Doublet Group distance statistics: 48802

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 0, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.004, 0.007, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.000, 0.069, 0.137, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.069 std_dev=0.068
C2'	A	0, 0.073, 0.159, 0.244, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.159 std_dev=0.086
O2'	A	0, 0.088, 0.180, 0.271, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.180 std_dev=0.091
O4'	A	0, 0.071, 0.167, 0.263, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.167 std_dev=0.096
C4'	A	0, 0.095, 0.235, 0.374, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.235 std_dev=0.139
C3'	A	0, 0.120, 0.262, 0.404, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.262 std_dev=0.142
C5'	B	0, 0.148, 0.335, 0.522, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.335 std_dev=0.187
OP1	B	0, 0.165, 0.353, 0.541, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.353 std_dev=0.188
P	B	0, 0.136, 0.329, 0.521, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.329 std_dev=0.193
O3'	A	0, 0.178, 0.376, 0.573, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.376 std_dev=0.198
O5'	B	0, 0.212, 0.431, 0.650, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.431 std_dev=0.219
C4'	B	0, 0.132, 0.356, 0.579, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.356 std_dev=0.223
C5'	A	0, 0.172, 0.400, 0.628, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.400 std_dev=0.228
O5'	A	0, 0.180, 0.440, 0.700, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.440 std_dev=0.260
OP2	B	0, 0.160, 0.434, 0.708, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.434 std_dev=0.274
O3'	B	0, 0.138, 0.416, 0.693, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.416 std_dev=0.277
C3'	B	0, 0.106, 0.402, 0.697, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.402 std_dev=0.296
P	A	0, 0.199, 0.524, 0.848, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.524 std_dev=0.325
O4'	B	0, 0.101, 0.439, 0.778, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.439 std_dev=0.338
OP2	A	0, 0.257, 0.599, 0.942, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.599 std_dev=0.342
OP1	A	0, 0.237, 0.591, 0.945, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.591 std_dev=0.354
C2'	B	0, -0.021, 0.535, 1.090, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.535 std_dev=0.555
C1'	B	0, -0.018, 0.541, 1.100, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.541 std_dev=0.559
N1	B	0, -0.103, 0.653, 1.409, 2.727 max_d=2.727 avg_d=0.653 std_dev=0.756
O2'	B	0, -0.191, 0.643, 1.478, 3.144 max_d=3.144 avg_d=0.643 std_dev=0.834
C6	B	0, -0.145, 0.695, 1.535, 3.091 max_d=3.091 avg_d=0.695 std_dev=0.840
O2	B	0, -0.110, 0.780, 1.671, 3.093 max_d=3.093 avg_d=0.780 std_dev=0.891
C2	B	0, -0.135, 0.765, 1.665, 3.181 max_d=3.181 avg_d=0.765 std_dev=0.900
C5	B	0, -0.194, 0.826, 1.846, 3.738 max_d=3.738 avg_d=0.826 std_dev=1.020
N3	B	0, -0.189, 0.889, 1.967, 3.829 max_d=3.829 avg_d=0.889 std_dev=1.078
C4	B	0, -0.220, 0.907, 2.033, 4.050 max_d=4.050 avg_d=0.907 std_dev=1.126
N4	B	0, -0.268, 1.038, 2.343, 4.693 max_d=4.693 avg_d=1.038 std_dev=1.306

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.10	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.01	0.04	0.04	0.09	0.04
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.08	0.09	0.05
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.10	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.07	0.07	0.09	0.06
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.08	0.08	0.10	0.08
C5'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.08	0.07	0.10	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.09	0.05
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.05	0.06	0.09	0.05
O2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.02	0.03	0.04	0.10	0.04
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.04	0.03	0.03	0.10	0.13	0.08
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.09	0.04	0.00	0.07	0.01	0.04	0.16	0.07	0.08
O4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.07	0.08	0.08	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.09	0.05
O5'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.08	0.05	0.05	0.03	0.03	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.04	0.08	0.10	0.07	0.06	0.08	0.05	0.07	0.05	0.06	0.04	0.10	0.16	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.09	0.09	0.05	0.09	0.06	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.10	0.13	0.07	0.08	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.08	0.01	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.08	0.07	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.24	0.26	0.13	0.14	0.18	0.15	0.19	0.13	0.13	0.12	0.23	0.18	0.13	0.15	0.07	0.11	0.15	0.08
C2	0.13	0.10	0.31	0.25	0.19	0.10	0.26	0.13	0.25	0.16	0.12	0.20	0.09	0.27	0.12	0.10	0.06	0.10	0.15	0.07
C2'	0.16	0.22	0.18	0.24	0.15	0.13	0.14	0.14	0.14	0.15	0.20	0.15	0.30	0.16	0.15	0.15	0.06	0.14	0.15	0.10
C3'	0.12	0.17	0.17	0.24	0.11	0.10	0.13	0.12	0.14	0.11	0.16	0.11	0.26	0.13	0.11	0.11	0.04	0.12	0.16	0.09
C4	0.28	0.31	0.47	0.25	0.44	0.10	0.50	0.14	0.47	0.36	0.36	0.47	0.22	0.55	0.21	0.11	0.12	0.08	0.21	0.12
C4'	0.12	0.17	0.20	0.25	0.11	0.12	0.15	0.14	0.16	0.11	0.16	0.10	0.27	0.14	0.11	0.13	0.06	0.10	0.16	0.08
C5	0.27	0.27	0.44	0.26	0.41	0.10	0.48	0.14	0.45	0.33	0.32	0.43	0.18	0.51	0.19	0.11	0.12	0.08	0.22	0.11
C5'	0.11	0.12	0.23	0.26	0.11	0.10	0.21	0.12	0.21	0.11	0.11	0.11	0.22	0.18	0.08	0.10	0.05	0.08	0.17	0.07
C6	0.20	0.17	0.36	0.27	0.29	0.11	0.37	0.14	0.35	0.24	0.20	0.31	0.12	0.38	0.15	0.11	0.09	0.08	0.20	0.10
N1	0.15	0.11	0.31	0.26	0.19	0.11	0.27	0.14	0.26	0.17	0.12	0.20	0.12	0.27	0.13	0.11	0.07	0.09	0.17	0.08
N3	0.20	0.21	0.40	0.24	0.32	0.07	0.38	0.13	0.36	0.26	0.24	0.33	0.14	0.41	0.17	0.07	0.08	0.07	0.17	0.09
O2	0.13	0.12	0.25	0.24	0.13	0.13	0.18	0.14	0.18	0.13	0.11	0.13	0.16	0.19	0.12	0.14	0.08	0.13	0.12	0.07
O2'	0.26	0.35	0.19	0.24	0.28	0.19	0.21	0.19	0.20	0.26	0.35	0.29	0.44	0.25	0.20	0.23	0.12	0.17	0.16	0.12
O3'	0.16	0.27	0.13	0.22	0.19	0.12	0.13	0.14	0.13	0.17	0.27	0.20	0.36	0.18	0.14	0.14	0.06	0.14	0.16	0.11
O4	0.37	0.43	0.55	0.25	0.58	0.13	0.63	0.14	0.59	0.47	0.49	0.61	0.34	0.68	0.24	0.16	0.16	0.13	0.24	0.15
O4'	0.13	0.13	0.26	0.26	0.13	0.13	0.21	0.15	0.21	0.13	0.12	0.13	0.21	0.20	0.12	0.14	0.07	0.09	0.16	0.07
O5'	0.12	0.15	0.25	0.27	0.12	0.12	0.22	0.14	0.21	0.12	0.13	0.12	0.26	0.20	0.10	0.13	0.05	0.06	0.15	0.05
OP1	0.12	0.18	0.21	0.25	0.11	0.13	0.19	0.16	0.19	0.11	0.16	0.10	0.30	0.15	0.11	0.14	0.10	0.07	0.16	0.07
OP2	0.13	0.19	0.25	0.28	0.13	0.13	0.20	0.14	0.20	0.13	0.17	0.13	0.31	0.18	0.10	0.14	0.06	0.09	0.15	0.08
P	0.11	0.18	0.21	0.25	0.09	0.11	0.16	0.13	0.17	0.10	0.17	0.09	0.31	0.14	0.08	0.12	0.03	0.08	0.15	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.23	0.01	0.19	0.17	0.30	0.21
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.27	0.09	0.28	0.23	0.48	0.32
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.16	0.06	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.32	0.39	0.42	0.37
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.05	0.14	0.07	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.19	0.02	0.32	0.35	0.63	0.42
C4'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.12	0.07	0.32	0.40	0.64	0.44
C5'	0.06	0.15	0.16	0.02	0.18	0.00	0.17	0.00	0.15	0.13	0.17	0.19	0.15	0.08	0.13	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.12	0.09	0.30	0.37	0.56	0.39
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.21	0.01	0.27	0.26	0.46	0.31
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.25	0.06	0.31	0.28	0.56	0.37
N4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.02	0.33	0.38	0.68	0.45
O2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.34	0.17	0.25	0.16	0.41	0.27
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.06	0.16	0.08	0.18	0.04	0.06	0.06	0.19	0.00	0.09	0.03	0.31	0.39	0.51	0.39
O3'	0.23	0.27	0.06	0.01	0.19	0.03	0.12	0.13	0.12	0.21	0.25	0.18	0.34	0.09	0.00	0.17	0.13	0.18	0.26	0.19
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.17	0.03	0.17	0.00	0.04	0.05	0.07	0.04
O5'	0.19	0.28	0.32	0.05	0.32	0.02	0.32	0.00	0.30	0.27	0.31	0.33	0.25	0.31	0.13	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.23	0.39	0.14	0.35	0.04	0.40	0.06	0.37	0.26	0.28	0.38	0.16	0.39	0.18	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.48	0.42	0.07	0.63	0.02	0.64	0.01	0.56	0.46	0.56	0.68	0.41	0.51	0.26	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.32	0.37	0.07	0.42	0.02	0.44	0.01	0.39	0.31	0.37	0.45	0.27	0.39	0.19	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00