Doublet Group distance statistics: 48861

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 8, 5, 4, 7, 4, 2, 1, 3, 0, 3, 3, 3, 2, 4, 0, 2, 2, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N7	B	0, 0.165, 0.403, 0.642, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.403 std_dev=0.239
C8	B	0, 0.207, 0.505, 0.803, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.505 std_dev=0.298
C5	B	0, 0.169, 0.494, 0.819, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.494 std_dev=0.325
N9	B	0, 0.217, 0.581, 0.945, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.581 std_dev=0.364
C4	B	0, 0.205, 0.583, 0.961, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.583 std_dev=0.378
C6	B	0, 0.124, 0.631, 1.139, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.631 std_dev=0.508
N3	B	0, 0.216, 0.753, 1.291, 2.017 max_d=2.017 avg_d=0.753 std_dev=0.538
C1'	B	0, 0.205, 0.746, 1.287, 2.241 max_d=2.241 avg_d=0.746 std_dev=0.541
N6	B	0, 0.099, 0.671, 1.243, 2.001 max_d=2.001 avg_d=0.671 std_dev=0.572
C2	B	0, 0.165, 0.841, 1.517, 2.488 max_d=2.488 avg_d=0.841 std_dev=0.676
N1	B	0, 0.118, 0.808, 1.499, 2.437 max_d=2.437 avg_d=0.808 std_dev=0.690
C2'	B	0, 0.016, 0.716, 1.415, 2.733 max_d=2.733 avg_d=0.716 std_dev=0.699
O4'	B	0, 0.161, 0.916, 1.670, 3.056 max_d=3.056 avg_d=0.916 std_dev=0.755
O2'	B	0, 0.040, 0.825, 1.611, 3.415 max_d=3.415 avg_d=0.825 std_dev=0.785
O4'	A	0, -0.156, 0.642, 1.440, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.642 std_dev=0.798
C2'	A	0, -0.172, 0.653, 1.477, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.653 std_dev=0.825
C3'	B	0, 0.019, 0.850, 1.681, 3.377 max_d=3.377 avg_d=0.850 std_dev=0.831
C4'	B	0, 0.080, 0.992, 1.903, 3.745 max_d=3.745 avg_d=0.992 std_dev=0.911
O5'	B	0, 0.119, 1.046, 1.973, 3.190 max_d=3.190 avg_d=1.046 std_dev=0.927
P	B	0, 0.225, 1.216, 2.206, 3.033 max_d=3.033 avg_d=1.216 std_dev=0.991
OP2	B	0, 0.254, 1.251, 2.249, 4.341 max_d=4.341 avg_d=1.251 std_dev=0.997
C3'	A	0, -0.233, 0.820, 1.874, 2.635 max_d=2.635 avg_d=0.820 std_dev=1.054
O3'	B	0, -0.024, 1.038, 2.100, 4.388 max_d=4.388 avg_d=1.038 std_dev=1.062
C5'	B	0, 0.053, 1.157, 2.262, 4.119 max_d=4.119 avg_d=1.157 std_dev=1.104
O3'	A	0, -0.269, 0.861, 1.991, 2.842 max_d=2.842 avg_d=0.861 std_dev=1.130
C4'	A	0, -0.228, 0.911, 2.050, 2.994 max_d=2.994 avg_d=0.911 std_dev=1.139
O2'	A	0, -0.224, 0.998, 2.219, 3.461 max_d=3.461 avg_d=0.998 std_dev=1.221
OP1	B	0, 0.230, 1.650, 3.071, 4.786 max_d=4.786 avg_d=1.650 std_dev=1.420
OP2	A	0, -0.059, 1.500, 3.059, 4.989 max_d=4.989 avg_d=1.500 std_dev=1.559
O5'	A	0, -0.223, 1.356, 2.936, 4.939 max_d=4.939 avg_d=1.356 std_dev=1.579
C5'	A	0, -0.297, 1.428, 3.152, 4.962 max_d=4.962 avg_d=1.428 std_dev=1.725
P	A	0, -0.197, 1.543, 3.284, 5.525 max_d=5.525 avg_d=1.543 std_dev=1.741
OP1	A	0, -0.281, 1.810, 3.900, 6.574 max_d=6.574 avg_d=1.810 std_dev=2.090

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.33	0.00	0.22	0.41	0.39	0.26
C2	0.02	0.00	0.47	0.28	0.01	0.23	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.43	0.17	0.43	0.33	0.30	0.51	0.31
C2'	0.00	0.47	0.00	0.00	0.25	0.01	0.12	0.22	0.23	0.23	0.37	0.46	0.16	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.50	0.91	0.86	0.71
C3'	0.02	0.28	0.00	0.00	0.27	0.01	0.34	0.02	0.36	0.28	0.33	0.23	0.39	0.34	0.21	0.02	0.01	0.02	0.16	0.67	0.26	0.29
C4	0.01	0.01	0.25	0.27	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.12	0.23	0.26	0.27	0.49	0.27
C4'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.08	0.00	0.07	0.01	0.07	0.25	0.16	0.23	0.07	0.20	0.08	0.29	0.02	0.00	0.02	0.31	0.14	0.07
C5	0.01	0.01	0.12	0.34	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.08	0.11	0.26	0.32	0.59	0.34
C5'	0.09	0.36	0.22	0.02	0.19	0.01	0.13	0.00	0.18	0.24	0.28	0.34	0.15	0.21	0.09	0.08	0.22	0.02	0.01	0.20	0.22	0.02
C6	0.01	0.00	0.23	0.36	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.08	0.20	0.27	0.35	0.64	0.36
C8	0.01	0.01	0.23	0.28	0.00	0.25	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.55	0.10	0.24	0.28	0.31	0.51	0.34
N1	0.02	0.00	0.37	0.33	0.01	0.16	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.10	0.34	0.30	0.30	0.59	0.32
N3	0.02	0.00	0.46	0.23	0.00	0.23	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.44	0.22	0.43	0.32	0.33	0.47	0.30
N6	0.02	0.01	0.16	0.39	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.13	0.13	0.28	0.46	0.73	0.42
N7	0.01	0.01	0.11	0.34	0.00	0.20	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.48	0.13	0.12	0.30	0.41	0.64	0.42
N9	0.00	0.01	0.02	0.21	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.12	0.01	0.21	0.26	0.43	0.24
O2'	0.02	0.43	0.00	0.02	0.14	0.29	0.22	0.08	0.17	0.55	0.27	0.44	0.23	0.48	0.21	0.00	0.04	0.20	0.41	0.94	1.02	0.70
O3'	0.33	0.17	0.02	0.01	0.12	0.02	0.08	0.22	0.08	0.10	0.10	0.22	0.13	0.13	0.12	0.04	0.00	0.23	0.26	0.53	0.15	0.23
O4'	0.00	0.43	0.02	0.02	0.23	0.00	0.11	0.02	0.20	0.24	0.34	0.43	0.13	0.12	0.01	0.20	0.23	0.00	0.10	0.16	0.17	0.14
O5'	0.22	0.33	0.50	0.16	0.26	0.02	0.26	0.01	0.27	0.28	0.30	0.32	0.28	0.30	0.21	0.41	0.26	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.41	0.30	0.91	0.67	0.27	0.31	0.32	0.20	0.35	0.31	0.30	0.33	0.46	0.41	0.26	0.94	0.53	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.51	0.86	0.26	0.49	0.14	0.59	0.22	0.64	0.51	0.59	0.47	0.73	0.64	0.43	1.02	0.15	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.31	0.71	0.29	0.27	0.07	0.34	0.02	0.36	0.34	0.32	0.30	0.42	0.42	0.24	0.70	0.23	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.15	0.30	0.35	0.13	0.25	0.13	0.23	0.13	0.24	0.18	0.12	0.15	0.20	0.19	0.37	0.42	0.25	0.20	0.71	0.63	0.27
C2	0.18	0.15	0.25	0.30	0.14	0.19	0.14	0.16	0.13	0.21	0.17	0.14	0.15	0.20	0.18	0.32	0.34	0.22	0.16	0.66	0.65	0.23
C2'	0.52	0.51	0.58	0.50	0.51	0.45	0.50	0.38	0.49	0.51	0.50	0.51	0.49	0.50	0.52	0.64	0.53	0.51	0.29	0.81	0.56	0.32
C3'	0.53	0.32	0.53	0.54	0.43	0.54	0.42	0.51	0.33	0.55	0.29	0.38	0.29	0.50	0.51	0.57	0.55	0.59	0.43	0.85	0.72	0.49
C4	0.22	0.12	0.30	0.33	0.14	0.24	0.13	0.21	0.12	0.25	0.15	0.12	0.15	0.21	0.20	0.37	0.37	0.26	0.18	0.69	0.64	0.25
C4'	0.16	0.43	0.21	0.32	0.22	0.22	0.23	0.23	0.37	0.18	0.48	0.31	0.42	0.16	0.16	0.26	0.38	0.23	0.19	0.69	0.65	0.30
C5	0.26	0.10	0.33	0.32	0.16	0.26	0.14	0.23	0.10	0.27	0.12	0.13	0.14	0.22	0.23	0.40	0.35	0.29	0.20	0.69	0.63	0.26
C5'	0.21	0.59	0.25	0.35	0.34	0.21	0.36	0.23	0.53	0.20	0.65	0.45	0.60	0.23	0.23	0.27	0.42	0.25	0.19	0.65	0.63	0.30
C6	0.25	0.10	0.31	0.30	0.17	0.24	0.14	0.20	0.10	0.27	0.11	0.13	0.15	0.22	0.23	0.39	0.31	0.27	0.17	0.67	0.63	0.24
C8	0.28	0.10	0.35	0.35	0.16	0.30	0.14	0.27	0.11	0.28	0.13	0.12	0.15	0.22	0.24	0.42	0.40	0.32	0.24	0.70	0.60	0.29
N1	0.21	0.11	0.26	0.28	0.14	0.20	0.14	0.16	0.11	0.23	0.12	0.12	0.14	0.21	0.19	0.34	0.30	0.23	0.15	0.65	0.64	0.23
N3	0.19	0.16	0.27	0.32	0.14	0.21	0.14	0.18	0.14	0.22	0.18	0.14	0.15	0.20	0.18	0.33	0.37	0.23	0.16	0.68	0.65	0.24
N6	0.30	0.13	0.34	0.29	0.20	0.26	0.16	0.21	0.12	0.29	0.12	0.18	0.16	0.22	0.27	0.42	0.30	0.31	0.19	0.67	0.64	0.26
N7	0.30	0.10	0.36	0.34	0.18	0.30	0.15	0.27	0.10	0.29	0.11	0.14	0.15	0.22	0.26	0.44	0.38	0.33	0.24	0.70	0.60	0.29
N9	0.24	0.12	0.32	0.34	0.14	0.26	0.13	0.24	0.12	0.26	0.15	0.11	0.15	0.21	0.21	0.39	0.40	0.27	0.21	0.70	0.63	0.27
O2'	0.45	0.53	0.52	0.39	0.46	0.41	0.45	0.40	0.49	0.41	0.54	0.49	0.51	0.41	0.44	0.61	0.47	0.47	0.34	0.91	0.53	0.43
O3'	0.24	0.22	0.24	0.26	0.18	0.26	0.17	0.26	0.17	0.26	0.23	0.19	0.17	0.22	0.22	0.31	0.29	0.31	0.19	0.74	0.63	0.30
O4'	0.26	0.64	0.31	0.37	0.41	0.23	0.41	0.20	0.58	0.23	0.69	0.52	0.63	0.27	0.28	0.35	0.43	0.22	0.20	0.64	0.66	0.25
O5'	0.30	0.44	0.21	0.29	0.30	0.31	0.30	0.33	0.42	0.29	0.50	0.35	0.48	0.26	0.28	0.28	0.33	0.40	0.23	0.63	0.68	0.36
OP1	0.62	0.40	0.54	0.42	0.43	0.65	0.39	0.71	0.37	0.59	0.42	0.40	0.41	0.48	0.55	0.67	0.35	0.76	0.58	1.03	0.50	0.71
OP2	0.82	0.67	0.67	0.77	0.71	0.85	0.67	0.86	0.64	0.78	0.65	0.69	0.64	0.71	0.77	0.67	0.75	0.94	0.75	0.76	1.10	0.82
P	0.52	0.41	0.38	0.37	0.39	0.54	0.37	0.58	0.39	0.50	0.44	0.38	0.44	0.41	0.46	0.47	0.33	0.67	0.45	0.81	0.65	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.10	0.32	0.22	0.14
C2	0.02	0.00	0.17	0.15	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.20	0.08	0.16	0.44	0.44	0.17
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.09	0.11	0.07	0.15	0.16	0.09	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.18	0.32	0.21	0.24
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.14	0.00	0.18	0.02	0.19	0.17	0.17	0.12	0.20	0.20	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.24	0.13	0.12
C4	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.04	0.16	0.43	0.42	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.13	0.04	0.05	0.08	0.12	0.05	0.15	0.02	0.00	0.02	0.10	0.19	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.11	0.03	0.21	0.47	0.56	0.22
C5'	0.04	0.06	0.09	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.08	0.06	0.15	0.17	0.08	0.07	0.10	0.02	0.01	0.12	0.23	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.19	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.14	0.05	0.22	0.48	0.62	0.23
C8	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.12	0.06	0.22	0.44	0.47	0.20
N1	0.02	0.00	0.15	0.17	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.17	0.07	0.19	0.47	0.55	0.21
N3	0.02	0.00	0.16	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.08	0.14	0.42	0.37	0.15
N6	0.02	0.01	0.09	0.20	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.20	0.16	0.04	0.25	0.50	0.71	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.20	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.14	0.04	0.26	0.48	0.62	0.25
N9	0.00	0.01	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.01	0.14	0.40	0.34	0.15
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.12	0.15	0.16	0.07	0.18	0.17	0.17	0.14	0.20	0.19	0.10	0.00	0.04	0.11	0.13	0.24	0.20	0.19
O3'	0.14	0.20	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.10	0.14	0.12	0.17	0.20	0.16	0.14	0.07	0.04	0.00	0.09	0.14	0.37	0.15	0.18
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.08	0.04	0.04	0.01	0.11	0.09	0.00	0.07	0.23	0.25	0.12
O5'	0.10	0.16	0.18	0.07	0.16	0.02	0.21	0.01	0.22	0.22	0.19	0.14	0.25	0.26	0.14	0.13	0.14	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.32	0.44	0.32	0.24	0.43	0.10	0.47	0.12	0.48	0.44	0.47	0.42	0.50	0.48	0.40	0.24	0.37	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.44	0.21	0.13	0.42	0.19	0.56	0.23	0.62	0.47	0.55	0.37	0.71	0.62	0.34	0.20	0.15	0.25	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.24	0.12	0.16	0.07	0.22	0.02	0.23	0.20	0.21	0.15	0.28	0.25	0.15	0.19	0.18	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00