Doublet Group distance statistics: 48879

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 5, 3, 3, 0, 2, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.034 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.004, 0.028, 0.053, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.028 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.021, 0.103, 0.184, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.103 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.013, 0.104, 0.196, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.104 std_dev=0.091
C4'	A	0, 0.043, 0.153, 0.263, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.153 std_dev=0.110
O2'	A	0, 0.036, 0.157, 0.277, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.157 std_dev=0.121
C3'	A	0, 0.039, 0.181, 0.322, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.181 std_dev=0.141
C5	B	0, 0.222, 0.393, 0.565, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.393 std_dev=0.171
N6	B	0, 0.231, 0.444, 0.657, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.444 std_dev=0.213
C5'	A	0, 0.051, 0.267, 0.482, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.267 std_dev=0.216
O3'	A	0, 0.072, 0.289, 0.505, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.289 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.204, 0.440, 0.675, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.440 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.202, 0.449, 0.697, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.449 std_dev=0.248
O5'	A	0, 0.011, 0.272, 0.534, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.272 std_dev=0.261
N9	B	0, 0.229, 0.524, 0.820, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.524 std_dev=0.295
N7	B	0, 0.185, 0.486, 0.787, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.486 std_dev=0.301
P	A	0, -0.008, 0.349, 0.706, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.349 std_dev=0.357
C8	B	0, 0.194, 0.579, 0.964, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.579 std_dev=0.385
OP2	A	0, -0.004, 0.391, 0.786, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.391 std_dev=0.395
C1'	B	0, 0.235, 0.637, 1.038, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.637 std_dev=0.401
OP1	A	0, -0.015, 0.413, 0.841, 2.125 max_d=2.125 avg_d=0.413 std_dev=0.428
N3	B	0, 0.128, 0.560, 0.991, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.560 std_dev=0.431
C2'	B	0, 0.199, 0.632, 1.065, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.632 std_dev=0.433
N1	B	0, 0.163, 0.611, 1.059, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.611 std_dev=0.448
O2'	B	0, 0.225, 0.717, 1.209, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.717 std_dev=0.492
O4'	B	0, 0.253, 0.774, 1.295, 2.222 max_d=2.222 avg_d=0.774 std_dev=0.521
C2	B	0, 0.129, 0.655, 1.181, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.655 std_dev=0.526
C3'	B	0, 0.197, 0.729, 1.261, 2.482 max_d=2.482 avg_d=0.729 std_dev=0.532
C4'	B	0, 0.252, 0.854, 1.456, 2.670 max_d=2.670 avg_d=0.854 std_dev=0.602
O3'	B	0, 0.172, 0.795, 1.418, 2.919 max_d=2.919 avg_d=0.795 std_dev=0.623
P	B	0, 0.214, 0.872, 1.529, 2.434 max_d=2.434 avg_d=0.872 std_dev=0.657
OP2	B	0, 0.111, 0.797, 1.483, 2.905 max_d=2.905 avg_d=0.797 std_dev=0.686
C5'	B	0, 0.259, 0.973, 1.687, 3.138 max_d=3.138 avg_d=0.973 std_dev=0.714
O5'	B	0, 0.190, 0.910, 1.630, 3.343 max_d=3.343 avg_d=0.910 std_dev=0.720
OP1	B	0, 0.235, 0.988, 1.741, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.988 std_dev=0.753

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.02	0.10	0.11	0.14	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.09	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.07	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.12	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.07	0.02	0.14	0.17	0.20	0.16
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.04	0.15	0.17	0.20	0.18
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.10	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.05	0.13	0.14	0.16	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.10	0.10	0.13	0.10
N3	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.06	0.02	0.12	0.14	0.18	0.14
N4	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.07	0.03	0.15	0.19	0.22	0.18
O2	0.03	0.01	0.09	0.08	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.09	0.09	0.04	0.08	0.08	0.12	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.03	0.06	0.06	0.09	0.00	0.05	0.04	0.04	0.09	0.06	0.05
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.09	0.03	0.06	0.07	0.09	0.05	0.00	0.02	0.12	0.17	0.18	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.08	0.07	0.11	0.09
O5'	0.06	0.10	0.04	0.08	0.14	0.01	0.15	0.01	0.13	0.10	0.12	0.15	0.08	0.04	0.12	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.11	0.08	0.10	0.17	0.06	0.17	0.06	0.14	0.10	0.14	0.19	0.08	0.09	0.17	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.14	0.07	0.12	0.20	0.03	0.20	0.02	0.16	0.13	0.18	0.22	0.12	0.06	0.18	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.05	0.08	0.16	0.02	0.18	0.01	0.14	0.10	0.14	0.18	0.08	0.05	0.14	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.18	0.14	0.13	0.15	0.17	0.15	0.22	0.15	0.17	0.19	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.12	0.19	0.26	0.54	0.41	0.38
C2	0.22	0.14	0.20	0.22	0.17	0.26	0.17	0.31	0.14	0.24	0.14	0.15	0.15	0.22	0.21	0.20	0.20	0.27	0.34	0.59	0.47	0.45
C2'	0.17	0.21	0.15	0.13	0.16	0.17	0.16	0.22	0.17	0.18	0.22	0.18	0.17	0.17	0.17	0.17	0.13	0.20	0.26	0.48	0.38	0.34
C3'	0.19	0.25	0.17	0.14	0.19	0.17	0.17	0.22	0.19	0.18	0.25	0.22	0.17	0.17	0.18	0.20	0.14	0.21	0.26	0.50	0.41	0.36
C4	0.27	0.14	0.25	0.28	0.19	0.34	0.18	0.41	0.14	0.28	0.14	0.16	0.15	0.24	0.25	0.25	0.27	0.33	0.43	0.65	0.55	0.54
C4'	0.17	0.25	0.16	0.12	0.18	0.15	0.16	0.19	0.19	0.17	0.24	0.22	0.17	0.16	0.17	0.19	0.13	0.18	0.23	0.54	0.40	0.36
C5	0.24	0.13	0.21	0.24	0.17	0.30	0.17	0.37	0.14	0.26	0.14	0.14	0.15	0.23	0.22	0.21	0.23	0.30	0.40	0.63	0.53	0.51
C5'	0.17	0.26	0.16	0.13	0.18	0.15	0.17	0.20	0.19	0.16	0.25	0.22	0.18	0.16	0.16	0.19	0.14	0.18	0.25	0.56	0.43	0.38
C6	0.20	0.14	0.18	0.19	0.16	0.25	0.16	0.31	0.14	0.23	0.15	0.14	0.14	0.21	0.19	0.18	0.18	0.26	0.35	0.61	0.50	0.47
N1	0.19	0.15	0.17	0.18	0.15	0.22	0.16	0.28	0.14	0.21	0.16	0.14	0.15	0.20	0.19	0.17	0.16	0.23	0.32	0.58	0.46	0.43
N3	0.27	0.14	0.25	0.27	0.19	0.33	0.18	0.38	0.14	0.28	0.14	0.17	0.15	0.24	0.25	0.25	0.26	0.32	0.41	0.63	0.52	0.51
N4	0.30	0.14	0.28	0.32	0.20	0.39	0.19	0.46	0.14	0.30	0.14	0.18	0.15	0.25	0.27	0.28	0.31	0.37	0.47	0.67	0.58	0.58
O2	0.20	0.15	0.19	0.19	0.17	0.23	0.17	0.26	0.15	0.22	0.15	0.16	0.16	0.21	0.20	0.19	0.18	0.23	0.29	0.55	0.40	0.38
O2'	0.22	0.24	0.20	0.17	0.21	0.19	0.20	0.19	0.20	0.21	0.25	0.22	0.19	0.20	0.21	0.23	0.17	0.22	0.21	0.42	0.29	0.26
O3'	0.27	0.34	0.27	0.22	0.27	0.24	0.24	0.24	0.26	0.24	0.33	0.31	0.22	0.22	0.26	0.31	0.22	0.27	0.25	0.45	0.36	0.32
O4'	0.17	0.22	0.15	0.15	0.17	0.17	0.17	0.22	0.19	0.18	0.23	0.19	0.18	0.18	0.17	0.17	0.15	0.19	0.26	0.58	0.43	0.39
O5'	0.14	0.22	0.14	0.12	0.15	0.13	0.13	0.19	0.16	0.14	0.22	0.18	0.16	0.13	0.13	0.17	0.14	0.15	0.24	0.54	0.41	0.37
OP1	0.15	0.24	0.16	0.13	0.16	0.14	0.15	0.20	0.18	0.14	0.24	0.21	0.17	0.14	0.14	0.19	0.15	0.15	0.25	0.55	0.42	0.38
OP2	0.11	0.17	0.11	0.12	0.10	0.16	0.10	0.24	0.12	0.13	0.17	0.13	0.13	0.12	0.10	0.12	0.14	0.16	0.28	0.54	0.44	0.41
P	0.14	0.22	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14	0.21	0.17	0.14	0.22	0.18	0.16	0.14	0.14	0.16	0.15	0.15	0.26	0.56	0.43	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.26	0.09	0.09
C2	0.04	0.00	0.17	0.15	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.20	0.04	0.09	0.40	0.18	0.16
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.06	0.13	0.16	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.32	0.08	0.10
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.08	0.10	0.11	0.14	0.07	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.30	0.08	0.10
C4	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.02	0.10	0.37	0.17	0.16
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.08	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.14	0.02	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.14	0.40	0.23	0.21
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.12	0.06	0.05	0.12	0.13	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.14	0.42	0.25	0.22
C8	0.02	0.02	0.06	0.10	0.02	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.16	0.35	0.20	0.19
N1	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.16	0.03	0.12	0.42	0.22	0.19
N3	0.04	0.01	0.16	0.14	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.17	0.18	0.04	0.08	0.37	0.15	0.14
N6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.09	0.04	0.17	0.44	0.30	0.26
N7	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04	0.18	0.39	0.26	0.23
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.10	0.33	0.14	0.14
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.08	0.03	0.06	0.03	0.10	0.04	0.15	0.17	0.08	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.26	0.06	0.07
O3'	0.01	0.20	0.02	0.00	0.10	0.01	0.07	0.02	0.11	0.10	0.16	0.18	0.09	0.08	0.03	0.04	0.00	0.01	0.10	0.28	0.11	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.15	0.07	0.06
O5'	0.06	0.09	0.05	0.08	0.10	0.01	0.14	0.01	0.14	0.16	0.12	0.08	0.17	0.18	0.10	0.04	0.10	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.26	0.40	0.32	0.30	0.37	0.14	0.40	0.05	0.42	0.35	0.42	0.37	0.44	0.39	0.33	0.26	0.28	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.18	0.08	0.08	0.17	0.02	0.23	0.02	0.25	0.20	0.22	0.15	0.30	0.26	0.14	0.06	0.11	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.10	0.10	0.16	0.04	0.21	0.01	0.22	0.19	0.19	0.14	0.26	0.23	0.14	0.07	0.11	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00