Doublet Group distance statistics: 48823

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 4, 14, 22, 9, 3, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.011, 0.016, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.011, 0.019, 0.028, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.015, 0.024, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.016, 0.025, 0.035, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.019 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.032, 0.051, 0.070, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.051 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.026, 0.055, 0.084, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.055 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.064, 0.138, 0.211, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.138 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.070, 0.154, 0.238, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.154 std_dev=0.084
C3'	A	0, 0.370, 0.505, 0.640, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.505 std_dev=0.135
C4'	A	0, 0.215, 0.354, 0.493, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.354 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.171, 0.312, 0.453, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.312 std_dev=0.141
OP1	B	0, 0.398, 0.551, 0.705, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.551 std_dev=0.154
P	B	0, 0.366, 0.544, 0.722, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.544 std_dev=0.178
O2'	B	0, 0.275, 0.460, 0.645, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.460 std_dev=0.185
C2'	B	0, 0.301, 0.486, 0.671, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.486 std_dev=0.185
OP2	B	0, 0.378, 0.569, 0.760, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.569 std_dev=0.191
C3'	B	0, 0.390, 0.586, 0.781, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.586 std_dev=0.195
O5'	B	0, 0.344, 0.540, 0.735, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.540 std_dev=0.196
O3'	B	0, 0.466, 0.670, 0.874, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.670 std_dev=0.204
O3'	A	0, 0.990, 1.196, 1.403, 1.716 max_d=1.716 avg_d=1.196 std_dev=0.206
C5'	B	0, 0.412, 0.627, 0.843, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.627 std_dev=0.215
C1'	B	0, 0.399, 0.623, 0.847, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.623 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.431, 0.661, 0.891, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.661 std_dev=0.230
OP2	A	0, 0.228, 0.459, 0.691, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.459 std_dev=0.231
P	A	0, 0.258, 0.490, 0.721, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.490 std_dev=0.232
N1	B	0, 0.419, 0.654, 0.890, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.654 std_dev=0.235
C6	B	0, 0.428, 0.664, 0.899, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.664 std_dev=0.236
O4'	B	0, 0.449, 0.697, 0.944, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.697 std_dev=0.247
C5	B	0, 0.457, 0.720, 0.983, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.720 std_dev=0.263
C2	B	0, 0.460, 0.735, 1.009, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.735 std_dev=0.274
O5'	A	0, 0.571, 0.846, 1.121, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.846 std_dev=0.275
OP1	A	0, 0.275, 0.554, 0.833, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.554 std_dev=0.279
C5'	A	0, 0.281, 0.560, 0.839, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.560 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.505, 0.794, 1.082, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.794 std_dev=0.288
N3	B	0, 0.509, 0.806, 1.103, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.806 std_dev=0.297
O2	B	0, 0.470, 0.779, 1.088, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.779 std_dev=0.309
O4	B	0, 0.552, 0.873, 1.194, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.873 std_dev=0.321

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.00	0.16	0.15	0.19	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.17	0.10	0.20	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.09	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.16	0.21	0.08
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.08	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.14	0.22	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.00	0.03	0.18	0.09	0.21	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.05	0.04	0.02	0.03	0.07	0.00	0.01	0.13	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.09	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.18	0.10	0.21	0.10
C5'	0.07	0.15	0.09	0.02	0.23	0.00	0.24	0.00	0.22	0.16	0.19	0.11	0.07	0.04	0.24	0.01	0.01	0.19	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.18	0.09	0.21	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.01	0.17	0.10	0.20	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.05	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.01	0.04	0.18	0.08	0.21	0.07
O2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.17	0.02	0.06	0.17	0.13	0.20	0.06
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.08	0.02	0.06	0.07	0.06	0.06	0.09	0.11	0.00	0.04	0.08	0.02	0.13	0.18	0.23	0.11
O3'	0.12	0.11	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.08	0.09	0.17	0.04	0.00	0.04	0.13	0.12	0.19	0.26	0.16
O4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.00	0.03	0.18	0.09	0.20	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.02	0.13	0.03	0.00	0.16	0.19	0.13	0.10
O5'	0.16	0.17	0.15	0.06	0.18	0.01	0.18	0.01	0.18	0.17	0.18	0.17	0.13	0.12	0.18	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.15	0.10	0.16	0.14	0.09	0.13	0.10	0.19	0.09	0.10	0.08	0.13	0.18	0.19	0.09	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.20	0.21	0.22	0.21	0.19	0.21	0.20	0.21	0.20	0.21	0.20	0.23	0.26	0.20	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.08	0.09	0.09	0.03	0.10	0.01	0.08	0.06	0.07	0.06	0.11	0.16	0.10	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.13	0.08	0.08	0.11	0.08	0.13	0.08	0.13	0.08	0.13	0.20	0.14	0.10	0.13	0.07	0.12	0.07	0.12	0.07
C2	0.08	0.09	0.10	0.09	0.11	0.07	0.15	0.07	0.14	0.08	0.10	0.13	0.15	0.11	0.12	0.06	0.10	0.07	0.12	0.07
C2'	0.07	0.15	0.07	0.08	0.12	0.08	0.14	0.09	0.13	0.08	0.15	0.22	0.13	0.10	0.15	0.08	0.11	0.08	0.11	0.07
C3'	0.10	0.14	0.09	0.10	0.15	0.10	0.17	0.11	0.17	0.11	0.17	0.19	0.11	0.12	0.19	0.10	0.13	0.08	0.11	0.08
C4	0.09	0.08	0.11	0.11	0.09	0.09	0.14	0.09	0.13	0.07	0.08	0.13	0.16	0.12	0.11	0.08	0.08	0.10	0.18	0.11
C4'	0.10	0.16	0.10	0.10	0.14	0.10	0.15	0.10	0.15	0.11	0.18	0.23	0.13	0.11	0.17	0.10	0.13	0.07	0.12	0.07
C5	0.08	0.09	0.10	0.09	0.09	0.08	0.14	0.08	0.12	0.07	0.09	0.15	0.15	0.11	0.11	0.07	0.09	0.09	0.17	0.10
C5'	0.08	0.13	0.08	0.09	0.12	0.09	0.15	0.10	0.15	0.08	0.14	0.20	0.12	0.10	0.14	0.08	0.13	0.16	0.22	0.15
C6	0.07	0.10	0.09	0.09	0.09	0.07	0.14	0.07	0.13	0.07	0.10	0.17	0.15	0.10	0.12	0.07	0.10	0.08	0.15	0.08
N1	0.07	0.10	0.08	0.08	0.10	0.07	0.14	0.07	0.13	0.07	0.10	0.16	0.15	0.10	0.12	0.06	0.11	0.08	0.13	0.07
N3	0.09	0.09	0.11	0.11	0.11	0.09	0.15	0.08	0.13	0.08	0.09	0.12	0.16	0.12	0.12	0.08	0.08	0.09	0.15	0.09
O2	0.10	0.12	0.12	0.10	0.15	0.07	0.17	0.08	0.16	0.11	0.13	0.14	0.16	0.12	0.16	0.07	0.14	0.08	0.12	0.09
O2'	0.08	0.14	0.09	0.11	0.12	0.10	0.16	0.12	0.15	0.08	0.14	0.22	0.15	0.12	0.15	0.09	0.13	0.12	0.14	0.12
O3'	0.18	0.17	0.19	0.23	0.21	0.21	0.20	0.20	0.21	0.16	0.21	0.20	0.19	0.25	0.24	0.18	0.20	0.14	0.13	0.14
O4	0.10	0.10	0.12	0.12	0.12	0.11	0.15	0.11	0.14	0.10	0.10	0.13	0.16	0.13	0.13	0.10	0.09	0.11	0.20	0.13
O4'	0.10	0.15	0.09	0.10	0.12	0.09	0.13	0.09	0.13	0.09	0.15	0.23	0.14	0.12	0.14	0.09	0.13	0.08	0.12	0.07
O5'	0.14	0.16	0.15	0.15	0.19	0.16	0.24	0.20	0.23	0.16	0.18	0.20	0.15	0.14	0.22	0.16	0.22	0.20	0.19	0.18
OP1	0.19	0.16	0.18	0.18	0.20	0.17	0.25	0.16	0.25	0.18	0.17	0.18	0.22	0.21	0.24	0.17	0.17	0.13	0.15	0.12
OP2	0.21	0.22	0.22	0.23	0.17	0.22	0.19	0.21	0.21	0.20	0.21	0.28	0.24	0.24	0.17	0.21	0.21	0.23	0.28	0.23
P	0.08	0.11	0.09	0.10	0.11	0.09	0.16	0.09	0.15	0.08	0.12	0.18	0.14	0.12	0.14	0.08	0.10	0.08	0.14	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.06	0.07	0.03
C2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.01	0.04	0.06	0.07	0.10	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.01	0.05	0.11	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.10	0.09	0.06
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.08	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.10	0.08	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.09	0.10	0.15	0.10
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.03	0.09	0.11	0.15	0.11
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.05	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.04	0.08	0.09	0.12	0.09
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.06	0.06	0.09	0.05
N3	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.01	0.03	0.07	0.08	0.13	0.08
O2	0.03	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.10	0.02	0.06	0.05	0.08	0.10	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.03	0.09	0.03	0.09	0.18	0.00	0.06	0.08	0.02	0.06	0.13	0.12	0.09
O3'	0.05	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.10	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.10	0.07	0.04
O4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.05	0.00	0.03	0.10	0.12	0.16	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.06	0.07	0.04
O5'	0.03	0.06	0.05	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.08	0.06	0.07	0.05	0.06	0.04	0.10	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.07	0.10	0.10	0.10	0.08	0.11	0.07	0.09	0.06	0.08	0.08	0.13	0.10	0.12	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.10	0.09	0.08	0.15	0.04	0.15	0.02	0.12	0.09	0.13	0.10	0.12	0.07	0.16	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.06	0.06	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.09	0.05	0.08	0.06	0.09	0.04	0.12	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00