Doublet Group distance statistics: 48769

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.007, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.007, 0.012, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.018 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.023, 0.039, 0.055, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.039 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.011, 0.066, 0.120, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.066 std_dev=0.054
P	B	0, 0.144, 0.437, 0.731, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.437 std_dev=0.293
OP1	B	0, 0.153, 0.485, 0.817, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.485 std_dev=0.332
O4'	A	0, 0.395, 0.819, 1.243, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.819 std_dev=0.424
P	A	0, 0.353, 0.813, 1.273, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.813 std_dev=0.460
C2'	A	0, 0.435, 0.907, 1.379, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.907 std_dev=0.472
O5'	A	0, 0.542, 1.157, 1.772, 1.708 max_d=1.708 avg_d=1.157 std_dev=0.615
C4'	A	0, 0.615, 1.253, 1.891, 1.749 max_d=1.749 avg_d=1.253 std_dev=0.638
C3'	A	0, 0.671, 1.360, 2.048, 1.847 max_d=1.847 avg_d=1.360 std_dev=0.688
O2'	A	0, 0.651, 1.367, 2.082, 1.881 max_d=1.881 avg_d=1.367 std_dev=0.716
O5'	B	0, 0.659, 1.412, 2.164, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.412 std_dev=0.752
C5'	A	0, 0.742, 1.543, 2.344, 2.231 max_d=2.231 avg_d=1.543 std_dev=0.801
OP1	A	0, 0.808, 1.656, 2.505, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.656 std_dev=0.848
OP2	B	0, 0.783, 1.640, 2.497, 2.427 max_d=2.427 avg_d=1.640 std_dev=0.857
O3'	A	0, 1.021, 2.057, 3.093, 2.691 max_d=2.691 avg_d=2.057 std_dev=1.036
OP2	A	0, 0.867, 1.929, 2.991, 3.158 max_d=3.158 avg_d=1.929 std_dev=1.062
C5'	B	0, 1.381, 2.890, 4.400, 4.204 max_d=4.204 avg_d=2.890 std_dev=1.509
C8	B	0, 1.644, 3.393, 5.143, 4.768 max_d=4.768 avg_d=3.393 std_dev=1.750
N7	B	0, 1.678, 3.458, 5.238, 4.782 max_d=4.782 avg_d=3.458 std_dev=1.780
C5	B	0, 1.699, 3.626, 5.553, 5.104 max_d=5.104 avg_d=3.626 std_dev=1.927
C6	B	0, 1.756, 3.762, 5.769, 5.402 max_d=5.402 avg_d=3.762 std_dev=2.007
O4'	B	0, 1.853, 3.879, 5.904, 5.629 max_d=5.629 avg_d=3.879 std_dev=2.026
N9	B	0, 1.864, 3.962, 6.060, 5.736 max_d=5.736 avg_d=3.962 std_dev=2.098
O6	B	0, 1.852, 3.951, 6.050, 5.745 max_d=5.745 avg_d=3.951 std_dev=2.099
C4'	B	0, 1.890, 3.991, 6.093, 5.719 max_d=5.719 avg_d=3.991 std_dev=2.101
C4	B	0, 1.908, 4.066, 6.225, 5.900 max_d=5.900 avg_d=4.066 std_dev=2.158
N1	B	0, 1.950, 4.124, 6.298, 5.914 max_d=5.914 avg_d=4.124 std_dev=2.174
C2	B	0, 2.266, 4.731, 7.197, 6.852 max_d=6.852 avg_d=4.731 std_dev=2.465
C1'	B	0, 2.236, 4.748, 7.260, 6.796 max_d=6.796 avg_d=4.748 std_dev=2.512
N3	B	0, 2.302, 4.823, 7.344, 6.972 max_d=6.972 avg_d=4.823 std_dev=2.521
C3'	B	0, 2.219, 4.741, 7.263, 6.660 max_d=6.660 avg_d=4.741 std_dev=2.522
N2	B	0, 2.670, 5.487, 8.305, 7.894 max_d=7.894 avg_d=5.487 std_dev=2.817
O3'	B	0, 2.662, 5.652, 8.641, 7.778 max_d=7.778 avg_d=5.652 std_dev=2.990
C2'	B	0, 2.709, 5.797, 8.885, 8.063 max_d=8.063 avg_d=5.797 std_dev=3.088
O2'	B	0, 3.675, 7.871, 12.067, 10.768 max_d=10.768 avg_d=7.871 std_dev=4.196

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.20	0.00	0.00	0.17	0.46	0.06	0.20
C2	0.01	0.00	0.15	0.18	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.07	0.15	0.57	0.10	0.18
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.00	0.10	0.16	0.13	0.01	0.10	0.26	0.00	0.01	0.03	0.01	0.35	0.73	0.26	0.49
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.21	0.00	0.17	0.01	0.13	0.13	0.21	0.17	0.01	0.00	0.22	0.01	0.04	0.29	0.06	0.16
C4	0.00	0.01	0.02	0.21	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.08	0.00	0.02	0.15	0.67	0.17	0.17
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.02	0.18	0.01	0.03	0.00	0.01	0.19	0.10	0.06
C5	0.00	0.01	0.10	0.17	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.08	0.01	0.05	0.16	0.66	0.16	0.17
C5'	0.08	0.09	0.16	0.01	0.12	0.00	0.13	0.00	0.12	0.10	0.11	0.07	0.03	0.17	0.13	0.00	0.01	0.26	0.22	0.01
C6	0.00	0.01	0.13	0.13	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.03	0.01	0.07	0.18	0.60	0.10	0.19
N1	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00	0.01	0.17	0.55	0.07	0.19
N3	0.01	0.00	0.10	0.21	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.04	0.00	0.05	0.15	0.63	0.14	0.17
O2	0.02	0.01	0.26	0.17	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.11	0.01	0.10	0.13	0.53	0.09	0.17
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.20	0.18	0.25	0.03	0.23	0.11	0.11	0.14	0.00	0.03	0.22	0.11	0.28	0.77	0.28	0.48
O3'	0.20	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.17	0.03	0.06	0.04	0.11	0.03	0.00	0.09	0.16	0.18	0.37	0.23	0.17
O4	0.00	0.01	0.03	0.22	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.09	0.00	0.02	0.15	0.71	0.19	0.17
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.05	0.10	0.11	0.16	0.02	0.00	0.03	0.18	0.09	0.07
O5'	0.17	0.15	0.35	0.04	0.15	0.01	0.16	0.01	0.18	0.17	0.15	0.13	0.28	0.18	0.15	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.46	0.57	0.73	0.29	0.67	0.19	0.66	0.26	0.60	0.55	0.63	0.53	0.77	0.37	0.71	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.10	0.26	0.06	0.17	0.10	0.16	0.22	0.10	0.07	0.14	0.09	0.28	0.23	0.19	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.18	0.49	0.16	0.17	0.06	0.17	0.01	0.19	0.19	0.17	0.17	0.48	0.17	0.17	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.52	0.69	0.63	0.60	0.79	0.43	1.03	0.49	1.08	1.02	0.90	0.55	0.60	1.17	0.77	0.75	0.89	0.44	0.06	1.24	0.03	0.24	0.03
C2	0.54	0.67	0.56	0.58	0.77	0.47	0.99	0.53	1.02	1.00	0.86	0.55	0.60	1.13	0.77	0.67	0.85	0.49	0.12	1.15	0.04	0.19	0.05
C2'	0.34	0.51	0.39	0.38	0.59	0.30	0.81	0.37	0.86	0.79	0.70	0.40	0.43	0.93	0.57	0.51	0.67	0.31	0.17	1.01	0.16	0.05	0.21
C3'	0.50	0.73	0.61	0.57	0.78	0.41	1.00	0.42	1.07	0.94	0.93	0.63	0.63	1.10	0.73	0.75	0.91	0.41	0.10	1.23	0.19	0.05	0.19
C4	0.93	0.87	1.00	1.03	0.96	0.93	1.06	0.88	1.04	1.12	0.95	0.79	0.86	1.14	1.01	1.29	1.40	0.87	0.32	1.09	0.15	0.17	0.14
C4'	0.81	1.04	1.01	0.92	1.10	0.67	1.32	0.66	1.39	1.26	1.25	0.93	0.94	1.42	1.06	1.18	1.26	0.66	0.17	1.54	0.05	0.29	0.07
C5	1.03	0.96	1.18	1.17	1.05	1.00	1.14	0.91	1.13	1.19	1.04	0.88	0.95	1.21	1.09	1.52	1.58	0.92	0.31	1.17	0.13	0.14	0.13
C5'	1.14	1.32	1.38	1.26	1.36	0.99	1.53	0.91	1.59	1.48	1.48	1.22	1.24	1.60	1.32	1.64	1.64	0.95	0.37	1.71	0.15	0.35	0.20
C6	0.89	0.90	1.05	1.03	1.00	0.83	1.13	0.78	1.14	1.16	1.03	0.80	0.87	1.23	1.02	1.33	1.42	0.77	0.22	1.22	0.09	0.11	0.09
N1	0.66	0.76	0.76	0.75	0.86	0.59	1.06	0.61	1.09	1.07	0.94	0.64	0.70	1.18	0.86	0.94	1.08	0.57	0.12	1.21	0.04	0.17	0.04
N3	0.67	0.73	0.68	0.73	0.83	0.64	0.99	0.67	1.00	1.03	0.87	0.62	0.68	1.11	0.84	0.85	1.03	0.64	0.20	1.10	0.08	0.11	0.08
O2	0.34	0.56	0.32	0.33	0.65	0.28	0.91	0.36	0.97	0.90	0.78	0.44	0.47	1.08	0.62	0.33	0.50	0.33	0.15	1.14	0.09	0.30	0.08
O2'	0.21	0.33	0.20	0.20	0.44	0.21	0.69	0.35	0.74	0.71	0.54	0.24	0.27	0.86	0.43	0.21	0.36	0.23	0.19	0.92	0.11	0.22	0.14
O3'	0.64	0.96	0.72	0.69	1.00	0.54	1.25	0.57	1.35	1.16	1.19	0.84	0.83	1.36	0.93	0.79	0.99	0.56	0.15	1.53	0.06	0.33	0.07
O4	1.01	0.87	1.04	1.09	0.96	1.04	1.01	0.97	0.98	1.09	0.91	0.80	0.88	1.07	1.02	1.37	1.42	0.97	0.40	0.99	0.20	0.31	0.20
O4'	0.85	1.04	1.05	0.98	1.13	0.70	1.36	0.70	1.42	1.33	1.25	0.91	0.95	1.48	1.10	1.21	1.30	0.69	0.24	1.57	0.11	0.40	0.16
O5'	1.21	1.30	1.43	1.33	1.35	1.10	1.48	1.00	1.52	1.46	1.43	1.22	1.25	1.54	1.34	1.74	1.75	1.04	0.42	1.61	0.16	0.27	0.22
OP1	1.62	1.59	1.80	1.71	1.68	1.56	1.79	1.50	1.79	1.82	1.70	1.50	1.57	1.86	1.70	2.16	2.10	1.50	0.87	1.86	0.66	0.67	0.70
OP2	1.34	1.41	1.62	1.47	1.39	1.19	1.43	0.95	1.46	1.38	1.45	1.40	1.38	1.42	1.37	2.08	1.97	1.11	0.33	1.49	0.13	0.13	0.08
P	1.27	1.30	1.52	1.40	1.35	1.17	1.45	1.04	1.47	1.44	1.40	1.23	1.27	1.50	1.35	1.90	1.84	1.09	0.44	1.53	0.17	0.21	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.24	0.01	0.25	0.05	0.16
C2	0.01	0.00	0.25	0.17	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.18	0.17	0.39	0.00	0.39	0.41	0.39
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.13	0.11	0.12	0.19	0.30	0.24	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.08	0.09	0.23	0.13
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.19	0.00	0.27	0.01	0.28	0.26	0.23	0.13	0.13	0.30	0.17	0.01	0.00	0.02	0.06	0.31	0.17	0.08	0.07
C4	0.01	0.00	0.13	0.19	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.09	0.09	0.51	0.01	0.50	0.44	0.47
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.06	0.18	0.03	0.12	0.08	0.17	0.07	0.24	0.02	0.00	0.01	0.09	0.15	0.18	0.02
C5	0.00	0.00	0.07	0.27	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.06	0.03	0.71	0.01	0.71	0.69	0.69
C5'	0.05	0.09	0.13	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.06	0.17	0.04	0.14	0.10	0.17	0.04	0.10	0.15	0.00	0.00	0.10	0.24	0.32	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.28	0.00	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.07	0.06	0.70	0.00	0.72	0.75	0.72
C8	0.00	0.01	0.12	0.26	0.00	0.18	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.12	0.12	0.81	0.01	0.76	0.63	0.73
N1	0.01	0.00	0.19	0.23	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.13	0.55	0.00	0.56	0.60	0.56
N2	0.01	0.00	0.30	0.13	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.25	0.21	0.28	0.01	0.27	0.32	0.28
N3	0.01	0.00	0.24	0.13	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.22	0.17	0.33	0.01	0.32	0.30	0.31
N7	0.00	0.00	0.06	0.30	0.00	0.17	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.15	0.07	0.87	0.01	0.87	0.83	0.85
N9	0.00	0.01	0.01	0.17	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.06	0.01	0.53	0.01	0.50	0.36	0.45
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.11	0.24	0.23	0.10	0.21	0.33	0.10	0.16	0.08	0.34	0.17	0.00	0.05	0.16	0.10	0.27	0.18	0.21	0.08
O3'	0.24	0.18	0.03	0.00	0.09	0.02	0.06	0.15	0.07	0.12	0.09	0.25	0.22	0.15	0.06	0.05	0.00	0.15	0.10	0.11	0.35	0.12	0.10
O4'	0.00	0.17	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.12	0.13	0.21	0.17	0.07	0.01	0.16	0.15	0.00	0.26	0.04	0.28	0.03	0.22
O5'	0.24	0.39	0.04	0.06	0.51	0.01	0.71	0.00	0.70	0.81	0.55	0.28	0.33	0.87	0.53	0.10	0.10	0.26	0.00	0.80	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.08	0.31	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.11	0.04	0.80	0.00	0.84	0.90	0.84
OP1	0.25	0.39	0.09	0.17	0.50	0.15	0.71	0.24	0.72	0.76	0.56	0.27	0.32	0.87	0.50	0.18	0.35	0.28	0.01	0.84	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.41	0.23	0.08	0.44	0.18	0.69	0.32	0.75	0.63	0.60	0.32	0.30	0.83	0.36	0.21	0.12	0.03	0.01	0.90	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.39	0.13	0.07	0.47	0.02	0.69	0.01	0.72	0.73	0.56	0.28	0.31	0.85	0.45	0.08	0.10	0.22	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00