Doublet Group distance statistics: 48855

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 1,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C8	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2'	A	0, -0.102, 0.165, 0.433, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.165 std_dev=0.267
O4'	A	0, -0.139, 0.170, 0.479, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.170 std_dev=0.309
N4	B	0, 0.380, 0.710, 1.041, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.710 std_dev=0.330
C4	B	0, 0.471, 0.833, 1.196, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.833 std_dev=0.362
N3	B	0, 0.507, 0.881, 1.255, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.881 std_dev=0.374
O2'	A	0, -0.174, 0.212, 0.598, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.212 std_dev=0.386
C2	B	0, 0.602, 1.009, 1.417, 1.522 max_d=1.522 avg_d=1.009 std_dev=0.408
O2	B	0, 0.641, 1.069, 1.497, 1.698 max_d=1.698 avg_d=1.069 std_dev=0.428
C5	B	0, 0.521, 1.010, 1.498, 1.697 max_d=1.697 avg_d=1.010 std_dev=0.488
N1	B	0, 0.645, 1.165, 1.684, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.165 std_dev=0.520
C6	B	0, 0.600, 1.192, 1.784, 2.168 max_d=2.168 avg_d=1.192 std_dev=0.592
C3'	A	0, -0.286, 0.321, 0.929, 2.025 max_d=2.025 avg_d=0.321 std_dev=0.608
P	B	0, 0.689, 1.310, 1.930, 2.321 max_d=2.321 avg_d=1.310 std_dev=0.621
C4'	A	0, -0.297, 0.348, 0.993, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.348 std_dev=0.645
C1'	B	0, 0.727, 1.374, 2.021, 2.480 max_d=2.480 avg_d=1.374 std_dev=0.647
O5'	B	0, 0.699, 1.362, 2.025, 2.471 max_d=2.471 avg_d=1.362 std_dev=0.663
O4'	B	0, 0.702, 1.380, 2.058, 2.618 max_d=2.618 avg_d=1.380 std_dev=0.678
OP2	B	0, 0.571, 1.274, 1.976, 2.735 max_d=2.735 avg_d=1.274 std_dev=0.703
C2'	B	0, 0.729, 1.476, 2.224, 2.959 max_d=2.959 avg_d=1.476 std_dev=0.748
C5'	B	0, 0.683, 1.443, 2.203, 2.984 max_d=2.984 avg_d=1.443 std_dev=0.760
C3'	B	0, 0.711, 1.472, 2.234, 3.011 max_d=3.011 avg_d=1.472 std_dev=0.762
C4'	B	0, 0.730, 1.495, 2.259, 3.011 max_d=3.011 avg_d=1.495 std_dev=0.764
O3'	A	0, -0.389, 0.458, 1.305, 2.829 max_d=2.829 avg_d=0.458 std_dev=0.847
O3'	B	0, 0.773, 1.623, 2.473, 3.392 max_d=3.392 avg_d=1.623 std_dev=0.850
O2'	B	0, 0.822, 1.710, 2.599, 3.558 max_d=3.558 avg_d=1.710 std_dev=0.888
C5'	A	0, -0.436, 0.560, 1.557, 3.364 max_d=3.364 avg_d=0.560 std_dev=0.997
O5'	A	0, -0.403, 0.627, 1.657, 3.525 max_d=3.525 avg_d=0.627 std_dev=1.030
OP1	B	0, 0.583, 1.642, 2.701, 4.182 max_d=4.182 avg_d=1.642 std_dev=1.059
P	A	0, -0.421, 0.940, 2.302, 4.731 max_d=4.731 avg_d=0.940 std_dev=1.361
OP2	A	0, -0.365, 1.046, 2.456, 4.933 max_d=4.933 avg_d=1.046 std_dev=1.410
OP1	A	0, -0.491, 1.090, 2.670, 5.478 max_d=5.478 avg_d=1.090 std_dev=1.581

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.04	0.05	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.22	0.20	0.00	0.09	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.13	0.10	0.12	0.24	0.14
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.13	0.02	0.10	0.02	0.13	0.05	0.19	0.21	0.11	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.13	0.13	0.09
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.21	0.00	0.27	0.01	0.28	0.24	0.25	0.16	0.30	0.29	0.18	0.03	0.01	0.01	0.07	0.11	0.11	0.08
C4	0.01	0.00	0.13	0.21	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.08	0.15	0.17	0.25	0.19
C4'	0.03	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.17	0.04	0.10	0.06	0.15	0.06	0.18	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.10	0.27	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.04	0.27	0.31	0.40	0.33
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.15	0.00	0.11	0.27	0.03	0.07	0.16	0.27	0.11	0.15	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00
C6	0.02	0.00	0.13	0.28	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.08	0.26	0.31	0.42	0.32
C8	0.00	0.01	0.05	0.24	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.18	0.16	0.06	0.33	0.34	0.37	0.38
N1	0.02	0.00	0.19	0.25	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.11	0.18	0.22	0.34	0.23
N3	0.02	0.00	0.21	0.16	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.13	0.13	0.07	0.07	0.18	0.10
N6	0.02	0.00	0.11	0.30	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.19	0.18	0.07	0.31	0.40	0.51	0.40
N7	0.01	0.01	0.02	0.29	0.00	0.15	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.20	0.20	0.02	0.37	0.42	0.49	0.45
N9	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.12	0.03	0.01	0.16	0.16	0.20	0.19
O2'	0.00	0.06	0.00	0.03	0.11	0.18	0.16	0.15	0.16	0.18	0.11	0.05	0.19	0.20	0.12	0.00	0.09	0.13	0.05	0.06	0.05	0.05
O3'	0.15	0.11	0.04	0.01	0.05	0.03	0.13	0.07	0.13	0.16	0.10	0.13	0.18	0.20	0.03	0.09	0.00	0.08	0.18	0.23	0.25	0.20
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.08	0.01	0.04	0.02	0.08	0.06	0.11	0.13	0.07	0.02	0.01	0.13	0.08	0.00	0.08	0.07	0.13	0.10
O5'	0.04	0.10	0.08	0.07	0.15	0.01	0.27	0.01	0.26	0.33	0.18	0.07	0.31	0.37	0.16	0.05	0.18	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.12	0.13	0.11	0.17	0.02	0.31	0.03	0.31	0.34	0.22	0.07	0.40	0.42	0.16	0.06	0.23	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.24	0.13	0.11	0.25	0.03	0.40	0.01	0.42	0.37	0.34	0.18	0.51	0.49	0.20	0.05	0.25	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.14	0.09	0.08	0.19	0.01	0.33	0.00	0.32	0.38	0.23	0.10	0.40	0.45	0.19	0.05	0.20	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.11	0.31	0.27	0.13	0.23	0.23	0.21	0.25	0.19	0.08	0.10	0.08	0.34	0.27	0.22	0.21	0.34	0.53	0.24
C2	0.25	0.13	0.33	0.29	0.15	0.27	0.30	0.23	0.31	0.23	0.08	0.08	0.10	0.34	0.28	0.26	0.23	0.35	0.58	0.25
C2'	0.41	0.37	0.51	0.43	0.36	0.38	0.40	0.30	0.41	0.39	0.35	0.34	0.37	0.55	0.43	0.38	0.28	0.27	0.62	0.21
C3'	0.37	0.31	0.42	0.35	0.33	0.35	0.39	0.29	0.39	0.36	0.30	0.32	0.30	0.45	0.32	0.37	0.28	0.23	0.65	0.22
C4	0.20	0.10	0.28	0.23	0.11	0.20	0.21	0.18	0.22	0.17	0.06	0.06	0.08	0.29	0.22	0.20	0.19	0.35	0.54	0.22
C4'	0.14	0.11	0.18	0.17	0.11	0.16	0.17	0.18	0.18	0.13	0.12	0.12	0.11	0.20	0.17	0.14	0.20	0.40	0.41	0.29
C5	0.13	0.07	0.20	0.16	0.06	0.14	0.12	0.13	0.14	0.11	0.06	0.06	0.07	0.20	0.14	0.13	0.15	0.40	0.50	0.22
C5'	0.15	0.12	0.18	0.19	0.11	0.17	0.17	0.20	0.18	0.13	0.13	0.11	0.14	0.19	0.21	0.15	0.22	0.40	0.41	0.30
C6	0.12	0.08	0.18	0.14	0.08	0.13	0.11	0.11	0.13	0.10	0.07	0.10	0.08	0.18	0.13	0.13	0.13	0.41	0.51	0.21
C8	0.13	0.07	0.21	0.17	0.07	0.14	0.12	0.14	0.14	0.11	0.05	0.06	0.06	0.22	0.16	0.13	0.16	0.39	0.48	0.23
N1	0.18	0.10	0.24	0.21	0.08	0.20	0.20	0.17	0.21	0.16	0.06	0.06	0.08	0.25	0.20	0.20	0.17	0.38	0.55	0.23
N3	0.26	0.14	0.34	0.30	0.16	0.27	0.29	0.23	0.31	0.23	0.09	0.11	0.10	0.36	0.30	0.26	0.23	0.33	0.58	0.24
N6	0.09	0.10	0.12	0.09	0.13	0.08	0.12	0.10	0.10	0.09	0.11	0.17	0.09	0.11	0.09	0.08	0.12	0.48	0.45	0.22
N7	0.10	0.06	0.16	0.12	0.06	0.11	0.08	0.13	0.10	0.08	0.06	0.07	0.06	0.16	0.11	0.10	0.15	0.43	0.46	0.23
N9	0.19	0.09	0.27	0.23	0.10	0.20	0.19	0.17	0.21	0.16	0.06	0.07	0.08	0.29	0.22	0.18	0.19	0.35	0.52	0.22
O2'	0.26	0.19	0.39	0.33	0.21	0.25	0.28	0.20	0.29	0.24	0.17	0.19	0.17	0.42	0.35	0.23	0.21	0.42	0.50	0.26
O3'	0.17	0.13	0.21	0.15	0.15	0.15	0.21	0.11	0.21	0.16	0.13	0.15	0.12	0.24	0.13	0.17	0.13	0.32	0.48	0.19
O4'	0.16	0.14	0.20	0.19	0.15	0.18	0.18	0.21	0.19	0.15	0.16	0.17	0.15	0.22	0.19	0.16	0.23	0.43	0.40	0.32
O5'	0.23	0.16	0.24	0.19	0.19	0.20	0.26	0.17	0.26	0.21	0.14	0.18	0.13	0.26	0.16	0.24	0.18	0.29	0.48	0.21
OP1	0.24	0.18	0.23	0.19	0.21	0.20	0.28	0.17	0.28	0.23	0.17	0.20	0.15	0.25	0.17	0.27	0.17	0.26	0.47	0.20
OP2	0.34	0.29	0.32	0.25	0.31	0.28	0.36	0.23	0.36	0.33	0.28	0.30	0.27	0.33	0.20	0.36	0.22	0.24	0.52	0.21
P	0.23	0.17	0.23	0.18	0.20	0.19	0.27	0.16	0.27	0.22	0.16	0.19	0.14	0.25	0.16	0.26	0.16	0.25	0.46	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.24	0.11	0.07
C2	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.19	0.04	0.15	0.35	0.14	0.17
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.21	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.05	0.06
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.15	0.10	0.22	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.10	0.08
C4	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.19	0.46	0.22	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.18	0.47	0.27	0.25
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.10	0.07	0.10	0.12	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.06	0.16	0.42	0.23	0.20
N1	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.13	0.34	0.15	0.15
N3	0.01	0.00	0.09	0.15	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.19	0.03	0.18	0.41	0.17	0.22
N4	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.01	0.19	0.49	0.25	0.27
O2	0.01	0.01	0.21	0.22	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.26	0.07	0.14	0.30	0.10	0.15
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.05	0.05	0.07	0.04	0.07	0.03	0.04	0.05	0.13	0.00	0.03	0.06	0.06	0.12	0.07	0.07
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.13	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.19	0.13	0.26	0.03	0.00	0.01	0.15	0.15	0.22	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.00	0.10	0.25	0.11	0.06
O5'	0.07	0.15	0.04	0.10	0.19	0.01	0.18	0.01	0.16	0.13	0.18	0.19	0.14	0.06	0.15	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.24	0.35	0.09	0.03	0.46	0.09	0.47	0.07	0.42	0.34	0.41	0.49	0.30	0.12	0.15	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.14	0.05	0.10	0.22	0.06	0.27	0.13	0.23	0.15	0.17	0.25	0.10	0.07	0.22	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.06	0.08	0.25	0.01	0.25	0.01	0.20	0.15	0.22	0.27	0.15	0.07	0.11	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00