Doublet Group distance statistics: 48832

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.011, 0.029, 0.046, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.015, 0.034, 0.053, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.034 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.010, 0.030, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.041 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.025, 0.076, 0.127, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.076 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.055, 0.211, 0.367, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.211 std_dev=0.156
C2'	A	0, 0.104, 0.291, 0.478, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.291 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.127, 0.318, 0.508, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.318 std_dev=0.191
C3'	A	0, 0.088, 0.348, 0.608, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.348 std_dev=0.260
O5'	A	0, 0.185, 0.459, 0.734, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.459 std_dev=0.275
OP2	B	0, 0.214, 0.569, 0.924, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.569 std_dev=0.355
OP1	B	0, 0.237, 0.607, 0.977, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.607 std_dev=0.370
C5'	A	0, 0.198, 0.584, 0.969, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.584 std_dev=0.385
O2'	A	0, 0.256, 0.644, 1.032, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.644 std_dev=0.388
P	B	0, 0.188, 0.589, 0.991, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.589 std_dev=0.401
C3'	B	0, 0.113, 0.562, 1.010, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.562 std_dev=0.449
C2'	B	0, 0.107, 0.574, 1.041, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.574 std_dev=0.467
O3'	A	0, 0.237, 0.731, 1.224, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.731 std_dev=0.494
O5'	B	0, 0.126, 0.633, 1.141, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.633 std_dev=0.507
O3'	B	0, 0.114, 0.629, 1.143, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.629 std_dev=0.515
C5'	B	0, 0.159, 0.699, 1.238, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.699 std_dev=0.540
P	A	0, 0.168, 0.709, 1.250, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.709 std_dev=0.541
O2'	B	0, 0.229, 0.771, 1.314, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.771 std_dev=0.543
O2	B	0, -0.002, 0.548, 1.098, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.548 std_dev=0.550
OP1	A	0, 0.164, 0.732, 1.300, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.732 std_dev=0.568
C4'	B	0, 0.115, 0.685, 1.255, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.685 std_dev=0.570
C1'	B	0, 0.055, 0.664, 1.274, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.664 std_dev=0.609
C2	B	0, -0.005, 0.649, 1.302, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.649 std_dev=0.654
O4'	B	0, 0.051, 0.718, 1.384, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.718 std_dev=0.666
N1	B	0, 0.049, 0.742, 1.434, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.742 std_dev=0.692
OP2	A	0, 0.197, 0.899, 1.600, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.899 std_dev=0.701
N3	B	0, 0.039, 0.792, 1.545, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.792 std_dev=0.753
C6	B	0, 0.131, 0.953, 1.775, 2.255 max_d=2.255 avg_d=0.953 std_dev=0.822
C4	B	0, 0.139, 1.049, 1.960, 2.535 max_d=2.535 avg_d=1.049 std_dev=0.911
C5	B	0, 0.178, 1.121, 2.064, 2.599 max_d=2.599 avg_d=1.121 std_dev=0.943
O4	B	0, 0.188, 1.202, 2.216, 2.856 max_d=2.856 avg_d=1.202 std_dev=1.014

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.06	0.03	0.21	0.05	0.00	0.05	0.19	0.11	0.07
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.01	0.02	0.19	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.32	0.01	0.02	0.14	0.20	0.13	0.11
C2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.07	0.02	0.06	0.06	0.06	0.02	0.09	0.16	0.00	0.08	0.08	0.02	0.06	0.22	0.11	0.09
C3'	0.04	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.01	0.07	0.20	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.35	0.14	0.19
C4	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.11	0.01	0.34	0.02	0.03	0.01	0.03	0.23	0.21	0.00	0.04	0.24	0.21	0.11	0.16
C4'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.16	0.01	0.15	0.06	0.05	0.08	0.04	0.04	0.11	0.01	0.02	0.21	0.05	0.09
C5	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.16	0.00	0.39	0.01	0.02	0.02	0.03	0.17	0.12	0.02	0.06	0.27	0.22	0.11	0.18
C5'	0.07	0.19	0.06	0.02	0.34	0.01	0.39	0.00	0.34	0.21	0.26	0.09	0.04	0.09	0.35	0.02	0.01	0.09	0.05	0.03
C6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.15	0.01	0.34	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.12	0.03	0.06	0.22	0.21	0.08	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.02	0.21	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.20	0.03	0.02	0.14	0.20	0.09	0.10
N3	0.04	0.01	0.09	0.07	0.01	0.05	0.02	0.26	0.01	0.02	0.00	0.03	0.24	0.29	0.02	0.03	0.19	0.21	0.12	0.14
O2	0.06	0.01	0.16	0.20	0.03	0.08	0.03	0.09	0.02	0.02	0.03	0.00	0.28	0.43	0.04	0.04	0.10	0.20	0.19	0.12
O2'	0.03	0.22	0.00	0.04	0.23	0.04	0.17	0.04	0.12	0.10	0.24	0.28	0.00	0.07	0.24	0.03	0.09	0.25	0.14	0.11
O3'	0.21	0.32	0.08	0.02	0.21	0.04	0.12	0.09	0.12	0.20	0.29	0.43	0.07	0.00	0.21	0.15	0.15	0.57	0.33	0.34
O4	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.11	0.02	0.35	0.03	0.03	0.02	0.04	0.24	0.21	0.00	0.04	0.26	0.22	0.12	0.18
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.04	0.03	0.15	0.04	0.00	0.10	0.13	0.15	0.08
O5'	0.05	0.14	0.06	0.08	0.24	0.02	0.27	0.01	0.22	0.14	0.19	0.10	0.09	0.15	0.26	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02
OP1	0.19	0.20	0.22	0.35	0.21	0.21	0.22	0.09	0.21	0.20	0.21	0.20	0.25	0.57	0.22	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.13	0.11	0.14	0.11	0.05	0.11	0.05	0.08	0.09	0.12	0.19	0.14	0.33	0.12	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.09	0.19	0.16	0.09	0.18	0.03	0.14	0.10	0.14	0.12	0.11	0.34	0.18	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.05	0.06	0.03	0.09	0.06	0.16	0.14	0.16	0.08	0.05	0.11	0.24	0.10	0.09	0.03	0.20	0.25	0.28	0.16
C2	0.12	0.12	0.16	0.12	0.08	0.04	0.08	0.06	0.11	0.11	0.12	0.16	0.29	0.17	0.09	0.06	0.18	0.20	0.25	0.11
C2'	0.09	0.09	0.11	0.13	0.12	0.16	0.19	0.22	0.19	0.09	0.07	0.17	0.14	0.08	0.12	0.13	0.27	0.32	0.30	0.23
C3'	0.30	0.30	0.31	0.30	0.29	0.32	0.32	0.34	0.32	0.30	0.29	0.34	0.30	0.24	0.29	0.31	0.36	0.34	0.30	0.28
C4	0.17	0.15	0.21	0.15	0.12	0.09	0.19	0.04	0.22	0.18	0.12	0.16	0.33	0.18	0.10	0.11	0.11	0.12	0.27	0.08
C4'	0.18	0.20	0.18	0.18	0.20	0.19	0.23	0.21	0.22	0.18	0.20	0.25	0.22	0.13	0.20	0.18	0.24	0.21	0.29	0.15
C5	0.18	0.15	0.20	0.13	0.18	0.08	0.26	0.05	0.27	0.20	0.14	0.16	0.34	0.18	0.16	0.11	0.10	0.14	0.32	0.09
C5'	0.11	0.14	0.09	0.04	0.17	0.04	0.25	0.03	0.24	0.13	0.14	0.22	0.20	0.06	0.18	0.07	0.11	0.09	0.36	0.12
C6	0.16	0.13	0.17	0.10	0.16	0.06	0.24	0.06	0.25	0.17	0.12	0.14	0.32	0.16	0.15	0.08	0.12	0.18	0.32	0.10
N1	0.14	0.12	0.15	0.09	0.10	0.04	0.17	0.08	0.19	0.14	0.11	0.16	0.31	0.16	0.09	0.06	0.16	0.21	0.29	0.11
N3	0.15	0.13	0.20	0.15	0.08	0.08	0.11	0.03	0.15	0.14	0.12	0.16	0.31	0.19	0.08	0.09	0.14	0.16	0.24	0.08
O2	0.11	0.17	0.14	0.12	0.18	0.03	0.13	0.07	0.10	0.12	0.19	0.18	0.25	0.17	0.20	0.06	0.22	0.18	0.20	0.12
O2'	0.15	0.08	0.20	0.24	0.21	0.26	0.31	0.34	0.28	0.14	0.09	0.19	0.13	0.19	0.23	0.21	0.40	0.47	0.40	0.40
O3'	0.61	0.55	0.63	0.61	0.52	0.62	0.56	0.62	0.60	0.59	0.51	0.55	0.64	0.57	0.48	0.62	0.61	0.56	0.44	0.52
O4	0.20	0.17	0.24	0.18	0.15	0.12	0.21	0.08	0.24	0.21	0.15	0.18	0.34	0.20	0.12	0.14	0.11	0.10	0.24	0.11
O4'	0.07	0.04	0.05	0.02	0.10	0.03	0.16	0.09	0.16	0.07	0.06	0.09	0.21	0.11	0.11	0.01	0.17	0.19	0.29	0.12
O5'	0.08	0.09	0.06	0.05	0.15	0.07	0.23	0.10	0.21	0.10	0.10	0.17	0.19	0.03	0.16	0.05	0.19	0.19	0.25	0.07
OP1	0.09	0.17	0.12	0.15	0.08	0.15	0.15	0.17	0.12	0.07	0.15	0.30	0.09	0.13	0.10	0.11	0.25	0.21	0.23	0.12
OP2	0.06	0.19	0.08	0.12	0.06	0.14	0.12	0.17	0.10	0.05	0.17	0.31	0.07	0.07	0.08	0.10	0.25	0.24	0.15	0.10
P	0.02	0.12	0.03	0.07	0.08	0.08	0.18	0.12	0.16	0.03	0.10	0.23	0.12	0.03	0.10	0.05	0.21	0.19	0.21	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.08	0.19	0.10
C2	0.03	0.00	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.01	0.07	0.04	0.06	0.14	0.09
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.03	0.09	0.02	0.04	0.10	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.10	0.28	0.13
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.22	0.07
C4	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.02	0.11	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.05	0.02	0.07	0.04	0.05	0.08	0.04
C5'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.09	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.04	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.05	0.03	0.08	0.02	0.06	0.15	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.07	0.17	0.10
N3	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.05
O2	0.06	0.01	0.10	0.05	0.01	0.11	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.08	0.02	0.14	0.08	0.10	0.18	0.12
O2'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.02	0.14	0.03	0.14	0.03	0.05	0.21	0.00	0.04	0.07	0.02	0.06	0.13	0.36	0.18
O3'	0.04	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.08	0.04	0.00	0.06	0.02	0.04	0.07	0.22	0.07
O4	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.07	0.06	0.00	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.04	0.14	0.02	0.02	0.04	0.00	0.05	0.09	0.11	0.06
O5'	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.08	0.06	0.04	0.05	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.06	0.10	0.07	0.05	0.08	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.10	0.13	0.07	0.08	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.14	0.28	0.22	0.03	0.11	0.08	0.03	0.15	0.17	0.07	0.18	0.36	0.22	0.06	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.09	0.13	0.07	0.03	0.03	0.04	0.01	0.08	0.10	0.05	0.12	0.18	0.07	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00