Doublet Group distance statistics: 48827

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 5, 3, 5, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.012, 0.048, 0.083, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.048 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.034, 0.073, 0.112, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.073 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.048, 0.089, 0.130, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.089 std_dev=0.041
C3'	A	0, 0.078, 0.137, 0.197, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.137 std_dev=0.060
C4'	A	0, 0.063, 0.125, 0.186, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.125 std_dev=0.061
O3'	A	0, 0.127, 0.222, 0.317, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.222 std_dev=0.095
C5'	A	0, 0.138, 0.241, 0.343, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.241 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.040, 0.149, 0.257, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.149 std_dev=0.108
P	B	0, 0.268, 0.452, 0.635, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.452 std_dev=0.184
OP1	A	0, 0.153, 0.342, 0.531, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.342 std_dev=0.189
OP2	B	0, 0.278, 0.503, 0.727, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.503 std_dev=0.225
OP1	B	0, 0.204, 0.440, 0.675, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.440 std_dev=0.236
O5'	B	0, 0.198, 0.510, 0.823, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.510 std_dev=0.312
C5'	B	0, 0.142, 0.482, 0.822, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.482 std_dev=0.340
O5'	A	0, -0.009, 0.354, 0.717, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.354 std_dev=0.363
P	A	0, -0.062, 0.394, 0.849, 2.327 max_d=2.327 avg_d=0.394 std_dev=0.456
C4'	B	0, -0.066, 0.602, 1.270, 3.456 max_d=3.456 avg_d=0.602 std_dev=0.668
OP2	A	0, -0.305, 0.503, 1.310, 4.042 max_d=4.042 avg_d=0.503 std_dev=0.807
O4'	B	0, -0.176, 0.692, 1.561, 4.467 max_d=4.467 avg_d=0.692 std_dev=0.869
C3'	B	0, -0.321, 0.695, 1.711, 5.158 max_d=5.158 avg_d=0.695 std_dev=1.016
C6	B	0, -0.290, 0.806, 1.903, 5.621 max_d=5.621 avg_d=0.806 std_dev=1.096
C5	B	0, -0.324, 0.858, 2.040, 6.050 max_d=6.050 avg_d=0.858 std_dev=1.182
O3'	B	0, -0.506, 0.682, 1.870, 5.929 max_d=5.929 avg_d=0.682 std_dev=1.188
C1'	B	0, -0.430, 0.817, 2.063, 6.314 max_d=6.314 avg_d=0.817 std_dev=1.247
N1	B	0, -0.456, 0.869, 2.194, 6.717 max_d=6.717 avg_d=0.869 std_dev=1.325
C2'	B	0, -0.495, 0.853, 2.201, 6.812 max_d=6.812 avg_d=0.853 std_dev=1.348
C4	B	0, -0.525, 0.981, 2.487, 7.620 max_d=7.620 avg_d=0.981 std_dev=1.506
O2'	B	0, -0.619, 0.899, 2.416, 7.622 max_d=7.622 avg_d=0.899 std_dev=1.517
O4	B	0, -0.568, 1.042, 2.651, 8.136 max_d=8.136 avg_d=1.042 std_dev=1.610
C2	B	0, -0.662, 0.995, 2.652, 8.327 max_d=8.327 avg_d=0.995 std_dev=1.657
N3	B	0, -0.682, 1.041, 2.764, 8.660 max_d=8.660 avg_d=1.041 std_dev=1.723
O2	B	0, -0.814, 1.070, 2.954, 9.420 max_d=9.420 avg_d=1.070 std_dev=1.884

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.04	0.17	0.11
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.16	0.06	0.36	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.00	0.03	0.04	0.02	0.12	0.04	0.20	0.11
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.17	0.04	0.22	0.12
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.25	0.10	0.57	0.34
C4'	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.27	0.10	0.59	0.36
C5'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.07	0.08	0.05	0.10	0.02	0.10	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.24	0.08	0.46	0.29
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.16	0.06	0.34	0.21
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.21	0.08	0.47	0.28
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.12	0.05	0.29	0.17
O2'	0.01	0.06	0.00	0.03	0.04	0.10	0.02	0.10	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.06	0.04	0.06	0.09	0.07	0.12	0.08
O3'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.07	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.06	0.17	0.07
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.27	0.11	0.63	0.37
O4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.07	0.05
O5'	0.08	0.16	0.12	0.17	0.25	0.01	0.27	0.00	0.24	0.16	0.21	0.12	0.09	0.13	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.06	0.04	0.04	0.10	0.05	0.10	0.05	0.08	0.06	0.08	0.05	0.07	0.06	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.36	0.20	0.22	0.57	0.03	0.59	0.02	0.46	0.34	0.47	0.29	0.12	0.17	0.63	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.22	0.11	0.12	0.34	0.02	0.36	0.01	0.29	0.21	0.28	0.17	0.08	0.07	0.37	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.12	0.23	0.38	0.22	0.12	0.25	0.17	0.21	0.13	0.16	0.08	0.26	0.63	0.25	0.18	0.15	0.07	0.11	0.09
C2	0.08	0.08	0.21	0.34	0.15	0.11	0.18	0.16	0.15	0.10	0.10	0.07	0.22	0.55	0.17	0.16	0.15	0.06	0.09	0.07
C2'	0.24	0.29	0.09	0.26	0.38	0.06	0.39	0.15	0.34	0.29	0.33	0.25	0.11	0.52	0.41	0.29	0.19	0.07	0.12	0.10
C3'	0.21	0.25	0.13	0.29	0.34	0.08	0.35	0.16	0.31	0.25	0.29	0.21	0.14	0.55	0.38	0.26	0.20	0.06	0.10	0.09
C4	0.22	0.24	0.44	0.53	0.17	0.30	0.13	0.31	0.15	0.21	0.21	0.28	0.47	0.71	0.15	0.12	0.08	0.14	0.09	0.09
C4'	0.08	0.11	0.27	0.42	0.23	0.16	0.26	0.21	0.21	0.12	0.15	0.07	0.31	0.70	0.27	0.16	0.15	0.05	0.10	0.08
C5	0.24	0.25	0.50	0.58	0.16	0.33	0.12	0.32	0.14	0.21	0.22	0.31	0.54	0.79	0.14	0.13	0.08	0.12	0.09	0.07
C5'	0.13	0.10	0.44	0.57	0.09	0.29	0.13	0.32	0.09	0.08	0.06	0.17	0.50	0.85	0.13	0.08	0.09	0.07	0.12	0.05
C6	0.13	0.14	0.41	0.52	0.06	0.26	0.06	0.27	0.06	0.10	0.11	0.20	0.45	0.76	0.06	0.06	0.09	0.08	0.08	0.05
N1	0.04	0.05	0.29	0.41	0.12	0.16	0.15	0.20	0.12	0.05	0.06	0.07	0.31	0.65	0.15	0.11	0.13	0.06	0.09	0.06
N3	0.07	0.08	0.28	0.39	0.06	0.17	0.07	0.21	0.06	0.06	0.07	0.11	0.29	0.57	0.07	0.07	0.11	0.10	0.08	0.05
O2	0.21	0.22	0.09	0.22	0.29	0.07	0.31	0.10	0.28	0.24	0.25	0.20	0.11	0.43	0.31	0.28	0.20	0.10	0.10	0.13
O2'	0.25	0.31	0.09	0.27	0.41	0.07	0.41	0.16	0.35	0.30	0.36	0.28	0.10	0.52	0.45	0.29	0.16	0.07	0.16	0.08
O3'	0.32	0.38	0.08	0.21	0.47	0.07	0.46	0.14	0.41	0.37	0.42	0.35	0.08	0.47	0.50	0.35	0.24	0.08	0.11	0.12
O4	0.35	0.36	0.53	0.59	0.29	0.39	0.26	0.37	0.28	0.33	0.34	0.40	0.56	0.73	0.28	0.25	0.11	0.19	0.11	0.14
O4'	0.04	0.05	0.35	0.48	0.14	0.20	0.18	0.22	0.13	0.05	0.07	0.09	0.39	0.75	0.18	0.10	0.11	0.07	0.10	0.08
O5'	0.13	0.11	0.23	0.34	0.20	0.07	0.26	0.09	0.23	0.15	0.13	0.08	0.26	0.61	0.22	0.26	0.29	0.17	0.11	0.21
OP1	0.15	0.17	0.46	0.55	0.08	0.27	0.10	0.26	0.08	0.12	0.13	0.25	0.52	0.82	0.09	0.10	0.14	0.07	0.09	0.08
OP2	0.28	0.21	0.10	0.15	0.28	0.24	0.36	0.27	0.36	0.28	0.22	0.17	0.13	0.39	0.29	0.45	0.52	0.41	0.36	0.44
P	0.14	0.11	0.22	0.30	0.20	0.08	0.27	0.09	0.24	0.16	0.13	0.10	0.26	0.56	0.22	0.28	0.35	0.24	0.20	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.19	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.12	0.07	0.17	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.07	0.00	0.01	0.03	0.00	0.13	0.15	0.17	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.07	0.03	0.06	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.17	0.23	0.16	0.07
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.17	0.12	0.12	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.11	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.17	0.13	0.12	0.10
C5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.03	0.07	0.01	0.01	0.15	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.15	0.10	0.14	0.11
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.12	0.07	0.17	0.10
N3	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.15	0.09	0.14	0.10
O2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.11	0.06	0.19	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.04	0.03	0.03	0.09	0.17	0.17	0.04
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.07	0.03	0.06	0.09	0.04	0.00	0.06	0.02	0.15	0.31	0.14	0.10
O4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.17	0.14	0.11	0.10
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.21	0.12
O5'	0.07	0.12	0.13	0.17	0.17	0.01	0.17	0.01	0.15	0.12	0.15	0.11	0.09	0.15	0.17	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.15	0.23	0.12	0.11	0.13	0.15	0.10	0.07	0.09	0.06	0.17	0.31	0.14	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.17	0.17	0.16	0.12	0.21	0.12	0.25	0.14	0.17	0.14	0.19	0.17	0.14	0.11	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.10	0.05	0.07	0.10	0.04	0.10	0.02	0.11	0.10	0.10	0.10	0.04	0.10	0.10	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00