Doublet Group distance statistics: 48895

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 8, 7, 1, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N6	A	0, -0.649, 0.538, 1.726, 3.473 max_d=3.473 avg_d=0.538 std_dev=1.188
N6	B	0, -0.296, 0.908, 2.111, 3.525 max_d=3.525 avg_d=0.908 std_dev=1.203
N1	B	0, -0.511, 0.914, 2.339, 4.162 max_d=4.162 avg_d=0.914 std_dev=1.425
C6	B	0, -0.577, 0.952, 2.482, 4.430 max_d=4.430 avg_d=0.952 std_dev=1.529
N1	A	0, -0.859, 0.682, 2.224, 4.295 max_d=4.295 avg_d=0.682 std_dev=1.541
C6	A	0, -0.885, 0.693, 2.272, 4.494 max_d=4.494 avg_d=0.693 std_dev=1.578
C2	B	0, -0.872, 1.468, 3.808, 6.778 max_d=6.778 avg_d=1.468 std_dev=2.340
C2	A	0, -1.401, 1.102, 3.605, 6.878 max_d=6.878 avg_d=1.102 std_dev=2.503
C5	B	0, -1.052, 1.466, 3.984, 7.195 max_d=7.195 avg_d=1.466 std_dev=2.518
C5	A	0, -1.448, 1.139, 3.726, 7.219 max_d=7.219 avg_d=1.139 std_dev=2.587
N3	B	0, -1.349, 1.790, 4.928, 8.963 max_d=8.963 avg_d=1.790 std_dev=3.139
C4	B	0, -1.494, 1.666, 4.826, 8.901 max_d=8.901 avg_d=1.666 std_dev=3.160
N7	B	0, -1.227, 1.972, 5.171, 9.170 max_d=9.170 avg_d=1.972 std_dev=3.199
C4	A	0, -1.813, 1.424, 4.661, 8.978 max_d=8.978 avg_d=1.424 std_dev=3.237
N3	A	0, -1.837, 1.445, 4.726, 9.046 max_d=9.046 avg_d=1.445 std_dev=3.281
N7	A	0, -1.832, 1.453, 4.738, 9.096 max_d=9.096 avg_d=1.453 std_dev=3.285
C8	B	0, -1.675, 2.296, 6.267, 11.311 max_d=11.311 avg_d=2.296 std_dev=3.971
N9	B	0, -1.897, 2.131, 6.159, 11.346 max_d=11.346 avg_d=2.131 std_dev=4.028
C8	A	0, -2.276, 1.803, 5.882, 11.253 max_d=11.253 avg_d=1.803 std_dev=4.079
N9	A	0, -2.308, 1.812, 5.933, 11.400 max_d=11.400 avg_d=1.812 std_dev=4.121
C1'	B	0, -2.432, 2.545, 7.523, 13.951 max_d=13.951 avg_d=2.545 std_dev=4.978
C1'	A	0, -2.853, 2.229, 7.312, 14.035 max_d=14.035 avg_d=2.229 std_dev=5.082
C2'	A	0, -2.741, 2.602, 7.945, 14.961 max_d=14.961 avg_d=2.602 std_dev=5.343
C2'	B	0, -2.452, 3.005, 8.461, 15.491 max_d=15.491 avg_d=3.005 std_dev=5.457
O4'	B	0, -2.740, 2.819, 8.378, 15.595 max_d=15.595 avg_d=2.819 std_dev=5.559
O4'	A	0, -2.963, 2.771, 8.504, 16.069 max_d=16.069 avg_d=2.771 std_dev=5.734
C3'	A	0, -2.867, 2.981, 8.830, 16.576 max_d=16.576 avg_d=2.981 std_dev=5.848
OP2	B	0, -1.925, 4.053, 10.031, 17.130 max_d=17.130 avg_d=4.053 std_dev=5.978
O5'	B	0, -2.268, 3.742, 9.752, 17.237 max_d=17.237 avg_d=3.742 std_dev=6.010
C3'	B	0, -2.491, 3.547, 9.584, 17.195 max_d=17.195 avg_d=3.547 std_dev=6.037
O2'	A	0, -3.102, 2.942, 8.986, 16.786 max_d=16.786 avg_d=2.942 std_dev=6.044
O2'	B	0, -2.637, 3.460, 9.557, 17.404 max_d=17.404 avg_d=3.460 std_dev=6.097
O5'	A	0, -2.690, 3.529, 9.748, 18.665 max_d=18.665 avg_d=3.529 std_dev=6.219
OP1	A	0, -2.063, 4.236, 10.534, 20.745 max_d=20.745 avg_d=4.236 std_dev=6.298
P	B	0, -2.236, 4.120, 10.475, 18.204 max_d=18.204 avg_d=4.120 std_dev=6.356
C4'	B	0, -2.978, 3.382, 9.742, 17.947 max_d=17.947 avg_d=3.382 std_dev=6.360
C4'	A	0, -3.218, 3.192, 9.602, 18.087 max_d=18.087 avg_d=3.192 std_dev=6.410
O3'	A	0, -3.043, 3.429, 9.902, 18.382 max_d=18.382 avg_d=3.429 std_dev=6.472
C5'	B	0, -2.863, 3.787, 10.436, 18.895 max_d=18.895 avg_d=3.787 std_dev=6.650
P	A	0, -2.580, 4.149, 10.878, 20.528 max_d=20.528 avg_d=4.149 std_dev=6.729
C5'	A	0, -3.151, 3.678, 10.508, 19.773 max_d=19.773 avg_d=3.678 std_dev=6.830
O3'	B	0, -2.585, 4.246, 11.077, 19.455 max_d=19.455 avg_d=4.246 std_dev=6.831
OP1	B	0, -2.828, 4.555, 11.938, 21.168 max_d=21.168 avg_d=4.555 std_dev=7.383
OP2	A	0, -3.102, 4.360, 11.821, 21.612 max_d=21.612 avg_d=4.360 std_dev=7.462

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.13	0.30	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.24	0.27	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.19	0.35	0.10	0.24	0.91	0.30	0.28
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.02	0.04	0.01	0.09	0.13	0.18	0.24	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.13	0.12
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.14	0.00	0.08	0.01	0.14	0.14	0.22	0.25	0.11	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.10	0.13
C4	0.01	0.01	0.12	0.14	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.16	0.05	0.24	0.83	0.31	0.26
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.18	0.22	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.28	1.06	0.42	0.33
C5'	0.04	0.09	0.01	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.14	0.17	0.12	0.08	0.16	0.18	0.11	0.03	0.04	0.03	0.01	0.36	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.04	0.28	1.17	0.44	0.35
C8	0.01	0.01	0.13	0.14	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.07	0.28	0.85	0.38	0.28
N1	0.02	0.00	0.18	0.22	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.14	0.29	0.07	0.26	1.09	0.38	0.33
N3	0.02	0.00	0.24	0.25	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.31	0.10	0.21	0.76	0.25	0.24
N6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.02	0.30	1.31	0.51	0.39
N7	0.01	0.02	0.08	0.09	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04	0.30	1.11	0.48	0.35
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.66	0.26	0.21
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.08	0.03	0.04	0.03	0.08	0.08	0.14	0.18	0.06	0.06	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.07	0.12	0.07
O3'	0.02	0.35	0.01	0.01	0.16	0.01	0.09	0.04	0.17	0.17	0.29	0.31	0.14	0.11	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.23	0.11	0.12
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.07	0.07	0.10	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.09	0.13	0.04
O5'	0.13	0.24	0.10	0.08	0.24	0.04	0.28	0.01	0.28	0.28	0.26	0.21	0.30	0.30	0.22	0.07	0.05	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.30	0.91	0.20	0.11	0.83	0.18	1.06	0.36	1.17	0.85	1.09	0.76	1.31	1.11	0.66	0.07	0.23	0.09	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.30	0.13	0.10	0.31	0.22	0.42	0.37	0.44	0.38	0.38	0.25	0.51	0.48	0.26	0.12	0.11	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.28	0.12	0.13	0.26	0.02	0.33	0.02	0.35	0.28	0.33	0.24	0.39	0.35	0.21	0.07	0.12	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.09	0.13	0.37	0.12	0.21	0.16	0.28	0.15	0.19	0.10	0.09	0.20	0.21	0.14	0.40	0.18	0.13	0.41	0.79	1.17	0.27
C2	0.15	0.09	0.22	0.51	0.14	0.27	0.18	0.31	0.17	0.21	0.11	0.11	0.22	0.23	0.16	0.24	0.37	0.13	0.43	0.84	1.14	0.23
C2'	0.23	0.16	0.25	0.54	0.23	0.36	0.28	0.42	0.26	0.32	0.19	0.17	0.31	0.34	0.26	0.28	0.36	0.25	0.52	0.66	1.32	0.38
C3'	0.25	0.19	0.27	0.52	0.26	0.36	0.31	0.41	0.30	0.34	0.23	0.20	0.35	0.36	0.28	0.28	0.33	0.26	0.51	0.66	1.30	0.36
C4	0.12	0.09	0.14	0.37	0.12	0.21	0.16	0.26	0.15	0.18	0.10	0.09	0.19	0.20	0.14	0.37	0.19	0.12	0.37	0.84	1.10	0.21
C4'	0.13	0.12	0.15	0.35	0.14	0.20	0.18	0.27	0.18	0.21	0.13	0.12	0.23	0.23	0.15	0.40	0.18	0.13	0.39	0.80	1.16	0.26
C5	0.11	0.09	0.12	0.29	0.11	0.18	0.14	0.22	0.14	0.15	0.10	0.09	0.17	0.17	0.12	0.43	0.14	0.12	0.30	0.89	0.99	0.15
C5'	0.19	0.21	0.20	0.33	0.20	0.23	0.23	0.27	0.23	0.24	0.21	0.20	0.27	0.26	0.20	0.43	0.23	0.19	0.36	0.83	1.10	0.24
C6	0.11	0.09	0.13	0.32	0.12	0.18	0.14	0.21	0.13	0.15	0.10	0.10	0.16	0.16	0.12	0.39	0.16	0.12	0.28	0.93	0.95	0.11
C8	0.11	0.10	0.12	0.24	0.11	0.16	0.14	0.22	0.13	0.16	0.10	0.10	0.17	0.18	0.12	0.49	0.17	0.13	0.30	0.86	1.02	0.18
N1	0.13	0.10	0.18	0.45	0.13	0.23	0.16	0.26	0.15	0.18	0.11	0.11	0.19	0.19	0.15	0.28	0.29	0.12	0.35	0.90	1.03	0.15
N3	0.14	0.09	0.19	0.48	0.13	0.26	0.18	0.31	0.16	0.21	0.10	0.09	0.21	0.23	0.16	0.29	0.31	0.13	0.43	0.81	1.17	0.26
N6	0.11	0.10	0.12	0.24	0.11	0.15	0.12	0.16	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.13	0.12	0.45	0.16	0.12	0.20	0.98	0.81	0.10
N7	0.11	0.10	0.12	0.21	0.11	0.15	0.13	0.19	0.13	0.14	0.10	0.10	0.16	0.16	0.12	0.50	0.19	0.13	0.26	0.90	0.95	0.14
N9	0.11	0.09	0.12	0.33	0.11	0.19	0.15	0.26	0.14	0.18	0.10	0.09	0.19	0.20	0.13	0.42	0.15	0.13	0.36	0.83	1.10	0.22
O2'	0.24	0.14	0.27	0.58	0.23	0.38	0.28	0.45	0.25	0.33	0.17	0.17	0.30	0.35	0.26	0.27	0.41	0.26	0.57	0.62	1.38	0.43
O3'	0.32	0.25	0.36	0.63	0.32	0.44	0.37	0.49	0.36	0.41	0.28	0.26	0.41	0.43	0.35	0.22	0.45	0.33	0.58	0.58	1.39	0.43
O4'	0.09	0.13	0.11	0.25	0.09	0.12	0.11	0.19	0.11	0.13	0.10	0.12	0.16	0.15	0.09	0.48	0.17	0.08	0.32	0.88	1.07	0.20
O5'	0.32	0.33	0.31	0.42	0.33	0.34	0.35	0.36	0.36	0.35	0.34	0.32	0.39	0.37	0.33	0.46	0.35	0.32	0.42	0.84	1.10	0.32
OP1	1.38	1.40	1.40	1.47	1.39	1.39	1.38	1.39	1.38	1.37	1.40	1.40	1.34	1.36	1.38	1.07	1.23	1.36	1.41	0.71	1.96	1.25
OP2	0.66	0.66	0.70	0.60	0.60	0.62	0.51	0.53	0.49	0.51	0.57	0.68	0.39	0.45	0.59	1.19	0.98	0.62	0.42	1.47	0.37	0.50
P	0.40	0.42	0.41	0.46	0.41	0.41	0.42	0.40	0.43	0.41	0.43	0.42	0.45	0.43	0.40	0.53	0.46	0.39	0.43	0.88	1.04	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.19	0.01	0.13	0.70	0.11	0.24
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.39	0.25	0.03	0.09	0.99	0.47	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.14	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.30	0.57	0.18	0.37
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.17	0.01	0.29	0.01	0.27	0.38	0.18	0.07	0.33	0.39	0.22	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.13	0.09
C4	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.29	0.09	0.02	0.09	0.97	0.42	0.19
C4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.09	0.15	0.05	0.02	0.12	0.15	0.08	0.28	0.01	0.00	0.02	0.12	0.20	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.29	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.15	0.01	0.13	1.05	0.60	0.15
C5'	0.05	0.04	0.14	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.11	0.06	0.04	0.12	0.12	0.04	0.12	0.18	0.03	0.01	0.19	0.35	0.03
C6	0.01	0.00	0.05	0.27	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.36	0.12	0.02	0.14	1.06	0.67	0.14
C8	0.01	0.01	0.04	0.38	0.01	0.15	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.31	0.02	0.14	1.00	0.46	0.18
N1	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.40	0.12	0.03	0.11	1.04	0.60	0.16
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.28	0.03	0.09	0.93	0.36	0.20
N6	0.01	0.00	0.04	0.33	0.01	0.12	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.36	0.20	0.02	0.18	1.07	0.79	0.11
N7	0.01	0.01	0.03	0.39	0.01	0.15	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.32	0.02	0.18	1.06	0.66	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.07	0.01	0.08	0.90	0.30	0.21
O2'	0.02	0.39	0.00	0.02	0.29	0.28	0.31	0.12	0.36	0.16	0.40	0.34	0.36	0.24	0.17	0.00	0.04	0.20	0.18	0.41	0.12	0.26
O3'	0.19	0.25	0.04	0.01	0.09	0.01	0.15	0.18	0.12	0.31	0.12	0.28	0.20	0.32	0.07	0.04	0.00	0.13	0.23	0.43	0.27	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.20	0.13	0.00	0.09	0.56	0.14	0.17
O5'	0.13	0.09	0.30	0.06	0.09	0.02	0.13	0.01	0.14	0.14	0.11	0.09	0.18	0.18	0.08	0.18	0.23	0.09	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.70	0.99	0.57	0.14	0.97	0.12	1.05	0.19	1.06	1.00	1.04	0.93	1.07	1.06	0.90	0.41	0.43	0.56	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.47	0.18	0.13	0.42	0.20	0.60	0.35	0.67	0.46	0.60	0.36	0.79	0.66	0.30	0.12	0.27	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.18	0.37	0.09	0.19	0.06	0.15	0.03	0.14	0.18	0.16	0.20	0.11	0.14	0.21	0.26	0.29	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00