Doublet Group distance statistics: 48860

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 14, 14, 10, 9, 1, 4, 2, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.014, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.020, 0.030, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.020, 0.036, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.015, 0.032, 0.048, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.020, 0.038, 0.055, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.038 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.016, 0.036, 0.057, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.036 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.020, 0.045, 0.070, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.045 std_dev=0.025
C5	B	0, 0.204, 0.347, 0.489, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.347 std_dev=0.142
N7	B	0, 0.203, 0.390, 0.578, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.390 std_dev=0.187
C6	B	0, 0.177, 0.371, 0.565, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.371 std_dev=0.194
C4	B	0, 0.240, 0.442, 0.644, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.442 std_dev=0.202
N6	B	0, 0.200, 0.423, 0.647, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.423 std_dev=0.223
N9	B	0, 0.338, 0.566, 0.793, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.566 std_dev=0.227
C8	B	0, 0.280, 0.528, 0.777, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.528 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.222, 0.506, 0.790, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.506 std_dev=0.284
O4'	A	0, -0.076, 0.223, 0.522, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.223 std_dev=0.299
N1	B	0, 0.175, 0.479, 0.783, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.479 std_dev=0.304
C2'	A	0, -0.019, 0.286, 0.590, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.286 std_dev=0.305
C2	B	0, 0.201, 0.519, 0.837, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.519 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.440, 0.765, 1.090, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.765 std_dev=0.325
O2'	A	0, 0.098, 0.444, 0.790, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.444 std_dev=0.346
O4'	B	0, 0.494, 0.905, 1.316, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.905 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.473, 0.890, 1.307, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.890 std_dev=0.417
C4'	A	0, -0.107, 0.353, 0.813, 2.613 max_d=2.613 avg_d=0.353 std_dev=0.460
C3'	B	0, 0.513, 0.993, 1.473, 2.452 max_d=2.452 avg_d=0.993 std_dev=0.480
C3'	A	0, -0.060, 0.435, 0.930, 2.842 max_d=2.842 avg_d=0.435 std_dev=0.495
C4'	B	0, 0.536, 1.065, 1.593, 2.633 max_d=2.633 avg_d=1.065 std_dev=0.528
O2'	B	0, 0.474, 1.028, 1.582, 2.575 max_d=2.575 avg_d=1.028 std_dev=0.554
C5'	B	0, 0.481, 1.128, 1.775, 3.094 max_d=3.094 avg_d=1.128 std_dev=0.647
O3'	B	0, 0.525, 1.189, 1.854, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.189 std_dev=0.664
O3'	A	0, 0.001, 0.705, 1.409, 4.030 max_d=4.030 avg_d=0.705 std_dev=0.704
C5'	A	0, -0.138, 0.642, 1.422, 4.402 max_d=4.402 avg_d=0.642 std_dev=0.780
O5'	A	0, -0.111, 0.748, 1.607, 4.767 max_d=4.767 avg_d=0.748 std_dev=0.859
O5'	B	0, 0.634, 1.664, 2.694, 3.914 max_d=3.914 avg_d=1.664 std_dev=1.030
P	A	0, -0.165, 0.992, 2.150, 5.978 max_d=5.978 avg_d=0.992 std_dev=1.158
OP2	A	0, 0.147, 1.317, 2.486, 4.404 max_d=4.404 avg_d=1.317 std_dev=1.169
P	B	0, 0.620, 1.873, 3.126, 4.465 max_d=4.465 avg_d=1.873 std_dev=1.253
OP2	B	0, 0.577, 2.138, 3.699, 5.257 max_d=5.257 avg_d=2.138 std_dev=1.561
OP1	B	0, 0.775, 2.343, 3.912, 5.010 max_d=5.010 avg_d=2.343 std_dev=1.569
OP1	A	0, -0.168, 1.707, 3.582, 7.414 max_d=7.414 avg_d=1.707 std_dev=1.875

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.30	0.28	0.14
C2	0.03	0.00	0.22	0.14	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.28	0.22	0.17	0.31	0.85	0.36	0.37
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.02	0.11	0.11	0.17	0.22	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.23	0.17	0.13
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.07	0.16	0.11	0.14	0.07	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.16	0.21	0.16	0.14
C4	0.02	0.01	0.11	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.09	0.09	0.28	0.81	0.33	0.34
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.11	0.08	0.09	0.08	0.10	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.22	0.30	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.05	0.34	1.08	0.40	0.45
C5'	0.03	0.19	0.02	0.02	0.14	0.01	0.17	0.00	0.18	0.21	0.19	0.17	0.21	0.21	0.11	0.05	0.04	0.02	0.01	0.39	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.08	0.36	1.17	0.43	0.49
C8	0.02	0.02	0.11	0.16	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.17	0.10	0.35	0.95	0.39	0.44
N1	0.03	0.00	0.17	0.11	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.17	0.13	0.34	1.04	0.41	0.44
N3	0.03	0.00	0.22	0.14	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.20	0.17	0.27	0.70	0.31	0.31
N6	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.09	0.06	0.39	1.34	0.48	0.55
N7	0.01	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.06	0.38	1.20	0.44	0.52
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.24	0.67	0.31	0.29
O2'	0.01	0.28	0.00	0.02	0.14	0.05	0.10	0.05	0.15	0.09	0.23	0.27	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.08	0.13	0.20	0.08
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.09	0.02	0.07	0.04	0.09	0.17	0.17	0.20	0.09	0.14	0.05	0.04	0.00	0.02	0.15	0.33	0.17	0.13
O4'	0.00	0.17	0.01	0.01	0.09	0.00	0.05	0.02	0.08	0.10	0.13	0.17	0.06	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.13	0.40	0.12
O5'	0.11	0.31	0.13	0.16	0.28	0.02	0.34	0.01	0.36	0.35	0.34	0.27	0.39	0.38	0.24	0.08	0.15	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.30	0.85	0.23	0.21	0.81	0.22	1.08	0.39	1.17	0.95	1.04	0.70	1.34	1.20	0.67	0.13	0.33	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.36	0.17	0.16	0.33	0.30	0.40	0.36	0.43	0.39	0.41	0.31	0.48	0.44	0.31	0.20	0.17	0.40	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.37	0.13	0.14	0.34	0.04	0.45	0.01	0.49	0.44	0.44	0.31	0.55	0.52	0.29	0.08	0.13	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.12	0.15	0.12	0.09	0.17	0.09	0.35	0.12	0.10	0.14	0.10	0.14	0.10	0.09	0.18	0.17	0.12	1.39	1.79	2.00	1.58
C2	0.10	0.13	0.16	0.12	0.09	0.15	0.09	0.31	0.12	0.13	0.14	0.10	0.14	0.12	0.10	0.20	0.17	0.13	1.34	1.50	1.94	1.43
C2'	0.12	0.25	0.16	0.13	0.17	0.21	0.17	0.40	0.23	0.12	0.27	0.21	0.26	0.13	0.13	0.18	0.14	0.15	1.41	1.72	2.00	1.57
C3'	0.08	0.21	0.12	0.13	0.11	0.21	0.11	0.40	0.18	0.10	0.23	0.15	0.22	0.09	0.08	0.13	0.17	0.14	1.34	1.68	1.89	1.51
C4	0.09	0.12	0.15	0.12	0.09	0.17	0.09	0.35	0.11	0.10	0.13	0.09	0.14	0.09	0.09	0.17	0.15	0.12	1.38	1.68	2.01	1.54
C4'	0.15	0.14	0.20	0.21	0.12	0.23	0.11	0.38	0.12	0.15	0.15	0.13	0.13	0.13	0.13	0.20	0.25	0.18	1.33	1.76	1.87	1.53
C5	0.09	0.12	0.14	0.12	0.09	0.18	0.10	0.36	0.13	0.10	0.14	0.10	0.16	0.10	0.09	0.15	0.15	0.13	1.38	1.68	2.00	1.54
C5'	0.28	0.23	0.34	0.36	0.24	0.33	0.23	0.42	0.21	0.28	0.22	0.24	0.20	0.26	0.27	0.34	0.41	0.29	1.24	1.69	1.70	1.43
C6	0.09	0.13	0.13	0.11	0.09	0.18	0.10	0.35	0.13	0.10	0.14	0.10	0.17	0.10	0.09	0.14	0.13	0.13	1.37	1.56	1.97	1.48
C8	0.10	0.12	0.15	0.14	0.09	0.20	0.10	0.37	0.13	0.11	0.14	0.10	0.15	0.11	0.10	0.15	0.18	0.13	1.36	1.79	1.96	1.57
N1	0.10	0.12	0.14	0.11	0.09	0.16	0.09	0.32	0.12	0.12	0.14	0.10	0.16	0.11	0.10	0.17	0.14	0.13	1.33	1.45	1.91	1.41
N3	0.10	0.12	0.16	0.12	0.09	0.16	0.09	0.33	0.11	0.12	0.13	0.10	0.13	0.11	0.10	0.20	0.17	0.13	1.37	1.61	1.99	1.50
N6	0.10	0.14	0.13	0.13	0.11	0.20	0.12	0.37	0.16	0.11	0.16	0.12	0.20	0.12	0.10	0.12	0.14	0.13	1.36	1.52	1.94	1.47
N7	0.10	0.13	0.15	0.15	0.10	0.20	0.11	0.38	0.14	0.12	0.14	0.11	0.17	0.12	0.10	0.14	0.18	0.13	1.36	1.76	1.97	1.56
N9	0.09	0.11	0.15	0.12	0.09	0.18	0.09	0.35	0.11	0.10	0.13	0.09	0.14	0.09	0.09	0.16	0.16	0.12	1.38	1.76	2.00	1.57
O2'	0.20	0.31	0.23	0.19	0.24	0.25	0.24	0.41	0.29	0.20	0.32	0.27	0.31	0.21	0.21	0.26	0.19	0.21	1.44	1.75	2.05	1.60
O3'	0.11	0.30	0.11	0.12	0.17	0.22	0.17	0.42	0.26	0.11	0.33	0.23	0.29	0.11	0.11	0.12	0.15	0.15	1.35	1.64	1.88	1.49
O4'	0.16	0.19	0.21	0.19	0.16	0.22	0.16	0.36	0.18	0.15	0.20	0.17	0.18	0.15	0.15	0.21	0.23	0.17	1.36	1.84	1.93	1.58
O5'	0.43	0.40	0.47	0.46	0.41	0.44	0.40	0.49	0.39	0.45	0.39	0.40	0.38	0.43	0.43	0.47	0.50	0.43	1.24	1.67	1.65	1.41
OP1	1.44	1.27	1.44	1.40	1.36	1.33	1.34	1.20	1.25	1.46	1.22	1.33	1.19	1.41	1.43	1.44	1.42	1.44	0.80	0.82	0.86	0.78
OP2	0.58	0.50	0.60	0.60	0.51	0.61	0.49	0.67	0.45	0.59	0.47	0.51	0.42	0.54	0.56	0.60	0.64	0.60	1.34	1.89	1.61	1.57
P	0.61	0.52	0.65	0.63	0.56	0.57	0.55	0.54	0.51	0.64	0.50	0.54	0.49	0.61	0.61	0.65	0.68	0.60	1.03	1.47	1.34	1.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.32	0.15	0.28	0.16
C2	0.03	0.00	0.24	0.21	0.01	0.09	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.28	0.18	0.69	0.45	0.97	0.61
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.02	0.09	0.01	0.13	0.11	0.20	0.23	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.33	0.33	0.24	0.21
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.13	0.01	0.10	0.02	0.14	0.10	0.18	0.19	0.12	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.38	0.54	0.13	0.26
C4	0.01	0.01	0.13	0.13	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.16	0.10	0.74	0.49	0.90	0.60
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.10	0.08	0.10	0.08	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.16	0.24	0.08
C5	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.13	0.07	0.96	0.75	1.22	0.84
C5'	0.03	0.22	0.01	0.02	0.17	0.01	0.21	0.00	0.24	0.16	0.24	0.19	0.26	0.20	0.12	0.06	0.07	0.01	0.01	0.39	0.41	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.14	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.19	0.10	0.98	0.79	1.34	0.91
C8	0.01	0.01	0.11	0.10	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.11	0.08	0.97	0.78	1.01	0.78
N1	0.02	0.00	0.20	0.18	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.26	0.15	0.86	0.63	1.21	0.79
N3	0.02	0.00	0.23	0.19	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.25	0.17	0.59	0.35	0.78	0.49
N6	0.02	0.01	0.11	0.12	0.01	0.10	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.18	0.09	1.09	0.97	1.55	1.06
N7	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.10	0.04	1.08	0.94	1.33	0.97
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.69	0.45	0.71	0.49
O2'	0.02	0.24	0.00	0.02	0.12	0.06	0.10	0.06	0.15	0.09	0.21	0.22	0.14	0.08	0.04	0.00	0.05	0.04	0.06	0.10	0.11	0.08
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.16	0.02	0.13	0.07	0.19	0.11	0.26	0.25	0.18	0.10	0.06	0.05	0.00	0.02	0.21	0.57	0.17	0.20
O4'	0.01	0.18	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.01	0.10	0.08	0.15	0.17	0.09	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.13	0.09	0.16	0.13
O5'	0.32	0.69	0.33	0.38	0.74	0.02	0.96	0.01	0.98	0.97	0.86	0.59	1.09	1.08	0.69	0.06	0.21	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.45	0.33	0.54	0.49	0.16	0.75	0.39	0.79	0.78	0.63	0.35	0.97	0.94	0.45	0.10	0.57	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.97	0.24	0.13	0.90	0.24	1.22	0.41	1.34	1.01	1.21	0.78	1.55	1.33	0.71	0.11	0.17	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.61	0.21	0.26	0.60	0.08	0.84	0.02	0.91	0.78	0.79	0.49	1.06	0.97	0.49	0.08	0.20	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00