Doublet Group distance statistics: 48812

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.008, 0.028, 0.047, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.012, 0.040, 0.069, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.040 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.007, 0.036, 0.066, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.030
C5	A	0, 0.015, 0.054, 0.092, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.054 std_dev=0.038
O2	A	0, 0.022, 0.076, 0.131, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.076 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.080, 0.278, 0.475, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.278 std_dev=0.197
O4'	A	0, 0.107, 0.367, 0.626, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.367 std_dev=0.259
C3'	A	0, 0.136, 0.465, 0.794, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.465 std_dev=0.329
P	A	0, 0.047, 0.391, 0.735, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.391 std_dev=0.344
O2'	A	0, 0.146, 0.508, 0.870, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.508 std_dev=0.362
P	B	0, 0.151, 0.519, 0.886, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.519 std_dev=0.367
C4'	A	0, 0.152, 0.541, 0.930, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.541 std_dev=0.389
OP1	A	0, 0.039, 0.445, 0.850, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.445 std_dev=0.406
OP2	A	0, 0.186, 0.664, 1.142, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.664 std_dev=0.478
O3'	A	0, 0.209, 0.716, 1.223, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.716 std_dev=0.507
O5'	A	0, 0.153, 0.667, 1.181, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.667 std_dev=0.514
OP1	B	0, 0.212, 0.729, 1.247, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.729 std_dev=0.518
C4'	B	0, 0.248, 0.850, 1.453, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.850 std_dev=0.603
O3'	B	0, 0.241, 0.854, 1.468, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.854 std_dev=0.613
OP2	B	0, 0.282, 0.964, 1.645, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.964 std_dev=0.682
O5'	B	0, 0.288, 0.993, 1.698, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.993 std_dev=0.705
C5'	A	0, 0.281, 1.018, 1.755, 1.722 max_d=1.722 avg_d=1.018 std_dev=0.737
C5'	B	0, 0.326, 1.115, 1.904, 1.696 max_d=1.696 avg_d=1.115 std_dev=0.789
C3'	B	0, 0.320, 1.116, 1.913, 1.807 max_d=1.807 avg_d=1.116 std_dev=0.797
O4'	B	0, 0.371, 1.270, 2.170, 1.964 max_d=1.964 avg_d=1.270 std_dev=0.900
C6	B	0, 0.594, 2.082, 3.570, 3.387 max_d=3.387 avg_d=2.082 std_dev=1.488
C1'	B	0, 0.662, 2.271, 3.881, 3.540 max_d=3.540 avg_d=2.271 std_dev=1.610
C2'	B	0, 0.677, 2.324, 3.970, 3.611 max_d=3.611 avg_d=2.324 std_dev=1.646
N1	B	0, 0.736, 2.538, 4.341, 4.009 max_d=4.009 avg_d=2.538 std_dev=1.802
C5	B	0, 0.782, 2.726, 4.670, 4.399 max_d=4.399 avg_d=2.726 std_dev=1.944
O2'	B	0, 0.833, 2.849, 4.865, 4.366 max_d=4.366 avg_d=2.849 std_dev=2.016
C2	B	0, 1.010, 3.465, 5.921, 5.395 max_d=5.395 avg_d=3.465 std_dev=2.456
C4	B	0, 1.071, 3.692, 6.312, 5.821 max_d=5.821 avg_d=3.692 std_dev=2.621
O2	B	0, 1.143, 3.912, 6.682, 6.034 max_d=6.034 avg_d=3.912 std_dev=2.770
N3	B	0, 1.163, 3.995, 6.826, 6.229 max_d=6.229 avg_d=3.995 std_dev=2.831
N4	B	0, 1.292, 4.446, 7.600, 6.980 max_d=6.980 avg_d=4.446 std_dev=3.154

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.02	0.00	0.19	0.19	0.17	0.11
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.25	0.17	0.15	0.11
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.01	0.01	0.05	0.04	0.15	0.24	0.11	0.10
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.15	0.27	0.06	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.12	0.01	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.24	0.09	0.14	0.07
C4'	0.00	0.05	0.04	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.10	0.05	0.08	0.00	0.19	0.05	0.12	0.01	0.02	0.14	0.20	0.02
C5	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.23	0.09	0.15	0.07
C5'	0.04	0.15	0.02	0.03	0.26	0.01	0.27	0.00	0.21	0.14	0.21	0.11	0.17	0.05	0.28	0.00	0.01	0.19	0.26	0.02
C6	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.09	0.25	0.15	0.16	0.11
N1	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.25	0.18	0.16	0.12
N3	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.25	0.13	0.15	0.09
O2	0.04	0.01	0.07	0.05	0.01	0.00	0.00	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.25	0.19	0.15	0.12
O2'	0.07	0.05	0.01	0.03	0.02	0.19	0.02	0.17	0.04	0.02	0.04	0.08	0.00	0.01	0.02	0.18	0.18	0.31	0.03	0.17
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.06	0.07	0.01	0.00	0.05	0.05	0.16	0.33	0.08	0.18
O4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.12	0.01	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.23	0.06	0.13	0.05
O4'	0.00	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.09	0.04	0.03	0.04	0.18	0.05	0.07	0.00	0.18	0.18	0.22	0.13
O5'	0.19	0.25	0.15	0.15	0.24	0.02	0.23	0.01	0.25	0.25	0.25	0.25	0.18	0.16	0.23	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.19	0.17	0.24	0.27	0.09	0.14	0.09	0.19	0.15	0.18	0.13	0.19	0.31	0.33	0.06	0.18	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.17	0.15	0.11	0.06	0.14	0.20	0.15	0.26	0.16	0.16	0.15	0.15	0.03	0.08	0.13	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.11	0.10	0.12	0.07	0.02	0.07	0.02	0.11	0.12	0.09	0.12	0.17	0.18	0.05	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.16	0.22	0.09	0.16	0.12	0.16	0.18	0.06	0.19	0.03	0.32	0.28	0.49	0.14	0.32	0.05	0.19	0.35	0.14
C2	0.35	0.12	0.19	0.11	0.19	0.14	0.21	0.15	0.07	0.15	0.05	0.34	0.24	0.45	0.16	0.34	0.09	0.17	0.33	0.14
C2'	0.30	0.13	0.16	0.15	0.15	0.05	0.17	0.34	0.02	0.14	0.01	0.29	0.24	0.41	0.22	0.20	0.13	0.09	0.47	0.26
C3'	0.34	0.20	0.22	0.15	0.08	0.07	0.12	0.39	0.03	0.19	0.07	0.21	0.33	0.48	0.22	0.20	0.12	0.09	0.45	0.28
C4	0.49	0.27	0.33	0.02	0.06	0.24	0.10	0.08	0.08	0.27	0.11	0.20	0.42	0.63	0.08	0.44	0.24	0.06	0.19	0.09
C4'	0.35	0.18	0.21	0.15	0.11	0.08	0.14	0.33	0.04	0.18	0.04	0.26	0.30	0.48	0.22	0.24	0.08	0.13	0.39	0.22
C5	0.52	0.32	0.37	0.04	0.03	0.24	0.07	0.10	0.11	0.31	0.15	0.18	0.47	0.68	0.06	0.44	0.22	0.07	0.22	0.10
C5'	0.33	0.20	0.23	0.29	0.18	0.22	0.22	0.46	0.15	0.20	0.11	0.30	0.31	0.47	0.37	0.24	0.21	0.24	0.45	0.34
C6	0.49	0.28	0.33	0.05	0.07	0.20	0.11	0.15	0.10	0.28	0.11	0.22	0.42	0.63	0.10	0.41	0.16	0.12	0.28	0.13
N1	0.41	0.19	0.25	0.08	0.14	0.15	0.16	0.17	0.07	0.21	0.04	0.30	0.31	0.53	0.14	0.36	0.10	0.15	0.33	0.15
N3	0.40	0.17	0.24	0.07	0.14	0.19	0.17	0.11	0.06	0.19	0.02	0.28	0.30	0.50	0.13	0.39	0.17	0.11	0.25	0.12
O2	0.25	0.07	0.11	0.17	0.29	0.11	0.29	0.18	0.13	0.10	0.16	0.44	0.12	0.33	0.21	0.27	0.07	0.21	0.39	0.16
O2'	0.17	0.03	0.04	0.22	0.32	0.09	0.31	0.36	0.14	0.01	0.18	0.47	0.07	0.29	0.26	0.10	0.19	0.11	0.49	0.26
O3'	0.28	0.17	0.17	0.19	0.10	0.13	0.14	0.48	0.03	0.15	0.07	0.22	0.29	0.42	0.25	0.10	0.20	0.07	0.51	0.33
O4	0.51	0.31	0.37	0.05	0.02	0.29	0.07	0.02	0.10	0.30	0.16	0.15	0.47	0.67	0.05	0.47	0.31	0.09	0.12	0.06
O4'	0.37	0.16	0.22	0.11	0.16	0.10	0.17	0.21	0.06	0.18	0.03	0.32	0.28	0.49	0.17	0.30	0.06	0.16	0.32	0.14
O5'	0.66	0.48	0.54	0.19	0.17	0.33	0.13	0.04	0.27	0.46	0.32	0.16	0.63	0.85	0.12	0.53	0.30	0.29	0.15	0.09
OP1	0.65	0.51	0.51	0.11	0.21	0.23	0.15	0.15	0.27	0.47	0.38	0.14	0.68	0.82	0.03	0.46	0.20	0.12	0.22	0.07
OP2	0.41	0.25	0.28	0.11	0.12	0.04	0.18	0.33	0.02	0.21	0.10	0.27	0.43	0.62	0.19	0.25	0.02	0.13	0.38	0.27
P	0.54	0.37	0.41	0.04	0.08	0.18	0.08	0.18	0.14	0.35	0.22	0.18	0.54	0.73	0.07	0.39	0.15	0.07	0.26	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.06	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.11	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.12	0.04	0.26	0.06	0.31	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.12	0.05
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.10	0.03	0.20	0.02	0.01	0.03	0.20	0.29	0.12	0.16
C4	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.46	0.19	0.57	0.31
C4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.03	0.00	0.04	0.03	0.15	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.50	0.18	0.58	0.32
C5'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.10	0.03	0.06	0.06	0.11	0.02	0.04	0.02	0.01	0.19	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.04	0.43	0.09	0.41	0.21
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.28	0.03	0.27	0.10
N3	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.05	0.36	0.12	0.45	0.22
N4	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.51	0.26	0.68	0.38
O2	0.02	0.00	0.14	0.20	0.02	0.11	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.22	0.04	0.16	0.07	0.20	0.05
O2'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.08	0.00	0.03	0.02	0.06	0.10	0.05	0.10
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.04	0.10	0.02	0.11	0.05	0.22	0.03	0.00	0.03	0.12	0.39	0.06	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.03	0.00	0.03	0.20	0.15	0.18
O5'	0.09	0.26	0.12	0.20	0.46	0.04	0.50	0.01	0.43	0.28	0.36	0.51	0.16	0.06	0.12	0.03	0.00	0.05	0.02	0.01
OP1	0.13	0.06	0.08	0.29	0.19	0.03	0.18	0.19	0.09	0.03	0.12	0.26	0.07	0.10	0.39	0.20	0.05	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.31	0.12	0.12	0.57	0.15	0.58	0.25	0.41	0.27	0.45	0.68	0.20	0.05	0.06	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.05	0.16	0.31	0.08	0.32	0.02	0.21	0.10	0.22	0.38	0.05	0.10	0.16	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00