Doublet Group distance statistics: 48814

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, -0.002, 0.010, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.003, 0.024, 0.046, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.008, 0.053, 0.097, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.053 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.019, 0.070, 0.121, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.070 std_dev=0.051
O4	A	0, 0.028, 0.094, 0.161, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.094 std_dev=0.067
C2'	A	0, 0.029, 0.105, 0.181, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.105 std_dev=0.076
C4'	A	0, 0.034, 0.209, 0.384, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.209 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.010, 0.267, 0.525, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.267 std_dev=0.258
O2'	A	0, 0.091, 0.353, 0.615, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.353 std_dev=0.262
OP1	B	0, 0.133, 0.478, 0.824, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.478 std_dev=0.345
P	B	0, 0.163, 0.565, 0.966, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.565 std_dev=0.401
OP2	B	0, 0.196, 0.690, 1.184, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.690 std_dev=0.494
C5'	A	0, 0.013, 0.632, 1.250, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.632 std_dev=0.619
C5'	B	0, 0.137, 0.796, 1.455, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.796 std_dev=0.659
O5'	B	0, 0.169, 0.840, 1.510, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.840 std_dev=0.670
O5'	A	0, 0.090, 0.763, 1.435, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.763 std_dev=0.672
O3'	A	0, -0.037, 0.665, 1.367, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.665 std_dev=0.702
O3'	B	0, 0.172, 0.979, 1.787, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.979 std_dev=0.808
C4'	B	0, 0.151, 0.990, 1.829, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.990 std_dev=0.839
C5	B	0, 0.252, 1.104, 1.955, 2.074 max_d=2.074 avg_d=1.104 std_dev=0.852
C6	B	0, 0.239, 1.103, 1.968, 2.111 max_d=2.111 avg_d=1.103 std_dev=0.865
P	A	0, 0.204, 1.089, 1.974, 2.168 max_d=2.168 avg_d=1.089 std_dev=0.885
C3'	B	0, 0.198, 1.084, 1.969, 2.169 max_d=2.169 avg_d=1.084 std_dev=0.885
OP1	A	0, 0.246, 1.218, 2.191, 2.380 max_d=2.380 avg_d=1.218 std_dev=0.973
O4'	B	0, 0.169, 1.146, 2.123, 2.388 max_d=2.388 avg_d=1.146 std_dev=0.977
OP2	A	0, 0.262, 1.244, 2.226, 2.401 max_d=2.401 avg_d=1.244 std_dev=0.982
C2'	B	0, 0.217, 1.321, 2.426, 2.704 max_d=2.704 avg_d=1.321 std_dev=1.105
C1'	B	0, 0.205, 1.338, 2.470, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.338 std_dev=1.133
O2'	B	0, 0.188, 1.331, 2.475, 2.792 max_d=2.792 avg_d=1.331 std_dev=1.144
C4	B	0, 0.247, 1.391, 2.535, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.391 std_dev=1.144
N1	B	0, 0.219, 1.365, 2.511, 2.804 max_d=2.804 avg_d=1.365 std_dev=1.146
N4	B	0, 0.259, 1.421, 2.584, 2.848 max_d=2.848 avg_d=1.421 std_dev=1.163
N3	B	0, 0.220, 1.650, 3.080, 3.487 max_d=3.487 avg_d=1.650 std_dev=1.430
C2	B	0, 0.209, 1.642, 3.074, 3.491 max_d=3.491 avg_d=1.642 std_dev=1.433
O2	B	0, 0.183, 1.894, 3.604, 4.144 max_d=4.144 avg_d=1.894 std_dev=1.711

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.27	0.02	0.00	0.18	0.08	0.08	0.05
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.37	0.02	0.01	0.21	0.10	0.15	0.08
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.20	0.01	0.03	0.07	0.11	0.00	0.08	0.06	0.01	0.05	0.06	0.10	0.04
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.15	0.02	0.01	0.02	0.03	0.07	0.08	0.12	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.25	0.00	0.01	0.29	0.24	0.33	0.24
C4'	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.22	0.20
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.01	0.01	0.31	0.29	0.37	0.28
C5'	0.08	0.11	0.20	0.01	0.24	0.00	0.32	0.00	0.32	0.18	0.15	0.05	0.10	0.21	0.25	0.02	0.00	0.32	0.24	0.01
C6	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.01	0.28	0.24	0.29	0.22
N1	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.24	0.02	0.00	0.23	0.14	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.34	0.02	0.01	0.26	0.17	0.24	0.16
O2	0.06	0.00	0.11	0.15	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.49	0.02	0.03	0.14	0.01	0.08	0.08
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.15	0.07	0.10	0.10	0.06	0.07	0.15	0.17	0.00	0.07	0.17	0.02	0.03	0.06	0.11	0.05
O3'	0.27	0.37	0.08	0.01	0.25	0.01	0.14	0.21	0.12	0.24	0.34	0.49	0.07	0.00	0.26	0.18	0.15	0.19	0.18	0.05
O4	0.02	0.02	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.00	0.02	0.02	0.02	0.17	0.26	0.00	0.01	0.31	0.27	0.37	0.28
O4'	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.01	0.00	0.25	0.13	0.06	0.05
O5'	0.18	0.21	0.05	0.07	0.29	0.00	0.31	0.00	0.28	0.23	0.26	0.14	0.03	0.15	0.31	0.25	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.10	0.06	0.08	0.24	0.02	0.29	0.32	0.24	0.14	0.17	0.01	0.06	0.19	0.27	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.15	0.10	0.12	0.33	0.22	0.37	0.24	0.29	0.17	0.24	0.08	0.11	0.18	0.37	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.04	0.04	0.24	0.20	0.28	0.01	0.22	0.11	0.16	0.08	0.05	0.05	0.28	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.41	0.38	0.44	0.40	0.31	0.38	0.30	0.30	0.34	0.38	0.35	0.27	0.43	0.45	0.43	0.38	0.19	0.14	0.16	0.12
C2	0.39	0.34	0.42	0.41	0.29	0.39	0.31	0.33	0.35	0.36	0.31	0.26	0.37	0.40	0.43	0.37	0.21	0.16	0.19	0.15
C2'	0.27	0.25	0.30	0.25	0.20	0.22	0.20	0.14	0.22	0.24	0.22	0.17	0.28	0.31	0.29	0.22	0.05	0.06	0.10	0.04
C3'	0.24	0.23	0.26	0.22	0.17	0.19	0.16	0.13	0.18	0.21	0.20	0.15	0.27	0.26	0.24	0.20	0.06	0.07	0.09	0.06
C4	0.28	0.21	0.28	0.29	0.19	0.28	0.24	0.27	0.28	0.25	0.18	0.16	0.21	0.26	0.28	0.28	0.20	0.22	0.22	0.21
C4'	0.59	0.56	0.58	0.51	0.47	0.53	0.45	0.45	0.50	0.55	0.52	0.43	0.62	0.60	0.50	0.56	0.33	0.23	0.23	0.23
C5	0.30	0.23	0.31	0.30	0.20	0.31	0.25	0.29	0.29	0.27	0.19	0.17	0.23	0.29	0.30	0.30	0.20	0.22	0.22	0.21
C5'	0.58	0.52	0.51	0.42	0.43	0.51	0.43	0.44	0.48	0.53	0.48	0.38	0.58	0.54	0.36	0.59	0.29	0.15	0.15	0.18
C6	0.35	0.28	0.36	0.35	0.25	0.35	0.28	0.32	0.32	0.32	0.25	0.21	0.30	0.35	0.36	0.35	0.21	0.21	0.21	0.20
N1	0.39	0.34	0.41	0.39	0.29	0.38	0.30	0.33	0.34	0.36	0.31	0.25	0.37	0.41	0.41	0.37	0.21	0.18	0.19	0.16
N3	0.32	0.26	0.33	0.33	0.23	0.32	0.26	0.29	0.30	0.29	0.23	0.19	0.26	0.30	0.34	0.30	0.20	0.19	0.20	0.18
O2	0.46	0.43	0.50	0.49	0.37	0.45	0.36	0.35	0.40	0.43	0.40	0.33	0.47	0.48	0.52	0.42	0.24	0.14	0.19	0.13
O2'	0.16	0.16	0.21	0.15	0.12	0.08	0.10	0.02	0.12	0.14	0.14	0.10	0.20	0.24	0.19	0.10	0.11	0.11	0.04	0.13
O3'	0.10	0.07	0.04	0.09	0.16	0.18	0.20	0.28	0.18	0.12	0.09	0.18	0.05	0.03	0.05	0.18	0.35	0.33	0.31	0.40
O4	0.24	0.19	0.24	0.25	0.18	0.24	0.21	0.23	0.24	0.22	0.18	0.16	0.20	0.21	0.24	0.23	0.20	0.21	0.24	0.22
O4'	0.50	0.46	0.50	0.46	0.38	0.47	0.37	0.40	0.42	0.46	0.42	0.34	0.51	0.51	0.46	0.48	0.28	0.21	0.19	0.19
O5'	0.55	0.52	0.50	0.48	0.49	0.53	0.51	0.52	0.53	0.53	0.50	0.47	0.53	0.47	0.44	0.56	0.43	0.41	0.40	0.40
OP1	0.42	0.41	0.39	0.37	0.37	0.39	0.36	0.37	0.38	0.40	0.39	0.34	0.45	0.37	0.36	0.41	0.30	0.29	0.27	0.26
OP2	0.43	0.41	0.44	0.42	0.37	0.41	0.37	0.39	0.40	0.42	0.39	0.34	0.45	0.42	0.44	0.41	0.31	0.31	0.29	0.28
P	0.36	0.35	0.34	0.33	0.31	0.34	0.32	0.33	0.34	0.35	0.33	0.29	0.38	0.32	0.31	0.36	0.26	0.26	0.23	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01
C2	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.16	0.03
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.04	0.04	0.08	0.02	0.00	0.00	0.06	0.10	0.17	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.06	0.06	0.05
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01
C5	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.08	0.09	0.10	0.06
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.03	0.10	0.11	0.12	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.08	0.02
N3	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05
N4	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.02	0.05	0.07	0.07	0.07
O2	0.05	0.01	0.05	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.10	0.06	0.04	0.01	0.03	0.03
O2'	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.06	0.04	0.00	0.01	0.03	0.06	0.07	0.13	0.01
O3'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.05	0.06	0.10	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.18	0.03
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.05	0.08	0.05	0.01
O5'	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.10	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.08	0.03	0.09	0.10	0.06	0.10	0.09	0.08	0.11	0.06	0.04	0.07	0.01	0.07	0.09	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.04	0.16	0.17	0.06	0.09	0.10	0.03	0.12	0.08	0.04	0.07	0.03	0.13	0.18	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.05	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00