Doublet Group distance statistics: 48903

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C2'	A	0, 0.049, 0.136, 0.223, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.136 std_dev=0.087
O4'	A	0, 0.024, 0.126, 0.227, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.126 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.073, 0.211, 0.348, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.211 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.105, 0.298, 0.491, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.298 std_dev=0.193
C3'	A	0, 0.134, 0.329, 0.525, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.329 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.166, 0.384, 0.602, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.384 std_dev=0.218
N9	B	0, 0.162, 0.418, 0.674, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.418 std_dev=0.256
O3'	A	0, 0.173, 0.431, 0.690, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.431 std_dev=0.259
C5'	A	0, 0.147, 0.412, 0.677, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.412 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.173, 0.439, 0.706, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.439 std_dev=0.267
C5	B	0, 0.189, 0.461, 0.732, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.461 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.202, 0.478, 0.755, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.478 std_dev=0.277
O5'	A	0, 0.166, 0.450, 0.734, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.450 std_dev=0.284
C2	B	0, 0.151, 0.435, 0.719, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.435 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.113, 0.398, 0.682, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.398 std_dev=0.284
C1'	B	0, 0.167, 0.474, 0.782, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.474 std_dev=0.308
P	A	0, 0.174, 0.524, 0.875, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.524 std_dev=0.351
O4'	B	0, 0.149, 0.500, 0.852, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.500 std_dev=0.352
C4'	B	0, 0.242, 0.619, 0.996, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.619 std_dev=0.377
C8	B	0, 0.141, 0.518, 0.895, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.518 std_dev=0.377
N6	B	0, 0.257, 0.636, 1.014, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.636 std_dev=0.378
OP2	A	0, 0.150, 0.543, 0.937, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.543 std_dev=0.394
N7	B	0, 0.183, 0.590, 0.997, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.590 std_dev=0.407
OP1	A	0, 0.192, 0.605, 1.017, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.605 std_dev=0.412
C3'	B	0, 0.130, 0.568, 1.007, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.568 std_dev=0.438
O5'	B	0, 0.320, 0.766, 1.212, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.766 std_dev=0.446
O3'	B	0, 0.134, 0.622, 1.110, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.622 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.325, 0.842, 1.358, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.842 std_dev=0.516
C2'	B	0, -0.030, 0.493, 1.015, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.493 std_dev=0.523
P	B	0, 0.328, 0.856, 1.385, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.856 std_dev=0.529
O2'	B	0, 0.069, 0.816, 1.563, 2.626 max_d=2.626 avg_d=0.816 std_dev=0.747
OP2	B	0, 0.268, 1.312, 2.356, 3.040 max_d=3.040 avg_d=1.312 std_dev=1.044
OP1	B	0, 0.221, 1.478, 2.735, 3.596 max_d=3.596 avg_d=1.478 std_dev=1.257

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.03	0.04	0.05	0.11	0.06
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.01	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.10	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.09	0.12	0.11	0.10	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.12	0.07
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.05	0.05	0.09	0.06
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.08	0.08	0.11	0.08
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.06	0.08	0.05	0.03	0.08	0.09	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.08	0.09	0.13	0.09
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.11	0.08	0.09	0.07
N1	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.06	0.08	0.13	0.08
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.03	0.04	0.04	0.10	0.06
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.11	0.03	0.10	0.11	0.15	0.11
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.12	0.10	0.11	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.05	0.08	0.06
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.03	0.11	0.12	0.07	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.06	0.06	0.03
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.11	0.09	0.15	0.14	0.11	0.09	0.04	0.04	0.00	0.01	0.08	0.15	0.15	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.10	0.12	0.12
O5'	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05	0.02	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.04	0.10	0.12	0.06	0.02	0.08	0.10	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.05	0.07	0.10	0.05	0.05	0.08	0.05	0.09	0.08	0.08	0.04	0.11	0.10	0.05	0.06	0.15	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.11	0.10	0.12	0.09	0.03	0.11	0.01	0.13	0.09	0.13	0.10	0.15	0.11	0.08	0.06	0.15	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.06	0.05	0.07	0.06	0.04	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.06	0.11	0.10	0.06	0.03	0.10	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.27	0.33	0.39	0.24	0.23	0.26	0.18	0.26	0.27	0.23	0.27	0.35	0.31	0.24	0.23	0.33	0.20	0.24	1.34	0.63	0.27
C2	0.24	0.27	0.26	0.35	0.22	0.22	0.25	0.18	0.24	0.27	0.22	0.25	0.33	0.31	0.23	0.21	0.30	0.21	0.23	1.36	0.62	0.28
C2'	0.30	0.31	0.35	0.45	0.29	0.29	0.31	0.26	0.31	0.32	0.29	0.31	0.37	0.35	0.30	0.23	0.40	0.25	0.33	1.28	0.78	0.29
C3'	0.30	0.32	0.38	0.49	0.28	0.30	0.29	0.27	0.30	0.29	0.29	0.31	0.35	0.32	0.28	0.20	0.44	0.23	0.36	1.20	0.84	0.26
C4	0.25	0.27	0.32	0.39	0.24	0.23	0.25	0.18	0.26	0.26	0.23	0.27	0.35	0.30	0.24	0.22	0.33	0.20	0.24	1.32	0.65	0.25
C4'	0.25	0.27	0.36	0.42	0.23	0.23	0.25	0.18	0.26	0.25	0.24	0.27	0.34	0.28	0.23	0.21	0.37	0.18	0.27	1.29	0.70	0.24
C5	0.25	0.27	0.33	0.40	0.23	0.24	0.25	0.19	0.27	0.25	0.24	0.26	0.36	0.28	0.23	0.22	0.35	0.19	0.24	1.26	0.67	0.23
C5'	0.24	0.24	0.37	0.43	0.21	0.22	0.21	0.17	0.23	0.21	0.21	0.25	0.32	0.24	0.20	0.22	0.37	0.15	0.25	1.25	0.70	0.20
C6	0.24	0.27	0.31	0.40	0.23	0.24	0.25	0.19	0.26	0.25	0.24	0.26	0.36	0.28	0.23	0.21	0.34	0.19	0.24	1.25	0.68	0.23
C8	0.26	0.26	0.37	0.42	0.24	0.25	0.25	0.19	0.27	0.25	0.24	0.27	0.36	0.28	0.24	0.24	0.36	0.19	0.25	1.25	0.67	0.22
N1	0.24	0.27	0.27	0.36	0.23	0.23	0.25	0.18	0.25	0.26	0.23	0.25	0.35	0.30	0.23	0.20	0.31	0.20	0.23	1.32	0.65	0.26
N3	0.25	0.27	0.28	0.36	0.23	0.22	0.25	0.17	0.24	0.27	0.22	0.26	0.33	0.31	0.24	0.21	0.31	0.20	0.23	1.36	0.62	0.27
N6	0.23	0.26	0.33	0.41	0.22	0.25	0.24	0.20	0.27	0.23	0.24	0.25	0.36	0.26	0.22	0.21	0.36	0.18	0.25	1.18	0.70	0.21
N7	0.26	0.26	0.37	0.43	0.23	0.25	0.25	0.20	0.27	0.24	0.24	0.26	0.36	0.27	0.23	0.23	0.37	0.19	0.25	1.21	0.69	0.21
N9	0.26	0.27	0.34	0.40	0.24	0.24	0.26	0.18	0.26	0.26	0.24	0.27	0.35	0.29	0.24	0.23	0.34	0.20	0.24	1.31	0.65	0.25
O2'	0.31	0.30	0.34	0.41	0.30	0.29	0.34	0.27	0.33	0.37	0.28	0.30	0.41	0.40	0.32	0.26	0.37	0.28	0.31	1.37	0.71	0.36
O3'	0.31	0.34	0.39	0.51	0.31	0.33	0.32	0.32	0.33	0.33	0.31	0.33	0.38	0.35	0.31	0.19	0.48	0.26	0.41	1.17	0.92	0.31
O4'	0.24	0.24	0.33	0.37	0.21	0.20	0.24	0.14	0.25	0.24	0.21	0.24	0.35	0.29	0.21	0.23	0.30	0.17	0.19	1.36	0.59	0.26
O5'	0.25	0.24	0.39	0.44	0.20	0.24	0.19	0.19	0.21	0.18	0.19	0.25	0.29	0.21	0.20	0.22	0.38	0.17	0.26	1.20	0.71	0.17
OP1	0.28	0.24	0.44	0.47	0.20	0.28	0.17	0.22	0.18	0.16	0.18	0.26	0.25	0.17	0.21	0.27	0.41	0.20	0.27	1.12	0.74	0.11
OP2	0.30	0.24	0.46	0.49	0.22	0.30	0.17	0.25	0.17	0.17	0.18	0.28	0.22	0.16	0.23	0.29	0.43	0.22	0.29	1.06	0.74	0.08
P	0.27	0.23	0.42	0.45	0.20	0.26	0.17	0.20	0.18	0.16	0.17	0.25	0.26	0.17	0.20	0.27	0.38	0.19	0.25	1.15	0.70	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.00	0.08	0.81	0.10	0.21
C2	0.02	0.00	0.17	0.20	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.06	0.16	1.06	0.51	0.14
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.09	0.03	0.06	0.10	0.09	0.10	0.14	0.17	0.08	0.08	0.03	0.01	0.06	0.02	0.25	0.65	0.18	0.34
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.20	0.01	0.27	0.01	0.28	0.26	0.25	0.17	0.31	0.30	0.18	0.03	0.02	0.02	0.06	0.19	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.16	0.15	0.04	0.16	1.05	0.46	0.15
C4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.10	0.15	0.07	0.03	0.12	0.15	0.08	0.21	0.03	0.00	0.01	0.25	0.15	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.27	0.01	0.11	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.20	0.25	0.02	0.24	1.09	0.65	0.13
C5'	0.03	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.17	0.10	0.05	0.17	0.19	0.09	0.11	0.12	0.01	0.01	0.09	0.31	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.28	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.26	0.03	0.25	1.10	0.72	0.13
C8	0.02	0.01	0.10	0.26	0.00	0.15	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.27	0.06	0.24	1.05	0.53	0.15
N1	0.02	0.00	0.14	0.25	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.21	0.05	0.21	1.10	0.64	0.13
N3	0.02	0.00	0.17	0.17	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.17	0.13	0.06	0.12	1.02	0.40	0.16
N6	0.02	0.01	0.08	0.31	0.02	0.12	0.02	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.24	0.31	0.03	0.29	1.09	0.84	0.13
N7	0.02	0.01	0.08	0.30	0.01	0.15	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.22	0.31	0.04	0.29	1.08	0.72	0.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.13	0.14	0.01	0.13	0.99	0.35	0.17
O2'	0.02	0.18	0.01	0.03	0.16	0.21	0.20	0.11	0.21	0.19	0.19	0.17	0.24	0.22	0.13	0.00	0.08	0.15	0.17	0.50	0.13	0.25
O3'	0.08	0.16	0.06	0.02	0.15	0.03	0.25	0.12	0.26	0.27	0.21	0.13	0.31	0.31	0.14	0.08	0.00	0.05	0.14	0.20	0.14	0.15
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.03	0.04	0.01	0.15	0.05	0.00	0.05	0.70	0.10	0.16
O5'	0.08	0.16	0.25	0.06	0.16	0.01	0.24	0.01	0.25	0.24	0.21	0.12	0.29	0.29	0.13	0.17	0.14	0.05	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.81	1.06	0.65	0.19	1.05	0.25	1.09	0.09	1.10	1.05	1.10	1.02	1.09	1.08	0.99	0.50	0.20	0.70	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.51	0.18	0.08	0.46	0.15	0.65	0.31	0.72	0.53	0.64	0.40	0.84	0.72	0.35	0.13	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.14	0.34	0.08	0.15	0.07	0.13	0.01	0.13	0.15	0.13	0.16	0.13	0.14	0.17	0.25	0.15	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00