Doublet Group distance statistics: 48816

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.017
C4	A	0, -0.002, 0.016, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.018
C2	A	0, -0.001, 0.018, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.019
C1'	A	0, -0.003, 0.019, 0.041, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.022
C6	A	0, -0.004, 0.018, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.023
N1	A	0, -0.006, 0.020, 0.046, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.026
O2	A	0, -0.004, 0.048, 0.099, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.048 std_dev=0.051
O2'	A	0, -0.005, 0.062, 0.130, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.062 std_dev=0.067
O4'	A	0, -0.011, 0.061, 0.133, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.061 std_dev=0.072
O4	A	0, -0.013, 0.079, 0.172, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.079 std_dev=0.093
C2'	A	0, -0.021, 0.089, 0.198, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.089 std_dev=0.110
C5'	B	0, -0.031, 0.112, 0.256, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.112 std_dev=0.144
C5'	A	0, -0.031, 0.155, 0.341, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.155 std_dev=0.186
C4'	A	0, -0.036, 0.158, 0.353, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.158 std_dev=0.194
O5'	A	0, -0.047, 0.166, 0.379, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.166 std_dev=0.213
OP1	A	0, -0.043, 0.179, 0.402, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.179 std_dev=0.223
P	A	0, -0.057, 0.167, 0.391, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.167 std_dev=0.224
P	B	0, -0.054, 0.172, 0.399, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.172 std_dev=0.226
C3'	A	0, -0.051, 0.187, 0.424, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.187 std_dev=0.238
OP2	A	0, -0.069, 0.192, 0.453, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.192 std_dev=0.261
O3'	A	0, -0.075, 0.232, 0.538, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.232 std_dev=0.307
C4'	B	0, -0.115, 0.287, 0.690, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.287 std_dev=0.402
OP2	B	0, -0.112, 0.321, 0.754, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.321 std_dev=0.433
C3'	B	0, -0.168, 0.439, 1.045, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.439 std_dev=0.606
OP1	B	0, -0.169, 0.439, 1.047, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.439 std_dev=0.608
O4'	B	0, -0.188, 0.480, 1.149, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.480 std_dev=0.669
O3'	B	0, -0.187, 0.490, 1.166, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.490 std_dev=0.676
O5'	B	0, -0.204, 0.524, 1.252, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.524 std_dev=0.728
C2'	B	0, -0.255, 0.648, 1.552, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.648 std_dev=0.904
C1'	B	0, -0.265, 0.652, 1.569, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.652 std_dev=0.917
C6	B	0, -0.272, 0.681, 1.633, 2.027 max_d=2.027 avg_d=0.681 std_dev=0.952
O2'	B	0, -0.267, 0.717, 1.701, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.717 std_dev=0.984
N1	B	0, -0.291, 0.726, 1.743, 2.165 max_d=2.165 avg_d=0.726 std_dev=1.017
C5	B	0, -0.299, 0.746, 1.791, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.746 std_dev=1.045
C2	B	0, -0.334, 0.855, 2.045, 2.538 max_d=2.538 avg_d=0.855 std_dev=1.190
C4	B	0, -0.343, 0.877, 2.096, 2.601 max_d=2.601 avg_d=0.877 std_dev=1.219
O2	B	0, -0.349, 0.907, 2.164, 2.684 max_d=2.684 avg_d=0.907 std_dev=1.256
N3	B	0, -0.361, 0.930, 2.221, 2.756 max_d=2.756 avg_d=0.930 std_dev=1.291
N4	B	0, -0.367, 0.969, 2.304, 2.857 max_d=2.857 avg_d=0.969 std_dev=1.335

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.06	0.01	0.05
C2	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.01	0.06	0.11	0.03	0.01
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07
C3'	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.03	0.08	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.09	0.03	0.00
C4	0.01	0.02	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.18	0.11	0.07
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01
C5	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.18	0.13	0.08
C5'	0.03	0.01	0.06	0.03	0.04	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.14	0.09	0.04
N1	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.02
N3	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.04	0.14	0.06	0.03
O2	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.09	0.06	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.04	0.01	0.07	0.03	0.09	0.09
O3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.07	0.09	0.05	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.00	0.00
O4	0.00	0.03	0.08	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03	0.00	0.00	0.03	0.21	0.14	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.05	0.01	0.04
O5'	0.08	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.07	0.07	0.02	0.03	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.06	0.11	0.05	0.09	0.18	0.06	0.18	0.04	0.14	0.09	0.14	0.09	0.03	0.07	0.21	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.03	0.07	0.03	0.11	0.00	0.13	0.01	0.09	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.09	0.00	0.11	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.26	0.23	0.14	0.12	0.19	0.21	0.12	0.30	0.31	0.15	0.01	0.28	0.24	0.08	0.34	0.04	0.47	0.39	0.12
C2	0.27	0.19	0.19	0.12	0.02	0.16	0.09	0.12	0.21	0.24	0.07	0.12	0.23	0.20	0.07	0.30	0.03	0.41	0.39	0.10
C2'	0.21	0.10	0.10	0.03	0.05	0.11	0.05	0.08	0.17	0.17	0.02	0.18	0.13	0.12	0.04	0.26	0.07	0.38	0.42	0.05
C3'	0.32	0.21	0.19	0.10	0.07	0.19	0.17	0.15	0.28	0.28	0.09	0.07	0.23	0.21	0.02	0.36	0.06	0.49	0.38	0.14
C4	0.17	0.07	0.17	0.14	0.13	0.13	0.06	0.11	0.09	0.13	0.06	0.29	0.12	0.17	0.15	0.19	0.20	0.30	0.25	0.09
C4'	0.39	0.32	0.29	0.17	0.21	0.23	0.30	0.15	0.38	0.38	0.22	0.09	0.34	0.30	0.11	0.39	0.10	0.52	0.38	0.16
C5	0.20	0.13	0.21	0.17	0.02	0.14	0.06	0.10	0.16	0.18	0.02	0.17	0.16	0.21	0.18	0.21	0.18	0.33	0.27	0.10
C5'	0.34	0.28	0.26	0.17	0.19	0.20	0.28	0.13	0.35	0.33	0.19	0.08	0.29	0.28	0.12	0.34	0.04	0.51	0.38	0.15
C6	0.26	0.19	0.23	0.17	0.06	0.16	0.15	0.11	0.23	0.24	0.09	0.07	0.22	0.23	0.15	0.26	0.10	0.39	0.32	0.11
N1	0.28	0.21	0.21	0.13	0.06	0.16	0.15	0.11	0.25	0.26	0.10	0.07	0.24	0.22	0.09	0.29	0.04	0.42	0.38	0.10
N3	0.21	0.11	0.16	0.11	0.09	0.14	0.02	0.11	0.12	0.17	0.02	0.23	0.16	0.16	0.08	0.25	0.13	0.34	0.35	0.08
O2	0.32	0.23	0.21	0.12	0.05	0.19	0.11	0.14	0.24	0.28	0.10	0.08	0.27	0.22	0.05	0.35	0.07	0.45	0.36	0.11
O2'	0.18	0.06	0.06	0.01	0.10	0.09	0.01	0.08	0.11	0.13	0.07	0.24	0.10	0.07	0.09	0.24	0.08	0.31	0.39	0.02
O3'	0.46	0.35	0.32	0.21	0.20	0.32	0.30	0.26	0.41	0.42	0.23	0.05	0.38	0.34	0.11	0.51	0.23	0.60	0.29	0.24
O4	0.13	0.01	0.16	0.16	0.27	0.14	0.22	0.14	0.01	0.06	0.16	0.45	0.06	0.16	0.20	0.16	0.26	0.24	0.07	0.11
O4'	0.39	0.35	0.31	0.20	0.25	0.22	0.33	0.14	0.40	0.39	0.26	0.14	0.37	0.32	0.14	0.38	0.08	0.51	0.38	0.16
O5'	0.32	0.24	0.26	0.18	0.15	0.21	0.25	0.15	0.32	0.31	0.15	0.03	0.25	0.27	0.14	0.33	0.00	0.50	0.32	0.18
OP1	0.08	0.04	0.08	0.02	0.01	0.02	0.07	0.07	0.11	0.08	0.03	0.10	0.04	0.08	0.02	0.07	0.26	0.28	0.46	0.03
OP2	0.20	0.15	0.17	0.09	0.09	0.08	0.18	0.02	0.22	0.20	0.07	0.01	0.14	0.18	0.08	0.18	0.11	0.42	0.42	0.07
P	0.20	0.13	0.17	0.11	0.06	0.11	0.16	0.06	0.21	0.19	0.04	0.05	0.13	0.18	0.10	0.20	0.11	0.42	0.37	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.10	0.41	0.24
C2	0.02	0.00	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.07	0.00	0.16	0.09	0.25	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.14	0.13	0.45	0.12
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.01	0.17	0.03	0.17	0.04	0.01	0.10	0.15	0.02	0.01	0.02	0.26	0.28	0.45	0.02
C4	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.16	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.07	0.05	0.38	0.01	0.11	0.01
C4'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.16	0.04	0.04	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.44	0.09
C5	0.02	0.02	0.07	0.17	0.01	0.17	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.17	0.06	0.41	0.02	0.15	0.02
C5'	0.02	0.01	0.02	0.03	0.16	0.01	0.22	0.00	0.18	0.04	0.08	0.20	0.09	0.03	0.04	0.02	0.01	0.20	0.42	0.01
C6	0.03	0.00	0.09	0.17	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.06	0.16	0.05	0.28	0.08	0.09	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.13	0.11	0.28	0.19
N3	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.02	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03	0.03	0.29	0.03	0.06	0.07
N4	0.00	0.03	0.01	0.10	0.00	0.12	0.02	0.20	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.05	0.08	0.06	0.45	0.05	0.26	0.09
O2	0.05	0.01	0.17	0.15	0.04	0.10	0.03	0.09	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.18	0.20	0.04	0.06	0.11	0.37	0.23
O2'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.00	0.09	0.05	0.18	0.00	0.02	0.02	0.03	0.14	0.46	0.12
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.07	0.01	0.17	0.04	0.16	0.03	0.03	0.08	0.20	0.02	0.00	0.02	0.29	0.45	0.47	0.07
O4'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.03	0.06	0.04	0.02	0.02	0.00	0.21	0.16	0.45	0.29
O5'	0.03	0.16	0.14	0.26	0.38	0.02	0.41	0.01	0.28	0.13	0.29	0.45	0.06	0.03	0.29	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.09	0.13	0.28	0.01	0.13	0.02	0.20	0.08	0.11	0.03	0.05	0.11	0.14	0.45	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.41	0.25	0.45	0.45	0.11	0.44	0.15	0.42	0.09	0.28	0.06	0.26	0.37	0.46	0.47	0.45	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.24	0.17	0.12	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01	0.10	0.19	0.07	0.09	0.23	0.12	0.07	0.29	0.00	0.01	0.01	0.00