -1.244, 0.880, 3.004, 12.072 max_d=12.072 avg_d=0.880 std_dev=2.124
N2	B	0, -1.547, 0.983, 3.512, 14.327 max_d=14.327 avg_d=0.983 std_dev=2.530

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.01	0.00	0.04	0.12	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.10	0.01	0.02	0.07	0.17	0.29	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.05	0.02	0.03	0.06	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.16	0.12	0.17
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.17	0.00	0.20	0.01	0.19	0.10	0.11	0.05	0.02	0.01	0.18	0.01	0.04	0.13	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.00	0.01	0.18	0.18	0.57	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.05	0.02	0.12	0.02	0.09	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.01	0.01	0.22	0.16	0.59	0.26
C5'	0.02	0.04	0.07	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.11	0.05	0.07	0.03	0.05	0.08	0.13	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.19	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.01	0.18	0.14	0.43	0.18
N1	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.01	0.08	0.15	0.26	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.06	0.01	0.02	0.11	0.18	0.43	0.13
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.19	0.01	0.03	0.06	0.18	0.20	0.06
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.15	0.12	0.09	0.05	0.06	0.09	0.18	0.22	0.00	0.05	0.16	0.09	0.10	0.10	0.12	0.13
O3'	0.13	0.10	0.02	0.01	0.08	0.02	0.13	0.08	0.11	0.05	0.06	0.19	0.05	0.00	0.09	0.10	0.11	0.30	0.10	0.14
O4	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.09	0.00	0.02	0.20	0.19	0.64	0.25
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.10	0.02	0.00	0.03	0.09	0.07	0.05
O5'	0.04	0.07	0.15	0.04	0.18	0.01	0.22	0.01	0.18	0.08	0.11	0.06	0.10	0.11	0.20	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.17	0.16	0.13	0.18	0.06	0.16	0.08	0.14	0.15	0.18	0.18	0.10	0.30	0.19	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.29	0.12	0.07	0.57	0.11	0.59	0.18	0.43	0.26	0.43	0.20	0.12	0.10	0.64	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.17	0.04	0.21	0.01	0.26	0.01	0.18	0.08	0.13	0.06	0.13	0.14	0.25	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.76	0.28	0.81	0.66	0.24	0.79	0.19	0.52	0.32	0.09	0.11	0.41	0.45	0.37	0.34	1.16	0.76	0.77	0.36	0.60	0.15	0.11	0.12
C2	0.41	0.18	0.40	0.32	0.16	0.56	0.43	0.40	0.56	0.26	0.40	0.13	0.11	0.54	0.11	0.70	0.42	0.53	0.32	0.75	0.11	0.10	0.10
C2'	0.82	0.35	0.91	0.74	0.28	0.85	0.16	0.56	0.31	0.08	0.09	0.50	0.53	0.35	0.38	1.33	0.88	0.80	0.40	0.61	0.12	0.10	0.11
C3'	0.81	0.40	0.89	0.71	0.31	0.80	0.14	0.51	0.28	0.08	0.09	0.59	0.57	0.35	0.39	1.30	0.85	0.76	0.36	0.60	0.12	0.10	0.11
C4	0.17	0.78	0.28	0.30	0.66	0.14	0.90	0.14	1.05	0.60	0.97	0.74	0.61	0.88	0.46	0.16	0.25	0.16	0.11	1.19	0.09	0.08	0.07
C4'	0.82	0.45	0.88	0.70	0.35	0.78	0.12	0.51	0.26	0.08	0.11	0.63	0.62	0.33	0.42	1.25	0.81	0.76	0.33	0.59	0.16	0.11	0.11
C5	0.13	0.73	0.19	0.20	0.62	0.19	0.92	0.17	1.12	0.58	0.98	0.67	0.54	0.93	0.40	0.21	0.15	0.21	0.11	1.32	0.09	0.09	0.07
C5'	0.77	0.37	0.79	0.62	0.30	0.73	0.17	0.50	0.34	0.10	0.12	0.55	0.55	0.34	0.39	1.13	0.71	0.74	0.33	0.69	0.19	0.12	0.13
C6	0.27	0.40	0.22	0.16	0.34	0.39	0.69	0.28	0.87	0.42	0.68	0.32	0.22	0.77	0.17	0.51	0.22	0.40	0.18	1.12	0.10	0.09	0.07
N1	0.48	0.14	0.47	0.37	0.12	0.58	0.44	0.40	0.59	0.25	0.39	0.12	0.13	0.57	0.11	0.79	0.46	0.57	0.28	0.83	0.12	0.10	0.09
N3	0.16	0.48	0.13	0.12	0.41	0.30	0.65	0.23	0.78	0.43	0.68	0.44	0.33	0.69	0.26	0.34	0.13	0.29	0.19	0.93	0.08	0.08	0.06
O2	0.58	0.15	0.62	0.54	0.16	0.74	0.26	0.53	0.36	0.18	0.22	0.20	0.26	0.38	0.24	0.93	0.66	0.66	0.44	0.55	0.15	0.13	0.16
O2'	0.92	0.58	1.06	0.83	0.45	0.88	0.10	0.52	0.12	0.12	0.24	0.76	0.73	0.23	0.50	1.52	0.99	0.82	0.31	0.38	0.15	0.22	0.12
O3'	0.65	0.40	0.79	0.58	0.23	0.61	0.22	0.29	0.32	0.21	0.09	0.62	0.53	0.48	0.26	1.22	0.75	0.55	0.16	0.63	0.20	0.19	0.18
O4	0.37	1.03	0.55	0.55	0.86	0.20	1.03	0.16	1.18	0.69	1.17	1.02	0.86	0.93	0.64	0.33	0.52	0.16	0.14	1.26	0.12	0.10	0.11
O4'	0.78	0.34	0.80	0.64	0.28	0.75	0.16	0.50	0.30	0.08	0.09	0.48	0.51	0.36	0.38	1.13	0.73	0.75	0.32	0.61	0.18	0.12	0.12
O5'	0.69	0.20	0.66	0.52	0.19	0.69	0.27	0.50	0.48	0.10	0.25	0.33	0.38	0.40	0.31	0.99	0.59	0.72	0.36	0.82	0.21	0.14	0.16
OP1	0.36	0.31	0.32	0.20	0.24	0.39	0.61	0.25	0.86	0.34	0.65	0.24	0.17	0.68	0.12	0.63	0.26	0.42	0.13	1.22	0.13	0.22	0.16
OP2	0.73	0.15	0.68	0.59	0.20	0.81	0.21	0.68	0.46	0.12	0.29	0.24	0.34	0.27	0.37	0.98	0.65	0.83	0.58	0.81	0.48	0.42	0.42
P	0.64	0.15	0.58	0.45	0.15	0.66	0.29	0.50	0.52	0.08	0.32	0.25	0.31	0.37	0.28	0.89	0.51	0.70	0.36	0.87	0.23	0.15	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.07	0.19	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02	0.25	0.01	0.15	0.53	0.31
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.03	0.12	0.26	0.13
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.06	0.04	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.13	0.07	0.15	0.30	0.14
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.25	0.01	0.11	0.46	0.28
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.05	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.29	0.01	0.12	0.55	0.34
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.04	0.04	0.02	0.09	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.31	0.00	0.13	0.62	0.37
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.26	0.01	0.10	0.41	0.27
N1	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.29	0.00	0.15	0.60	0.36
N2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.03	0.24	0.01	0.18	0.53	0.31
N3	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02	0.22	0.01	0.13	0.45	0.26
N7	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.30	0.01	0.11	0.53	0.34
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.22	0.01	0.09	0.36	0.22
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.10	0.10	0.05
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.03	0.07	0.11	0.04	0.09	0.05	0.11	0.05	0.03	0.00	0.01	0.06	0.09	0.18	0.24	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.06	0.05
O5'	0.11	0.25	0.11	0.13	0.25	0.01	0.29	0.00	0.31	0.26	0.29	0.24	0.22	0.30	0.22	0.05	0.06	0.07	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.33	0.00	0.14	0.66	0.40
OP1	0.07	0.15	0.12	0.15	0.11	0.07	0.12	0.07	0.13	0.10	0.15	0.18	0.13	0.11	0.09	0.10	0.18	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.53	0.26	0.30	0.46	0.05	0.55	0.03	0.62	0.41	0.60	0.53	0.45	0.53	0.36	0.10	0.24	0.06	0.01	0.66	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.31	0.13	0.14	0.28	0.02	0.34	0.01	0.37	0.27	0.36	0.31	0.26	0.34	0.22	0.05	0.09	0.05	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00