Doublet Group distance statistics: 48850

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.008
O4	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.033 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.023, 0.070, 0.118, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.070 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.006, 0.059, 0.113, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.059 std_dev=0.053
O5'	A	0, 0.053, 0.110, 0.167, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.110 std_dev=0.057
C3'	A	0, 0.038, 0.105, 0.173, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.105 std_dev=0.068
C4'	A	0, 0.029, 0.097, 0.164, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.097 std_dev=0.068
O2'	A	0, 0.038, 0.112, 0.185, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.112 std_dev=0.073
O3'	A	0, 0.055, 0.136, 0.218, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.136 std_dev=0.082
C5'	A	0, 0.024, 0.150, 0.276, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.150 std_dev=0.126
P	A	0, 0.097, 0.232, 0.366, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.232 std_dev=0.135
N1	B	0, 0.064, 0.227, 0.390, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.227 std_dev=0.163
N3	B	0, 0.132, 0.296, 0.459, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.296 std_dev=0.163
C1'	B	0, 0.081, 0.249, 0.416, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.249 std_dev=0.167
O4'	B	0, 0.077, 0.248, 0.419, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.248 std_dev=0.171
C2'	B	0, 0.089, 0.261, 0.433, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.261 std_dev=0.172
O2'	B	0, 0.106, 0.281, 0.457, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.281 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.146, 0.325, 0.505, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.325 std_dev=0.180
C4'	B	0, 0.081, 0.262, 0.443, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.262 std_dev=0.181
C5'	B	0, 0.059, 0.246, 0.433, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.246 std_dev=0.187
C3'	B	0, 0.098, 0.285, 0.473, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.285 std_dev=0.187
O5'	B	0, 0.044, 0.239, 0.433, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.239 std_dev=0.194
O3'	B	0, 0.121, 0.324, 0.527, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.324 std_dev=0.203
C4	B	0, 0.005, 0.210, 0.414, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.210 std_dev=0.205
OP1	A	0, 0.136, 0.343, 0.551, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.343 std_dev=0.208
P	B	0, 0.077, 0.297, 0.517, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.297 std_dev=0.220
OP2	A	0, 0.131, 0.351, 0.571, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.351 std_dev=0.220
O4	B	0, -0.010, 0.212, 0.435, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.212 std_dev=0.222
C6	B	0, 0.026, 0.263, 0.499, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.263 std_dev=0.236
OP1	B	0, 0.037, 0.290, 0.542, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.290 std_dev=0.252
C5	B	0, 0.040, 0.297, 0.554, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.297 std_dev=0.257
OP2	B	0, 0.129, 0.388, 0.647, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.388 std_dev=0.259
O2	B	0, 0.191, 0.468, 0.746, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.468 std_dev=0.278

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.11	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.06	0.07	0.14	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.10	0.03
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.05	0.09	0.04
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.06	0.07	0.15	0.08
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.06	0.14	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01
C6	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.14	0.07
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.13	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.06	0.08	0.15	0.08
O2	0.03	0.00	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.06	0.06	0.08	0.14	0.08
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.10	0.08	0.11	0.07
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.07	0.15	0.08
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.05	0.11	0.06
O5'	0.05	0.06	0.03	0.07	0.06	0.01	0.06	0.00	0.06	0.06	0.06	0.06	0.01	0.10	0.05	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.04	0.07	0.03	0.05	0.07	0.02	0.06	0.02	0.06	0.06	0.08	0.08	0.03	0.08	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.14	0.10	0.09	0.15	0.08	0.14	0.05	0.14	0.13	0.15	0.14	0.10	0.11	0.15	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.03	0.04	0.08	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.08	0.08	0.02	0.07	0.08	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.02	0.08	0.04	0.05	0.06	0.13	0.07
C2	0.02	0.05	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	0.06	0.04	0.02	0.07	0.03	0.02	0.03	0.10	0.04
C2'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.07	0.03	0.04	0.06	0.12	0.07
C3'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.02	0.04	0.06	0.13	0.07
C4	0.04	0.09	0.01	0.02	0.09	0.03	0.04	0.01	0.03	0.05	0.11	0.11	0.01	0.03	0.12	0.06	0.05	0.04	0.12	0.06
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.13	0.07
C5	0.07	0.10	0.04	0.04	0.10	0.05	0.06	0.03	0.05	0.07	0.11	0.11	0.03	0.05	0.12	0.08	0.08	0.08	0.15	0.09
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.13	0.07
C6	0.06	0.09	0.04	0.04	0.10	0.05	0.06	0.03	0.05	0.07	0.11	0.10	0.03	0.05	0.12	0.08	0.08	0.08	0.15	0.09
N1	0.04	0.06	0.02	0.02	0.07	0.03	0.03	0.01	0.03	0.04	0.08	0.08	0.02	0.02	0.09	0.05	0.05	0.06	0.13	0.07
N3	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.07	0.07	0.04	0.02	0.09	0.03	0.02	0.02	0.10	0.04
O2	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.08	0.02
O2'	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.05	0.07	0.12	0.07
O3'	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.04	0.07	0.13	0.07
O4	0.05	0.10	0.01	0.02	0.09	0.03	0.04	0.02	0.03	0.05	0.12	0.12	0.01	0.03	0.11	0.06	0.05	0.04	0.12	0.06
O4'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.06	0.13	0.07
O5'	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.10	0.06
OP1	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.05	0.04	0.05	0.08	0.09	0.16	0.10
OP2	0.07	0.06	0.08	0.08	0.08	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.06	0.06	0.07	0.07	0.08	0.09	0.13	0.14	0.21	0.16
P	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.07	0.08	0.14	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.06	0.14	0.08
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.06	0.05	0.15	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.13	0.06
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.08	0.05
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.06	0.06	0.11	0.08
O2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.05	0.01	0.06	0.05	0.05	0.06	0.05
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.04	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01
O3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02
O4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.15	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.06	0.04
O5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.05	0.04	0.06	0.05	0.03	0.03	0.07	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.02	0.01	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.08	0.04	0.05	0.14	0.03	0.15	0.01	0.13	0.08	0.11	0.06	0.04	0.06	0.15	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.06	0.05	0.08	0.05	0.01	0.02	0.09	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00