Doublet Group distance statistics: 48880

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 5, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.006 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.004, 0.007, 0.019, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.007 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C2'	A	0, 0.120, 0.243, 0.365, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.243 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.107, 0.238, 0.369, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.238 std_dev=0.131
O2'	A	0, 0.106, 0.253, 0.401, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.253 std_dev=0.147
C4'	A	0, 0.223, 0.419, 0.615, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.419 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.238, 0.436, 0.634, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.436 std_dev=0.198
N6	B	0, 0.100, 0.309, 0.517, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.309 std_dev=0.209
C6	B	0, 0.168, 0.392, 0.616, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.392 std_dev=0.224
O3'	A	0, 0.335, 0.617, 0.898, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.617 std_dev=0.281
N1	B	0, 0.248, 0.540, 0.832, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.540 std_dev=0.292
C5	B	0, 0.371, 0.669, 0.967, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.669 std_dev=0.298
C5'	A	0, 0.400, 0.739, 1.077, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.739 std_dev=0.339
C2	B	0, 0.384, 0.732, 1.081, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.732 std_dev=0.348
O5'	A	0, 0.405, 0.763, 1.122, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.763 std_dev=0.359
C4	B	0, 0.513, 0.910, 1.307, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.910 std_dev=0.397
N3	B	0, 0.513, 0.915, 1.316, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.915 std_dev=0.401
N7	B	0, 0.471, 0.889, 1.307, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.889 std_dev=0.418
P	A	0, 0.534, 1.008, 1.482, 1.451 max_d=1.451 avg_d=1.008 std_dev=0.474
OP2	A	0, 0.576, 1.062, 1.549, 1.519 max_d=1.519 avg_d=1.062 std_dev=0.486
N9	B	0, 0.676, 1.237, 1.799, 1.772 max_d=1.772 avg_d=1.237 std_dev=0.561
C8	B	0, 0.637, 1.219, 1.802, 1.826 max_d=1.826 avg_d=1.219 std_dev=0.582
OP1	A	0, 0.660, 1.276, 1.893, 1.868 max_d=1.868 avg_d=1.276 std_dev=0.617
C1'	B	0, 0.858, 1.568, 2.278, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.568 std_dev=0.710
O2'	B	0, 1.090, 1.956, 2.821, 2.704 max_d=2.704 avg_d=1.956 std_dev=0.866
C2'	B	0, 1.034, 1.922, 2.811, 2.703 max_d=2.703 avg_d=1.922 std_dev=0.889
O4'	B	0, 1.053, 2.053, 3.054, 3.036 max_d=3.036 avg_d=2.053 std_dev=1.001
C3'	B	0, 1.239, 2.457, 3.674, 3.567 max_d=3.567 avg_d=2.457 std_dev=1.217
C4'	B	0, 1.262, 2.549, 3.835, 3.756 max_d=3.756 avg_d=2.549 std_dev=1.286
OP2	B	0, 1.428, 2.725, 4.022, 4.258 max_d=4.258 avg_d=2.725 std_dev=1.297
P	B	0, 1.520, 2.837, 4.154, 3.899 max_d=3.899 avg_d=2.837 std_dev=1.317
OP1	B	0, 1.589, 2.919, 4.249, 4.094 max_d=4.094 avg_d=2.919 std_dev=1.330
O5'	B	0, 1.566, 2.996, 4.426, 4.278 max_d=4.278 avg_d=2.996 std_dev=1.430
O3'	B	0, 1.408, 2.878, 4.348, 4.235 max_d=4.235 avg_d=2.878 std_dev=1.470
C5'	B	0, 1.414, 3.005, 4.596, 4.531 max_d=4.531 avg_d=3.005 std_dev=1.591

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.10	0.06
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.03	0.11	0.12	0.20	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.17	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.08	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.11	0.04	0.08	0.07	0.15	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.13	0.09
C4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.17	0.20	0.28	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.04	0.18	0.21	0.27	0.22
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.12	0.07	0.08	0.12	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.05	0.15	0.16	0.20	0.17
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.11	0.11	0.17	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.03	0.14	0.16	0.24	0.17
N4	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.18	0.23	0.30	0.24
O2	0.01	0.00	0.17	0.15	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.19	0.05	0.09	0.09	0.18	0.11
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.03	0.07	0.03	0.07	0.03	0.07	0.05	0.15	0.00	0.03	0.04	0.04	0.10	0.06	0.04
O3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.07	0.02	0.12	0.02	0.12	0.04	0.09	0.08	0.19	0.03	0.00	0.02	0.09	0.21	0.21	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.16	0.10
O5'	0.04	0.11	0.06	0.07	0.17	0.01	0.18	0.01	0.15	0.11	0.14	0.18	0.09	0.04	0.09	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.12	0.10	0.14	0.20	0.07	0.21	0.05	0.16	0.11	0.16	0.23	0.09	0.10	0.21	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.20	0.08	0.13	0.28	0.03	0.27	0.01	0.20	0.17	0.24	0.30	0.18	0.06	0.21	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.05	0.09	0.21	0.02	0.22	0.02	0.17	0.12	0.17	0.24	0.11	0.04	0.14	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.16	0.20	0.17	0.21	0.23	0.21	0.22	0.18	0.25	0.15	0.18	0.16	0.25	0.24	0.22	0.16	0.28	0.83	1.08	0.98	0.93
C2	0.32	0.20	0.33	0.33	0.27	0.34	0.27	0.33	0.20	0.33	0.17	0.24	0.15	0.32	0.31	0.33	0.33	0.36	0.96	1.16	1.08	1.04
C2'	0.20	0.22	0.18	0.17	0.18	0.20	0.16	0.19	0.18	0.20	0.23	0.19	0.19	0.18	0.19	0.19	0.19	0.25	0.80	0.99	0.92	0.86
C3'	0.20	0.21	0.18	0.17	0.18	0.20	0.16	0.20	0.16	0.20	0.21	0.19	0.15	0.19	0.19	0.19	0.18	0.25	0.81	1.02	0.94	0.88
C4	0.36	0.21	0.39	0.41	0.29	0.41	0.27	0.40	0.20	0.36	0.18	0.26	0.16	0.33	0.34	0.38	0.43	0.40	1.03	1.19	1.11	1.11
C4'	0.22	0.15	0.16	0.15	0.19	0.20	0.19	0.20	0.16	0.23	0.14	0.16	0.16	0.23	0.21	0.18	0.15	0.26	0.81	1.09	0.98	0.93
C5	0.33	0.19	0.33	0.33	0.26	0.36	0.26	0.35	0.20	0.34	0.17	0.23	0.18	0.32	0.31	0.33	0.34	0.37	0.99	1.17	1.08	1.08
C5'	0.23	0.16	0.18	0.16	0.20	0.22	0.21	0.22	0.19	0.25	0.15	0.18	0.19	0.25	0.23	0.20	0.15	0.27	0.82	1.13	1.01	0.96
C6	0.29	0.18	0.27	0.26	0.24	0.30	0.24	0.29	0.19	0.31	0.16	0.21	0.18	0.30	0.29	0.28	0.26	0.34	0.94	1.14	1.05	1.04
N1	0.28	0.18	0.26	0.25	0.24	0.29	0.24	0.28	0.19	0.30	0.16	0.21	0.17	0.29	0.28	0.28	0.24	0.32	0.91	1.13	1.04	1.01
N3	0.36	0.21	0.39	0.41	0.29	0.40	0.27	0.39	0.20	0.36	0.18	0.26	0.15	0.33	0.34	0.38	0.43	0.39	1.02	1.19	1.11	1.10
N4	0.39	0.23	0.44	0.48	0.30	0.46	0.28	0.46	0.21	0.38	0.19	0.28	0.16	0.34	0.37	0.43	0.52	0.43	1.06	1.19	1.11	1.14
O2	0.32	0.20	0.33	0.32	0.27	0.33	0.27	0.31	0.19	0.33	0.17	0.24	0.13	0.32	0.31	0.33	0.32	0.34	0.92	1.14	1.06	1.00
O2'	0.21	0.26	0.20	0.20	0.19	0.20	0.18	0.17	0.22	0.20	0.28	0.21	0.23	0.18	0.19	0.20	0.24	0.25	0.77	0.97	0.89	0.83
O3'	0.23	0.33	0.24	0.22	0.23	0.21	0.20	0.18	0.24	0.20	0.33	0.28	0.22	0.18	0.21	0.25	0.25	0.25	0.78	0.96	0.90	0.83
O4'	0.26	0.22	0.22	0.18	0.24	0.23	0.25	0.23	0.24	0.27	0.21	0.23	0.24	0.27	0.26	0.24	0.16	0.28	0.82	1.12	1.00	0.95
O5'	0.23	0.15	0.19	0.18	0.20	0.23	0.20	0.25	0.17	0.25	0.14	0.17	0.17	0.24	0.23	0.21	0.16	0.27	0.83	1.11	0.99	0.95
OP1	0.25	0.18	0.20	0.18	0.22	0.24	0.23	0.25	0.20	0.26	0.18	0.20	0.20	0.26	0.24	0.22	0.15	0.28	0.83	1.10	0.98	0.94
OP2	0.18	0.13	0.15	0.14	0.15	0.19	0.15	0.20	0.13	0.20	0.13	0.14	0.13	0.18	0.18	0.16	0.13	0.22	0.76	0.98	0.87	0.86
P	0.21	0.14	0.17	0.15	0.18	0.20	0.19	0.22	0.16	0.23	0.14	0.16	0.16	0.22	0.21	0.19	0.14	0.24	0.80	1.07	0.95	0.92

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.54	0.37	0.28
C2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.42	0.86	0.69	0.56
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.06	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.72	0.48	0.39
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.10	0.10	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.24	0.77	0.41	0.42
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.43	0.80	0.62	0.52
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.34	0.24	0.10
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.53	0.86	0.71	0.62
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.22	0.36	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.54	0.92	0.76	0.66
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.53	0.73	0.57	0.54
N1	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.12	0.04	0.49	0.92	0.75	0.63
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.36	0.79	0.61	0.49
N6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.02	0.05	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.11	0.04	0.59	0.95	0.80	0.71
N7	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.58	0.83	0.70	0.64
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.41	0.70	0.52	0.45
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.52	0.38	0.21
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.10	0.07	0.12	0.11	0.11	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.17	0.75	0.38	0.36
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.12	0.30	0.21	0.09
O5'	0.22	0.42	0.21	0.24	0.43	0.01	0.53	0.01	0.54	0.53	0.49	0.36	0.59	0.58	0.41	0.05	0.17	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.54	0.86	0.72	0.77	0.80	0.34	0.86	0.22	0.92	0.73	0.92	0.79	0.95	0.83	0.70	0.52	0.75	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.69	0.48	0.41	0.62	0.24	0.71	0.36	0.76	0.57	0.75	0.61	0.80	0.70	0.52	0.38	0.38	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.56	0.39	0.42	0.52	0.10	0.62	0.02	0.66	0.54	0.63	0.49	0.71	0.64	0.45	0.21	0.36	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00