Doublet Group distance statistics: 48856

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.006, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N1	A	0, -0.001, 0.014, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.002, 0.013, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.015
N7	A	0, -0.002, 0.016, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.019
N9	A	0, -0.003, 0.016, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.004, 0.015, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.020
N3	A	0, -0.005, 0.015, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.020
N6	A	0, -0.003, 0.019, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.004, 0.019, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.023
C8	A	0, -0.004, 0.024, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.029
O2	B	0, -0.072, 0.238, 0.548, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.238 std_dev=0.310
N3	B	0, -0.078, 0.245, 0.568, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.245 std_dev=0.323
N4	B	0, -0.091, 0.241, 0.572, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.241 std_dev=0.332
OP1	B	0, -0.066, 0.274, 0.614, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.274 std_dev=0.340
C4	B	0, -0.093, 0.263, 0.620, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.263 std_dev=0.356
C2	B	0, -0.089, 0.276, 0.640, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.276 std_dev=0.364
OP2	B	0, -0.107, 0.331, 0.769, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.331 std_dev=0.438
P	B	0, -0.115, 0.353, 0.821, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.353 std_dev=0.468
C5	B	0, -0.125, 0.346, 0.816, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.346 std_dev=0.471
N1	B	0, -0.133, 0.382, 0.898, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.382 std_dev=0.515
C6	B	0, -0.150, 0.414, 0.978, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.414 std_dev=0.564
C1'	B	0, -0.173, 0.486, 1.146, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.486 std_dev=0.659
O5'	B	0, -0.197, 0.554, 1.304, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.554 std_dev=0.751
O4'	B	0, -0.223, 0.600, 1.424, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.600 std_dev=0.823
C2'	B	0, -0.227, 0.628, 1.483, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.628 std_dev=0.855
O2'	B	0, -0.247, 0.663, 1.574, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.663 std_dev=0.910
C4'	B	0, -0.290, 0.778, 1.846, 2.288 max_d=2.288 avg_d=0.778 std_dev=1.068
O4'	A	0, -0.312, 0.783, 1.877, 2.330 max_d=2.330 avg_d=0.783 std_dev=1.094
C3'	B	0, -0.298, 0.802, 1.902, 2.358 max_d=2.358 avg_d=0.802 std_dev=1.100
C5'	B	0, -0.300, 0.809, 1.917, 2.376 max_d=2.376 avg_d=0.809 std_dev=1.109
C2'	A	0, -0.331, 0.848, 2.027, 2.515 max_d=2.515 avg_d=0.848 std_dev=1.179
C4'	A	0, -0.396, 1.000, 2.395, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.000 std_dev=1.395
O3'	B	0, -0.379, 1.041, 2.461, 3.049 max_d=3.049 avg_d=1.041 std_dev=1.420
O2'	A	0, -0.447, 1.156, 2.759, 3.423 max_d=3.423 avg_d=1.156 std_dev=1.603
C3'	A	0, -0.482, 1.224, 2.929, 3.635 max_d=3.635 avg_d=1.224 std_dev=1.705
O3'	A	0, -0.652, 1.655, 3.962, 4.918 max_d=4.918 avg_d=1.655 std_dev=2.307
C5'	A	0, -0.772, 1.926, 4.624, 5.742 max_d=5.742 avg_d=1.926 std_dev=2.698
O5'	A	0, -0.984, 2.463, 5.909, 7.336 max_d=7.336 avg_d=2.463 std_dev=3.446
P	A	0, -1.410, 3.516, 8.443, 10.483 max_d=10.483 avg_d=3.516 std_dev=4.927
OP1	A	0, -1.537, 3.845, 9.227, 11.456 max_d=11.456 avg_d=3.845 std_dev=5.382
OP2	A	0, -1.576, 3.940, 9.455, 11.739 max_d=11.739 avg_d=3.940 std_dev=5.515

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.14	0.06
C2	0.03	0.00	0.05	0.46	0.00	0.61	0.01	1.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.41	0.34	0.46	1.50	2.11	1.15	1.73
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.03	0.12	0.02	0.12	0.12	0.09	0.03	0.13	0.14	0.08	0.00	0.07	0.02	0.14	0.11	0.26	0.18
C3'	0.02	0.46	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.04	0.01	0.50	0.26	0.47	0.11	0.42	0.17	0.01	0.01	0.02	0.16	0.04	0.46	0.25
C4	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.25	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.01	0.25	0.54	0.88	0.03	0.52
C4'	0.00	0.61	0.03	0.00	0.25	0.00	0.06	0.01	0.21	0.39	0.45	0.59	0.12	0.26	0.06	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.29	0.02
C5	0.01	0.01	0.12	0.13	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.20	0.12	0.12	0.52	0.61	0.05
C5'	0.02	1.14	0.02	0.04	0.47	0.01	0.19	0.00	0.47	0.57	0.88	1.03	0.30	0.36	0.03	0.09	0.05	0.01	0.00	0.05	0.34	0.00
C6	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.21	0.00	0.47	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.09	0.23	0.50	1.04	0.23	0.53
C8	0.00	0.01	0.12	0.50	0.00	0.39	0.00	0.57	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.49	0.25	0.89	0.65	1.58	1.08
N1	0.03	0.00	0.09	0.26	0.00	0.45	0.01	0.88	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.32	0.14	0.37	1.11	1.78	0.59	1.30
N3	0.04	0.00	0.03	0.47	0.00	0.59	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.34	0.45	1.36	1.74	1.00	1.46
N6	0.01	0.01	0.13	0.11	0.00	0.12	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.21	0.17	0.25	0.80	0.64	0.23
N7	0.00	0.01	0.14	0.42	0.00	0.26	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.46	0.11	0.65	0.37	1.56	0.86
N9	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.19	0.01	0.12	0.11	0.56	0.21
O2'	0.01	0.41	0.00	0.01	0.18	0.11	0.08	0.09	0.18	0.18	0.32	0.39	0.12	0.10	0.02	0.00	0.09	0.06	0.07	0.03	0.35	0.12
O3'	0.04	0.34	0.07	0.01	0.01	0.01	0.20	0.05	0.09	0.49	0.14	0.34	0.21	0.46	0.19	0.09	0.00	0.01	0.23	0.00	0.91	0.43
O4'	0.00	0.46	0.02	0.02	0.25	0.00	0.12	0.01	0.23	0.25	0.37	0.45	0.17	0.11	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.04	0.19	0.19
O5'	0.00	1.50	0.14	0.16	0.54	0.02	0.12	0.00	0.50	0.89	1.11	1.36	0.25	0.65	0.12	0.07	0.23	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	2.11	0.11	0.04	0.88	0.02	0.52	0.05	1.04	0.65	1.78	1.74	0.80	0.37	0.11	0.03	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	1.15	0.26	0.46	0.03	0.29	0.61	0.34	0.23	1.58	0.59	1.00	0.64	1.56	0.56	0.35	0.91	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	1.73	0.18	0.25	0.52	0.02	0.05	0.00	0.53	1.08	1.30	1.46	0.23	0.86	0.21	0.12	0.43	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.15	0.41	0.60	0.16	0.44	0.27	0.37	0.29	0.25	0.10	0.10	0.11	0.36	0.75	0.33	0.33	0.03	0.02	0.15
C2	0.28	0.14	0.39	0.57	0.17	0.43	0.30	0.36	0.32	0.25	0.08	0.09	0.08	0.33	0.69	0.34	0.30	0.04	0.05	0.14
C2'	0.29	0.24	0.32	0.44	0.29	0.35	0.34	0.25	0.32	0.28	0.24	0.31	0.19	0.28	0.53	0.33	0.19	0.17	0.16	0.00
C3'	0.11	0.26	0.11	0.09	0.13	0.06	0.02	0.06	0.00	0.12	0.27	0.13	0.37	0.19	0.17	0.02	0.04	0.17	0.14	0.02
C4	0.24	0.10	0.34	0.52	0.11	0.38	0.23	0.31	0.26	0.20	0.05	0.05	0.06	0.29	0.64	0.29	0.28	0.01	0.03	0.12
C4'	0.28	0.51	0.18	0.10	0.42	0.01	0.20	0.03	0.18	0.32	0.57	0.48	0.62	0.28	0.24	0.14	0.05	0.08	0.06	0.01
C5	0.18	0.05	0.27	0.43	0.05	0.31	0.17	0.24	0.20	0.15	0.00	0.02	0.02	0.22	0.54	0.24	0.23	0.02	0.05	0.09
C5'	0.84	1.17	0.74	0.37	1.01	0.44	0.67	0.30	0.65	0.88	1.24	1.08	1.34	0.88	0.23	0.61	0.23	0.19	0.16	0.14
C6	0.18	0.05	0.25	0.42	0.03	0.30	0.17	0.24	0.20	0.14	0.01	0.06	0.01	0.21	0.51	0.24	0.22	0.01	0.07	0.09
C8	0.17	0.05	0.26	0.43	0.05	0.30	0.14	0.23	0.17	0.13	0.01	0.01	0.02	0.23	0.55	0.22	0.22	0.05	0.03	0.07
N1	0.24	0.09	0.32	0.49	0.11	0.37	0.26	0.30	0.28	0.21	0.03	0.01	0.04	0.27	0.59	0.30	0.26	0.03	0.07	0.12
N3	0.28	0.14	0.40	0.58	0.16	0.43	0.29	0.36	0.31	0.25	0.09	0.10	0.08	0.34	0.71	0.33	0.31	0.03	0.03	0.14
N6	0.11	0.01	0.16	0.31	0.06	0.22	0.07	0.15	0.11	0.07	0.07	0.15	0.03	0.13	0.38	0.18	0.17	0.02	0.10	0.06
N7	0.14	0.02	0.22	0.38	0.01	0.25	0.11	0.19	0.14	0.10	0.02	0.05	0.01	0.18	0.48	0.19	0.20	0.05	0.05	0.05
N9	0.23	0.10	0.34	0.52	0.10	0.37	0.21	0.31	0.24	0.19	0.05	0.05	0.06	0.29	0.65	0.28	0.28	0.01	0.01	0.11
O2'	0.59	0.62	0.65	0.71	0.62	0.57	0.57	0.40	0.56	0.59	0.63	0.65	0.62	0.65	0.81	0.56	0.29	0.20	0.20	0.00
O3'	0.04	0.15	0.08	0.09	0.01	0.09	0.13	0.07	0.09	0.03	0.13	0.05	0.26	0.16	0.14	0.09	0.05	0.19	0.15	0.02
O4'	0.12	0.36	0.05	0.32	0.33	0.17	0.11	0.18	0.06	0.18	0.44	0.42	0.44	0.04	0.50	0.01	0.19	0.04	0.04	0.11
O5'	1.12	1.52	1.09	0.68	1.30	0.67	0.88	0.45	0.87	1.17	1.60	1.38	1.73	1.25	0.56	0.82	0.35	0.22	0.16	0.17
OP1	2.21	2.71	2.16	1.62	2.36	1.61	1.82	1.27	1.84	2.25	2.79	2.42	3.01	2.40	1.50	1.82	1.08	0.72	0.63	0.73
OP2	0.71	1.29	0.77	0.22	0.93	0.07	0.34	0.31	0.32	0.77	1.40	1.03	1.63	1.00	0.15	0.24	0.47	0.83	0.92	0.85
P	1.53	2.05	1.53	1.01	1.73	0.94	1.18	0.61	1.18	1.59	2.15	1.81	2.35	1.75	0.90	1.13	0.44	0.14	0.04	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.00	0.21	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.14	0.13	0.37	0.14
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.03	0.07	0.02	0.06	0.03	0.05	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.14	0.24	0.13
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.03	0.13	0.08	0.11	0.16	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.20	0.15	0.14
C4	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.18	0.01	0.13	0.21	0.44	0.20
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.00	0.00	0.02	0.05	0.04	0.00
C5	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.19	0.01	0.12	0.21	0.42	0.19
C5'	0.04	0.05	0.02	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.08	0.07	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.12	0.15	0.35	0.16
N1	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.11	0.33	0.13
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.14	0.18	0.42	0.17
N4	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.21	0.01	0.13	0.24	0.46	0.21
O2	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.13	0.09	0.34	0.11
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.06	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.15	0.03
O3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.18	0.00	0.19	0.02	0.15	0.08	0.13	0.21	0.03	0.03	0.00	0.00	0.05	0.22	0.06	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.06	0.07
O5'	0.10	0.14	0.13	0.11	0.13	0.02	0.12	0.00	0.12	0.13	0.14	0.13	0.13	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.00	0.13	0.14	0.20	0.21	0.05	0.21	0.10	0.15	0.11	0.18	0.24	0.09	0.01	0.22	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.37	0.24	0.15	0.44	0.04	0.42	0.01	0.35	0.33	0.42	0.46	0.34	0.15	0.06	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.14	0.13	0.14	0.20	0.00	0.19	0.00	0.16	0.13	0.17	0.21	0.11	0.03	0.11	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00