Doublet Group distance statistics: 48893

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 5, 8, 10, 12, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N6	B	0, -0.151, 1.462, 3.076, 3.720 max_d=3.720 avg_d=1.462 std_dev=1.613
N6	A	0, -0.416, 1.219, 2.855, 3.911 max_d=3.911 avg_d=1.219 std_dev=1.635
N1	B	0, -0.197, 1.498, 3.193, 3.866 max_d=3.866 avg_d=1.498 std_dev=1.695
N1	A	0, -0.508, 1.367, 3.242, 4.163 max_d=4.163 avg_d=1.367 std_dev=1.875
C6	B	0, -0.274, 1.655, 3.585, 4.337 max_d=4.337 avg_d=1.655 std_dev=1.929
C6	A	0, -0.560, 1.473, 3.505, 4.448 max_d=4.448 avg_d=1.473 std_dev=2.033
C2	B	0, -0.473, 2.408, 5.289, 6.429 max_d=6.429 avg_d=2.408 std_dev=2.881
C2	A	0, -0.863, 2.244, 5.352, 6.790 max_d=6.790 avg_d=2.244 std_dev=3.107
C5	B	0, -0.614, 2.612, 5.838, 7.111 max_d=7.111 avg_d=2.612 std_dev=3.226
C5	A	0, -0.921, 2.422, 5.766, 7.205 max_d=7.205 avg_d=2.422 std_dev=3.344
N3	B	0, -0.753, 3.173, 7.099, 8.643 max_d=8.643 avg_d=3.173 std_dev=3.926
C4	B	0, -0.809, 3.161, 7.131, 8.691 max_d=8.691 avg_d=3.161 std_dev=3.970
C4	A	0, -1.133, 2.990, 7.114, 8.877 max_d=8.877 avg_d=2.990 std_dev=4.124
N3	A	0, -1.138, 2.991, 7.121, 8.940 max_d=8.940 avg_d=2.991 std_dev=4.130
N7	B	0, -0.809, 3.366, 7.542, 9.200 max_d=9.200 avg_d=3.366 std_dev=4.176
N7	A	0, -1.170, 3.125, 7.421, 9.370 max_d=9.370 avg_d=3.125 std_dev=4.296
N9	B	0, -1.105, 4.023, 9.150, 11.173 max_d=11.173 avg_d=4.023 std_dev=5.127
C8	B	0, -1.082, 4.070, 9.222, 11.262 max_d=11.262 avg_d=4.070 std_dev=5.152
N9	A	0, -1.462, 3.830, 9.121, 11.341 max_d=11.341 avg_d=3.830 std_dev=5.291
C8	A	0, -1.444, 3.850, 9.143, 11.396 max_d=11.396 avg_d=3.850 std_dev=5.293
C1'	B	0, -1.379, 4.919, 11.217, 13.719 max_d=13.719 avg_d=4.919 std_dev=6.298
C1'	A	0, -1.814, 4.699, 11.212, 13.926 max_d=13.926 avg_d=4.699 std_dev=6.513
C2'	A	0, -1.850, 5.094, 12.039, 15.220 max_d=15.220 avg_d=5.094 std_dev=6.945
O4'	B	0, -1.519, 5.495, 12.509, 15.410 max_d=15.410 avg_d=5.495 std_dev=7.014
C2'	B	0, -1.575, 5.486, 12.546, 15.467 max_d=15.467 avg_d=5.486 std_dev=7.061
O4'	A	0, -1.992, 5.413, 12.817, 15.954 max_d=15.954 avg_d=5.413 std_dev=7.404
C3'	A	0, -1.976, 5.642, 13.260, 17.173 max_d=17.173 avg_d=5.642 std_dev=7.618
O2'	A	0, -2.026, 5.768, 13.563, 16.862 max_d=16.862 avg_d=5.768 std_dev=7.794
OP1	A	0, -1.708, 6.123, 13.954, 18.051 max_d=18.051 avg_d=6.123 std_dev=7.831
O2'	B	0, -1.728, 6.108, 13.944, 17.103 max_d=17.103 avg_d=6.108 std_dev=7.836
C3'	B	0, -1.692, 6.190, 14.073, 17.402 max_d=17.402 avg_d=6.190 std_dev=7.883
O5'	A	0, -1.991, 6.020, 14.030, 17.973 max_d=17.973 avg_d=6.020 std_dev=8.010
O5'	B	0, -1.703, 6.417, 14.537, 18.847 max_d=18.847 avg_d=6.417 std_dev=8.120
C4'	B	0, -1.801, 6.364, 14.529, 17.773 max_d=17.773 avg_d=6.364 std_dev=8.165
OP2	B	0, -1.575, 6.674, 14.924, 19.440 max_d=19.440 avg_d=6.674 std_dev=8.249
C4'	A	0, -2.169, 6.117, 14.403, 17.781 max_d=17.781 avg_d=6.117 std_dev=8.286
O3'	A	0, -2.116, 6.243, 14.603, 18.371 max_d=18.371 avg_d=6.243 std_dev=8.359
P	A	0, -1.976, 6.524, 15.024, 18.824 max_d=18.824 avg_d=6.524 std_dev=8.500
P	B	0, -1.758, 6.883, 15.524, 19.460 max_d=19.460 avg_d=6.883 std_dev=8.641
C5'	B	0, -1.879, 6.778, 15.434, 18.944 max_d=18.944 avg_d=6.778 std_dev=8.656
C5'	A	0, -2.228, 6.601, 15.430, 19.207 max_d=19.207 avg_d=6.601 std_dev=8.829
OP2	A	0, -1.894, 7.049, 15.992, 20.127 max_d=20.127 avg_d=7.049 std_dev=8.943
O3'	B	0, -1.867, 7.079, 16.026, 19.852 max_d=19.852 avg_d=7.079 std_dev=8.946
OP1	B	0, -1.930, 7.956, 17.842, 21.862 max_d=21.862 avg_d=7.956 std_dev=9.886

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.21	0.00	0.09	0.29	0.50	0.16
C2	0.02	0.00	0.19	0.21	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.05	0.11	0.38	0.66	0.12
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.12	0.12	0.07	0.16	0.19	0.10	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.24	0.31	0.33	0.26
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.19	0.00	0.23	0.01	0.25	0.19	0.24	0.17	0.28	0.23	0.15	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.12	0.06
C4	0.01	0.01	0.11	0.19	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.03	0.10	0.35	0.67	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.09	0.07	0.05	0.09	0.09	0.06	0.17	0.03	0.00	0.01	0.17	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.09	0.03	0.14	0.40	0.76	0.18
C5'	0.04	0.06	0.12	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.05	0.10	0.09	0.04	0.06	0.12	0.02	0.01	0.21	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.25	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.10	0.04	0.16	0.44	0.77	0.18
C8	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.11	0.03	0.12	0.34	0.75	0.22
N1	0.02	0.00	0.16	0.24	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.05	0.14	0.43	0.73	0.15
N3	0.02	0.00	0.19	0.17	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.05	0.09	0.34	0.62	0.11
N6	0.02	0.01	0.10	0.28	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.14	0.05	0.18	0.48	0.81	0.21
N7	0.01	0.01	0.04	0.23	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.16	0.13	0.02	0.15	0.40	0.81	0.22
N9	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.01	0.07	0.31	0.64	0.16
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.11	0.17	0.15	0.06	0.14	0.15	0.12	0.10	0.16	0.16	0.10	0.00	0.04	0.12	0.17	0.27	0.30	0.22
O3'	0.21	0.12	0.02	0.01	0.08	0.03	0.09	0.12	0.10	0.11	0.09	0.14	0.14	0.13	0.08	0.04	0.00	0.16	0.15	0.18	0.15	0.20
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.12	0.16	0.00	0.05	0.27	0.50	0.16
O5'	0.09	0.11	0.24	0.04	0.10	0.01	0.14	0.01	0.16	0.12	0.14	0.09	0.18	0.15	0.07	0.17	0.15	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.29	0.38	0.31	0.08	0.35	0.17	0.40	0.21	0.44	0.34	0.43	0.34	0.48	0.40	0.31	0.27	0.18	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.50	0.66	0.33	0.12	0.67	0.20	0.76	0.18	0.77	0.75	0.73	0.62	0.81	0.81	0.64	0.30	0.15	0.50	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.12	0.26	0.06	0.14	0.04	0.18	0.01	0.18	0.22	0.15	0.11	0.21	0.22	0.16	0.22	0.20	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.16	0.10	0.18	0.09	0.09	0.07	0.13	0.08	0.07	0.12	0.15	0.12	0.10	0.08	0.21	0.25	0.15	0.30	0.51	0.59	0.31
C2	0.11	0.17	0.15	0.25	0.11	0.13	0.10	0.18	0.12	0.10	0.16	0.15	0.14	0.11	0.10	0.17	0.30	0.13	0.29	0.50	0.55	0.27
C2'	0.20	0.25	0.12	0.15	0.19	0.13	0.17	0.10	0.17	0.16	0.22	0.23	0.16	0.16	0.18	0.25	0.19	0.24	0.44	0.51	0.66	0.36
C3'	0.31	0.39	0.25	0.18	0.30	0.22	0.25	0.14	0.26	0.22	0.34	0.37	0.22	0.20	0.27	0.38	0.20	0.33	0.46	0.46	0.61	0.30
C4	0.11	0.16	0.10	0.17	0.09	0.08	0.07	0.11	0.08	0.06	0.12	0.14	0.13	0.09	0.08	0.20	0.24	0.16	0.31	0.48	0.56	0.28
C4'	0.16	0.21	0.08	0.11	0.13	0.11	0.08	0.11	0.09	0.07	0.16	0.20	0.10	0.08	0.11	0.25	0.18	0.20	0.29	0.48	0.55	0.26
C5	0.15	0.16	0.09	0.13	0.11	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.11	0.15	0.14	0.09	0.10	0.23	0.21	0.21	0.35	0.45	0.53	0.27
C5'	0.20	0.23	0.12	0.09	0.16	0.15	0.10	0.11	0.11	0.09	0.17	0.22	0.11	0.09	0.14	0.29	0.17	0.24	0.33	0.45	0.55	0.26
C6	0.14	0.16	0.09	0.14	0.11	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.11	0.15	0.14	0.09	0.10	0.21	0.21	0.20	0.35	0.45	0.51	0.26
C8	0.17	0.16	0.10	0.11	0.11	0.13	0.08	0.10	0.08	0.09	0.10	0.16	0.14	0.10	0.11	0.26	0.22	0.23	0.35	0.45	0.55	0.28
N1	0.10	0.16	0.12	0.21	0.09	0.09	0.07	0.12	0.09	0.06	0.14	0.14	0.13	0.08	0.08	0.17	0.26	0.14	0.31	0.47	0.52	0.25
N3	0.11	0.16	0.13	0.23	0.10	0.11	0.09	0.17	0.11	0.10	0.14	0.14	0.14	0.11	0.09	0.18	0.29	0.13	0.29	0.50	0.56	0.29
N6	0.19	0.17	0.10	0.10	0.15	0.15	0.13	0.12	0.13	0.14	0.13	0.18	0.18	0.14	0.16	0.25	0.20	0.26	0.39	0.45	0.49	0.27
N7	0.19	0.16	0.11	0.10	0.13	0.15	0.10	0.12	0.10	0.11	0.11	0.17	0.15	0.11	0.14	0.27	0.21	0.26	0.37	0.44	0.53	0.28
N9	0.13	0.16	0.09	0.15	0.09	0.09	0.07	0.10	0.08	0.06	0.11	0.15	0.13	0.09	0.08	0.22	0.23	0.18	0.32	0.48	0.57	0.29
O2'	0.16	0.21	0.20	0.32	0.16	0.20	0.16	0.27	0.17	0.17	0.19	0.19	0.18	0.18	0.15	0.22	0.37	0.16	0.28	0.55	0.61	0.36
O3'	0.21	0.32	0.12	0.13	0.21	0.16	0.16	0.21	0.17	0.15	0.26	0.29	0.14	0.14	0.18	0.28	0.13	0.24	0.18	0.50	0.44	0.23
O4'	0.16	0.18	0.16	0.21	0.13	0.15	0.12	0.17	0.12	0.12	0.14	0.17	0.16	0.14	0.13	0.25	0.28	0.18	0.23	0.52	0.55	0.30
O5'	0.32	0.33	0.22	0.15	0.27	0.26	0.21	0.19	0.21	0.21	0.27	0.34	0.18	0.19	0.26	0.38	0.19	0.36	0.46	0.45	0.60	0.32
OP1	0.61	0.60	0.54	0.51	0.57	0.59	0.53	0.57	0.52	0.53	0.55	0.61	0.51	0.51	0.57	0.55	0.40	0.65	0.65	0.41	0.78	0.51
OP2	1.04	0.96	0.92	0.85	0.94	1.04	0.86	0.98	0.81	0.89	0.87	0.99	0.71	0.82	0.96	1.10	0.88	1.14	1.03	0.91	0.80	0.79
P	0.42	0.39	0.30	0.21	0.34	0.39	0.26	0.33	0.24	0.27	0.31	0.41	0.17	0.22	0.35	0.47	0.24	0.50	0.47	0.41	0.50	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.13	0.28	0.08	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.21	0.07	0.23	0.38	0.27	0.17
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.08	0.06	0.09	0.09	0.09	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.28	0.16	0.15
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.02	0.16	0.17	0.14	0.11	0.18	0.18	0.10	0.02	0.01	0.01	0.22	0.35	0.16	0.18
C4	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.13	0.04	0.23	0.38	0.24	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.09	0.04	0.03	0.07	0.09	0.05	0.10	0.02	0.00	0.02	0.12	0.15	0.06
C5	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.15	0.04	0.28	0.42	0.33	0.18
C5'	0.03	0.07	0.07	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.06	0.12	0.13	0.07	0.04	0.08	0.01	0.01	0.22	0.25	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.18	0.05	0.29	0.43	0.38	0.20
C8	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.14	0.04	0.28	0.40	0.25	0.16
N1	0.02	0.00	0.09	0.14	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.20	0.06	0.27	0.41	0.34	0.19
N3	0.02	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.19	0.06	0.21	0.36	0.21	0.15
N6	0.01	0.01	0.09	0.18	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.21	0.05	0.32	0.45	0.44	0.22
N7	0.01	0.01	0.06	0.18	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.17	0.03	0.30	0.43	0.36	0.19
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.02	0.22	0.35	0.17	0.14
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.14	0.10	0.14	0.04	0.17	0.07	0.20	0.18	0.17	0.10	0.07	0.00	0.04	0.08	0.08	0.19	0.10	0.09
O3'	0.10	0.21	0.02	0.01	0.13	0.02	0.15	0.08	0.18	0.14	0.20	0.19	0.21	0.17	0.08	0.04	0.00	0.07	0.19	0.49	0.20	0.25
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.08	0.07	0.00	0.06	0.28	0.14	0.18
O5'	0.13	0.23	0.20	0.22	0.23	0.02	0.28	0.01	0.29	0.28	0.27	0.21	0.32	0.30	0.22	0.08	0.19	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.28	0.38	0.28	0.35	0.38	0.12	0.42	0.22	0.43	0.40	0.41	0.36	0.45	0.43	0.35	0.19	0.49	0.28	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.27	0.16	0.16	0.24	0.15	0.33	0.25	0.38	0.25	0.34	0.21	0.44	0.36	0.17	0.10	0.20	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.17	0.15	0.18	0.16	0.06	0.18	0.02	0.20	0.16	0.19	0.15	0.22	0.19	0.14	0.09	0.25	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00