Doublet Group distance statistics: 48869

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.006, 0.022, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.019
O4'	A	0, -0.001, 0.167, 0.336, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.167 std_dev=0.168
C2'	A	0, 0.014, 0.198, 0.382, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.198 std_dev=0.184
C4'	A	0, 0.037, 0.250, 0.463, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.250 std_dev=0.213
O2'	A	0, 0.022, 0.316, 0.611, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.316 std_dev=0.294
C3'	A	0, 0.007, 0.314, 0.622, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.314 std_dev=0.308
C5	B	0, 0.154, 0.473, 0.793, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.473 std_dev=0.319
C6	B	0, 0.216, 0.552, 0.888, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.552 std_dev=0.336
N1	B	0, 0.260, 0.603, 0.946, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.603 std_dev=0.343
C4	B	0, 0.200, 0.544, 0.887, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.544 std_dev=0.343
C2	B	0, 0.302, 0.660, 1.018, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.660 std_dev=0.358
C8	B	0, 0.092, 0.485, 0.879, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.485 std_dev=0.394
N3	B	0, 0.292, 0.686, 1.079, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.686 std_dev=0.394
N7	B	0, 0.060, 0.458, 0.856, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.458 std_dev=0.398
N9	B	0, 0.154, 0.575, 0.996, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.575 std_dev=0.421
C5'	A	0, 0.065, 0.491, 0.917, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.491 std_dev=0.426
N6	B	0, 0.242, 0.697, 1.151, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.697 std_dev=0.454
O3'	A	0, 0.001, 0.487, 0.973, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.487 std_dev=0.486
C1'	B	0, 0.205, 0.794, 1.383, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.794 std_dev=0.589
O5'	A	0, 0.054, 0.782, 1.510, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.782 std_dev=0.728
O4'	B	0, 0.304, 1.103, 1.902, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.103 std_dev=0.799
C4'	B	0, 0.026, 1.378, 2.730, 3.225 max_d=3.225 avg_d=1.378 std_dev=1.352
P	A	0, -0.085, 1.518, 3.122, 3.717 max_d=3.717 avg_d=1.518 std_dev=1.603
OP1	A	0, -0.060, 1.680, 3.420, 4.083 max_d=4.083 avg_d=1.680 std_dev=1.740
C2'	B	0, 0.004, 1.877, 3.750, 4.324 max_d=4.324 avg_d=1.877 std_dev=1.873
C3'	B	0, 0.124, 2.251, 4.378, 4.855 max_d=4.855 avg_d=2.251 std_dev=2.127
C5'	B	0, 0.173, 2.446, 4.719, 5.590 max_d=5.590 avg_d=2.446 std_dev=2.273
OP2	A	0, -0.264, 2.024, 4.312, 4.926 max_d=4.926 avg_d=2.024 std_dev=2.288
O2'	B	0, -0.175, 2.470, 5.114, 5.987 max_d=5.987 avg_d=2.470 std_dev=2.645
O3'	B	0, 0.125, 2.880, 5.635, 6.264 max_d=6.264 avg_d=2.880 std_dev=2.755
O5'	B	0, 0.294, 3.374, 6.454, 7.281 max_d=7.281 avg_d=3.374 std_dev=3.080
P	B	0, -0.098, 4.353, 8.804, 9.982 max_d=9.982 avg_d=4.353 std_dev=4.451
OP2	B	0, -0.302, 4.632, 9.567, 10.660 max_d=10.660 avg_d=4.632 std_dev=4.935
OP1	B	0, -0.217, 4.968, 10.153, 11.683 max_d=11.683 avg_d=4.968 std_dev=5.185

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.23	0.30	0.09
C2	0.04	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.20	0.14	0.04	0.47	0.33	1.07	0.55
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.09	0.09	0.13	0.05	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.32	0.22	0.46	0.13
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.09	0.22	0.07	0.09	0.12	0.20	0.11	0.02	0.01	0.01	0.41	0.16	0.54	0.23
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.07	0.02	0.48	0.37	0.99	0.56
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.07	0.15	0.04	0.04	0.10	0.14	0.07	0.08	0.01	0.00	0.03	0.36	0.06	0.22
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.02	0.59	0.63	1.32	0.83
C5'	0.04	0.10	0.02	0.01	0.14	0.01	0.21	0.00	0.20	0.28	0.15	0.08	0.24	0.28	0.16	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.10	0.02	0.61	0.68	1.44	0.89
C8	0.01	0.01	0.09	0.22	0.00	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.24	0.01	0.59	0.63	1.11	0.78
N1	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.09	0.03	0.55	0.52	1.30	0.75
N3	0.03	0.00	0.13	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.14	0.04	0.41	0.23	0.87	0.41
N6	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.02	0.66	0.86	1.63	1.06
N7	0.00	0.01	0.07	0.20	0.00	0.14	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.23	0.01	0.65	0.81	1.43	0.99
N9	0.00	0.02	0.03	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.43	0.32	0.79	0.45
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.10	0.08	0.07	0.08	0.11	0.05	0.16	0.19	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.08	0.20	0.44	0.18	0.20
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.07	0.01	0.13	0.03	0.10	0.24	0.09	0.14	0.14	0.23	0.10	0.02	0.00	0.01	0.36	0.21	0.43	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.33	0.05	0.22
O5'	0.18	0.47	0.32	0.41	0.48	0.03	0.59	0.00	0.61	0.59	0.55	0.41	0.66	0.65	0.43	0.20	0.36	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.33	0.22	0.16	0.37	0.36	0.63	0.03	0.68	0.63	0.52	0.23	0.86	0.81	0.32	0.44	0.21	0.33	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	1.07	0.46	0.54	0.99	0.06	1.32	0.02	1.44	1.11	1.30	0.87	1.63	1.43	0.79	0.18	0.43	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.55	0.13	0.23	0.56	0.22	0.83	0.02	0.89	0.78	0.75	0.41	1.06	0.99	0.45	0.20	0.12	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.26	0.19	0.59	0.07	0.56	0.09	1.24	0.28	0.31	0.36	0.10	0.40	0.18	0.23	1.06	0.24	0.24	1.89	2.26	3.89	2.73
C2	0.26	0.33	0.14	0.64	0.14	0.44	0.15	0.82	0.27	0.37	0.40	0.20	0.35	0.31	0.24	0.68	0.41	0.24	1.30	1.11	2.97	1.81
C2'	0.38	0.27	0.32	0.46	0.12	0.48	0.13	1.09	0.30	0.35	0.38	0.12	0.44	0.22	0.28	1.21	0.23	0.25	1.69	2.01	3.69	2.51
C3'	0.49	0.20	0.54	0.21	0.11	0.33	0.04	1.00	0.27	0.39	0.35	0.03	0.45	0.19	0.34	1.50	0.35	0.16	1.68	2.15	3.74	2.59
C4	0.31	0.28	0.17	0.58	0.08	0.52	0.11	1.10	0.30	0.33	0.38	0.12	0.44	0.20	0.23	0.97	0.26	0.23	1.70	1.88	3.60	2.44
C4'	0.41	0.24	0.39	0.36	0.05	0.44	0.06	1.22	0.30	0.30	0.37	0.06	0.47	0.11	0.26	1.35	0.18	0.14	1.95	2.53	4.05	2.91
C5	0.34	0.25	0.23	0.52	0.06	0.52	0.11	1.15	0.33	0.31	0.37	0.09	0.50	0.15	0.23	1.06	0.20	0.24	1.77	2.00	3.68	2.54
C5'	0.48	0.30	0.55	0.27	0.19	0.36	0.20	1.22	0.38	0.33	0.43	0.19	0.56	0.18	0.32	1.53	0.39	0.13	2.05	2.77	4.17	3.08
C6	0.32	0.26	0.19	0.53	0.07	0.47	0.11	0.99	0.33	0.34	0.38	0.11	0.52	0.19	0.23	0.94	0.23	0.23	1.55	1.58	3.33	2.20
C8	0.36	0.23	0.29	0.49	0.04	0.58	0.12	1.36	0.33	0.26	0.37	0.07	0.51	0.09	0.22	1.21	0.17	0.27	2.05	2.58	4.11	2.98
N1	0.27	0.31	0.15	0.60	0.12	0.43	0.13	0.81	0.30	0.37	0.40	0.17	0.43	0.30	0.24	0.72	0.35	0.24	1.29	1.10	2.92	1.80
N3	0.27	0.32	0.13	0.64	0.12	0.49	0.13	0.96	0.28	0.35	0.39	0.17	0.37	0.27	0.23	0.80	0.38	0.23	1.49	1.47	3.28	2.11
N6	0.34	0.22	0.26	0.44	0.05	0.45	0.13	0.99	0.36	0.32	0.36	0.07	0.57	0.12	0.24	1.02	0.21	0.23	1.57	1.62	3.31	2.23
N7	0.37	0.22	0.31	0.45	0.04	0.56	0.13	1.33	0.34	0.26	0.36	0.05	0.54	0.08	0.22	1.22	0.19	0.27	2.01	2.49	4.04	2.92
N9	0.33	0.26	0.21	0.56	0.07	0.56	0.10	1.24	0.30	0.30	0.37	0.10	0.45	0.15	0.23	1.08	0.21	0.25	1.89	2.25	3.88	2.72
O2'	0.34	0.38	0.24	0.64	0.20	0.60	0.23	1.16	0.37	0.35	0.46	0.24	0.46	0.27	0.27	1.03	0.37	0.32	1.72	1.96	3.69	2.49
O3'	0.55	0.17	0.64	0.16	0.17	0.28	0.08	0.90	0.24	0.44	0.32	0.08	0.43	0.24	0.39	1.62	0.46	0.20	1.56	2.01	3.62	2.45
O4'	0.35	0.25	0.22	0.55	0.05	0.58	0.09	1.35	0.29	0.29	0.36	0.09	0.43	0.13	0.22	1.14	0.16	0.24	2.05	2.59	4.12	2.99
O5'	1.06	0.50	1.12	0.36	0.70	0.16	0.56	0.80	0.37	0.87	0.37	0.66	0.27	0.66	0.88	2.13	0.90	0.49	1.61	2.47	3.76	2.69
OP1	1.55	0.69	1.66	0.93	1.00	0.69	0.78	0.37	0.50	1.24	0.49	0.95	0.32	0.92	1.27	2.75	1.56	0.96	1.09	2.08	3.22	2.20
OP2	2.30	1.59	2.39	1.58	1.83	1.30	1.61	0.38	1.34	1.98	1.36	1.82	1.06	1.69	2.05	3.47	2.18	1.63	0.57	1.71	2.70	1.72
P	1.66	0.89	1.72	0.96	1.17	0.75	0.97	0.34	0.70	1.39	0.69	1.13	0.46	1.10	1.42	2.79	1.56	1.07	1.06	2.05	3.18	2.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.27	0.01	0.25	0.21	0.66	0.28
C2	0.01	0.00	0.06	0.14	0.01	0.53	0.01	1.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.49	0.85	1.84	0.20	0.98
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.03	0.07	0.21	0.06	0.09	0.05	0.06	0.07	0.09	0.05	0.01	0.03	0.02	0.26	0.45	0.18	0.21
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.19	0.00	0.38	0.03	0.32	0.57	0.16	0.16	0.42	0.57	0.30	0.01	0.01	0.02	0.32	0.35	0.11	0.23
C4	0.00	0.01	0.05	0.19	0.00	0.18	0.00	0.47	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.26	0.27	0.68	0.81	0.12
C4'	0.02	0.53	0.03	0.00	0.18	0.00	0.10	0.01	0.12	0.49	0.35	0.53	0.10	0.39	0.13	0.28	0.02	0.01	0.02	0.20	0.27	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.38	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.21	0.11	0.57	0.22	1.51	0.65
C5'	0.11	1.15	0.21	0.03	0.47	0.01	0.24	0.00	0.40	0.77	0.83	1.10	0.28	0.62	0.18	0.10	0.20	0.02	0.00	0.27	0.37	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.32	0.01	0.12	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.22	0.37	0.61	1.23	0.32
C8	0.01	0.01	0.09	0.57	0.00	0.49	0.00	0.77	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.44	0.16	0.27	1.33	0.93	2.29	1.58
N1	0.01	0.00	0.05	0.16	0.01	0.35	0.01	0.83	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.20	0.38	0.49	1.38	0.47	0.48
N3	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.53	0.00	1.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.12	0.49	0.79	1.61	0.18	0.86
N6	0.01	0.01	0.07	0.42	0.01	0.10	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.31	0.14	0.58	0.30	1.68	0.67
N7	0.01	0.01	0.09	0.57	0.00	0.39	0.00	0.62	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.44	0.25	0.15	1.22	0.77	2.38	1.51
N9	0.01	0.02	0.05	0.30	0.01	0.13	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.05	0.02	0.57	0.15	1.25	0.65
O2'	0.04	0.12	0.01	0.01	0.12	0.28	0.27	0.10	0.21	0.44	0.08	0.14	0.29	0.44	0.23	0.00	0.09	0.20	0.03	0.17	0.26	0.02
O3'	0.27	0.13	0.03	0.01	0.11	0.02	0.21	0.20	0.25	0.16	0.20	0.12	0.31	0.25	0.05	0.09	0.00	0.19	0.20	0.30	0.14	0.16
O4'	0.01	0.49	0.02	0.02	0.26	0.01	0.11	0.02	0.22	0.27	0.38	0.49	0.14	0.15	0.02	0.20	0.19	0.00	0.37	0.10	0.68	0.42
O5'	0.25	0.85	0.26	0.32	0.27	0.02	0.57	0.00	0.37	1.33	0.49	0.79	0.58	1.22	0.57	0.03	0.20	0.37	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.21	1.84	0.45	0.35	0.68	0.20	0.22	0.27	0.61	0.93	1.38	1.61	0.30	0.77	0.15	0.17	0.30	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.66	0.20	0.18	0.11	0.81	0.27	1.51	0.37	1.23	2.29	0.47	0.18	1.68	2.38	1.25	0.26	0.14	0.68	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.98	0.21	0.23	0.12	0.03	0.65	0.01	0.32	1.58	0.48	0.86	0.67	1.51	0.65	0.02	0.16	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00