Doublet Group distance statistics: 48831

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.015, 0.034, 0.054, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.008, 0.053, 0.099, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.053 std_dev=0.045
O2	A	0, 0.036, 0.084, 0.132, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.084 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.073, 0.264, 0.456, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.264 std_dev=0.191
O4'	A	0, 0.107, 0.326, 0.545, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.326 std_dev=0.219
OP2	B	0, 0.172, 0.391, 0.610, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.391 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.169, 0.395, 0.620, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.395 std_dev=0.226
O2'	A	0, 0.087, 0.315, 0.543, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.315 std_dev=0.228
C5	B	0, 0.146, 0.375, 0.604, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.375 std_dev=0.229
P	B	0, 0.163, 0.404, 0.646, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.404 std_dev=0.241
OP1	B	0, 0.170, 0.424, 0.678, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.424 std_dev=0.254
C4'	A	0, 0.138, 0.407, 0.675, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.407 std_dev=0.268
C3'	A	0, 0.126, 0.427, 0.727, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.427 std_dev=0.300
O4	B	0, 0.187, 0.508, 0.829, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.508 std_dev=0.321
O5'	B	0, 0.086, 0.410, 0.733, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.410 std_dev=0.323
C4	B	0, 0.180, 0.507, 0.834, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.507 std_dev=0.327
C5'	B	0, 0.089, 0.442, 0.794, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.442 std_dev=0.353
O5'	A	0, 0.223, 0.621, 1.020, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.621 std_dev=0.399
N1	B	0, 0.163, 0.570, 0.978, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.570 std_dev=0.408
O4'	B	0, 0.162, 0.572, 0.983, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.572 std_dev=0.410
C4'	B	0, 0.135, 0.570, 1.004, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.570 std_dev=0.435
O3'	A	0, 0.184, 0.629, 1.074, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.629 std_dev=0.445
OP2	A	0, 0.343, 0.794, 1.244, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.794 std_dev=0.451
P	A	0, 0.348, 0.812, 1.276, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.812 std_dev=0.464
C1'	B	0, 0.177, 0.642, 1.107, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.642 std_dev=0.465
C3'	B	0, 0.174, 0.640, 1.107, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.640 std_dev=0.467
C5'	A	0, 0.247, 0.722, 1.197, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.722 std_dev=0.475
C2'	B	0, 0.203, 0.708, 1.214, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.708 std_dev=0.505
O3'	B	0, 0.233, 0.767, 1.302, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.767 std_dev=0.534
N3	B	0, 0.229, 0.767, 1.305, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.767 std_dev=0.538
OP1	A	0, 0.449, 1.008, 1.567, 1.528 max_d=1.528 avg_d=1.008 std_dev=0.559
C2	B	0, 0.235, 0.831, 1.426, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.831 std_dev=0.596
O2'	B	0, 0.308, 0.922, 1.535, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.922 std_dev=0.613
O2	B	0, 0.335, 1.129, 1.923, 2.468 max_d=2.468 avg_d=1.129 std_dev=0.794

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.19	0.06	0.12
C2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01	0.07	0.10	0.13	0.18	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.03	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.13	0.00	0.02	0.06	0.00	0.08	0.06	0.17	0.04
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.07	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.14	0.11	0.20	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.13	0.15	0.27	0.16
C4'	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.06	0.00	0.00	0.15	0.03	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.13	0.15	0.26	0.16
C5'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.12	0.09	0.11	0.10	0.06	0.05	0.14	0.02	0.00	0.12	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.05	0.12	0.12	0.20	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.09	0.13	0.15	0.11
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.11	0.13	0.23	0.14
O2	0.06	0.00	0.13	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.14	0.02	0.12	0.10	0.15	0.17	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.02	0.08	0.15	0.00	0.05	0.06	0.02	0.06	0.14	0.11	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.00	0.08	0.03	0.10	0.05	0.11	0.03	0.09	0.14	0.05	0.00	0.11	0.02	0.17	0.21	0.25	0.20
O4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.02	0.13	0.17	0.30	0.18
O4'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.30	0.14	0.22
O5'	0.04	0.10	0.08	0.14	0.13	0.00	0.13	0.00	0.12	0.09	0.11	0.10	0.06	0.17	0.13	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.13	0.06	0.11	0.15	0.15	0.15	0.12	0.12	0.13	0.13	0.15	0.14	0.21	0.17	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.18	0.17	0.20	0.27	0.03	0.26	0.02	0.20	0.15	0.23	0.17	0.11	0.25	0.30	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.11	0.04	0.12	0.16	0.07	0.16	0.02	0.12	0.11	0.14	0.12	0.05	0.20	0.18	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.10	0.03	0.05	0.15	0.06	0.18	0.05	0.18	0.13	0.12	0.08	0.04	0.10	0.19	0.19	0.05	0.15	0.11	0.09
C2	0.07	0.09	0.07	0.12	0.14	0.06	0.12	0.08	0.11	0.05	0.14	0.12	0.07	0.17	0.20	0.14	0.09	0.13	0.10	0.09
C2'	0.08	0.06	0.12	0.18	0.11	0.12	0.07	0.16	0.07	0.06	0.10	0.06	0.11	0.23	0.17	0.11	0.20	0.15	0.13	0.14
C3'	0.07	0.05	0.12	0.20	0.09	0.14	0.05	0.20	0.06	0.05	0.08	0.05	0.11	0.25	0.15	0.09	0.22	0.15	0.12	0.17
C4	0.12	0.19	0.19	0.23	0.15	0.15	0.10	0.15	0.09	0.11	0.21	0.25	0.21	0.29	0.21	0.15	0.15	0.15	0.13	0.15
C4'	0.13	0.13	0.03	0.05	0.19	0.04	0.19	0.07	0.17	0.14	0.17	0.12	0.04	0.11	0.23	0.16	0.08	0.12	0.08	0.08
C5	0.10	0.15	0.18	0.21	0.13	0.13	0.11	0.13	0.10	0.09	0.18	0.21	0.19	0.28	0.19	0.13	0.14	0.15	0.12	0.13
C5'	0.18	0.19	0.10	0.04	0.25	0.07	0.25	0.02	0.23	0.19	0.22	0.17	0.10	0.08	0.29	0.19	0.05	0.12	0.09	0.06
C6	0.07	0.10	0.12	0.17	0.12	0.09	0.12	0.10	0.11	0.06	0.14	0.15	0.13	0.24	0.18	0.13	0.11	0.14	0.10	0.11
N1	0.07	0.08	0.07	0.12	0.13	0.06	0.13	0.08	0.12	0.06	0.13	0.10	0.07	0.18	0.19	0.14	0.09	0.14	0.10	0.09
N3	0.09	0.15	0.14	0.17	0.15	0.10	0.10	0.11	0.09	0.08	0.19	0.20	0.14	0.22	0.21	0.14	0.12	0.14	0.10	0.11
O2	0.08	0.09	0.04	0.09	0.15	0.07	0.13	0.09	0.11	0.07	0.14	0.09	0.03	0.13	0.21	0.15	0.08	0.12	0.11	0.09
O2'	0.11	0.04	0.10	0.15	0.08	0.11	0.09	0.13	0.11	0.09	0.05	0.02	0.10	0.18	0.14	0.15	0.18	0.18	0.16	0.15
O3'	0.13	0.08	0.18	0.25	0.11	0.21	0.11	0.27	0.12	0.11	0.09	0.07	0.16	0.29	0.15	0.14	0.29	0.18	0.15	0.22
O4	0.18	0.24	0.25	0.28	0.18	0.20	0.10	0.19	0.10	0.16	0.25	0.31	0.27	0.34	0.22	0.18	0.18	0.18	0.17	0.19
O4'	0.22	0.20	0.12	0.04	0.27	0.11	0.30	0.06	0.28	0.23	0.23	0.18	0.12	0.04	0.30	0.24	0.04	0.14	0.11	0.08
O5'	0.14	0.09	0.09	0.10	0.15	0.08	0.20	0.06	0.19	0.14	0.10	0.07	0.09	0.15	0.18	0.18	0.09	0.15	0.10	0.10
OP1	0.15	0.17	0.20	0.20	0.13	0.13	0.12	0.11	0.15	0.14	0.18	0.21	0.20	0.25	0.16	0.15	0.14	0.18	0.13	0.13
OP2	0.24	0.16	0.15	0.13	0.21	0.20	0.29	0.20	0.30	0.22	0.16	0.14	0.15	0.13	0.22	0.31	0.20	0.32	0.22	0.21
P	0.16	0.13	0.17	0.16	0.12	0.13	0.17	0.11	0.19	0.15	0.13	0.16	0.17	0.21	0.14	0.20	0.14	0.20	0.14	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.11	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.01	0.02	0.13	0.18	0.10	0.08
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.07	0.14	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.24	0.12	0.09
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.13	0.16	0.01	0.00	0.10	0.01	0.05	0.27	0.17	0.13
C4	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.00	0.04	0.15	0.13	0.10	0.10
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.07	0.07	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.14	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.11	0.07	0.11	0.08
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.13	0.00	0.13	0.00	0.09	0.06	0.11	0.08	0.02	0.02	0.15	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.06	0.03	0.12	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.07	0.11	0.05	0.04
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.01	0.03	0.16	0.19	0.13	0.11
O2	0.03	0.00	0.14	0.16	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.20	0.02	0.02	0.14	0.24	0.15	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.26	0.12	0.08
O3'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.14	0.20	0.04	0.00	0.11	0.01	0.06	0.37	0.24	0.19
O4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.00	0.05	0.17	0.15	0.14	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.14	0.12
O5'	0.03	0.13	0.04	0.05	0.15	0.01	0.11	0.01	0.06	0.07	0.16	0.14	0.03	0.06	0.17	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.11	0.18	0.24	0.27	0.13	0.14	0.07	0.06	0.03	0.11	0.19	0.24	0.26	0.37	0.15	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.10	0.12	0.17	0.10	0.03	0.11	0.01	0.12	0.05	0.13	0.15	0.12	0.24	0.14	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.08	0.09	0.13	0.10	0.02	0.08	0.01	0.07	0.04	0.11	0.12	0.08	0.19	0.14	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00