Doublet Group distance statistics: 48806

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C4	A	0, -0.001, 0.012, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C1'	A	0, -0.004, 0.016, 0.035, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.016 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.001, 0.020, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.020 std_dev=0.021
O4	A	0, -0.008, 0.029, 0.066, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.029 std_dev=0.037
O2	A	0, -0.008, 0.040, 0.088, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.040 std_dev=0.048
O3'	A	0, 0.065, 0.209, 0.353, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.209 std_dev=0.144
O4'	A	0, 0.013, 0.158, 0.304, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.158 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.060, 0.211, 0.363, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.211 std_dev=0.151
C2'	A	0, 0.010, 0.172, 0.335, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.172 std_dev=0.162
C4'	A	0, 0.031, 0.206, 0.382, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.206 std_dev=0.176
O2'	A	0, 0.001, 0.279, 0.558, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.279 std_dev=0.279
OP2	B	0, 0.080, 0.372, 0.663, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.372 std_dev=0.291
O5'	B	0, 0.072, 0.388, 0.704, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.388 std_dev=0.316
P	B	0, 0.067, 0.400, 0.734, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.400 std_dev=0.333
C5'	A	0, -0.003, 0.332, 0.667, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.332 std_dev=0.335
OP1	B	0, 0.099, 0.458, 0.817, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.458 std_dev=0.359
C5'	B	0, 0.121, 0.514, 0.908, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.514 std_dev=0.394
C6	B	0, 0.088, 0.503, 0.917, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.503 std_dev=0.414
O5'	A	0, -0.048, 0.368, 0.784, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.368 std_dev=0.416
C5	B	0, 0.053, 0.475, 0.898, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.475 std_dev=0.423
N1	B	0, 0.118, 0.556, 0.995, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.556 std_dev=0.438
O4'	B	0, 0.155, 0.599, 1.043, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.599 std_dev=0.444
C4	B	0, 0.061, 0.516, 0.971, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.516 std_dev=0.455
C2	B	0, 0.112, 0.572, 1.031, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.572 std_dev=0.459
C1'	B	0, 0.150, 0.610, 1.069, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.610 std_dev=0.460
N3	B	0, 0.087, 0.552, 1.017, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.552 std_dev=0.465
C4'	B	0, 0.094, 0.563, 1.031, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.563 std_dev=0.469
P	A	0, 0.117, 0.597, 1.078, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.597 std_dev=0.481
N4	B	0, 0.055, 0.545, 1.035, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.545 std_dev=0.490
C3'	B	0, 0.029, 0.521, 1.013, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.521 std_dev=0.492
O2	B	0, 0.138, 0.634, 1.130, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.634 std_dev=0.496
C2'	B	0, 0.098, 0.599, 1.099, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.599 std_dev=0.500
O3'	B	0, 0.017, 0.569, 1.122, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.569 std_dev=0.552
O2'	B	0, 0.147, 0.720, 1.292, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.720 std_dev=0.573
OP1	A	0, 0.234, 0.859, 1.484, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.859 std_dev=0.625
OP2	A	0, 0.181, 0.868, 1.555, 2.115 max_d=2.115 avg_d=0.868 std_dev=0.687

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.03	0.00	0.07	0.20	0.28	0.14
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.05	0.12	0.31	0.48	0.24
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.06	0.01	0.03	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.21	0.10	0.07
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.11	0.06
C4	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.11	0.41	0.57	0.28
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04
C5	0.01	0.02	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.11	0.04	0.00	0.05	0.10	0.47	0.54	0.28
C5'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.04	0.08	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.15	0.08	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.04	0.01	0.06	0.11	0.43	0.48	0.26
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.10	0.31	0.43	0.22
N3	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.04	0.12	0.35	0.54	0.26
O2	0.07	0.01	0.10	0.09	0.03	0.07	0.03	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.17	0.13	0.04	0.09	0.14	0.28	0.46	0.24
O2'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.03	0.12	0.02	0.05	0.17	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.26	0.09	0.07
O3'	0.05	0.08	0.02	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.07	0.13	0.02	0.00	0.06	0.04	0.05	0.06	0.15	0.08
O4	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.00	0.04	0.10	0.42	0.60	0.28
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.04	0.00	0.08	0.13	0.35	0.15
O5'	0.07	0.12	0.05	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.12	0.14	0.05	0.05	0.10	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.20	0.31	0.21	0.07	0.41	0.06	0.47	0.15	0.43	0.31	0.35	0.28	0.26	0.06	0.42	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.48	0.10	0.11	0.57	0.11	0.54	0.08	0.48	0.43	0.54	0.46	0.09	0.15	0.60	0.35	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.24	0.07	0.06	0.28	0.04	0.28	0.02	0.26	0.22	0.26	0.24	0.07	0.08	0.28	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.18	0.07	0.06	0.23	0.04	0.18	0.03	0.13	0.13	0.22	0.30	0.17	0.07	0.06	0.09	0.05	0.05	0.06	0.03
C2	0.10	0.20	0.07	0.04	0.27	0.04	0.22	0.04	0.15	0.15	0.25	0.35	0.19	0.07	0.04	0.08	0.04	0.11	0.05	0.05
C2'	0.09	0.16	0.05	0.04	0.20	0.06	0.15	0.05	0.11	0.12	0.20	0.27	0.15	0.06	0.04	0.10	0.05	0.09	0.05	0.05
C3'	0.09	0.15	0.06	0.05	0.19	0.06	0.14	0.05	0.11	0.11	0.19	0.25	0.15	0.07	0.06	0.09	0.06	0.07	0.06	0.05
C4	0.05	0.15	0.04	0.08	0.25	0.10	0.15	0.14	0.07	0.08	0.23	0.35	0.15	0.03	0.10	0.08	0.12	0.21	0.18	0.18
C4'	0.06	0.12	0.04	0.04	0.17	0.03	0.11	0.04	0.07	0.08	0.16	0.23	0.12	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04
C5	0.06	0.14	0.05	0.09	0.21	0.11	0.12	0.13	0.07	0.08	0.20	0.32	0.13	0.05	0.11	0.10	0.12	0.19	0.16	0.17
C5'	0.03	0.09	0.03	0.05	0.13	0.04	0.06	0.06	0.02	0.04	0.13	0.20	0.09	0.02	0.06	0.03	0.05	0.05	0.03	0.05
C6	0.05	0.14	0.03	0.06	0.20	0.07	0.12	0.09	0.07	0.07	0.20	0.30	0.13	0.03	0.08	0.07	0.08	0.15	0.10	0.12
N1	0.07	0.17	0.04	0.03	0.23	0.03	0.16	0.04	0.11	0.11	0.22	0.31	0.16	0.04	0.05	0.07	0.03	0.10	0.04	0.06
N3	0.09	0.20	0.05	0.03	0.28	0.04	0.22	0.07	0.14	0.14	0.26	0.36	0.19	0.04	0.05	0.07	0.05	0.17	0.07	0.11
O2	0.14	0.22	0.11	0.08	0.29	0.07	0.25	0.05	0.20	0.19	0.27	0.36	0.21	0.10	0.06	0.12	0.08	0.07	0.11	0.05
O2'	0.14	0.19	0.10	0.09	0.24	0.11	0.20	0.11	0.16	0.16	0.23	0.30	0.19	0.11	0.08	0.15	0.10	0.13	0.08	0.09
O3'	0.18	0.22	0.15	0.15	0.26	0.15	0.22	0.15	0.20	0.20	0.26	0.31	0.22	0.16	0.16	0.17	0.15	0.13	0.16	0.14
O4	0.06	0.16	0.06	0.11	0.27	0.13	0.16	0.18	0.07	0.08	0.24	0.38	0.15	0.06	0.13	0.10	0.17	0.24	0.24	0.23
O4'	0.06	0.13	0.04	0.05	0.18	0.03	0.12	0.05	0.08	0.09	0.18	0.25	0.13	0.04	0.07	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05
O5'	0.09	0.13	0.07	0.06	0.15	0.06	0.10	0.06	0.10	0.10	0.16	0.20	0.13	0.07	0.05	0.08	0.08	0.08	0.08	0.07
OP1	0.31	0.36	0.31	0.30	0.37	0.26	0.32	0.23	0.30	0.32	0.39	0.42	0.37	0.31	0.31	0.28	0.27	0.26	0.28	0.25
OP2	0.63	0.70	0.56	0.51	0.70	0.53	0.64	0.49	0.61	0.64	0.72	0.74	0.71	0.58	0.48	0.61	0.51	0.41	0.47	0.47
P	0.24	0.30	0.20	0.18	0.31	0.18	0.25	0.16	0.24	0.26	0.32	0.35	0.30	0.22	0.17	0.22	0.19	0.16	0.18	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.07	0.07
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.09	0.10	0.11	0.09
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.02
C4	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.13	0.15	0.16	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.13	0.15	0.15	0.14
C5'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.09	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.12	0.12	0.11	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.09	0.09	0.09
N3	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.11	0.12	0.14	0.12
N4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.14	0.18	0.20	0.17
O2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.03	0.08	0.09	0.09	0.08
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.04
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.04	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.06	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.07	0.08	0.08	0.08
O5'	0.06	0.09	0.01	0.03	0.13	0.01	0.13	0.01	0.12	0.09	0.11	0.14	0.08	0.03	0.05	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.10	0.05	0.06	0.15	0.05	0.15	0.05	0.12	0.09	0.12	0.18	0.09	0.06	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.01	0.03	0.16	0.02	0.15	0.01	0.11	0.09	0.14	0.20	0.09	0.02	0.06	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.09	0.02	0.02	0.14	0.02	0.14	0.01	0.11	0.09	0.12	0.17	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00