Doublet Group distance statistics: 48863

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 10, 12, 0, 1, 7, 2, 3, 4, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.024, 0.049, 0.074, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.049 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.024, 0.049, 0.075, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.049 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.027, 0.058, 0.089, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.058 std_dev=0.031
N6	B	0, 0.224, 0.417, 0.610, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.417 std_dev=0.193
C6	B	0, 0.187, 0.389, 0.592, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.389 std_dev=0.202
C5	B	0, 0.144, 0.372, 0.600, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.372 std_dev=0.228
N1	B	0, 0.237, 0.479, 0.721, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.479 std_dev=0.242
N7	B	0, 0.159, 0.414, 0.669, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.414 std_dev=0.255
C4	B	0, 0.123, 0.423, 0.723, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.423 std_dev=0.300
C2	B	0, 0.203, 0.510, 0.818, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.510 std_dev=0.307
C8	B	0, 0.174, 0.492, 0.811, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.492 std_dev=0.318
N3	B	0, 0.136, 0.483, 0.830, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.483 std_dev=0.347
N9	B	0, 0.136, 0.486, 0.835, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.486 std_dev=0.349
O4'	A	0, -0.166, 0.197, 0.559, 1.916 max_d=1.916 avg_d=0.197 std_dev=0.363
C2'	A	0, -0.112, 0.257, 0.625, 2.007 max_d=2.007 avg_d=0.257 std_dev=0.368
O4'	B	0, 0.275, 0.681, 1.087, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.681 std_dev=0.406
C1'	B	0, 0.166, 0.599, 1.032, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.599 std_dev=0.433
O2'	A	0, -0.111, 0.357, 0.825, 2.520 max_d=2.520 avg_d=0.357 std_dev=0.468
C4'	A	0, -0.163, 0.356, 0.876, 2.808 max_d=2.808 avg_d=0.356 std_dev=0.520
C4'	B	0, 0.343, 0.865, 1.387, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.865 std_dev=0.522
C3'	A	0, -0.147, 0.398, 0.943, 3.130 max_d=3.130 avg_d=0.398 std_dev=0.545
C5'	B	0, 0.407, 0.967, 1.526, 2.754 max_d=2.754 avg_d=0.967 std_dev=0.560
C2'	B	0, 0.176, 0.757, 1.339, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.757 std_dev=0.581
C3'	B	0, 0.294, 0.886, 1.478, 2.136 max_d=2.136 avg_d=0.886 std_dev=0.592
O5'	B	0, 0.343, 0.954, 1.565, 2.556 max_d=2.556 avg_d=0.954 std_dev=0.611
O2'	B	0, 0.186, 0.876, 1.566, 2.415 max_d=2.415 avg_d=0.876 std_dev=0.690
O3'	A	0, -0.131, 0.583, 1.297, 4.339 max_d=4.339 avg_d=0.583 std_dev=0.714
O3'	B	0, 0.366, 1.120, 1.873, 2.740 max_d=2.740 avg_d=1.120 std_dev=0.754
P	B	0, 0.387, 1.178, 1.970, 3.408 max_d=3.408 avg_d=1.178 std_dev=0.792
C5'	A	0, -0.265, 0.598, 1.461, 4.923 max_d=4.923 avg_d=0.598 std_dev=0.863
O5'	A	0, -0.184, 0.740, 1.665, 5.438 max_d=5.438 avg_d=0.740 std_dev=0.925
OP1	B	0, 0.451, 1.397, 2.344, 4.809 max_d=4.809 avg_d=1.397 std_dev=0.947
OP2	B	0, 0.188, 1.215, 2.242, 5.863 max_d=5.863 avg_d=1.215 std_dev=1.027
OP2	A	0, 0.101, 1.133, 2.165, 5.443 max_d=5.443 avg_d=1.133 std_dev=1.032
P	A	0, 0.007, 1.047, 2.087, 6.185 max_d=6.185 avg_d=1.047 std_dev=1.040
OP1	A	0, 0.057, 1.267, 2.477, 7.551 max_d=7.551 avg_d=1.267 std_dev=1.210

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.14	0.26	0.25	0.16
C2	0.02	0.00	0.24	0.17	0.01	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.19	0.20	0.35	0.39	0.52	0.39
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.03	0.06	0.07	0.11	0.12	0.18	0.24	0.08	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.43	0.40	0.31
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.02	0.16	0.16	0.16	0.15	0.17	0.17	0.09	0.01	0.01	0.02	0.18	0.34	0.30	0.22
C4	0.01	0.01	0.12	0.12	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.09	0.11	0.30	0.35	0.47	0.35
C4'	0.01	0.11	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.14	0.09	0.11	0.08	0.12	0.05	0.12	0.03	0.00	0.02	0.20	0.16	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.05	0.36	0.43	0.58	0.45
C5'	0.04	0.23	0.07	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.19	0.23	0.21	0.20	0.21	0.23	0.12	0.07	0.10	0.03	0.01	0.13	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.16	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.09	0.39	0.47	0.64	0.49
C8	0.01	0.01	0.12	0.16	0.00	0.14	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.18	0.16	0.12	0.38	0.40	0.47	0.42
N1	0.02	0.00	0.18	0.16	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	0.16	0.38	0.44	0.60	0.45
N3	0.02	0.00	0.24	0.15	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.18	0.20	0.31	0.35	0.45	0.33
N6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.14	0.07	0.42	0.54	0.72	0.56
N7	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.16	0.06	0.41	0.48	0.61	0.51
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.26	0.30	0.37	0.29
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.10	0.12	0.08	0.07	0.10	0.18	0.17	0.23	0.09	0.15	0.06	0.00	0.05	0.08	0.11	0.43	0.39	0.27
O3'	0.09	0.19	0.02	0.01	0.09	0.03	0.10	0.10	0.12	0.16	0.15	0.18	0.14	0.16	0.05	0.05	0.00	0.07	0.15	0.29	0.32	0.18
O4'	0.00	0.20	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.03	0.09	0.12	0.16	0.20	0.07	0.06	0.01	0.08	0.07	0.00	0.06	0.16	0.15	0.09
O5'	0.14	0.35	0.21	0.18	0.30	0.02	0.36	0.01	0.39	0.38	0.38	0.31	0.42	0.41	0.26	0.11	0.15	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.26	0.39	0.43	0.34	0.35	0.20	0.43	0.13	0.47	0.40	0.44	0.35	0.54	0.48	0.30	0.43	0.29	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.52	0.40	0.30	0.47	0.16	0.58	0.16	0.64	0.47	0.60	0.45	0.72	0.61	0.37	0.39	0.32	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.39	0.31	0.22	0.35	0.08	0.45	0.02	0.49	0.42	0.45	0.33	0.56	0.51	0.29	0.27	0.18	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.14	0.20	0.26	0.13	0.21	0.13	0.25	0.13	0.18	0.15	0.12	0.15	0.16	0.16	0.19	0.33	0.19	0.54	0.76	0.98	0.70
C2	0.17	0.14	0.19	0.22	0.14	0.18	0.14	0.19	0.14	0.19	0.15	0.13	0.16	0.18	0.17	0.19	0.26	0.18	0.48	0.61	0.92	0.62
C2'	0.18	0.29	0.20	0.23	0.21	0.18	0.21	0.22	0.27	0.18	0.31	0.24	0.29	0.18	0.18	0.20	0.29	0.17	0.50	0.71	0.94	0.66
C3'	0.19	0.26	0.21	0.28	0.18	0.24	0.18	0.31	0.22	0.19	0.27	0.21	0.24	0.17	0.18	0.20	0.34	0.20	0.51	0.74	0.90	0.66
C4	0.17	0.13	0.20	0.24	0.13	0.20	0.13	0.22	0.13	0.18	0.14	0.12	0.14	0.16	0.16	0.19	0.30	0.19	0.51	0.69	0.97	0.67
C4'	0.22	0.19	0.28	0.34	0.17	0.30	0.16	0.37	0.16	0.22	0.19	0.18	0.16	0.18	0.20	0.26	0.41	0.24	0.54	0.83	0.92	0.71
C5	0.17	0.12	0.20	0.25	0.13	0.21	0.13	0.23	0.13	0.18	0.14	0.12	0.16	0.16	0.16	0.19	0.30	0.19	0.52	0.68	0.97	0.67
C5'	0.33	0.30	0.41	0.47	0.29	0.43	0.27	0.51	0.26	0.31	0.29	0.30	0.25	0.28	0.31	0.39	0.54	0.35	0.62	0.94	0.93	0.80
C6	0.17	0.12	0.19	0.23	0.13	0.19	0.13	0.21	0.14	0.18	0.14	0.12	0.17	0.16	0.16	0.19	0.28	0.19	0.49	0.62	0.95	0.64
C8	0.18	0.12	0.22	0.29	0.13	0.24	0.13	0.28	0.13	0.19	0.13	0.12	0.15	0.16	0.16	0.21	0.35	0.21	0.54	0.76	0.98	0.71
N1	0.17	0.12	0.18	0.21	0.13	0.17	0.13	0.18	0.12	0.19	0.13	0.12	0.15	0.17	0.16	0.18	0.25	0.18	0.47	0.58	0.91	0.60
N3	0.17	0.15	0.19	0.23	0.14	0.19	0.14	0.21	0.14	0.19	0.16	0.13	0.15	0.17	0.16	0.19	0.28	0.18	0.50	0.66	0.94	0.65
N6	0.19	0.15	0.21	0.25	0.15	0.21	0.16	0.23	0.17	0.19	0.17	0.15	0.21	0.18	0.17	0.20	0.29	0.20	0.49	0.59	0.94	0.63
N7	0.19	0.13	0.22	0.28	0.14	0.24	0.14	0.27	0.14	0.19	0.14	0.13	0.16	0.16	0.17	0.21	0.35	0.21	0.53	0.73	0.98	0.70
N9	0.17	0.12	0.21	0.26	0.13	0.21	0.12	0.25	0.12	0.18	0.14	0.12	0.14	0.16	0.16	0.19	0.33	0.19	0.53	0.74	0.98	0.69
O2'	0.22	0.32	0.23	0.24	0.24	0.19	0.24	0.22	0.29	0.22	0.34	0.28	0.31	0.22	0.22	0.24	0.29	0.22	0.52	0.73	0.97	0.69
O3'	0.16	0.33	0.17	0.23	0.20	0.20	0.20	0.29	0.28	0.15	0.35	0.26	0.30	0.15	0.16	0.17	0.28	0.17	0.48	0.73	0.87	0.64
O4'	0.27	0.26	0.32	0.36	0.24	0.31	0.23	0.34	0.24	0.26	0.26	0.25	0.24	0.24	0.25	0.31	0.42	0.28	0.56	0.82	0.95	0.72
O5'	0.47	0.44	0.52	0.57	0.44	0.56	0.42	0.64	0.41	0.45	0.43	0.45	0.39	0.42	0.45	0.51	0.61	0.49	0.81	1.11	1.07	0.98
OP1	0.60	0.56	0.60	0.64	0.55	0.68	0.52	0.79	0.51	0.56	0.53	0.56	0.47	0.52	0.57	0.60	0.69	0.64	0.92	1.25	1.12	1.11
OP2	0.74	0.72	0.71	0.73	0.72	0.79	0.70	0.87	0.69	0.71	0.71	0.73	0.67	0.70	0.72	0.71	0.73	0.77	1.00	1.28	1.21	1.18
P	0.61	0.55	0.62	0.68	0.56	0.71	0.53	0.81	0.51	0.58	0.52	0.56	0.48	0.55	0.58	0.62	0.72	0.65	0.95	1.27	1.16	1.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.13	0.20	0.15
C2	0.03	0.00	0.17	0.16	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.23	0.09	0.36	0.35	0.59	0.43
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.02	0.10	0.07	0.14	0.17	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.19	0.20	0.19	0.17
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.12	0.10	0.15	0.15	0.11	0.09	0.05	0.01	0.01	0.02	0.24	0.30	0.15	0.20
C4	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.05	0.37	0.33	0.55	0.40
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.10	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.47	0.45	0.73	0.53
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.15	0.12	0.09	0.16	0.16	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.19	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.16	0.05	0.48	0.49	0.80	0.57
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.12	0.06	0.48	0.41	0.62	0.48
N1	0.02	0.00	0.14	0.15	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.07	0.43	0.44	0.72	0.51
N3	0.02	0.00	0.17	0.15	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.20	0.08	0.31	0.29	0.49	0.36
N6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.15	0.04	0.53	0.57	0.91	0.64
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.53	0.51	0.79	0.58
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.34	0.28	0.44	0.33
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.05	0.07	0.05	0.11	0.06	0.15	0.17	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.06	0.11	0.11	0.08
O3'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.12	0.02	0.12	0.03	0.16	0.12	0.21	0.20	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.02	0.18	0.34	0.16	0.17
O4'	0.00	0.09	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.12	0.13	0.15	0.12
O5'	0.17	0.36	0.19	0.24	0.37	0.02	0.47	0.01	0.48	0.48	0.43	0.31	0.53	0.53	0.34	0.06	0.18	0.12	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.13	0.35	0.20	0.30	0.33	0.10	0.45	0.19	0.49	0.41	0.44	0.29	0.57	0.51	0.28	0.11	0.34	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.59	0.19	0.15	0.55	0.13	0.73	0.19	0.80	0.62	0.72	0.49	0.91	0.79	0.44	0.11	0.16	0.15	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.43	0.17	0.20	0.40	0.04	0.53	0.02	0.57	0.48	0.51	0.36	0.64	0.58	0.33	0.08	0.17	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00