Doublet Group distance statistics: 48904

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.020 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.018, 0.032, 0.046, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.032 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.016
O4'	A	0, 0.003, 0.140, 0.277, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.140 std_dev=0.137
C2'	A	0, 0.011, 0.150, 0.289, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.150 std_dev=0.139
C4'	A	0, 0.071, 0.220, 0.369, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.220 std_dev=0.149
O2'	A	0, -0.027, 0.179, 0.384, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.179 std_dev=0.205
C3'	A	0, 0.052, 0.263, 0.474, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.263 std_dev=0.211
C6	B	0, 0.369, 0.589, 0.810, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.589 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.357, 0.596, 0.834, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.596 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.359, 0.598, 0.838, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.598 std_dev=0.240
N6	B	0, 0.369, 0.611, 0.853, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.611 std_dev=0.242
N7	B	0, 0.389, 0.660, 0.932, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.660 std_dev=0.271
O4'	B	0, 0.413, 0.685, 0.957, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.685 std_dev=0.272
C4	B	0, 0.313, 0.588, 0.863, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.588 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.321, 0.598, 0.876, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.598 std_dev=0.278
C4'	B	0, 0.421, 0.705, 0.989, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.705 std_dev=0.284
N3	B	0, 0.307, 0.595, 0.884, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.595 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.508, 0.803, 1.098, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.803 std_dev=0.295
C5'	A	0, 0.083, 0.382, 0.682, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.382 std_dev=0.299
N9	B	0, 0.318, 0.629, 0.941, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.629 std_dev=0.312
C8	B	0, 0.362, 0.675, 0.987, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.675 std_dev=0.312
C1'	B	0, 0.357, 0.683, 1.009, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.683 std_dev=0.326
O3'	A	0, 0.061, 0.418, 0.775, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.418 std_dev=0.357
O3'	B	0, 0.336, 0.698, 1.060, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.698 std_dev=0.362
O5'	B	0, 0.499, 0.929, 1.359, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.929 std_dev=0.430
P	B	0, 0.575, 1.010, 1.444, 1.619 max_d=1.619 avg_d=1.010 std_dev=0.435
O5'	A	0, 0.041, 0.499, 0.958, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.499 std_dev=0.459
C2'	B	0, 0.619, 1.084, 1.548, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.084 std_dev=0.465
OP2	A	0, 0.309, 0.787, 1.265, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.787 std_dev=0.478
P	A	0, 0.175, 0.686, 1.197, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.686 std_dev=0.511
C5'	B	0, 0.338, 0.883, 1.428, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.883 std_dev=0.545
OP1	A	0, 0.206, 0.859, 1.511, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.859 std_dev=0.653
OP1	B	0, 0.898, 1.654, 2.409, 2.759 max_d=2.759 avg_d=1.654 std_dev=0.756
O2'	B	0, 0.695, 1.581, 2.467, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.581 std_dev=0.886
OP2	B	0, 0.496, 1.493, 2.491, 2.884 max_d=2.884 avg_d=1.493 std_dev=0.998

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.07	0.09	0.18	0.09
C2	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.17	0.01	0.08	0.10	0.28	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.10	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.12	0.04
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.10	0.11	0.12	0.13	0.10	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.07	0.03
C4	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.12	0.13	0.27	0.16
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02
C5	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.16	0.19	0.32	0.21
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.12	0.10	0.08	0.11	0.12	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02
C6	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.15	0.19	0.34	0.21
C8	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.03	0.21	0.23	0.31	0.23
N1	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.02	0.11	0.15	0.32	0.18
N3	0.02	0.00	0.10	0.13	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.16	0.01	0.07	0.07	0.26	0.12
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.13	0.03	0.17	0.24	0.37	0.24
N7	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.03	0.21	0.25	0.35	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.15	0.25	0.16
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.02	0.12	0.08	0.02
O3'	0.03	0.17	0.03	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.12	0.11	0.15	0.16	0.13	0.12	0.04	0.08	0.00	0.03	0.10	0.11	0.07	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.09	0.10	0.17	0.08
O5'	0.07	0.08	0.02	0.03	0.12	0.01	0.16	0.01	0.15	0.21	0.11	0.07	0.17	0.21	0.14	0.02	0.10	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.10	0.07	0.06	0.13	0.08	0.19	0.07	0.19	0.23	0.15	0.07	0.24	0.25	0.15	0.12	0.11	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.28	0.12	0.07	0.27	0.08	0.32	0.07	0.34	0.31	0.32	0.26	0.37	0.35	0.25	0.08	0.07	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.04	0.03	0.16	0.02	0.21	0.02	0.21	0.23	0.18	0.12	0.24	0.25	0.16	0.02	0.08	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.25	0.47	0.38	0.26	0.22	0.26	0.26	0.24	0.27	0.23	0.26	0.23	0.27	0.27	0.46	0.18	0.20	0.22	0.33	0.49	0.26
C2	0.20	0.26	0.38	0.35	0.22	0.22	0.22	0.29	0.23	0.21	0.25	0.24	0.25	0.22	0.21	0.41	0.18	0.16	0.23	0.24	0.60	0.29
C2'	0.25	0.27	0.46	0.39	0.26	0.24	0.26	0.28	0.26	0.26	0.26	0.27	0.27	0.27	0.26	0.46	0.20	0.21	0.24	0.30	0.52	0.26
C3'	0.26	0.27	0.48	0.38	0.26	0.25	0.25	0.28	0.25	0.26	0.25	0.27	0.25	0.26	0.26	0.48	0.23	0.24	0.28	0.32	0.48	0.24
C4	0.25	0.25	0.46	0.38	0.26	0.22	0.25	0.27	0.24	0.27	0.24	0.26	0.23	0.26	0.26	0.44	0.18	0.19	0.22	0.30	0.51	0.26
C4'	0.28	0.27	0.51	0.39	0.28	0.25	0.26	0.28	0.25	0.28	0.25	0.28	0.23	0.27	0.28	0.51	0.22	0.24	0.26	0.35	0.46	0.25
C5	0.28	0.25	0.50	0.39	0.28	0.23	0.27	0.27	0.25	0.30	0.23	0.27	0.23	0.29	0.29	0.49	0.19	0.21	0.22	0.32	0.46	0.24
C5'	0.30	0.27	0.54	0.40	0.28	0.27	0.26	0.31	0.23	0.28	0.24	0.29	0.21	0.26	0.29	0.57	0.25	0.29	0.30	0.37	0.42	0.25
C6	0.26	0.25	0.47	0.39	0.27	0.23	0.27	0.27	0.25	0.28	0.24	0.26	0.24	0.28	0.28	0.45	0.19	0.19	0.21	0.28	0.49	0.24
C8	0.31	0.24	0.55	0.40	0.29	0.24	0.29	0.27	0.25	0.32	0.22	0.27	0.23	0.31	0.32	0.57	0.20	0.24	0.23	0.39	0.42	0.25
N1	0.21	0.26	0.40	0.36	0.23	0.22	0.23	0.28	0.24	0.23	0.25	0.25	0.25	0.24	0.23	0.41	0.18	0.16	0.22	0.23	0.56	0.27
N3	0.22	0.26	0.40	0.36	0.23	0.22	0.23	0.28	0.23	0.23	0.25	0.25	0.24	0.23	0.23	0.41	0.17	0.17	0.23	0.26	0.57	0.28
N6	0.29	0.25	0.52	0.40	0.29	0.23	0.28	0.26	0.25	0.31	0.23	0.27	0.22	0.29	0.30	0.51	0.20	0.21	0.21	0.31	0.44	0.22
N7	0.32	0.24	0.56	0.41	0.30	0.24	0.29	0.27	0.25	0.33	0.22	0.28	0.23	0.31	0.32	0.59	0.20	0.24	0.22	0.39	0.41	0.25
N9	0.28	0.25	0.49	0.39	0.27	0.23	0.27	0.27	0.25	0.29	0.23	0.27	0.23	0.28	0.28	0.48	0.19	0.21	0.22	0.34	0.47	0.26
O2'	0.25	0.28	0.44	0.39	0.27	0.25	0.27	0.30	0.27	0.27	0.28	0.28	0.29	0.28	0.26	0.46	0.20	0.20	0.22	0.29	0.57	0.28
O3'	0.25	0.27	0.45	0.38	0.25	0.26	0.25	0.29	0.25	0.25	0.25	0.27	0.27	0.25	0.25	0.47	0.26	0.25	0.32	0.30	0.50	0.24
O4'	0.30	0.28	0.53	0.41	0.29	0.25	0.27	0.28	0.25	0.30	0.25	0.29	0.23	0.28	0.30	0.53	0.19	0.23	0.22	0.37	0.46	0.27
O5'	0.26	0.21	0.51	0.36	0.23	0.25	0.21	0.32	0.18	0.25	0.17	0.23	0.17	0.23	0.25	0.55	0.29	0.29	0.37	0.32	0.40	0.23
OP1	0.45	0.38	0.66	0.53	0.40	0.46	0.35	0.50	0.30	0.39	0.32	0.41	0.25	0.35	0.42	0.72	0.46	0.48	0.49	0.44	0.39	0.31
OP2	0.57	0.49	0.75	0.61	0.54	0.59	0.51	0.64	0.47	0.56	0.46	0.53	0.43	0.53	0.56	0.82	0.54	0.61	0.61	0.59	0.43	0.44
P	0.41	0.34	0.61	0.47	0.37	0.43	0.34	0.49	0.30	0.38	0.30	0.38	0.26	0.35	0.39	0.68	0.42	0.46	0.49	0.44	0.39	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.26	0.00	0.24	0.52	0.20	0.20
C2	0.03	0.00	0.37	0.24	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.37	0.19	0.21	0.33	0.42	0.39	0.19
C2'	0.00	0.37	0.00	0.00	0.19	0.01	0.10	0.19	0.16	0.20	0.28	0.38	0.12	0.14	0.04	0.00	0.02	0.02	0.46	0.60	0.56	0.30
C3'	0.03	0.24	0.00	0.00	0.16	0.00	0.13	0.01	0.17	0.05	0.22	0.23	0.16	0.08	0.07	0.01	0.01	0.02	0.26	0.64	0.33	0.20
C4	0.01	0.00	0.19	0.16	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.17	0.11	0.33	0.32	0.42	0.18
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.11	0.08	0.12	0.04	0.09	0.02	0.20	0.01	0.01	0.01	0.59	0.19	0.25
C5	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.15	0.05	0.35	0.28	0.56	0.30
C5'	0.07	0.13	0.19	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.16	0.24	0.13	0.13	0.19	0.24	0.13	0.06	0.17	0.01	0.01	0.42	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.16	0.17	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.14	0.09	0.36	0.32	0.58	0.33
C8	0.02	0.00	0.20	0.05	0.00	0.11	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.17	0.14	0.33	0.24	0.57	0.30
N1	0.02	0.00	0.28	0.22	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.16	0.16	0.35	0.34	0.49	0.25
N3	0.03	0.00	0.38	0.23	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.36	0.20	0.21	0.32	0.45	0.33	0.17
N6	0.01	0.01	0.12	0.16	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.13	0.06	0.36	0.38	0.66	0.41
N7	0.01	0.00	0.14	0.08	0.00	0.09	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.15	0.08	0.34	0.34	0.65	0.40
N9	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.19	0.02	0.31	0.28	0.39	0.14
O2'	0.02	0.37	0.00	0.01	0.18	0.20	0.21	0.06	0.23	0.31	0.29	0.36	0.25	0.31	0.14	0.00	0.04	0.12	0.39	1.01	0.39	0.48
O3'	0.26	0.19	0.02	0.01	0.17	0.01	0.15	0.17	0.14	0.17	0.16	0.20	0.13	0.15	0.19	0.04	0.00	0.19	0.16	0.90	0.08	0.36
O4'	0.00	0.21	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.14	0.16	0.21	0.06	0.08	0.02	0.12	0.19	0.00	0.13	0.43	0.26	0.26
O5'	0.24	0.33	0.46	0.26	0.33	0.01	0.35	0.01	0.36	0.33	0.35	0.32	0.36	0.34	0.31	0.39	0.16	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.52	0.42	0.60	0.64	0.32	0.59	0.28	0.42	0.32	0.24	0.34	0.45	0.38	0.34	0.28	1.01	0.90	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.39	0.56	0.33	0.42	0.19	0.56	0.37	0.58	0.57	0.49	0.33	0.66	0.65	0.39	0.39	0.08	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.19	0.30	0.20	0.18	0.25	0.30	0.02	0.33	0.30	0.25	0.17	0.41	0.40	0.14	0.48	0.36	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00