Doublet Group distance statistics: 48797

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 2, 5, 2, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N1	A	0, -0.002, 0.006, 0.013, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C6	A	0, -0.001, 0.006, 0.014, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C2	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C4	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.008 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.015 std_dev=0.015
O4	A	0, -0.004, 0.038, 0.081, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.038 std_dev=0.043
P	B	0, 0.160, 0.341, 0.521, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.341 std_dev=0.181
C2'	A	0, -0.096, 0.090, 0.276, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.090 std_dev=0.186
O5'	B	0, 0.164, 0.353, 0.542, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.353 std_dev=0.189
O4'	A	0, -0.103, 0.095, 0.293, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.095 std_dev=0.198
C5'	B	0, 0.177, 0.382, 0.586, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.382 std_dev=0.205
OP1	B	0, 0.199, 0.408, 0.616, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.408 std_dev=0.208
O2'	A	0, -0.113, 0.115, 0.343, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.115 std_dev=0.228
C4'	B	0, 0.178, 0.422, 0.666, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.422 std_dev=0.244
OP2	B	0, 0.087, 0.337, 0.587, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.337 std_dev=0.250
C3'	B	0, 0.186, 0.460, 0.734, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.460 std_dev=0.274
O4'	B	0, 0.117, 0.397, 0.677, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.397 std_dev=0.280
C3'	A	0, -0.160, 0.150, 0.460, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.150 std_dev=0.310
C2'	B	0, 0.149, 0.473, 0.796, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.473 std_dev=0.324
C1'	B	0, 0.100, 0.431, 0.763, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.431 std_dev=0.332
C4'	A	0, -0.178, 0.155, 0.487, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.155 std_dev=0.332
O3'	B	0, 0.218, 0.560, 0.902, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.560 std_dev=0.342
O3'	A	0, -0.166, 0.195, 0.557, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.195 std_dev=0.361
N1	B	0, 0.045, 0.422, 0.799, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.422 std_dev=0.377
O2'	B	0, 0.161, 0.564, 0.968, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.564 std_dev=0.404
C6	B	0, -0.014, 0.402, 0.817, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.402 std_dev=0.415
C2	B	0, 0.004, 0.481, 0.959, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.481 std_dev=0.478
O2	B	0, 0.000, 0.544, 1.089, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.544 std_dev=0.545
C5	B	0, -0.111, 0.435, 0.980, 2.290 max_d=2.290 avg_d=0.435 std_dev=0.545
N3	B	0, -0.052, 0.501, 1.055, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.501 std_dev=0.553
C4	B	0, -0.100, 0.483, 1.066, 2.291 max_d=2.291 avg_d=0.483 std_dev=0.583
C5'	A	0, -0.315, 0.272, 0.858, 2.724 max_d=2.724 avg_d=0.272 std_dev=0.587
O5'	A	0, -0.341, 0.317, 0.975, 3.073 max_d=3.073 avg_d=0.317 std_dev=0.658
N4	B	0, -0.160, 0.540, 1.240, 2.902 max_d=2.902 avg_d=0.540 std_dev=0.700
P	A	0, -0.448, 0.441, 1.331, 4.160 max_d=4.160 avg_d=0.441 std_dev=0.890
OP1	A	0, -0.427, 0.592, 1.611, 4.808 max_d=4.808 avg_d=0.592 std_dev=1.019
OP2	A	0, -0.818, 0.618, 2.055, 6.630 max_d=6.630 avg_d=0.618 std_dev=1.436

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.09	0.04
C2	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.05	0.10	0.16	0.28	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.07	0.02
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.08	0.07	0.11	0.09	0.01	0.00	0.12	0.01	0.02	0.09	0.06	0.03
C4	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.00	0.02	0.23	0.16	0.63	0.30
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.11	0.04	0.03	0.06	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.11	0.11	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.00	0.06	0.28	0.13	0.70	0.35
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.16	0.00	0.22	0.00	0.20	0.08	0.08	0.06	0.05	0.02	0.17	0.00	0.01	0.17	0.21	0.00
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.06	0.00	0.07	0.24	0.10	0.54	0.28
N1	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.12	0.12	0.30	0.14
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.16	0.17	0.44	0.20
O2	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.09	0.04	0.18	0.14	0.05
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.09	0.05	0.10	0.05	0.09	0.05	0.05	0.06	0.00	0.04	0.10	0.05	0.03	0.09	0.04	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.02	0.06	0.05	0.11	0.08	0.04	0.00	0.12	0.01	0.05	0.25	0.10	0.06
O4	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.00	0.02	0.26	0.16	0.72	0.34
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.03	0.09	0.05	0.01	0.02	0.00	0.03	0.09	0.08	0.03
O5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.23	0.01	0.28	0.01	0.24	0.12	0.16	0.04	0.03	0.05	0.26	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.16	0.05	0.09	0.16	0.11	0.13	0.17	0.10	0.12	0.17	0.18	0.09	0.25	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.28	0.07	0.06	0.63	0.11	0.70	0.21	0.54	0.30	0.44	0.14	0.04	0.10	0.72	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.12	0.02	0.03	0.30	0.01	0.35	0.00	0.28	0.14	0.20	0.05	0.03	0.06	0.34	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.33	0.13	0.12	0.44	0.06	0.40	0.10	0.30	0.28	0.40	0.50	0.31	0.13	0.20	0.17	0.11	0.20	0.23	0.15
C2	0.21	0.30	0.17	0.15	0.38	0.10	0.38	0.11	0.32	0.28	0.35	0.41	0.27	0.15	0.20	0.17	0.10	0.19	0.18	0.12
C2'	0.35	0.46	0.23	0.13	0.50	0.17	0.43	0.12	0.37	0.40	0.50	0.52	0.46	0.26	0.13	0.33	0.21	0.13	0.17	0.13
C3'	0.23	0.33	0.15	0.16	0.38	0.08	0.32	0.09	0.26	0.27	0.37	0.44	0.32	0.15	0.24	0.21	0.16	0.12	0.15	0.11
C4	0.22	0.30	0.19	0.19	0.39	0.16	0.38	0.16	0.32	0.28	0.35	0.43	0.27	0.18	0.24	0.19	0.14	0.18	0.08	0.08
C4'	0.14	0.20	0.25	0.33	0.29	0.21	0.23	0.24	0.15	0.16	0.26	0.40	0.21	0.24	0.44	0.10	0.14	0.23	0.24	0.18
C5	0.21	0.31	0.17	0.17	0.42	0.13	0.40	0.14	0.32	0.28	0.37	0.48	0.27	0.16	0.25	0.17	0.12	0.18	0.07	0.07
C5'	0.20	0.20	0.37	0.45	0.24	0.29	0.19	0.29	0.13	0.17	0.22	0.34	0.23	0.38	0.58	0.15	0.16	0.23	0.21	0.17
C6	0.20	0.31	0.15	0.15	0.43	0.09	0.41	0.11	0.32	0.28	0.38	0.50	0.28	0.13	0.23	0.16	0.10	0.19	0.11	0.09
N1	0.21	0.32	0.15	0.13	0.42	0.07	0.40	0.10	0.31	0.28	0.38	0.47	0.29	0.13	0.21	0.17	0.10	0.19	0.17	0.12
N3	0.22	0.29	0.19	0.18	0.37	0.15	0.37	0.14	0.32	0.28	0.33	0.39	0.26	0.18	0.22	0.19	0.13	0.18	0.08	0.08
O2	0.22	0.29	0.17	0.16	0.35	0.10	0.36	0.11	0.31	0.28	0.33	0.35	0.27	0.16	0.19	0.18	0.10	0.20	0.27	0.16
O2'	0.39	0.53	0.30	0.18	0.54	0.21	0.41	0.14	0.36	0.43	0.57	0.56	0.55	0.33	0.15	0.34	0.19	0.18	0.25	0.16
O3'	0.23	0.32	0.17	0.17	0.34	0.10	0.25	0.10	0.22	0.26	0.36	0.38	0.34	0.17	0.25	0.22	0.17	0.12	0.15	0.12
O4	0.23	0.29	0.22	0.22	0.38	0.19	0.38	0.19	0.32	0.28	0.34	0.41	0.27	0.21	0.25	0.21	0.17	0.18	0.15	0.11
O4'	0.13	0.22	0.21	0.29	0.37	0.19	0.32	0.24	0.19	0.17	0.31	0.48	0.21	0.21	0.40	0.09	0.16	0.27	0.27	0.21
O5'	0.16	0.21	0.31	0.39	0.29	0.22	0.27	0.21	0.18	0.17	0.25	0.38	0.22	0.32	0.53	0.11	0.09	0.14	0.11	0.08
OP1	0.24	0.19	0.47	0.60	0.29	0.44	0.23	0.46	0.14	0.17	0.23	0.44	0.22	0.50	0.81	0.22	0.28	0.42	0.30	0.28
OP2	0.32	0.37	0.55	0.57	0.27	0.33	0.24	0.24	0.22	0.30	0.34	0.29	0.45	0.57	0.74	0.21	0.11	0.16	0.21	0.19
P	0.19	0.21	0.38	0.45	0.26	0.27	0.25	0.24	0.17	0.17	0.22	0.35	0.25	0.40	0.62	0.13	0.09	0.13	0.09	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.09	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.08	0.09	0.10	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.11	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.08	0.03
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.09	0.08	0.11	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.08	0.02
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.12	0.09	0.11	0.10
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.01	0.13	0.10	0.11	0.11
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.12	0.09	0.11	0.10
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.09	0.10	0.08
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.10	0.09	0.10	0.08
N4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.12	0.09	0.11	0.10
O2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.05	0.09	0.11	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.09	0.00	0.02	0.03	0.04	0.14	0.05	0.06
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.11	0.11	0.13	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.07	0.02
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.09	0.08	0.05
O5'	0.04	0.08	0.03	0.02	0.12	0.01	0.13	0.01	0.12	0.08	0.10	0.12	0.05	0.04	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.08	0.10	0.05	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.14	0.08	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.10	0.08	0.08	0.11	0.06	0.11	0.05	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.05	0.07	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.03	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.10	0.08	0.08	0.10	0.06	0.06	0.02	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00