Doublet Group distance statistics: 48894

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 13, 15, 6, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	B	0, -0.234, 0.277, 0.787, 3.570 max_d=3.570 avg_d=0.277 std_dev=0.511
N1	A	0, -0.423, 0.094, 0.610, 3.481 max_d=3.481 avg_d=0.094 std_dev=0.517
N6	B	0, -0.246, 0.344, 0.934, 3.961 max_d=3.961 avg_d=0.344 std_dev=0.590
N6	A	0, -0.512, 0.120, 0.753, 4.266 max_d=4.266 avg_d=0.120 std_dev=0.633
C6	B	0, -0.316, 0.320, 0.956, 4.386 max_d=4.386 avg_d=0.320 std_dev=0.636
C6	A	0, -0.559, 0.110, 0.779, 4.498 max_d=4.498 avg_d=0.110 std_dev=0.669
C2	B	0, -0.511, 0.359, 1.230, 6.024 max_d=6.024 avg_d=0.359 std_dev=0.871
C2	A	0, -0.743, 0.142, 1.027, 5.946 max_d=5.946 avg_d=0.142 std_dev=0.885
C5	B	0, -0.625, 0.415, 1.454, 7.154 max_d=7.154 avg_d=0.415 std_dev=1.040
C5	A	0, -0.904, 0.178, 1.260, 7.274 max_d=7.274 avg_d=0.178 std_dev=1.082
N3	B	0, -0.785, 0.428, 1.641, 8.347 max_d=8.347 avg_d=0.428 std_dev=1.213
N3	A	0, -1.031, 0.203, 1.436, 8.292 max_d=8.292 avg_d=0.203 std_dev=1.234
C4	B	0, -0.825, 0.431, 1.687, 8.631 max_d=8.631 avg_d=0.431 std_dev=1.256
C4	A	0, -1.072, 0.212, 1.496, 8.631 max_d=8.631 avg_d=0.212 std_dev=1.284
N7	B	0, -0.810, 0.544, 1.899, 9.284 max_d=9.284 avg_d=0.544 std_dev=1.354
N7	A	0, -1.175, 0.242, 1.660, 9.535 max_d=9.535 avg_d=0.242 std_dev=1.417
N9	B	0, -1.102, 0.533, 2.168, 11.203 max_d=11.203 avg_d=0.533 std_dev=1.635
C8	B	0, -1.059, 0.592, 2.244, 11.320 max_d=11.320 avg_d=0.592 std_dev=1.651
N9	A	0, -1.399, 0.272, 1.943, 11.227 max_d=11.227 avg_d=0.272 std_dev=1.671
C8	A	0, -1.421, 0.290, 2.002, 11.512 max_d=11.512 avg_d=0.290 std_dev=1.712
C1'	B	0, -1.400, 0.610, 2.620, 13.746 max_d=13.746 avg_d=0.610 std_dev=2.010
C1'	A	0, -1.718, 0.325, 2.367, 13.717 max_d=13.717 avg_d=0.325 std_dev=2.042
C2'	A	0, -1.731, 0.419, 2.569, 14.506 max_d=14.506 avg_d=0.419 std_dev=2.150
O4'	B	0, -1.562, 0.672, 2.906, 15.269 max_d=15.269 avg_d=0.672 std_dev=2.234
C2'	B	0, -1.555, 0.707, 2.968, 15.463 max_d=15.463 avg_d=0.707 std_dev=2.261
O2'	B	0, -1.565, 0.753, 3.071, 15.698 max_d=15.698 avg_d=0.753 std_dev=2.318
O4'	A	0, -1.916, 0.431, 2.778, 15.814 max_d=15.814 avg_d=0.431 std_dev=2.347
C3'	A	0, -1.874, 0.524, 2.923, 16.165 max_d=16.165 avg_d=0.524 std_dev=2.398
O2'	A	0, -1.916, 0.506, 2.927, 16.360 max_d=16.360 avg_d=0.506 std_dev=2.422
C3'	B	0, -1.842, 0.780, 3.402, 17.914 max_d=17.914 avg_d=0.780 std_dev=2.622
C4'	A	0, -2.097, 0.538, 3.172, 17.752 max_d=17.752 avg_d=0.538 std_dev=2.634
C4'	B	0, -1.869, 0.766, 3.401, 17.993 max_d=17.993 avg_d=0.766 std_dev=2.635
O3'	A	0, -2.001, 0.650, 3.301, 17.814 max_d=17.814 avg_d=0.650 std_dev=2.651
O5'	A	0, -1.896, 0.795, 3.486, 17.799 max_d=17.799 avg_d=0.795 std_dev=2.691
O5'	B	0, -1.869, 0.871, 3.610, 18.715 max_d=18.715 avg_d=0.871 std_dev=2.740
C5'	B	0, -1.962, 0.859, 3.681, 19.270 max_d=19.270 avg_d=0.859 std_dev=2.821
O3'	B	0, -1.996, 0.839, 3.675, 19.297 max_d=19.297 avg_d=0.839 std_dev=2.836
C5'	A	0, -2.189, 0.663, 3.515, 19.251 max_d=19.251 avg_d=0.663 std_dev=2.852
OP2	A	0, -1.863, 1.023, 3.910, 18.160 max_d=18.160 avg_d=1.023 std_dev=2.887
OP2	B	0, -1.910, 1.001, 3.913, 19.783 max_d=19.783 avg_d=1.001 std_dev=2.912
P	A	0, -2.011, 0.954, 3.919, 19.223 max_d=19.223 avg_d=0.954 std_dev=2.965
P	B	0, -2.041, 0.956, 3.953, 20.441 max_d=20.441 avg_d=0.956 std_dev=2.997
OP1	A	0, -2.082, 1.072, 4.225, 19.878 max_d=19.878 avg_d=1.072 std_dev=3.153
OP1	B	0, -2.359, 1.008, 4.376, 22.995 max_d=22.995 avg_d=1.008 std_dev=3.368

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.03	0.23	0.33	0.44	0.29
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.06	0.06	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.16	0.24	0.07	0.14
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.13	0.11	0.07	0.15	0.15	0.09	0.02	0.01	0.01	0.21	0.33	0.07	0.19
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.27	0.33	0.44	0.31
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.02	0.03	0.06	0.08	0.04	0.05	0.03	0.00	0.01	0.09	0.18	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.01	0.37	0.45	0.62	0.44
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.10	0.15	0.07	0.03	0.13	0.15	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.14	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.36	0.48	0.67	0.46
C8	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.42	0.43	0.57	0.45
N1	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.30	0.41	0.58	0.39
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.07	0.03	0.20	0.27	0.36	0.24
N6	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.41	0.55	0.78	0.54
N7	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.02	0.45	0.52	0.72	0.53
N9	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.27	0.29	0.37	0.28
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.05	0.08	0.03	0.10	0.11	0.08	0.05	0.04	0.00	0.04	0.04	0.07	0.19	0.13	0.09
O3'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.08	0.03	0.13	0.03	0.13	0.14	0.10	0.07	0.16	0.16	0.07	0.04	0.00	0.02	0.14	0.36	0.18	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.09	0.17	0.07
O5'	0.10	0.23	0.16	0.21	0.27	0.01	0.37	0.01	0.36	0.42	0.30	0.20	0.41	0.45	0.27	0.07	0.14	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.33	0.24	0.33	0.33	0.09	0.45	0.14	0.48	0.43	0.41	0.27	0.55	0.52	0.29	0.19	0.36	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.44	0.07	0.07	0.44	0.18	0.62	0.22	0.67	0.57	0.58	0.36	0.78	0.72	0.37	0.13	0.18	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.29	0.14	0.19	0.31	0.04	0.44	0.01	0.46	0.45	0.39	0.24	0.54	0.53	0.28	0.09	0.15	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.14	0.09	0.07	0.08	0.08	0.16	0.08	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.08	0.25	0.24	0.09	0.23	0.20	0.34	0.21
C2	0.09	0.11	0.15	0.11	0.08	0.09	0.09	0.18	0.09	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.08	0.30	0.24	0.10	0.25	0.23	0.36	0.24
C2'	0.10	0.11	0.18	0.15	0.09	0.08	0.08	0.17	0.08	0.09	0.10	0.10	0.08	0.09	0.09	0.30	0.29	0.07	0.25	0.25	0.39	0.26
C3'	0.15	0.17	0.24	0.22	0.14	0.12	0.13	0.17	0.13	0.13	0.15	0.16	0.12	0.13	0.14	0.31	0.35	0.10	0.27	0.28	0.41	0.29
C4	0.08	0.10	0.13	0.10	0.08	0.08	0.08	0.16	0.08	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.08	0.24	0.24	0.09	0.22	0.19	0.34	0.21
C4'	0.08	0.10	0.14	0.11	0.08	0.09	0.07	0.18	0.07	0.08	0.09	0.10	0.09	0.09	0.07	0.21	0.23	0.09	0.24	0.22	0.38	0.24
C5	0.08	0.10	0.12	0.10	0.08	0.09	0.09	0.16	0.09	0.09	0.08	0.09	0.12	0.10	0.08	0.19	0.25	0.09	0.20	0.17	0.32	0.19
C5'	0.11	0.14	0.19	0.16	0.11	0.09	0.10	0.16	0.10	0.10	0.12	0.13	0.11	0.10	0.10	0.22	0.27	0.08	0.24	0.22	0.38	0.24
C6	0.08	0.10	0.12	0.10	0.08	0.09	0.09	0.16	0.09	0.09	0.08	0.09	0.12	0.10	0.08	0.19	0.25	0.09	0.20	0.17	0.31	0.19
C8	0.09	0.10	0.12	0.10	0.08	0.10	0.09	0.17	0.09	0.10	0.08	0.10	0.13	0.11	0.09	0.17	0.25	0.10	0.19	0.16	0.32	0.18
N1	0.08	0.10	0.14	0.10	0.08	0.09	0.08	0.17	0.08	0.09	0.09	0.09	0.11	0.10	0.08	0.25	0.24	0.09	0.23	0.20	0.34	0.22
N3	0.08	0.10	0.15	0.11	0.08	0.09	0.08	0.17	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.10	0.08	0.29	0.24	0.09	0.24	0.23	0.36	0.24
N6	0.09	0.10	0.12	0.10	0.09	0.10	0.10	0.16	0.11	0.10	0.09	0.10	0.15	0.11	0.09	0.15	0.25	0.10	0.19	0.15	0.29	0.17
N7	0.09	0.10	0.12	0.10	0.09	0.10	0.10	0.17	0.10	0.10	0.09	0.10	0.14	0.11	0.09	0.15	0.26	0.10	0.19	0.15	0.30	0.17
N9	0.08	0.09	0.13	0.10	0.08	0.09	0.08	0.16	0.08	0.09	0.08	0.09	0.11	0.10	0.08	0.22	0.25	0.09	0.22	0.18	0.34	0.20
O2'	0.12	0.14	0.11	0.09	0.13	0.14	0.13	0.21	0.14	0.13	0.14	0.14	0.14	0.14	0.12	0.29	0.19	0.15	0.26	0.25	0.38	0.25
O3'	0.15	0.18	0.25	0.23	0.14	0.13	0.13	0.20	0.13	0.13	0.16	0.17	0.13	0.13	0.14	0.33	0.35	0.11	0.29	0.31	0.45	0.32
O4'	0.08	0.10	0.11	0.08	0.08	0.11	0.09	0.19	0.09	0.10	0.08	0.10	0.11	0.11	0.08	0.20	0.22	0.11	0.23	0.19	0.34	0.21
O5'	0.33	0.36	0.39	0.36	0.32	0.28	0.29	0.17	0.30	0.28	0.34	0.36	0.27	0.27	0.31	0.42	0.47	0.28	0.45	0.37	0.42	0.36
OP1	0.52	0.57	0.60	0.58	0.50	0.46	0.44	0.36	0.44	0.43	0.51	0.57	0.37	0.40	0.49	0.60	0.64	0.44	0.58	0.54	0.64	0.54
OP2	0.77	0.79	0.78	0.79	0.74	0.76	0.68	0.64	0.68	0.68	0.74	0.79	0.61	0.65	0.73	0.78	0.86	0.76	0.91	0.81	0.72	0.76
P	0.48	0.52	0.53	0.51	0.46	0.44	0.41	0.33	0.42	0.40	0.47	0.52	0.36	0.38	0.45	0.54	0.59	0.44	0.60	0.52	0.54	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.17	0.01	0.17	0.16	0.17	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.27	0.08	0.18	0.13	0.18	0.10
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.11	0.10	0.11	0.08	0.06	0.11	0.12	0.08	0.00	0.03	0.01	0.22	0.23	0.42	0.25
C3'	0.03	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.05	0.09	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.28	0.10
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.20	0.04	0.20	0.12	0.17	0.10
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.10	0.04	0.07	0.05	0.09	0.04	0.13	0.02	0.01	0.02	0.17	0.17	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.02	0.22	0.15	0.27	0.17
C5'	0.07	0.12	0.11	0.01	0.11	0.01	0.14	0.00	0.14	0.19	0.12	0.11	0.16	0.19	0.12	0.07	0.10	0.02	0.01	0.21	0.12	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.08	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.19	0.03	0.22	0.17	0.30	0.18
C8	0.02	0.02	0.11	0.11	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.11	0.06	0.24	0.15	0.23	0.17
N1	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.23	0.06	0.20	0.14	0.25	0.15
N3	0.03	0.00	0.06	0.05	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.27	0.08	0.18	0.14	0.14	0.07
N6	0.03	0.01	0.11	0.09	0.01	0.05	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.22	0.17	0.03	0.24	0.22	0.37	0.23
N7	0.02	0.02	0.12	0.11	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.22	0.13	0.04	0.25	0.19	0.32	0.22
N9	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.15	0.01	0.20	0.12	0.14	0.09
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.13	0.13	0.19	0.07	0.19	0.19	0.16	0.09	0.22	0.22	0.12	0.00	0.04	0.09	0.18	0.21	0.53	0.26
O3'	0.17	0.27	0.03	0.01	0.20	0.02	0.16	0.10	0.19	0.11	0.23	0.27	0.17	0.13	0.15	0.04	0.00	0.11	0.13	0.20	0.21	0.09
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.08	0.03	0.04	0.01	0.09	0.11	0.00	0.14	0.18	0.10	0.08
O5'	0.17	0.18	0.22	0.05	0.20	0.02	0.22	0.01	0.22	0.24	0.20	0.18	0.24	0.25	0.20	0.18	0.13	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.13	0.23	0.16	0.12	0.17	0.15	0.21	0.17	0.15	0.14	0.14	0.22	0.19	0.12	0.21	0.20	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.18	0.42	0.28	0.17	0.17	0.27	0.12	0.30	0.23	0.25	0.14	0.37	0.32	0.14	0.53	0.21	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.25	0.10	0.10	0.04	0.17	0.01	0.18	0.17	0.15	0.07	0.23	0.22	0.09	0.26	0.09	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00