Doublet Group distance statistics: 48887

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 2, 1, 2, 3, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.021, 0.033, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.021, 0.034, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.021, 0.034, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.017, 0.032, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.055, 0.088, 0.121, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.088 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.058, 0.105, 0.151, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.105 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.084, 0.187, 0.289, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.187 std_dev=0.102
C2'	A	0, 0.100, 0.235, 0.370, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.235 std_dev=0.135
C4'	A	0, 0.132, 0.294, 0.455, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.294 std_dev=0.162
C4	B	0, 0.165, 0.397, 0.628, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.397 std_dev=0.231
C3'	A	0, 0.132, 0.369, 0.605, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.369 std_dev=0.236
O2'	A	0, 0.124, 0.391, 0.657, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.391 std_dev=0.266
O5'	A	0, 0.195, 0.465, 0.735, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.465 std_dev=0.270
N4	B	0, 0.273, 0.558, 0.844, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.558 std_dev=0.285
C5	B	0, 0.117, 0.419, 0.720, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.419 std_dev=0.302
OP2	A	0, 0.412, 0.718, 1.025, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.718 std_dev=0.306
N3	B	0, 0.191, 0.509, 0.828, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.509 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.222, 0.549, 0.875, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.549 std_dev=0.327
P	A	0, 0.320, 0.658, 0.996, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.658 std_dev=0.338
C2	B	0, 0.184, 0.563, 0.942, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.563 std_dev=0.379
C6	B	0, 0.102, 0.511, 0.920, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.511 std_dev=0.409
OP1	A	0, 0.428, 0.841, 1.255, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.841 std_dev=0.414
N1	B	0, 0.104, 0.535, 0.965, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.535 std_dev=0.430
O3'	A	0, 0.150, 0.598, 1.046, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.598 std_dev=0.448
O2	B	0, 0.263, 0.747, 1.230, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.747 std_dev=0.484
C2'	B	0, 0.187, 0.711, 1.235, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.711 std_dev=0.524
C1'	B	0, 0.181, 0.743, 1.305, 2.385 max_d=2.385 avg_d=0.743 std_dev=0.562
C3'	B	0, 0.150, 0.772, 1.393, 2.643 max_d=2.643 avg_d=0.772 std_dev=0.622
O2'	B	0, 0.204, 0.849, 1.494, 2.785 max_d=2.785 avg_d=0.849 std_dev=0.645
OP2	B	0, 0.102, 0.758, 1.414, 2.999 max_d=2.999 avg_d=0.758 std_dev=0.656
O4'	B	0, 0.214, 0.902, 1.590, 2.854 max_d=2.854 avg_d=0.902 std_dev=0.688
O5'	B	0, 0.115, 0.838, 1.562, 3.155 max_d=3.155 avg_d=0.838 std_dev=0.724
O3'	B	0, 0.153, 0.885, 1.617, 3.033 max_d=3.033 avg_d=0.885 std_dev=0.732
P	B	0, 0.109, 0.863, 1.617, 3.365 max_d=3.365 avg_d=0.863 std_dev=0.754
C4'	B	0, 0.168, 0.938, 1.708, 3.246 max_d=3.246 avg_d=0.938 std_dev=0.770
OP1	B	0, 0.181, 1.058, 1.936, 3.931 max_d=3.931 avg_d=1.058 std_dev=0.877
C5'	B	0, 0.146, 1.046, 1.945, 3.731 max_d=3.731 avg_d=1.046 std_dev=0.900

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.03	0.01	0.06	0.09	0.19	0.11
C2	0.03	0.00	0.06	0.10	0.02	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.09	0.05	0.15	0.15	0.24	0.16
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03	0.05	0.02	0.05	0.04	0.10	0.01	0.04	0.03	0.06	0.16	0.13	0.08
C3'	0.03	0.10	0.00	0.00	0.17	0.01	0.20	0.02	0.19	0.12	0.13	0.18	0.07	0.02	0.01	0.01	0.10	0.19	0.13	0.12
C4	0.02	0.02	0.03	0.17	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.22	0.03	0.21	0.20	0.26	0.20
C4'	0.01	0.06	0.04	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.11	0.07	0.08	0.11	0.06	0.12	0.03	0.00	0.02	0.15	0.06	0.04
C5	0.01	0.02	0.04	0.20	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.29	0.04	0.21	0.20	0.27	0.20
C5'	0.03	0.13	0.03	0.02	0.19	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.16	0.20	0.12	0.12	0.05	0.02	0.01	0.13	0.02	0.04
C6	0.02	0.02	0.05	0.19	0.01	0.11	0.01	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.25	0.05	0.17	0.16	0.24	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.12	0.02	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.12	0.01	0.13	0.13	0.22	0.14
N3	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.08	0.02	0.16	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.14	0.04	0.19	0.18	0.25	0.18
N4	0.02	0.02	0.04	0.18	0.01	0.11	0.01	0.20	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.25	0.04	0.23	0.22	0.27	0.22
O2	0.06	0.01	0.10	0.07	0.02	0.06	0.03	0.12	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.18	0.08	0.09	0.14	0.14	0.23	0.15
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.07	0.12	0.04	0.12	0.05	0.04	0.11	0.07	0.18	0.00	0.10	0.12	0.11	0.28	0.12	0.13
O3'	0.03	0.09	0.04	0.01	0.22	0.03	0.29	0.05	0.25	0.12	0.14	0.25	0.08	0.10	0.00	0.03	0.19	0.37	0.32	0.28
O4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.04	0.09	0.12	0.03	0.00	0.07	0.08	0.21	0.13
O5'	0.06	0.15	0.06	0.10	0.21	0.02	0.21	0.01	0.17	0.13	0.19	0.23	0.14	0.11	0.19	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.09	0.15	0.16	0.19	0.20	0.15	0.20	0.13	0.16	0.13	0.18	0.22	0.14	0.28	0.37	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.24	0.13	0.13	0.26	0.06	0.27	0.02	0.24	0.22	0.25	0.27	0.23	0.12	0.32	0.21	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.16	0.08	0.12	0.20	0.04	0.20	0.04	0.17	0.14	0.18	0.22	0.15	0.13	0.28	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.16	0.12	0.18	0.12	0.14	0.10	0.19	0.10	0.10	0.19	0.17	0.21	0.12	0.21	0.10	0.30	0.30	0.28	0.26
C2	0.16	0.15	0.18	0.25	0.16	0.23	0.16	0.28	0.18	0.15	0.17	0.22	0.16	0.17	0.26	0.20	0.38	0.34	0.33	0.33
C2'	0.10	0.10	0.10	0.15	0.11	0.11	0.17	0.14	0.16	0.10	0.11	0.12	0.14	0.10	0.18	0.11	0.26	0.28	0.28	0.25
C3'	0.10	0.12	0.10	0.14	0.10	0.10	0.15	0.13	0.14	0.10	0.12	0.11	0.16	0.11	0.17	0.10	0.26	0.27	0.25	0.23
C4	0.21	0.17	0.22	0.29	0.18	0.30	0.19	0.35	0.21	0.18	0.19	0.23	0.17	0.22	0.31	0.25	0.45	0.42	0.42	0.42
C4'	0.09	0.14	0.10	0.16	0.09	0.12	0.10	0.18	0.10	0.09	0.15	0.10	0.20	0.11	0.19	0.08	0.29	0.30	0.27	0.26
C5	0.15	0.13	0.17	0.25	0.15	0.25	0.16	0.31	0.18	0.14	0.16	0.20	0.14	0.16	0.28	0.20	0.41	0.40	0.40	0.39
C5'	0.11	0.16	0.13	0.19	0.11	0.16	0.09	0.22	0.09	0.11	0.17	0.13	0.22	0.14	0.23	0.11	0.33	0.33	0.29	0.29
C6	0.11	0.12	0.14	0.22	0.13	0.20	0.14	0.26	0.15	0.10	0.15	0.17	0.15	0.13	0.24	0.15	0.37	0.36	0.35	0.34
N1	0.11	0.13	0.14	0.21	0.13	0.18	0.13	0.24	0.14	0.10	0.16	0.18	0.15	0.12	0.23	0.14	0.35	0.33	0.32	0.31
N3	0.21	0.18	0.22	0.29	0.19	0.29	0.19	0.34	0.22	0.19	0.19	0.23	0.18	0.22	0.31	0.26	0.43	0.39	0.40	0.39
N4	0.25	0.20	0.26	0.33	0.21	0.35	0.22	0.41	0.25	0.22	0.21	0.24	0.20	0.27	0.36	0.31	0.49	0.46	0.47	0.47
O2	0.17	0.16	0.18	0.24	0.18	0.22	0.17	0.26	0.19	0.16	0.18	0.26	0.17	0.17	0.25	0.20	0.35	0.31	0.29	0.29
O2'	0.24	0.22	0.22	0.23	0.26	0.24	0.31	0.25	0.29	0.24	0.22	0.27	0.22	0.22	0.25	0.25	0.28	0.35	0.37	0.32
O3'	0.25	0.26	0.25	0.24	0.24	0.21	0.26	0.18	0.26	0.24	0.25	0.24	0.28	0.27	0.27	0.23	0.24	0.26	0.26	0.23
O4'	0.15	0.22	0.18	0.22	0.17	0.18	0.11	0.23	0.11	0.15	0.24	0.21	0.28	0.18	0.24	0.14	0.33	0.33	0.29	0.28
O5'	0.11	0.17	0.14	0.20	0.14	0.17	0.10	0.23	0.10	0.12	0.19	0.16	0.22	0.13	0.22	0.12	0.34	0.32	0.30	0.29
OP1	0.16	0.21	0.19	0.24	0.17	0.20	0.14	0.25	0.14	0.16	0.22	0.18	0.26	0.19	0.26	0.16	0.36	0.36	0.32	0.32
OP2	0.20	0.24	0.21	0.24	0.23	0.25	0.21	0.31	0.21	0.21	0.26	0.25	0.26	0.20	0.25	0.20	0.41	0.46	0.43	0.41
P	0.12	0.18	0.14	0.20	0.16	0.18	0.12	0.25	0.11	0.13	0.20	0.19	0.22	0.13	0.22	0.12	0.36	0.38	0.35	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.02	0.00	0.10	0.10	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.03	0.15	0.13	0.19	0.13
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.10	0.00	0.03	0.01	0.06	0.10	0.15	0.07
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.07	0.04	0.06	0.08	0.09	0.02	0.01	0.02	0.09	0.12	0.14	0.09
C4	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.04	0.22	0.20	0.23	0.19
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.03	0.04	0.08	0.06	0.03	0.04	0.00	0.02	0.10	0.08	0.03
C5	0.03	0.01	0.04	0.08	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.05	0.24	0.21	0.23	0.20
C5'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.12	0.01	0.15	0.00	0.13	0.06	0.08	0.14	0.06	0.03	0.06	0.02	0.01	0.12	0.04	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.08	0.05	0.21	0.17	0.19	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.15	0.13	0.17	0.11
N3	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.08	0.03	0.18	0.16	0.21	0.15
N4	0.03	0.02	0.05	0.08	0.01	0.08	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.10	0.05	0.24	0.23	0.26	0.22
O2	0.06	0.01	0.10	0.09	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.12	0.11	0.06	0.13	0.13	0.18	0.12
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.04	0.12	0.00	0.07	0.04	0.04	0.10	0.12	0.04
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.08	0.04	0.09	0.06	0.08	0.04	0.08	0.10	0.11	0.07	0.00	0.03	0.15	0.19	0.16	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.00	0.13	0.15	0.13	0.12
O5'	0.10	0.15	0.06	0.09	0.22	0.02	0.24	0.01	0.21	0.15	0.18	0.24	0.13	0.04	0.15	0.13	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.10	0.13	0.10	0.12	0.20	0.10	0.21	0.12	0.17	0.13	0.16	0.23	0.13	0.10	0.19	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.19	0.15	0.14	0.23	0.08	0.23	0.04	0.19	0.17	0.21	0.26	0.18	0.12	0.16	0.13	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.07	0.09	0.19	0.03	0.20	0.02	0.15	0.11	0.15	0.22	0.12	0.04	0.15	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00