Doublet Group distance statistics: 48809

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.008, 0.039, 0.071, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.039 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.008, 0.050, 0.091, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.050 std_dev=0.042
O3'	A	0, 0.018, 0.065, 0.113, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.065 std_dev=0.048
O2	A	0, 0.010, 0.062, 0.113, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.062 std_dev=0.051
O4'	A	0, -0.010, 0.056, 0.123, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.056 std_dev=0.067
C3'	A	0, -0.002, 0.071, 0.144, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.071 std_dev=0.073
C4'	A	0, -0.003, 0.078, 0.159, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.078 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.034, 0.119, 0.204, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.119 std_dev=0.085
C5'	A	0, -0.003, 0.112, 0.227, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.112 std_dev=0.115
C1'	B	0, 0.051, 0.173, 0.296, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.173 std_dev=0.123
P	A	0, 0.032, 0.157, 0.282, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.157 std_dev=0.125
C4'	B	0, 0.042, 0.174, 0.306, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.174 std_dev=0.132
O4'	B	0, 0.054, 0.203, 0.351, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.203 std_dev=0.148
O3'	B	0, 0.031, 0.213, 0.395, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.213 std_dev=0.182
N1	B	0, 0.065, 0.266, 0.466, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.266 std_dev=0.200
C3'	B	0, 0.031, 0.242, 0.452, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.242 std_dev=0.210
P	B	0, 0.067, 0.293, 0.518, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.293 std_dev=0.226
OP1	B	0, 0.038, 0.294, 0.550, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.294 std_dev=0.256
O5'	A	0, -0.041, 0.218, 0.477, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.218 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.071, 0.334, 0.596, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.334 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.036, 0.331, 0.627, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.331 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.055, 0.377, 0.699, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.377 std_dev=0.322
C5'	B	0, 0.046, 0.384, 0.723, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.384 std_dev=0.338
O2	B	0, 0.031, 0.399, 0.767, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.399 std_dev=0.368
O5'	B	0, 0.020, 0.431, 0.842, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.431 std_dev=0.411
C5	B	0, 0.077, 0.490, 0.904, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.490 std_dev=0.414
OP2	A	0, 0.012, 0.443, 0.875, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.443 std_dev=0.432
N3	B	0, 0.069, 0.510, 0.950, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.510 std_dev=0.440
O2'	B	0, 0.054, 0.517, 0.981, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.517 std_dev=0.463
OP1	A	0, 0.025, 0.494, 0.963, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.494 std_dev=0.469
C4	B	0, 0.078, 0.559, 1.039, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.559 std_dev=0.480
OP2	B	0, -0.029, 0.539, 1.107, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.539 std_dev=0.568
N4	B	0, 0.080, 0.715, 1.350, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.715 std_dev=0.635

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.28	0.07	0.06
C2	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.05	0.09	0.19	0.01	0.04
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.24	0.33	0.10	0.05
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.16	0.36	0.17	0.05
C4	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.04	0.07	0.04	0.01	0.01	0.08	0.11	0.15	0.04
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.29	0.22	0.04
C5	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.11	0.10	0.16	0.03
C5'	0.03	0.07	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.07	0.10	0.04	0.03	0.06	0.01	0.00	0.19	0.29	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.14	0.15	0.09	0.03
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.11	0.20	0.02	0.03
N3	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.03	0.02	0.03	0.08	0.15	0.08	0.04
O2	0.06	0.01	0.03	0.07	0.04	0.08	0.03	0.10	0.03	0.03	0.04	0.00	0.02	0.07	0.05	0.09	0.10	0.21	0.07	0.05
O2'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.03	0.09	0.00	0.27	0.34	0.10	0.09
O3'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.07	0.03	0.00	0.05	0.02	0.11	0.36	0.18	0.05
O4	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.05	0.09	0.05	0.00	0.01	0.06	0.11	0.20	0.06
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.28	0.11	0.10
O5'	0.09	0.09	0.24	0.16	0.08	0.01	0.11	0.00	0.14	0.11	0.08	0.10	0.27	0.11	0.06	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.28	0.19	0.33	0.36	0.11	0.29	0.10	0.19	0.15	0.20	0.15	0.21	0.34	0.36	0.11	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.01	0.10	0.17	0.15	0.22	0.16	0.29	0.09	0.02	0.08	0.07	0.10	0.18	0.20	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.06	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.09	0.05	0.06	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.06	0.04	0.02	0.07	0.05	0.09	0.08	0.07	0.05	0.07	0.09	0.09	0.12	0.06	0.08	0.24	0.09	0.23	0.05
C2	0.07	0.09	0.04	0.09	0.14	0.08	0.15	0.11	0.12	0.08	0.12	0.16	0.10	0.08	0.11	0.13	0.19	0.07	0.15	0.03
C2'	0.10	0.12	0.11	0.09	0.08	0.10	0.04	0.16	0.04	0.09	0.11	0.08	0.13	0.14	0.09	0.10	0.24	0.02	0.36	0.11
C3'	0.12	0.15	0.16	0.11	0.08	0.09	0.03	0.12	0.03	0.11	0.13	0.08	0.17	0.22	0.11	0.08	0.28	0.06	0.33	0.09
C4	0.07	0.16	0.12	0.12	0.22	0.12	0.20	0.24	0.16	0.13	0.20	0.25	0.16	0.08	0.13	0.15	0.12	0.09	0.08	0.09
C4'	0.10	0.10	0.12	0.07	0.05	0.07	0.05	0.09	0.03	0.07	0.09	0.05	0.14	0.19	0.08	0.08	0.26	0.11	0.23	0.06
C5	0.05	0.13	0.10	0.09	0.18	0.11	0.17	0.24	0.13	0.10	0.17	0.21	0.14	0.09	0.11	0.13	0.09	0.08	0.16	0.07
C5'	0.07	0.10	0.08	0.03	0.09	0.07	0.10	0.10	0.07	0.08	0.11	0.11	0.13	0.13	0.03	0.08	0.17	0.14	0.18	0.01
C6	0.04	0.10	0.05	0.06	0.13	0.09	0.13	0.20	0.10	0.08	0.12	0.16	0.10	0.04	0.09	0.11	0.06	0.05	0.21	0.05
N1	0.05	0.08	0.03	0.06	0.12	0.07	0.12	0.13	0.09	0.07	0.10	0.14	0.09	0.05	0.09	0.10	0.16	0.06	0.20	0.04
N3	0.07	0.14	0.10	0.13	0.20	0.10	0.19	0.17	0.15	0.12	0.17	0.23	0.14	0.06	0.13	0.14	0.03	0.08	0.07	0.04
O2	0.09	0.07	0.03	0.08	0.11	0.06	0.13	0.02	0.10	0.07	0.09	0.14	0.09	0.14	0.11	0.13	0.35	0.07	0.17	0.08
O2'	0.13	0.15	0.16	0.14	0.12	0.13	0.08	0.19	0.08	0.13	0.15	0.13	0.16	0.17	0.12	0.11	0.27	0.06	0.46	0.18
O3'	0.13	0.16	0.19	0.12	0.07	0.08	0.01	0.08	0.02	0.10	0.14	0.07	0.20	0.29	0.12	0.06	0.35	0.08	0.32	0.10
O4	0.10	0.20	0.15	0.14	0.27	0.14	0.25	0.27	0.19	0.16	0.25	0.31	0.20	0.12	0.13	0.17	0.24	0.14	0.10	0.15
O4'	0.06	0.06	0.05	0.02	0.08	0.05	0.11	0.07	0.08	0.05	0.07	0.10	0.09	0.13	0.06	0.08	0.22	0.14	0.16	0.04
O5'	0.21	0.26	0.23	0.22	0.29	0.19	0.29	0.13	0.26	0.24	0.29	0.31	0.28	0.23	0.25	0.19	0.02	0.16	0.08	0.09
OP1	0.33	0.32	0.30	0.30	0.28	0.36	0.24	0.43	0.26	0.32	0.31	0.28	0.33	0.30	0.31	0.36	0.23	0.12	0.41	0.21
OP2	0.13	0.19	0.10	0.11	0.20	0.15	0.17	0.23	0.14	0.16	0.21	0.22	0.19	0.07	0.10	0.16	0.14	0.06	0.26	0.09
P	0.11	0.17	0.08	0.09	0.17	0.15	0.15	0.23	0.12	0.14	0.19	0.20	0.18	0.07	0.08	0.15	0.12	0.04	0.26	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.12	0.12	0.48	0.14
C2	0.01	0.00	0.03	0.09	0.03	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.09	0.03	0.36	0.07	0.29	0.07
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.01	0.01	0.19	0.01	0.43	0.04
C3'	0.03	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.08	0.06	0.11	0.01	0.01	0.03	0.25	0.05	0.40	0.05
C4	0.03	0.03	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.08	0.04	0.51	0.09	0.08	0.17
C4'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.04	0.04	0.08	0.02	0.01	0.01	0.08	0.44	0.10
C5	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.52	0.09	0.09	0.17
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.15	0.08	0.09	0.07	0.01	0.01	0.07	0.32	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.44	0.07	0.28	0.10
N1	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.33	0.08	0.36	0.07
N3	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.04	0.11	0.03	0.45	0.08	0.17	0.12
N4	0.04	0.05	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.15	0.02	0.03	0.04	0.00	0.08	0.06	0.09	0.04	0.55	0.13	0.05	0.22
O2	0.04	0.01	0.07	0.11	0.05	0.04	0.03	0.08	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.02	0.11	0.04	0.31	0.07	0.32	0.07
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.09	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.00	0.06	0.06	0.03	0.09	0.47	0.14
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.08	0.02	0.06	0.07	0.03	0.05	0.11	0.09	0.11	0.06	0.00	0.02	0.17	0.05	0.39	0.04
O4'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.02	0.00	0.09	0.19	0.55	0.22
O5'	0.12	0.36	0.19	0.25	0.51	0.01	0.52	0.01	0.44	0.33	0.45	0.55	0.31	0.03	0.17	0.09	0.00	0.03	0.02	0.02
OP1	0.12	0.07	0.01	0.05	0.09	0.08	0.09	0.07	0.07	0.08	0.08	0.13	0.07	0.09	0.05	0.19	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.48	0.29	0.43	0.40	0.08	0.44	0.09	0.32	0.28	0.36	0.17	0.05	0.32	0.47	0.39	0.55	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.07	0.04	0.05	0.17	0.10	0.17	0.03	0.10	0.07	0.12	0.22	0.07	0.14	0.04	0.22	0.02	0.01	0.01	0.00